MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 chromosome

Total Repeats: 45478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014758	GAA	2	6	48262	48267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313672018
1002	NC_014758	GTA	2	6	48360	48365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672018
1003	NC_014758	GTT	2	6	48444	48449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313672018
1004	NC_014758	GGT	2	6	48452	48457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313672018
1005	NC_014758	A	6	6	48517	48522	100 %	0 %	0 %	0 %	313672018
1006	NC_014758	GACC	2	8	48559	48566	25 %	0 %	25 %	50 %	313672018
1007	NC_014758	CCA	2	6	48567	48572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313672018
1008	NC_014758	G	7	7	48575	48581	0 %	0 %	100 %	0 %	313672018
1009	NC_014758	TTG	2	6	48716	48721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313672018
1010	NC_014758	ATGGT	2	10	48726	48735	20 %	40 %	40 %	0 %	313672018
1011	NC_014758	TA	4	8	48772	48779	50 %	50 %	0 %	0 %	313672018
1012	NC_014758	TAC	2	6	48783	48788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313672018
1013	NC_014758	T	6	6	48791	48796	0 %	100 %	0 %	0 %	313672018
1014	NC_014758	T	7	7	48839	48845	0 %	100 %	0 %	0 %	313672019
1015	NC_014758	A	7	7	48926	48932	100 %	0 %	0 %	0 %	313672019
1016	NC_014758	CATA	2	8	48944	48951	50 %	25 %	0 %	25 %	313672019
1017	NC_014758	GTA	2	6	48973	48978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672019
1018	NC_014758	T	6	6	48984	48989	0 %	100 %	0 %	0 %	313672019
1019	NC_014758	ACCTC	2	10	49035	49044	20 %	20 %	0 %	60 %	313672019
1020	NC_014758	AGA	2	6	49094	49099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313672019
1021	NC_014758	T	6	6	49158	49163	0 %	100 %	0 %	0 %	313672019
1022	NC_014758	G	6	6	49238	49243	0 %	0 %	100 %	0 %	313672019
1023	NC_014758	TTG	2	6	49264	49269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313672019
1024	NC_014758	A	6	6	49273	49278	100 %	0 %	0 %	0 %	313672019
1025	NC_014758	ACA	2	6	49372	49377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313672019
1026	NC_014758	A	6	6	49394	49399	100 %	0 %	0 %	0 %	313672019
1027	NC_014758	AT	3	6	49418	49423	50 %	50 %	0 %	0 %	313672019
1028	NC_014758	GAT	2	6	49470	49475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672019
1029	NC_014758	TGT	2	6	49526	49531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313672019
1030	NC_014758	TAAA	2	8	49543	49550	75 %	25 %	0 %	0 %	313672019
1031	NC_014758	TCC	2	6	49577	49582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313672019
1032	NC_014758	GTC	2	6	49585	49590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313672019
1033	NC_014758	GA	3	6	49593	49598	50 %	0 %	50 %	0 %	313672019
1034	NC_014758	TTA	2	6	49642	49647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313672019
1035	NC_014758	T	6	6	49681	49686	0 %	100 %	0 %	0 %	313672019
1036	NC_014758	GAT	2	6	49715	49720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672019
1037	NC_014758	AT	3	6	49723	49728	50 %	50 %	0 %	0 %	313672019
1038	NC_014758	GAT	2	6	49806	49811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672019
1039	NC_014758	ATA	3	9	49881	49889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313672019
1040	NC_014758	TCT	2	6	49953	49958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313672020
1041	NC_014758	ATA	2	6	50039	50044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313672020
1042	NC_014758	TTATA	2	10	50069	50078	40 %	60 %	0 %	0 %	313672020
1043	NC_014758	TAT	2	6	50113	50118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313672020
1044	NC_014758	GTT	2	6	50152	50157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313672020
1045	NC_014758	TAAAGA	2	12	50160	50171	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313672020
1046	NC_014758	ATA	2	6	50210	50215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313672020
1047	NC_014758	AAGGG	2	10	50234	50243	40 %	0 %	60 %	0 %	313672020
1048	NC_014758	TAA	2	6	50370	50375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313672020
1049	NC_014758	A	6	6	50430	50435	100 %	0 %	0 %	0 %	313672020
1050	NC_014758	A	6	6	50475	50480	100 %	0 %	0 %	0 %	313672020
1051	NC_014758	AGT	2	6	50521	50526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672020
1052	NC_014758	AAT	2	6	50611	50616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313672020
1053	NC_014758	AGTA	2	8	50649	50656	50 %	25 %	25 %	0 %	313672020
1054	NC_014758	A	6	6	50656	50661	100 %	0 %	0 %	0 %	313672020
1055	NC_014758	GAT	2	6	50692	50697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672020
1056	NC_014758	ACA	2	6	50834	50839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313672020
1057	NC_014758	GATA	2	8	50841	50848	50 %	25 %	25 %	0 %	313672020
1058	NC_014758	GAAT	2	8	50874	50881	50 %	25 %	25 %	0 %	313672020
1059	NC_014758	AT	3	6	50880	50885	50 %	50 %	0 %	0 %	313672020
1060	NC_014758	ATT	2	6	50903	50908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313672020
1061	NC_014758	ACA	2	6	51071	51076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313672020
1062	NC_014758	A	7	7	51085	51091	100 %	0 %	0 %	0 %	313672020
1063	NC_014758	ATA	2	6	51149	51154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313672020
1064	NC_014758	CAG	2	6	51315	51320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313672020
1065	NC_014758	ACA	2	6	51398	51403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313672020
1066	NC_014758	AT	3	6	51411	51416	50 %	50 %	0 %	0 %	313672020
1067	NC_014758	CAA	2	6	51450	51455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313672020
1068	NC_014758	ATT	2	6	51509	51514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313672020
1069	NC_014758	TGA	3	9	51573	51581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672020
1070	NC_014758	TAT	2	6	51661	51666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313672020
1071	NC_014758	AGAT	2	8	51674	51681	50 %	25 %	25 %	0 %	313672020
1072	NC_014758	TAC	2	6	51682	51687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313672020
1073	NC_014758	A	6	6	51688	51693	100 %	0 %	0 %	0 %	313672020
1074	NC_014758	ATTA	2	8	51703	51710	50 %	50 %	0 %	0 %	313672020
1075	NC_014758	TAT	2	6	51718	51723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313672020
1076	NC_014758	GGA	2	6	51793	51798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313672020
1077	NC_014758	A	6	6	51829	51834	100 %	0 %	0 %	0 %	313672020
1078	NC_014758	AAT	2	6	51850	51855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313672020
1079	NC_014758	TA	3	6	51908	51913	50 %	50 %	0 %	0 %	313672020
1080	NC_014758	ATTC	2	8	52008	52015	25 %	50 %	0 %	25 %	313672020
1081	NC_014758	GGA	2	6	52036	52041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313672020
1082	NC_014758	TGA	2	6	52066	52071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672020
1083	NC_014758	GTG	2	6	52158	52163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313672021
1084	NC_014758	CAT	2	6	52197	52202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313672021
1085	NC_014758	TAAA	2	8	52255	52262	75 %	25 %	0 %	0 %	313672021
1086	NC_014758	GA	3	6	52271	52276	50 %	0 %	50 %	0 %	313672021
1087	NC_014758	TGC	2	6	52363	52368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313672021
1088	NC_014758	A	6	6	52451	52456	100 %	0 %	0 %	0 %	313672021
1089	NC_014758	AT	3	6	52488	52493	50 %	50 %	0 %	0 %	313672021
1090	NC_014758	AGA	2	6	52529	52534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313672021
1091	NC_014758	C	7	7	52537	52543	0 %	0 %	0 %	100 %	313672021
1092	NC_014758	ATC	2	6	52675	52680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313672021
1093	NC_014758	TGA	2	6	52684	52689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672021
1094	NC_014758	ATA	2	6	52692	52697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313672021
1095	NC_014758	GTA	2	6	52717	52722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672021
1096	NC_014758	ATTA	2	8	52796	52803	50 %	50 %	0 %	0 %	313672021
1097	NC_014758	A	6	6	52814	52819	100 %	0 %	0 %	0 %	313672021
1098	NC_014758	TGGG	2	8	52837	52844	0 %	25 %	75 %	0 %	313672021
1099	NC_014758	TGT	2	6	52877	52882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313672021
1100	NC_014758	GAA	2	6	52908	52913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313672021
1101	NC_014758	TTG	2	6	52958	52963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313672021
1102	NC_014758	A	6	6	53032	53037	100 %	0 %	0 %	0 %	313672021
1103	NC_014758	A	7	7	53059	53065	100 %	0 %	0 %	0 %	313672021
1104	NC_014758	T	6	6	53089	53094	0 %	100 %	0 %	0 %	313672022
1105	NC_014758	GCT	2	6	53110	53115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313672022
1106	NC_014758	TTC	2	6	53136	53141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313672022
1107	NC_014758	ATGG	2	8	53143	53150	25 %	25 %	50 %	0 %	313672022
1108	NC_014758	A	6	6	53238	53243	100 %	0 %	0 %	0 %	313672022
1109	NC_014758	A	7	7	53271	53277	100 %	0 %	0 %	0 %	313672022
1110	NC_014758	TAC	2	6	53317	53322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313672022
1111	NC_014758	TGA	2	6	53340	53345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313672022
1112	NC_014758	CTA	2	6	53366	53371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313672022
1113	NC_014758	CTT	2	6	53414	53419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313672022
1114	NC_014758	A	6	6	53454	53459	100 %	0 %	0 %	0 %	313672022
1115	NC_014758	AAT	2	6	53473	53478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313672022
1116	NC_014758	CTTT	2	8	53479	53486	0 %	75 %	0 %	25 %	313672022
1117	NC_014758	A	6	6	53653	53658	100 %	0 %	0 %	0 %	313672022
1118	NC_014758	AATG	2	8	53700	53707	50 %	25 %	25 %	0 %	313672022
1119	NC_014758	AAC	2	6	53745	53750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313672022
1120	NC_014758	TAT	2	6	53760	53765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313672022
1121	NC_014758	ATT	2	6	53870	53875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313672022
1122	NC_014758	T	7	7	53889	53895	0 %	100 %	0 %	0 %	313672022
1123	NC_014758	A	6	6	53974	53979	100 %	0 %	0 %	0 %	313672022
1124	NC_014758	GAA	2	6	53986	53991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313672022
1125	NC_014758	TC	3	6	54015	54020	0 %	50 %	0 %	50 %	313672022
1126	NC_014758	AGA	2	6	54024	54029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313672022
1127	NC_014758	AAC	2	6	54121	54126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313672023
1128	NC_014758	CCTGAT	2	12	54127	54138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313672023
1129	NC_014758	AT	3	6	54266	54271	50 %	50 %	0 %	0 %	313672023
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1152	NC_014758	TA	3	6	55534	55539	50 %	50 %	0 %	0 %	313672025
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1161	NC_014758	A	7	7	55996	56002	100 %	0 %	0 %	0 %	313672025
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1252	NC_014758	T	6	6	60450	60455	0 %	100 %	0 %	0 %	313672029
1253	NC_014758	CAT	2	6	60474	60479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313672029
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1255	NC_014758	A	6	6	60667	60672	100 %	0 %	0 %	0 %	313672030
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