MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 48524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014657	AACAG	2	10	24108	24117	60 %	0 %	20 %	20 %	312134102
502	NC_014657	GTT	2	6	24128	24133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134102
503	NC_014657	T	6	6	24183	24188	0 %	100 %	0 %	0 %	312134102
504	NC_014657	GAA	2	6	24205	24210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134102
505	NC_014657	AAT	2	6	24246	24251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134102
506	NC_014657	TAA	2	6	24277	24282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134102
507	NC_014657	GAA	2	6	24430	24435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134102
508	NC_014657	AT	3	6	24455	24460	50 %	50 %	0 %	0 %	312134102
509	NC_014657	TGT	2	6	24731	24736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134102
510	NC_014657	CTT	2	6	24762	24767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134102
511	NC_014657	TCT	2	6	24780	24785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134102
512	NC_014657	AGA	2	6	24827	24832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134102
513	NC_014657	TA	3	6	24846	24851	50 %	50 %	0 %	0 %	312134102
514	NC_014657	TG	3	6	24884	24889	0 %	50 %	50 %	0 %	312134102
515	NC_014657	A	7	7	24941	24947	100 %	0 %	0 %	0 %	312134102
516	NC_014657	TCT	2	6	25004	25009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134102
517	NC_014657	A	7	7	25065	25071	100 %	0 %	0 %	0 %	312134102
518	NC_014657	GTA	2	6	25188	25193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134102
519	NC_014657	TGC	2	6	25324	25329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134102
520	NC_014657	CTT	2	6	25366	25371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134102
521	NC_014657	AGGAC	2	10	25423	25432	40 %	0 %	40 %	20 %	312134102
522	NC_014657	TG	3	6	25434	25439	0 %	50 %	50 %	0 %	312134102
523	NC_014657	CAA	2	6	25459	25464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134102
524	NC_014657	ATC	2	6	25522	25527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134102
525	NC_014657	AGA	2	6	25540	25545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134102
526	NC_014657	TATT	2	8	25550	25557	25 %	75 %	0 %	0 %	312134102
527	NC_014657	A	7	7	25600	25606	100 %	0 %	0 %	0 %	312134102
528	NC_014657	ATTTT	2	10	25853	25862	20 %	80 %	0 %	0 %	312134103
529	NC_014657	GCA	2	6	25896	25901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134103
530	NC_014657	TAC	2	6	25904	25909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134103
531	NC_014657	AG	3	6	25952	25957	50 %	0 %	50 %	0 %	312134103
532	NC_014657	CTTTT	2	10	25970	25979	0 %	80 %	0 %	20 %	312134103
533	NC_014657	GCA	2	6	26034	26039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134103
534	NC_014657	ATT	2	6	26190	26195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134103
535	NC_014657	ATAAA	2	10	26196	26205	80 %	20 %	0 %	0 %	312134103
536	NC_014657	AGA	2	6	26238	26243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134103
537	NC_014657	TAT	2	6	26264	26269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134103
538	NC_014657	AAC	2	6	26277	26282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134103
539	NC_014657	ATTG	2	8	26293	26300	25 %	50 %	25 %	0 %	312134103
540	NC_014657	AAAT	2	8	26325	26332	75 %	25 %	0 %	0 %	312134103
541	NC_014657	A	6	6	26373	26378	100 %	0 %	0 %	0 %	312134103
542	NC_014657	TTG	2	6	26794	26799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134104
543	NC_014657	AGGA	2	8	26803	26810	50 %	0 %	50 %	0 %	312134104
544	NC_014657	TAAAA	2	10	26831	26840	80 %	20 %	0 %	0 %	312134104
545	NC_014657	GAG	2	6	26881	26886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134104
546	NC_014657	GCA	2	6	26955	26960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134104
547	NC_014657	GGC	2	6	27009	27014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312134104
548	NC_014657	A	7	7	27260	27266	100 %	0 %	0 %	0 %	312134105
549	NC_014657	GA	3	6	27270	27275	50 %	0 %	50 %	0 %	312134105
550	NC_014657	GTGAAA	2	12	27307	27318	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312134105
551	NC_014657	TG	3	6	27378	27383	0 %	50 %	50 %	0 %	312134105
552	NC_014657	TGA	2	6	27391	27396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134105
553	NC_014657	TAT	2	6	27402	27407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134105
554	NC_014657	AT	3	6	27480	27485	50 %	50 %	0 %	0 %	312134105
555	NC_014657	AGG	2	6	27499	27504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134105
556	NC_014657	T	6	6	27506	27511	0 %	100 %	0 %	0 %	312134105
557	NC_014657	CTT	2	6	27540	27545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134105
558	NC_014657	AT	3	6	27557	27562	50 %	50 %	0 %	0 %	312134105
559	NC_014657	T	6	6	27573	27578	0 %	100 %	0 %	0 %	312134105
560	NC_014657	GCA	2	6	27579	27584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134105
561	NC_014657	T	6	6	27609	27614	0 %	100 %	0 %	0 %	312134105
562	NC_014657	T	6	6	27637	27642	0 %	100 %	0 %	0 %	312134105
563	NC_014657	AGGCA	2	10	27665	27674	40 %	0 %	40 %	20 %	312134105
564	NC_014657	TC	3	6	27704	27709	0 %	50 %	0 %	50 %	312134105
565	NC_014657	AGC	2	6	27740	27745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134105
566	NC_014657	TGGCA	2	10	27779	27788	20 %	20 %	40 %	20 %	312134105
567	NC_014657	TTGGG	2	10	27800	27809	0 %	40 %	60 %	0 %	312134105
568	NC_014657	GCT	2	6	27911	27916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134105
569	NC_014657	AT	3	6	27986	27991	50 %	50 %	0 %	0 %	312134105
570	NC_014657	CTTG	2	8	27998	28005	0 %	50 %	25 %	25 %	312134105
571	NC_014657	A	6	6	28039	28044	100 %	0 %	0 %	0 %	312134105
572	NC_014657	TTG	2	6	28072	28077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134105
573	NC_014657	T	6	6	28094	28099	0 %	100 %	0 %	0 %	312134105
574	NC_014657	GA	3	6	28209	28214	50 %	0 %	50 %	0 %	312134105
575	NC_014657	CAA	2	6	28232	28237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134105
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578	NC_014657	A	6	6	28333	28338	100 %	0 %	0 %	0 %	312134105
579	NC_014657	GAAA	3	12	28361	28372	75 %	0 %	25 %	0 %	312134105
580	NC_014657	TGG	2	6	28442	28447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134105
581	NC_014657	TTAT	2	8	28484	28491	25 %	75 %	0 %	0 %	312134105
582	NC_014657	ACT	2	6	28513	28518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134105
583	NC_014657	CTT	2	6	28530	28535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134105
584	NC_014657	TTG	2	6	28546	28551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134105
585	NC_014657	TAC	2	6	28561	28566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134105
586	NC_014657	ATT	3	9	28635	28643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134105
587	NC_014657	TCGC	2	8	28704	28711	0 %	25 %	25 %	50 %	312134105
588	NC_014657	TTC	2	6	28771	28776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134105
589	NC_014657	CAG	2	6	28914	28919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134105
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591	NC_014657	TCT	2	6	29144	29149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134105
592	NC_014657	ATAG	2	8	29163	29170	50 %	25 %	25 %	0 %	312134105
593	NC_014657	AGA	2	6	29186	29191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134105
594	NC_014657	ATT	2	6	29263	29268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134105
595	NC_014657	TAT	2	6	29304	29309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134105
596	NC_014657	GAG	2	6	29331	29336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134105
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598	NC_014657	AG	3	6	29360	29365	50 %	0 %	50 %	0 %	312134105
599	NC_014657	TAA	2	6	29377	29382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134105
600	NC_014657	TAAT	2	8	29519	29526	50 %	50 %	0 %	0 %	312134106
601	NC_014657	A	7	7	29562	29568	100 %	0 %	0 %	0 %	312134106
602	NC_014657	TTA	2	6	29598	29603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134106
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604	NC_014657	CTT	2	6	29639	29644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134106
605	NC_014657	AT	3	6	29664	29669	50 %	50 %	0 %	0 %	312134106
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608	NC_014657	AAAAG	2	10	29785	29794	80 %	0 %	20 %	0 %	312134106
609	NC_014657	TCA	2	6	29819	29824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134106
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611	NC_014657	TA	3	6	29855	29860	50 %	50 %	0 %	0 %	312134106
612	NC_014657	TAT	2	6	29915	29920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134106
613	NC_014657	TAT	2	6	29936	29941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134106
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615	NC_014657	AGA	2	6	30018	30023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134106
616	NC_014657	AT	3	6	30032	30037	50 %	50 %	0 %	0 %	312134106
617	NC_014657	GA	3	6	30070	30075	50 %	0 %	50 %	0 %	312134106
618	NC_014657	GAA	2	6	30077	30082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134106
619	NC_014657	GAT	2	6	30239	30244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134106
620	NC_014657	TTAGA	2	10	30264	30273	40 %	40 %	20 %	0 %	312134106
621	NC_014657	TGA	2	6	30280	30285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134106
622	NC_014657	T	6	6	30298	30303	0 %	100 %	0 %	0 %	312134106
623	NC_014657	T	6	6	30322	30327	0 %	100 %	0 %	0 %	312134106
624	NC_014657	TCCT	2	8	30331	30338	0 %	50 %	0 %	50 %	312134106
625	NC_014657	CTG	2	6	30465	30470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134106
626	NC_014657	GGT	2	6	30487	30492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134106
627	NC_014657	TTA	2	6	30528	30533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134106
628	NC_014657	AT	3	6	30538	30543	50 %	50 %	0 %	0 %	312134106
629	NC_014657	GCA	2	6	30708	30713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134107
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