MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 plasmid pCALNI01

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014749	AT	3	6	809	814	50 %	50 %	0 %	0 %	313652021
2	NC_014749	TA	3	6	825	830	50 %	50 %	0 %	0 %	313652021
3	NC_014749	TA	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	313652022
4	NC_014749	GT	3	6	2510	2515	0 %	50 %	50 %	0 %	313652022
5	NC_014749	TC	3	6	3080	3085	0 %	50 %	0 %	50 %	313652022
6	NC_014749	AT	3	6	3565	3570	50 %	50 %	0 %	0 %	313652022
7	NC_014749	CT	3	6	4127	4132	0 %	50 %	0 %	50 %	313652023
8	NC_014749	AT	3	6	4367	4372	50 %	50 %	0 %	0 %	313652023
9	NC_014749	TA	3	6	4577	4582	50 %	50 %	0 %	0 %	313652023
10	NC_014749	TC	3	6	4649	4654	0 %	50 %	0 %	50 %	313652023
11	NC_014749	CT	3	6	4863	4868	0 %	50 %	0 %	50 %	313652023
12	NC_014749	GT	3	6	4945	4950	0 %	50 %	50 %	0 %	313652023
13	NC_014749	CT	3	6	5063	5068	0 %	50 %	0 %	50 %	313652023
14	NC_014749	CT	3	6	5174	5179	0 %	50 %	0 %	50 %	313652023
15	NC_014749	GT	3	6	5290	5295	0 %	50 %	50 %	0 %	313652023
16	NC_014749	AT	3	6	5442	5447	50 %	50 %	0 %	0 %	313652023
17	NC_014749	AG	3	6	6551	6556	50 %	0 %	50 %	0 %	313652024
18	NC_014749	CT	3	6	6651	6656	0 %	50 %	0 %	50 %	313652024
19	NC_014749	TC	3	6	7062	7067	0 %	50 %	0 %	50 %	313652024
20	NC_014749	TC	3	6	7516	7521	0 %	50 %	0 %	50 %	313652024
21	NC_014749	AG	3	6	8936	8941	50 %	0 %	50 %	0 %	313652027
22	NC_014749	TA	3	6	9024	9029	50 %	50 %	0 %	0 %	313652027
23	NC_014749	AT	3	6	11762	11767	50 %	50 %	0 %	0 %	313652029
24	NC_014749	AG	3	6	12009	12014	50 %	0 %	50 %	0 %	313652029
25	NC_014749	TA	3	6	12214	12219	50 %	50 %	0 %	0 %	313652029
26	NC_014749	AT	4	8	13005	13012	50 %	50 %	0 %	0 %	313652030
27	NC_014749	AT	3	6	13248	13253	50 %	50 %	0 %	0 %	313652030
28	NC_014749	GA	3	6	13588	13593	50 %	0 %	50 %	0 %	313652030
29	NC_014749	AT	3	6	13704	13709	50 %	50 %	0 %	0 %	313652030
30	NC_014749	AT	3	6	13923	13928	50 %	50 %	0 %	0 %	313652030
31	NC_014749	AG	3	6	13956	13961	50 %	0 %	50 %	0 %	313652030
32	NC_014749	AT	3	6	14250	14255	50 %	50 %	0 %	0 %	313652030
33	NC_014749	AT	4	8	14673	14680	50 %	50 %	0 %	0 %	313652030
34	NC_014749	AT	3	6	14715	14720	50 %	50 %	0 %	0 %	313652030
35	NC_014749	CA	3	6	15029	15034	50 %	0 %	0 %	50 %	313652031
36	NC_014749	TC	3	6	15218	15223	0 %	50 %	0 %	50 %	313652031
37	NC_014749	TA	3	6	15589	15594	50 %	50 %	0 %	0 %	313652031
38	NC_014749	AT	3	6	16135	16140	50 %	50 %	0 %	0 %	313652031
39	NC_014749	AT	3	6	17011	17016	50 %	50 %	0 %	0 %	313652033
40	NC_014749	AT	4	8	18234	18241	50 %	50 %	0 %	0 %	313652034
41	NC_014749	AT	3	6	18526	18531	50 %	50 %	0 %	0 %	313652034
42	NC_014749	AG	3	6	18614	18619	50 %	0 %	50 %	0 %	313652034
43	NC_014749	TA	3	6	18819	18824	50 %	50 %	0 %	0 %	313652034
44	NC_014749	TC	3	6	18833	18838	0 %	50 %	0 %	50 %	313652034
45	NC_014749	TC	3	6	20135	20140	0 %	50 %	0 %	50 %	313652036
46	NC_014749	TA	3	6	20351	20356	50 %	50 %	0 %	0 %	313652036
47	NC_014749	AT	3	6	20831	20836	50 %	50 %	0 %	0 %	313652036
48	NC_014749	AT	3	6	22756	22761	50 %	50 %	0 %	0 %	313652037
49	NC_014749	AT	4	8	22944	22951	50 %	50 %	0 %	0 %	313652037
50	NC_014749	AT	3	6	23052	23057	50 %	50 %	0 %	0 %	313652037
51	NC_014749	AT	3	6	23112	23117	50 %	50 %	0 %	0 %	313652037
52	NC_014749	TA	3	6	23319	23324	50 %	50 %	0 %	0 %	313652037
53	NC_014749	AT	4	8	23570	23577	50 %	50 %	0 %	0 %	313652037
54	NC_014749	AT	3	6	23616	23621	50 %	50 %	0 %	0 %	313652037
55	NC_014749	AG	3	6	23883	23888	50 %	0 %	50 %	0 %	313652037
56	NC_014749	AT	3	6	25305	25310	50 %	50 %	0 %	0 %	313652039
57	NC_014749	AT	3	6	25774	25779	50 %	50 %	0 %	0 %	313652039
58	NC_014749	AT	3	6	26335	26340	50 %	50 %	0 %	0 %	313652040
59	NC_014749	CT	3	6	26413	26418	0 %	50 %	0 %	50 %	313652040
60	NC_014749	TA	3	6	26907	26912	50 %	50 %	0 %	0 %	313652040
61	NC_014749	TA	3	6	26924	26929	50 %	50 %	0 %	0 %	313652040
62	NC_014749	TA	3	6	27102	27107	50 %	50 %	0 %	0 %	313652040
63	NC_014749	CA	3	6	27377	27382	50 %	0 %	0 %	50 %	313652041
64	NC_014749	TA	3	6	27531	27536	50 %	50 %	0 %	0 %	313652041
65	NC_014749	TG	3	6	27551	27556	0 %	50 %	50 %	0 %	313652041
66	NC_014749	AG	3	6	28118	28123	50 %	0 %	50 %	0 %	313652041
67	NC_014749	AT	3	6	29397	29402	50 %	50 %	0 %	0 %	313652042
68	NC_014749	AT	3	6	31030	31035	50 %	50 %	0 %	0 %	313652044
69	NC_014749	GA	3	6	32070	32075	50 %	0 %	50 %	0 %	313652045
70	NC_014749	GA	3	6	32367	32372	50 %	0 %	50 %	0 %	313652045
71	NC_014749	AG	3	6	32448	32453	50 %	0 %	50 %	0 %	313652045
72	NC_014749	AG	3	6	32508	32513	50 %	0 %	50 %	0 %	313652045
73	NC_014749	GA	3	6	32566	32571	50 %	0 %	50 %	0 %	313652045
74	NC_014749	TA	3	6	34118	34123	50 %	50 %	0 %	0 %	313652048
75	NC_014749	CA	3	6	34135	34140	50 %	0 %	0 %	50 %	313652048
76	NC_014749	AT	3	6	34172	34177	50 %	50 %	0 %	0 %	313652048
77	NC_014749	TA	3	6	35102	35107	50 %	50 %	0 %	0 %	313652049
78	NC_014749	TC	4	8	36563	36570	0 %	50 %	0 %	50 %	313652051
79	NC_014749	AT	3	6	37015	37020	50 %	50 %	0 %	0 %	313652053
80	NC_014749	GA	3	6	37177	37182	50 %	0 %	50 %	0 %	313652053
81	NC_014749	AT	3	6	38053	38058	50 %	50 %	0 %	0 %	313652054
82	NC_014749	AG	3	6	38300	38305	50 %	0 %	50 %	0 %	313652054
83	NC_014749	TA	3	6	38505	38510	50 %	50 %	0 %	0 %	313652054
84	NC_014749	AT	3	6	41608	41613	50 %	50 %	0 %	0 %	313652056
85	NC_014749	TC	3	6	41739	41744	0 %	50 %	0 %	50 %	313652057
86	NC_014749	TA	3	6	41876	41881	50 %	50 %	0 %	0 %	313652057
87	NC_014749	AT	3	6	42316	42321	50 %	50 %	0 %	0 %	313652057
88	NC_014749	TA	3	6	43646	43651	50 %	50 %	0 %	0 %	313652058
89	NC_014749	TG	3	6	43819	43824	0 %	50 %	50 %	0 %	313652058
90	NC_014749	TA	3	6	44769	44774	50 %	50 %	0 %	0 %	313652059
91	NC_014749	AT	4	8	45429	45436	50 %	50 %	0 %	0 %	313652060
92	NC_014749	AT	3	6	46229	46234	50 %	50 %	0 %	0 %	313652061
93	NC_014749	AT	3	6	47183	47188	50 %	50 %	0 %	0 %	313652062
94	NC_014749	CA	3	6	47194	47199	50 %	0 %	0 %	50 %	313652062
95	NC_014749	TA	3	6	47207	47212	50 %	50 %	0 %	0 %	313652062
96	NC_014749	AT	5	10	47334	47343	50 %	50 %	0 %	0 %	313652062
97	NC_014749	AT	3	6	47782	47787	50 %	50 %	0 %	0 %	313652063
98	NC_014749	TA	3	6	48014	48019	50 %	50 %	0 %	0 %	313652063
99	NC_014749	AC	3	6	49237	49242	50 %	0 %	0 %	50 %	313652065
100	NC_014749	TA	3	6	49403	49408	50 %	50 %	0 %	0 %	313652065
101	NC_014749	AT	3	6	49418	49423	50 %	50 %	0 %	0 %	313652065
102	NC_014749	AT	3	6	49632	49637	50 %	50 %	0 %	0 %	313652066
103	NC_014749	AT	3	6	49913	49918	50 %	50 %	0 %	0 %	313652066
104	NC_014749	AG	3	6	49952	49957	50 %	0 %	50 %	0 %	313652066
105	NC_014749	AT	4	8	50496	50503	50 %	50 %	0 %	0 %	313652067
106	NC_014749	AT	3	6	50583	50588	50 %	50 %	0 %	0 %	313652067
107	NC_014749	AT	3	6	50782	50787	50 %	50 %	0 %	0 %	313652067
108	NC_014749	TA	3	6	50939	50944	50 %	50 %	0 %	0 %	313652067
109	NC_014749	TA	3	6	52005	52010	50 %	50 %	0 %	0 %	313652068
110	NC_014749	AT	3	6	53505	53510	50 %	50 %	0 %	0 %	313652069
111	NC_014749	AT	3	6	54189	54194	50 %	50 %	0 %	0 %	313652070
112	NC_014749	GA	3	6	54753	54758	50 %	0 %	50 %	0 %	313652071
113	NC_014749	TA	3	6	55322	55327	50 %	50 %	0 %	0 %	313652072
114	NC_014749	TA	3	6	55445	55450	50 %	50 %	0 %	0 %	313652072
115	NC_014749	TA	4	8	55861	55868	50 %	50 %	0 %	0 %	313652072
116	NC_014749	CA	3	6	56182	56187	50 %	0 %	0 %	50 %	313652073
117	NC_014749	AT	3	6	56212	56217	50 %	50 %	0 %	0 %	313652073
118	NC_014749	AG	3	6	56451	56456	50 %	0 %	50 %	0 %	313652073
119	NC_014749	AC	3	6	56573	56578	50 %	0 %	0 %	50 %	313652073
120	NC_014749	AT	3	6	57291	57296	50 %	50 %	0 %	0 %	313652074
121	NC_014749	AT	3	6	57570	57575	50 %	50 %	0 %	0 %	313652075
122	NC_014749	TA	3	6	58135	58140	50 %	50 %	0 %	0 %	313652075

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.