MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B chromosome

Total Repeats: 5921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014721	ATGC	2	8	556	563	25 %	25 %	25 %	25 %	312792284
2	NC_014721	ATGT	2	8	607	614	25 %	50 %	25 %	0 %	312792284
3	NC_014721	AAAC	2	8	1001	1008	75 %	0 %	0 %	25 %	312792284
4	NC_014721	TGGA	2	8	2645	2652	25 %	25 %	50 %	0 %	312792285
5	NC_014721	ATCT	2	8	2722	2729	25 %	50 %	0 %	25 %	312792285
6	NC_014721	TAGA	2	8	3039	3046	50 %	25 %	25 %	0 %	312792286
7	NC_014721	GTTT	2	8	3118	3125	0 %	75 %	25 %	0 %	312792286
8	NC_014721	CTTG	2	8	3424	3431	0 %	50 %	25 %	25 %	312792286
9	NC_014721	GATT	2	8	4153	4160	25 %	50 %	25 %	0 %	312792287
10	NC_014721	TGTC	2	8	5176	5183	0 %	50 %	25 %	25 %	312792288
11	NC_014721	CTTT	2	8	5743	5750	0 %	75 %	0 %	25 %	312792288
12	NC_014721	AAGA	2	8	6136	6143	75 %	0 %	25 %	0 %	312792289
13	NC_014721	AGAT	2	8	6292	6299	50 %	25 %	25 %	0 %	312792289
14	NC_014721	TGAT	2	8	6916	6923	25 %	50 %	25 %	0 %	312792290
15	NC_014721	TACT	2	8	6933	6940	25 %	50 %	0 %	25 %	312792290
16	NC_014721	AAAG	2	8	11244	11251	75 %	0 %	25 %	0 %	312792291
17	NC_014721	AAAG	2	8	11270	11277	75 %	0 %	25 %	0 %	312792291
18	NC_014721	TAAA	2	8	11408	11415	75 %	25 %	0 %	0 %	312792291
19	NC_014721	AGAA	2	8	11774	11781	75 %	0 %	25 %	0 %	312792292
20	NC_014721	TGTA	2	8	11879	11886	25 %	50 %	25 %	0 %	312792292
21	NC_014721	GAAG	2	8	12259	12266	50 %	0 %	50 %	0 %	312792292
22	NC_014721	AGAT	2	8	12353	12360	50 %	25 %	25 %	0 %	312792292
23	NC_014721	AAAG	2	8	12363	12370	75 %	0 %	25 %	0 %	312792292
24	NC_014721	ATTA	2	8	12486	12493	50 %	50 %	0 %	0 %	312792292
25	NC_014721	AAAG	2	8	13253	13260	75 %	0 %	25 %	0 %	312792293
26	NC_014721	CCAG	2	8	13294	13301	25 %	0 %	25 %	50 %	312792293
27	NC_014721	GAGT	2	8	14389	14396	25 %	25 %	50 %	0 %	312792294
28	NC_014721	GACA	2	8	15733	15740	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
29	NC_014721	ATCA	2	8	15916	15923	50 %	25 %	0 %	25 %	312792295
30	NC_014721	CAGA	2	8	16157	16164	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
31	NC_014721	CAAG	2	8	16365	16372	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
32	NC_014721	TGAC	2	8	16590	16597	25 %	25 %	25 %	25 %	312792295
33	NC_014721	AAAC	2	8	16827	16834	75 %	0 %	0 %	25 %	312792295
34	NC_014721	GACA	2	8	17020	17027	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
35	NC_014721	ACAT	2	8	17381	17388	50 %	25 %	0 %	25 %	312792295
36	NC_014721	TAAG	2	8	17409	17416	50 %	25 %	25 %	0 %	312792295
37	NC_014721	GACA	2	8	17449	17456	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
38	NC_014721	ACAA	2	8	17531	17538	75 %	0 %	0 %	25 %	312792295
39	NC_014721	GACA	2	8	17944	17951	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
40	NC_014721	GTTA	2	8	19611	19618	25 %	50 %	25 %	0 %	312792296
41	NC_014721	GCCA	2	8	20143	20150	25 %	0 %	25 %	50 %	312792296
42	NC_014721	GGAT	2	8	20565	20572	25 %	25 %	50 %	0 %	312792296
43	NC_014721	TGGA	2	8	21961	21968	25 %	25 %	50 %	0 %	312792296
44	NC_014721	CAAA	2	8	23608	23615	75 %	0 %	0 %	25 %	312792296
45	NC_014721	CAAT	2	8	23989	23996	50 %	25 %	0 %	25 %	312792296
46	NC_014721	AAGA	2	8	26601	26608	75 %	0 %	25 %	0 %	312792297
47	NC_014721	GAAA	2	8	26932	26939	75 %	0 %	25 %	0 %	312792297
48	NC_014721	GAAT	2	8	27164	27171	50 %	25 %	25 %	0 %	312792297
49	NC_014721	GGAA	2	8	28279	28286	50 %	0 %	50 %	0 %	312792298
50	NC_014721	AAAC	2	8	28350	28357	75 %	0 %	0 %	25 %	312792298
51	NC_014721	AGAC	2	8	28395	28402	50 %	0 %	25 %	25 %	312792298
52	NC_014721	GTTT	2	8	28673	28680	0 %	75 %	25 %	0 %	312792298
53	NC_014721	AAGA	2	8	28756	28763	75 %	0 %	25 %	0 %	312792298
54	NC_014721	GAAG	2	8	28766	28773	50 %	0 %	50 %	0 %	312792298
55	NC_014721	GATG	2	8	29224	29231	25 %	25 %	50 %	0 %	312792298
56	NC_014721	TTTG	2	8	29716	29723	0 %	75 %	25 %	0 %	312792298
57	NC_014721	AAGC	2	8	29937	29944	50 %	0 %	25 %	25 %	312792298
58	NC_014721	TCAT	2	8	30385	30392	25 %	50 %	0 %	25 %	312792299
59	NC_014721	TCAT	2	8	30844	30851	25 %	50 %	0 %	25 %	312792299
60	NC_014721	AAGA	2	8	31160	31167	75 %	0 %	25 %	0 %	312792299
61	NC_014721	AAGA	2	8	31310	31317	75 %	0 %	25 %	0 %	312792299
62	NC_014721	AAGA	2	8	31460	31467	75 %	0 %	25 %	0 %	312792299
63	NC_014721	TCAT	2	8	31750	31757	25 %	50 %	0 %	25 %	312792299
64	NC_014721	AAAG	2	8	31918	31925	75 %	0 %	25 %	0 %	312792299
65	NC_014721	AAGA	2	8	32072	32079	75 %	0 %	25 %	0 %	312792299
66	NC_014721	GAAT	2	8	33245	33252	50 %	25 %	25 %	0 %	312792300
67	NC_014721	GTTT	2	8	33542	33549	0 %	75 %	25 %	0 %	312792300
68	NC_014721	AGCA	2	8	33580	33587	50 %	0 %	25 %	25 %	312792300
69	NC_014721	GCAA	2	8	33598	33605	50 %	0 %	25 %	25 %	312792300
70	NC_014721	GGTT	2	8	33860	33867	0 %	50 %	50 %	0 %	312792300
71	NC_014721	GAAA	2	8	34066	34073	75 %	0 %	25 %	0 %	312792301
72	NC_014721	ATGG	2	8	34441	34448	25 %	25 %	50 %	0 %	312792301
73	NC_014721	CTTT	2	8	34475	34482	0 %	75 %	0 %	25 %	312792301
74	NC_014721	GCTT	2	8	34716	34723	0 %	50 %	25 %	25 %	312792301
75	NC_014721	GATA	2	8	41250	41257	50 %	25 %	25 %	0 %	312792302
76	NC_014721	GAAA	2	8	41580	41587	75 %	0 %	25 %	0 %	312792302
77	NC_014721	AATA	2	8	41610	41617	75 %	25 %	0 %	0 %	312792302
78	NC_014721	TGAG	2	8	41687	41694	25 %	25 %	50 %	0 %	312792302
79	NC_014721	GATA	2	8	46418	46425	50 %	25 %	25 %	0 %	312792303
80	NC_014721	AACA	2	8	46453	46460	75 %	0 %	0 %	25 %	312792303
81	NC_014721	ATTG	2	8	46493	46500	25 %	50 %	25 %	0 %	312792303
82	NC_014721	TTTA	2	8	46505	46512	25 %	75 %	0 %	0 %	312792303
83	NC_014721	AGAA	2	8	46913	46920	75 %	0 %	25 %	0 %	312792303
84	NC_014721	TTAA	2	8	47034	47041	50 %	50 %	0 %	0 %	312792303
85	NC_014721	AGAT	2	8	47287	47294	50 %	25 %	25 %	0 %	312792303
86	NC_014721	AAAT	2	8	47893	47900	75 %	25 %	0 %	0 %	312792304
87	NC_014721	AGGA	2	8	48219	48226	50 %	0 %	50 %	0 %	312792304
88	NC_014721	GTAT	2	8	48447	48454	25 %	50 %	25 %	0 %	312792305
89	NC_014721	TAAA	2	8	49104	49111	75 %	25 %	0 %	0 %	312792306
90	NC_014721	AAGA	2	8	49965	49972	75 %	0 %	25 %	0 %	312792306
91	NC_014721	ATTT	2	8	52437	52444	25 %	75 %	0 %	0 %	312792308
92	NC_014721	AGAT	2	8	52552	52559	50 %	25 %	25 %	0 %	312792308
93	NC_014721	GAAG	2	8	52937	52944	50 %	0 %	50 %	0 %	312792308
94	NC_014721	ATTA	2	8	53441	53448	50 %	50 %	0 %	0 %	312792308
95	NC_014721	TGAA	2	8	53566	53573	50 %	25 %	25 %	0 %	312792308
96	NC_014721	TAAT	2	8	53668	53675	50 %	50 %	0 %	0 %	312792308
97	NC_014721	ATAC	2	8	53925	53932	50 %	25 %	0 %	25 %	312792308
98	NC_014721	AATA	2	8	54437	54444	75 %	25 %	0 %	0 %	312792309
99	NC_014721	GTAT	2	8	54459	54466	25 %	50 %	25 %	0 %	312792309
100	NC_014721	CATA	2	8	54487	54494	50 %	25 %	0 %	25 %	312792309
101	NC_014721	TAAG	2	8	54543	54550	50 %	25 %	25 %	0 %	312792310
102	NC_014721	TGTC	2	8	55021	55028	0 %	50 %	25 %	25 %	312792310
103	NC_014721	GAAA	2	8	55590	55597	75 %	0 %	25 %	0 %	312792311
104	NC_014721	ATGT	2	8	55738	55745	25 %	50 %	25 %	0 %	312792311
105	NC_014721	TTTA	2	8	55785	55792	25 %	75 %	0 %	0 %	312792311
106	NC_014721	GAAG	2	8	57602	57609	50 %	0 %	50 %	0 %	312792312
107	NC_014721	ATCA	2	8	57880	57887	50 %	25 %	0 %	25 %	312792312
108	NC_014721	GCTC	2	8	58062	58069	0 %	25 %	25 %	50 %	312792312
109	NC_014721	ACCA	2	8	64698	64705	50 %	0 %	0 %	50 %	312792317
110	NC_014721	AATG	2	8	65885	65892	50 %	25 %	25 %	0 %	312792318
111	NC_014721	ACAA	2	8	66384	66391	75 %	0 %	0 %	25 %	312792319
112	NC_014721	AGTA	2	8	67999	68006	50 %	25 %	25 %	0 %	312792320
113	NC_014721	AGTA	2	8	68085	68092	50 %	25 %	25 %	0 %	312792320
114	NC_014721	TGTT	2	8	68476	68483	0 %	75 %	25 %	0 %	312792321
115	NC_014721	TTCT	2	8	68821	68828	0 %	75 %	0 %	25 %	312792321
116	NC_014721	CTTT	2	8	69438	69445	0 %	75 %	0 %	25 %	312792322
117	NC_014721	AACT	2	8	69766	69773	50 %	25 %	0 %	25 %	312792322
118	NC_014721	GTAA	2	8	70747	70754	50 %	25 %	25 %	0 %	312792323
119	NC_014721	GGAA	2	8	70776	70783	50 %	0 %	50 %	0 %	312792323
120	NC_014721	TAAC	2	8	70820	70827	50 %	25 %	0 %	25 %	312792323
121	NC_014721	ATTG	2	8	71389	71396	25 %	50 %	25 %	0 %	312792323
122	NC_014721	TTAC	2	8	71872	71879	25 %	50 %	0 %	25 %	312792324
123	NC_014721	AGTG	2	8	72152	72159	25 %	25 %	50 %	0 %	312792324
124	NC_014721	TGAG	2	8	72458	72465	25 %	25 %	50 %	0 %	312792324
125	NC_014721	TGGT	2	8	74256	74263	0 %	50 %	50 %	0 %	312792327
126	NC_014721	TTTA	2	8	74530	74537	25 %	75 %	0 %	0 %	312792327
127	NC_014721	GATG	2	8	75676	75683	25 %	25 %	50 %	0 %	312792327
128	NC_014721	AGGA	2	8	75685	75692	50 %	0 %	50 %	0 %	312792327
129	NC_014721	ATAA	2	8	76554	76561	75 %	25 %	0 %	0 %	312792328
130	NC_014721	TTGG	2	8	76998	77005	0 %	50 %	50 %	0 %	312792328
131	NC_014721	AAGA	2	8	77099	77106	75 %	0 %	25 %	0 %	312792328
132	NC_014721	GATT	2	8	80014	80021	25 %	50 %	25 %	0 %	312792329
133	NC_014721	GTAT	2	8	80185	80192	25 %	50 %	25 %	0 %	312792329
134	NC_014721	GTCA	2	8	80817	80824	25 %	25 %	25 %	25 %	312792330
135	NC_014721	CCTG	2	8	80883	80890	0 %	25 %	25 %	50 %	312792330
136	NC_014721	CAAA	2	8	81040	81047	75 %	0 %	0 %	25 %	312792330
137	NC_014721	ATGC	2	8	81666	81673	25 %	25 %	25 %	25 %	312792330
138	NC_014721	AAGG	2	8	82415	82422	50 %	0 %	50 %	0 %	312792331
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