MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 56933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_014720	TTA	2	6	140789	140794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621220
3003	NC_014720	ATA	2	6	140810	140815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621220
3004	NC_014720	TTA	2	6	140831	140836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621220
3005	NC_014720	TTG	2	6	140876	140881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621220
3006	NC_014720	GCA	2	6	140902	140907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621220
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3008	NC_014720	CAG	2	6	140948	140953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621220
3009	NC_014720	GCA	2	6	140959	140964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621220
3010	NC_014720	TG	3	6	141013	141018	0 %	50 %	50 %	0 %	312621220
3011	NC_014720	AGA	2	6	141045	141050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621220
3012	NC_014720	T	6	6	141060	141065	0 %	100 %	0 %	0 %	312621220
3013	NC_014720	AACA	2	8	141105	141112	75 %	0 %	0 %	25 %	312621220
3014	NC_014720	TAAAT	2	10	141147	141156	60 %	40 %	0 %	0 %	312621220
3015	NC_014720	AGA	2	6	141171	141176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621220
3016	NC_014720	AGT	2	6	141210	141215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621220
3017	NC_014720	AGA	2	6	141246	141251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621220
3018	NC_014720	TAT	2	6	141288	141293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621220
3019	NC_014720	AGA	2	6	141294	141299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621220
3020	NC_014720	AGG	2	6	141311	141316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621220
3021	NC_014720	ATTA	2	8	141318	141325	50 %	50 %	0 %	0 %	312621220
3022	NC_014720	AT	3	6	141348	141353	50 %	50 %	0 %	0 %	312621220
3023	NC_014720	GATA	2	8	141489	141496	50 %	25 %	25 %	0 %	312621220
3024	NC_014720	TGA	2	6	141528	141533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621220
3025	NC_014720	ATA	2	6	141545	141550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621220
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3029	NC_014720	TTTG	2	8	141678	141685	0 %	75 %	25 %	0 %	312621220
3030	NC_014720	T	6	6	141704	141709	0 %	100 %	0 %	0 %	312621220
3031	NC_014720	TAAG	2	8	141761	141768	50 %	25 %	25 %	0 %	312621220
3032	NC_014720	AG	3	6	141785	141790	50 %	0 %	50 %	0 %	312621220
3033	NC_014720	A	6	6	141877	141882	100 %	0 %	0 %	0 %	312621221
3034	NC_014720	GTA	2	6	141883	141888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621221
3035	NC_014720	TGA	3	9	141894	141902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621221
3036	NC_014720	A	6	6	141943	141948	100 %	0 %	0 %	0 %	312621221
3037	NC_014720	ATT	2	6	142024	142029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621221
3038	NC_014720	GAT	2	6	142068	142073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621221
3039	NC_014720	A	8	8	142087	142094	100 %	0 %	0 %	0 %	312621221
3040	NC_014720	AAG	2	6	142148	142153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621221
3041	NC_014720	AAG	2	6	142223	142228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621221
3042	NC_014720	GAG	2	6	142234	142239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621221
3043	NC_014720	A	6	6	142250	142255	100 %	0 %	0 %	0 %	312621221
3044	NC_014720	TGA	2	6	142260	142265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621221
3045	NC_014720	AAG	2	6	142268	142273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621221
3046	NC_014720	GT	3	6	142284	142289	0 %	50 %	50 %	0 %	312621221
3047	NC_014720	TTA	2	6	142298	142303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621221
3048	NC_014720	A	7	7	142310	142316	100 %	0 %	0 %	0 %	312621221
3049	NC_014720	GAA	3	9	142321	142329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621221
3050	NC_014720	AGCA	2	8	142347	142354	50 %	0 %	25 %	25 %	312621221
3051	NC_014720	TAC	2	6	142381	142386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621221
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3054	NC_014720	TTAA	2	8	142486	142493	50 %	50 %	0 %	0 %	312621221
3055	NC_014720	TAT	2	6	142494	142499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621221
3056	NC_014720	AGCA	2	8	142508	142515	50 %	0 %	25 %	25 %	312621221
3057	NC_014720	AAG	2	6	142606	142611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621221
3058	NC_014720	AAAT	2	8	142641	142648	75 %	25 %	0 %	0 %	312621221
3059	NC_014720	TATT	2	8	142733	142740	25 %	75 %	0 %	0 %	312621222
3060	NC_014720	CAAA	2	8	142760	142767	75 %	0 %	0 %	25 %	312621222
3061	NC_014720	CTA	3	9	142846	142854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621222
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3063	NC_014720	CTTTTA	2	12	142895	142906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312621222
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3071	NC_014720	AT	3	6	143122	143127	50 %	50 %	0 %	0 %	312621222
3072	NC_014720	ATC	2	6	143206	143211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621222
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3075	NC_014720	TAAT	2	8	143477	143484	50 %	50 %	0 %	0 %	312621222
3076	NC_014720	TGAT	2	8	143485	143492	25 %	50 %	25 %	0 %	312621222
3077	NC_014720	AGAT	2	8	143509	143516	50 %	25 %	25 %	0 %	312621222
3078	NC_014720	TAAT	2	8	143518	143525	50 %	50 %	0 %	0 %	312621222
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3088	NC_014720	ATAA	2	8	143766	143773	75 %	25 %	0 %	0 %	312621222
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3095	NC_014720	T	7	7	143978	143984	0 %	100 %	0 %	0 %	312621222
3096	NC_014720	T	6	6	144138	144143	0 %	100 %	0 %	0 %	312621222
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3102	NC_014720	TA	3	6	144351	144356	50 %	50 %	0 %	0 %	312621222
3103	NC_014720	AAG	2	6	144399	144404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621222
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3108	NC_014720	ACC	2	6	144705	144710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312621223
3109	NC_014720	T	6	6	144809	144814	0 %	100 %	0 %	0 %	312621223
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3119	NC_014720	CAAG	2	8	145106	145113	50 %	0 %	25 %	25 %	312621223
3120	NC_014720	TGT	2	6	145116	145121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621223
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3123	NC_014720	CAA	2	6	145286	145291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621223
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3125	NC_014720	TAAT	2	8	145397	145404	50 %	50 %	0 %	0 %	312621223
3126	NC_014720	AAG	2	6	145446	145451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621223
3127	NC_014720	T	6	6	145468	145473	0 %	100 %	0 %	0 %	312621223
3128	NC_014720	ATCA	2	8	145485	145492	50 %	25 %	0 %	25 %	312621223
3129	NC_014720	TA	3	6	145509	145514	50 %	50 %	0 %	0 %	312621223
3130	NC_014720	ATC	2	6	145515	145520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621223
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3133	NC_014720	CTTC	2	8	145648	145655	0 %	50 %	0 %	50 %	312621223
3134	NC_014720	TAA	2	6	145778	145783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621223
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3140	NC_014720	ATC	2	6	145953	145958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621223
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3142	NC_014720	TAC	2	6	146052	146057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621224
3143	NC_014720	TAC	2	6	146072	146077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621224
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3146	NC_014720	ATC	2	6	146206	146211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621224
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3163	NC_014720	T	6	6	147207	147212	0 %	100 %	0 %	0 %	312621224
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3246	NC_014720	AAGG	2	8	151269	151276	50 %	0 %	50 %	0 %	312621226
3247	NC_014720	TTG	2	6	151288	151293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621226
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3249	NC_014720	GAT	2	6	151320	151325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621226
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3251	NC_014720	A	6	6	151378	151383	100 %	0 %	0 %	0 %	312621227
3252	NC_014720	TCA	2	6	151419	151424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621227
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3492	NC_014720	ATT	2	6	161105	161110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621233
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3494	NC_014720	TTCC	2	8	161183	161190	0 %	50 %	0 %	50 %	312621233
3495	NC_014720	ATG	2	6	161216	161221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621233
3496	NC_014720	AAGT	2	8	161256	161263	50 %	25 %	25 %	0 %	312621233
3497	NC_014720	AAT	2	6	161296	161301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621233
3498	NC_014720	ACAGA	2	10	161321	161330	60 %	0 %	20 %	20 %	312621233
3499	NC_014720	TA	3	6	161338	161343	50 %	50 %	0 %	0 %	312621233
3500	NC_014720	AAT	2	6	161356	161361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621233

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