MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 23860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_014774	TCA	2	6	82920	82925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121829
1503	NC_014774	GAA	2	6	82927	82932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121829
1504	NC_014774	GAT	2	6	83002	83007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121829
1505	NC_014774	AT	3	6	83075	83080	50 %	50 %	0 %	0 %	315121829
1506	NC_014774	CT	4	8	83176	83183	0 %	50 %	0 %	50 %	315121829
1507	NC_014774	A	6	6	83238	83243	100 %	0 %	0 %	0 %	315121829
1508	NC_014774	A	8	8	83378	83385	100 %	0 %	0 %	0 %	315121829
1509	NC_014774	AATC	2	8	83393	83400	50 %	25 %	0 %	25 %	315121829
1510	NC_014774	CCA	2	6	83434	83439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121829
1511	NC_014774	ACG	2	6	83474	83479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121829
1512	NC_014774	T	6	6	83513	83518	0 %	100 %	0 %	0 %	315121829
1513	NC_014774	CAT	2	6	83575	83580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121829
1514	NC_014774	ATTTC	2	10	83599	83608	20 %	60 %	0 %	20 %	315121829
1515	NC_014774	AC	3	6	83615	83620	50 %	0 %	0 %	50 %	315121830
1516	NC_014774	AAC	2	6	83622	83627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121830
1517	NC_014774	CAAA	2	8	83631	83638	75 %	0 %	0 %	25 %	315121830
1518	NC_014774	ATC	2	6	83671	83676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121830
1519	NC_014774	TC	3	6	83706	83711	0 %	50 %	0 %	50 %	315121830
1520	NC_014774	T	7	7	83714	83720	0 %	100 %	0 %	0 %	315121830
1521	NC_014774	ATT	2	6	83816	83821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121830
1522	NC_014774	CAAG	2	8	83864	83871	50 %	0 %	25 %	25 %	315121830
1523	NC_014774	AAG	2	6	83904	83909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121830
1524	NC_014774	TTC	2	6	83938	83943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121830
1525	NC_014774	T	6	6	83946	83951	0 %	100 %	0 %	0 %	315121830
1526	NC_014774	ATC	2	6	84052	84057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121830
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1530	NC_014774	CCA	2	6	84286	84291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121831
1531	NC_014774	ATCAG	2	10	84316	84325	40 %	20 %	20 %	20 %	315121831
1532	NC_014774	CGC	2	6	84519	84524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121831
1533	NC_014774	GCAA	2	8	84584	84591	50 %	0 %	25 %	25 %	315121831
1534	NC_014774	GCA	2	6	84622	84627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121831
1535	NC_014774	TCC	2	6	84636	84641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121831
1536	NC_014774	TAA	2	6	84668	84673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121831
1537	NC_014774	CGA	2	6	84701	84706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121831
1538	NC_014774	TGCG	2	8	84745	84752	0 %	25 %	50 %	25 %	315121831
1539	NC_014774	CCT	2	6	84754	84759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121831
1540	NC_014774	CTG	2	6	84824	84829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315121831
1541	NC_014774	ATCC	2	8	84832	84839	25 %	25 %	0 %	50 %	315121831
1542	NC_014774	TTC	2	6	84873	84878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121831
1543	NC_014774	GTT	2	6	84889	84894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121831
1544	NC_014774	TTTC	2	8	84983	84990	0 %	75 %	0 %	25 %	315121831
1545	NC_014774	ACA	2	6	85296	85301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121832
1546	NC_014774	CT	3	6	85304	85309	0 %	50 %	0 %	50 %	315121832
1547	NC_014774	TCC	2	6	85364	85369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121832
1548	NC_014774	CCAA	2	8	85375	85382	50 %	0 %	0 %	50 %	315121832
1549	NC_014774	TTC	2	6	85451	85456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121832
1550	NC_014774	CAT	2	6	85495	85500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121832
1551	NC_014774	TCC	2	6	85516	85521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121832
1552	NC_014774	TAG	2	6	85587	85592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121832
1553	NC_014774	ACC	2	6	85657	85662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121832
1554	NC_014774	GAAG	2	8	85835	85842	50 %	0 %	50 %	0 %	315121832
1555	NC_014774	CCA	2	6	85860	85865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121832
1556	NC_014774	AAT	2	6	85876	85881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121832
1557	NC_014774	AGTATC	2	12	85882	85893	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315121832
1558	NC_014774	CAC	2	6	86011	86016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121832
1559	NC_014774	ATC	2	6	86252	86257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121833
1560	NC_014774	CAA	2	6	86274	86279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121833
1561	NC_014774	TC	3	6	86374	86379	0 %	50 %	0 %	50 %	315121833
1562	NC_014774	TAT	2	6	86389	86394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121833
1563	NC_014774	GAT	3	9	86396	86404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121833
1564	NC_014774	ATT	2	6	86412	86417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121833
1565	NC_014774	GA	3	6	86479	86484	50 %	0 %	50 %	0 %	315121833
1566	NC_014774	ATT	2	6	86519	86524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121833
1567	NC_014774	ATC	2	6	86596	86601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121833
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1569	NC_014774	ATT	2	6	86707	86712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121833
1570	NC_014774	CAT	2	6	86726	86731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121833
1571	NC_014774	GCC	2	6	86774	86779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121833
1572	NC_014774	GGA	4	12	86924	86935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315121833
1573	NC_014774	ATA	2	6	86964	86969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121833
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1584	NC_014774	T	6	6	87439	87444	0 %	100 %	0 %	0 %	315121833
1585	NC_014774	TCT	2	6	87465	87470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121833
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1590	NC_014774	AAT	2	6	87698	87703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121834
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1593	NC_014774	A	7	7	87891	87897	100 %	0 %	0 %	0 %	315121834
1594	NC_014774	AAG	2	6	87982	87987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121834
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1597	NC_014774	TA	3	6	88100	88105	50 %	50 %	0 %	0 %	315121834
1598	NC_014774	CAA	2	6	88120	88125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121834
1599	NC_014774	AGA	2	6	88172	88177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121834
1600	NC_014774	CTG	2	6	88186	88191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315121834
1601	NC_014774	A	8	8	88289	88296	100 %	0 %	0 %	0 %	315121834
1602	NC_014774	TAA	2	6	88300	88305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121834
1603	NC_014774	A	6	6	88332	88337	100 %	0 %	0 %	0 %	315121834
1604	NC_014774	ACA	2	6	88378	88383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121834
1605	NC_014774	CAT	2	6	88447	88452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121834
1606	NC_014774	A	6	6	88931	88936	100 %	0 %	0 %	0 %	315121835
1607	NC_014774	GTAGAT	2	12	88937	88948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121835
1608	NC_014774	AT	3	6	88947	88952	50 %	50 %	0 %	0 %	315121835
1609	NC_014774	CTTA	2	8	88962	88969	25 %	50 %	0 %	25 %	315121835
1610	NC_014774	CGAT	2	8	88976	88983	25 %	25 %	25 %	25 %	315121835
1611	NC_014774	ATA	2	6	89155	89160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121836
1612	NC_014774	TGA	2	6	89183	89188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121836
1613	NC_014774	GAA	2	6	89199	89204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121836
1614	NC_014774	AAAC	2	8	89418	89425	75 %	0 %	0 %	25 %	315121836
1615	NC_014774	AATCA	2	10	89437	89446	60 %	20 %	0 %	20 %	315121836
1616	NC_014774	CCGT	2	8	89533	89540	0 %	25 %	25 %	50 %	315121836
1617	NC_014774	TC	4	8	89626	89633	0 %	50 %	0 %	50 %	315121836
1618	NC_014774	A	6	6	89655	89660	100 %	0 %	0 %	0 %	315121836
1619	NC_014774	GAAAA	2	10	89667	89676	80 %	0 %	20 %	0 %	315121836
1620	NC_014774	GAA	2	6	89730	89735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121836
1621	NC_014774	AGAA	2	8	89744	89751	75 %	0 %	25 %	0 %	315121836
1622	NC_014774	AGC	2	6	89961	89966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121837
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1625	NC_014774	TC	3	6	90171	90176	0 %	50 %	0 %	50 %	315121837
1626	NC_014774	ATGC	2	8	90199	90206	25 %	25 %	25 %	25 %	315121837
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