MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B chromosome

Total Repeats: 31362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014721	ATG	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792284
2	NC_014721	AGG	2	6	107	112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312792284
3	NC_014721	AAC	2	6	390	395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792284
4	NC_014721	TGT	2	6	429	434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792284
5	NC_014721	AAC	3	9	439	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792284
6	NC_014721	ACC	2	6	486	491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792284
7	NC_014721	CGG	2	6	525	530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312792284
8	NC_014721	CAT	2	6	571	576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792284
9	NC_014721	GAC	2	6	715	720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312792284
10	NC_014721	AAG	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792284
11	NC_014721	AAG	2	6	796	801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792284
12	NC_014721	ATA	2	6	802	807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792284
13	NC_014721	TCA	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792284
14	NC_014721	CCA	2	6	823	828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792284
15	NC_014721	AGA	2	6	846	851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792284
16	NC_014721	ACC	2	6	897	902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792284
17	NC_014721	CAA	2	6	1032	1037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792284
18	NC_014721	AAG	2	6	1212	1217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792284
19	NC_014721	AAT	2	6	1427	1432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792284
20	NC_014721	TGT	2	6	1659	1664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792285
21	NC_014721	CTG	2	6	1706	1711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312792285
22	NC_014721	CAA	2	6	1718	1723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792285
23	NC_014721	ACA	2	6	1780	1785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792285
24	NC_014721	AGA	2	6	1917	1922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792285
25	NC_014721	AAG	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792285
26	NC_014721	AGA	2	6	1946	1951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792285
27	NC_014721	TTG	2	6	2030	2035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792285
28	NC_014721	TTG	2	6	2045	2050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792285
29	NC_014721	AGA	3	9	2127	2135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792285
30	NC_014721	TTG	2	6	2150	2155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792285
31	NC_014721	CAA	2	6	2333	2338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792285
32	NC_014721	GAT	2	6	2517	2522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792285
33	NC_014721	GAC	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312792285
34	NC_014721	TTC	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792285
35	NC_014721	CTA	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792286
36	NC_014721	AAG	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792286
37	NC_014721	CTT	2	6	3251	3256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792286
38	NC_014721	ATA	2	6	3296	3301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792286
39	NC_014721	AGG	2	6	3357	3362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312792286
40	NC_014721	AGA	2	6	3390	3395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792286
41	NC_014721	ACA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792286
42	NC_014721	GAC	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312792286
43	NC_014721	AGA	2	6	3763	3768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792286
44	NC_014721	CTT	2	6	3919	3924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792287
45	NC_014721	GTT	3	9	4003	4011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792287
46	NC_014721	ATG	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792287
47	NC_014721	TAA	2	6	4037	4042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792287
48	NC_014721	ATA	2	6	4072	4077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792287
49	NC_014721	CAC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792288
50	NC_014721	TTC	2	6	4498	4503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792288
51	NC_014721	GGT	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312792288
52	NC_014721	TGT	2	6	4571	4576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792288
53	NC_014721	TGA	2	6	4823	4828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792288
54	NC_014721	ATG	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792288
55	NC_014721	ACA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792288
56	NC_014721	CAA	2	6	5032	5037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792288
57	NC_014721	GGT	2	6	5043	5048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312792288
58	NC_014721	CTG	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312792288
59	NC_014721	CTT	2	6	5136	5141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792288
60	NC_014721	AGA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
61	NC_014721	GGC	2	6	5339	5344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312792288
62	NC_014721	CTG	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312792288
63	NC_014721	AAG	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
64	NC_014721	CTT	3	9	5733	5741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792288
65	NC_014721	CCA	2	6	5802	5807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792288
66	NC_014721	ACC	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792288
67	NC_014721	AAG	2	6	5966	5971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
68	NC_014721	TTC	2	6	5974	5979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792288
69	NC_014721	AGA	2	6	6011	6016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
70	NC_014721	AAG	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
71	NC_014721	AGA	2	6	6070	6075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
72	NC_014721	GAA	2	6	6149	6154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792289
73	NC_014721	ATT	2	6	6242	6247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312792289
74	NC_014721	GAA	2	6	6262	6267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792289
75	NC_014721	AGA	2	6	6483	6488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
76	NC_014721	TGC	2	6	6593	6598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312792290
77	NC_014721	TTG	2	6	6652	6657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792290
78	NC_014721	CTG	2	6	6697	6702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312792290
79	NC_014721	CAA	2	6	6883	6888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792290
80	NC_014721	TGA	2	6	6962	6967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792290
81	NC_014721	ATC	2	6	7014	7019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792290
82	NC_014721	GAC	2	6	7082	7087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312792290
83	NC_014721	AAT	2	6	7118	7123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792290
84	NC_014721	CAA	2	6	7148	7153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792290
85	NC_014721	TTG	2	6	7354	7359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792290
86	NC_014721	AGA	2	6	7434	7439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
87	NC_014721	AGA	2	6	7463	7468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
88	NC_014721	TCA	2	6	7539	7544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792290
89	NC_014721	GAT	2	6	7691	7696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792290
90	NC_014721	AAG	2	6	7790	7795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
91	NC_014721	GAA	2	6	7833	7838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
92	NC_014721	GTG	2	6	7930	7935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312792290
93	NC_014721	TTG	2	6	7975	7980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792290
94	NC_014721	CAA	2	6	7996	8001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792290
95	NC_014721	CAC	2	6	8004	8009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792290
96	NC_014721	AAG	2	6	8167	8172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
97	NC_014721	ATG	2	6	8181	8186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792290
98	NC_014721	AAG	2	6	8208	8213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
99	NC_014721	GAT	3	9	8274	8282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792290
100	NC_014721	TTG	2	6	8287	8292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792290
101	NC_014721	ATG	2	6	8368	8373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792290
102	NC_014721	AGA	2	6	8420	8425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
103	NC_014721	TTG	2	6	8437	8442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792290
104	NC_014721	TCT	2	6	8471	8476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792290
105	NC_014721	AAG	2	6	8504	8509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
106	NC_014721	TTG	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792290
107	NC_014721	GAT	3	9	8613	8621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792290
108	NC_014721	GAA	2	6	8689	8694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
109	NC_014721	GAG	2	6	8769	8774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312792290
110	NC_014721	TGA	2	6	10954	10959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792291
111	NC_014721	ATA	2	6	10965	10970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792291
112	NC_014721	ATT	2	6	11007	11012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312792291
113	NC_014721	GTG	2	6	11021	11026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312792291
114	NC_014721	AGG	2	6	11054	11059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312792291
115	NC_014721	TTA	2	6	11101	11106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312792291
116	NC_014721	TCA	2	6	11167	11172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792291
117	NC_014721	ATT	2	6	11199	11204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312792291
118	NC_014721	GTA	2	6	11308	11313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792291
119	NC_014721	TAA	2	6	11386	11391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792291
120	NC_014721	GAA	2	6	11451	11456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792292
121	NC_014721	TTA	2	6	11591	11596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312792292
122	NC_014721	GGA	2	6	11643	11648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312792292
123	NC_014721	TAA	2	6	11751	11756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792292
124	NC_014721	CTT	2	6	11852	11857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792292
125	NC_014721	AAG	2	6	11873	11878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792292
126	NC_014721	GTT	2	6	12013	12018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792292
127	NC_014721	TTG	3	9	12116	12124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792292
128	NC_014721	AAG	2	6	12194	12199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792292
129	NC_014721	AAG	2	6	12201	12206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792292
130	NC_014721	TAA	2	6	12420	12425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792292
131	NC_014721	ATG	2	6	12563	12568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792292
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