MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 32505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014652	ATG	2	6	121	126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126263
2	NC_014652	AGG	2	6	151	156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126263
3	NC_014652	TGA	2	6	236	241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126263
4	NC_014652	TTC	2	6	367	372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126263
5	NC_014652	AGA	2	6	374	379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126263
6	NC_014652	TGT	2	6	473	478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126263
7	NC_014652	AAC	3	9	483	491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126263
8	NC_014652	ACC	2	6	530	535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126263
9	NC_014652	CAT	2	6	615	620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126263
10	NC_014652	GAC	2	6	759	764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126263
11	NC_014652	AAG	2	6	796	801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126263
12	NC_014652	AAG	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126263
13	NC_014652	ATA	2	6	846	851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126263
14	NC_014652	TCA	2	6	855	860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126263
15	NC_014652	CCA	2	6	867	872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126263
16	NC_014652	AGA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126263
17	NC_014652	GCC	2	6	941	946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312126263
18	NC_014652	CAA	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126263
19	NC_014652	AAG	2	6	1256	1261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126263
20	NC_014652	ACA	2	6	1368	1373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126263
21	NC_014652	AAT	2	6	1471	1476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126263
22	NC_014652	TGT	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126264
23	NC_014652	AAG	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126264
24	NC_014652	ATA	2	6	1727	1732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126264
25	NC_014652	CTG	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126264
26	NC_014652	CAA	2	6	1760	1765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126264
27	NC_014652	AAG	2	6	1980	1985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126264
28	NC_014652	AGA	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126264
29	NC_014652	TTG	2	6	2072	2077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126264
30	NC_014652	TTG	2	6	2087	2092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126264
31	NC_014652	AGA	3	9	2169	2177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126264
32	NC_014652	TTG	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126264
33	NC_014652	CAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126264
34	NC_014652	GAT	2	6	2559	2564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126264
35	NC_014652	GAC	2	6	2749	2754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126264
36	NC_014652	TTC	2	6	2774	2779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126264
37	NC_014652	TAA	2	6	2914	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126265
38	NC_014652	AAT	2	6	3103	3108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126265
39	NC_014652	AAG	2	6	3119	3124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126265
40	NC_014652	ACA	2	6	3182	3187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126265
41	NC_014652	ATA	2	6	3338	3343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126265
42	NC_014652	AGG	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126265
43	NC_014652	AGA	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126265
44	NC_014652	ACA	2	6	3569	3574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126265
45	NC_014652	CTT	2	6	3689	3694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126265
46	NC_014652	AGA	2	6	3752	3757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126265
47	NC_014652	AGA	2	6	3805	3810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126265
48	NC_014652	CTT	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126266
49	NC_014652	TTG	2	6	4043	4048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126266
50	NC_014652	ATG	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126266
51	NC_014652	TAA	2	6	4076	4081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126266
52	NC_014652	GAA	2	6	4097	4102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126266
53	NC_014652	AAT	2	6	4110	4115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126266
54	NC_014652	CAC	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126267
55	NC_014652	GTG	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126267
56	NC_014652	TTC	2	6	4538	4543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126267
57	NC_014652	TGG	2	6	4584	4589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126267
58	NC_014652	TGT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126267
59	NC_014652	TAC	2	6	4722	4727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126267
60	NC_014652	CGA	2	6	4761	4766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126267
61	NC_014652	TGA	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126267
62	NC_014652	TGG	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126267
63	NC_014652	ACA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126267
64	NC_014652	CTG	2	6	5111	5116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126267
65	NC_014652	CTT	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126267
66	NC_014652	AGC	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126267
67	NC_014652	AGA	2	6	5331	5336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126267
68	NC_014652	GGC	2	6	5379	5384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312126267
69	NC_014652	CTT	2	6	5650	5655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126267
70	NC_014652	CTT	3	9	5773	5781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126267
71	NC_014652	AAG	2	6	6006	6011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126267
72	NC_014652	CTT	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126267
73	NC_014652	AAG	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126267
74	NC_014652	AGA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126267
75	NC_014652	GAA	2	6	6189	6194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126268
76	NC_014652	AGA	2	6	6275	6280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126268
77	NC_014652	AAT	2	6	6281	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126268
78	NC_014652	GAA	2	6	6300	6305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126268
79	NC_014652	AGC	2	6	6983	6988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126269
80	NC_014652	GTC	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126269
81	NC_014652	ACA	2	6	7050	7055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126269
82	NC_014652	GAT	2	6	7133	7138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126269
83	NC_014652	TGG	2	6	7210	7215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126269
84	NC_014652	AAG	2	6	7334	7339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126269
85	NC_014652	CGA	2	6	7422	7427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126269
86	NC_014652	AGC	2	6	7493	7498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126269
87	NC_014652	GTA	2	6	7541	7546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126269
88	NC_014652	AGA	2	6	7835	7840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126269
89	NC_014652	CTT	2	6	8093	8098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126269
90	NC_014652	TGA	2	6	8107	8112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126269
91	NC_014652	GGT	2	6	8320	8325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126269
92	NC_014652	GGA	2	6	8573	8578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126270
93	NC_014652	AGA	2	6	8706	8711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
94	NC_014652	TGC	2	6	8816	8821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126270
95	NC_014652	TTG	2	6	8875	8880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126270
96	NC_014652	CTG	2	6	8920	8925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126270
97	NC_014652	CAA	2	6	9106	9111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126270
98	NC_014652	AAT	2	6	9200	9205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126270
99	NC_014652	CAA	2	6	9307	9312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126270
100	NC_014652	GTT	2	6	9345	9350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126270
101	NC_014652	AAG	2	6	9460	9465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
102	NC_014652	AAT	2	6	9560	9565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126270
103	NC_014652	TTG	2	6	9577	9582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126270
104	NC_014652	AGA	2	6	9657	9662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
105	NC_014652	AGA	2	6	9686	9691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
106	NC_014652	TCA	2	6	9762	9767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126270
107	NC_014652	GAA	2	6	9888	9893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
108	NC_014652	GAT	2	6	9914	9919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126270
109	NC_014652	AAG	2	6	10013	10018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
110	NC_014652	GAA	2	6	10056	10061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
111	NC_014652	CAA	2	6	10180	10185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126270
112	NC_014652	AGA	2	6	10202	10207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
113	NC_014652	CAA	2	6	10219	10224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126270
114	NC_014652	CAC	2	6	10227	10232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126270
115	NC_014652	AAG	2	6	10390	10395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
116	NC_014652	ATG	2	6	10404	10409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126270
117	NC_014652	AAG	2	6	10431	10436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
118	NC_014652	ACA	2	6	10461	10466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126270
119	NC_014652	GAT	3	9	10497	10505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126270
120	NC_014652	TTG	2	6	10510	10515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126270
121	NC_014652	AAG	2	6	10598	10603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
122	NC_014652	TTG	2	6	10660	10665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126270
123	NC_014652	TCT	2	6	10694	10699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126270
124	NC_014652	AAG	2	6	10727	10732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
125	NC_014652	GCG	2	6	10762	10767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312126270
126	NC_014652	TTG	2	6	10813	10818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126270
127	NC_014652	GAT	3	9	10836	10844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126270
128	NC_014652	GAA	2	6	10912	10917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126270
129	NC_014652	ATA	2	6	10954	10959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126270
130	NC_014652	TGG	2	6	11322	11327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126271
131	NC_014652	AGA	2	6	11737	11742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126271
132	NC_014652	TAT	2	6	11809	11814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126271
133	NC_014652	AAG	2	6	11938	11943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126271
134	NC_014652	TTG	2	6	12168	12173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126271
135	NC_014652	TGG	2	6	12223	12228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126271
136	NC_014652	AGA	2	6	12310	12315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126271
137	NC_014652	GCA	2	6	12398	12403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126271
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139	NC_014652	GAA	2	6	12500	12505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126271
140	NC_014652	ATT	2	6	12513	12518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126271
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151	NC_014652	CTT	2	6	13747	13752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126272
152	NC_014652	CTT	3	9	13804	13812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126272
153	NC_014652	GCG	2	6	13909	13914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312126272
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156	NC_014652	CTA	2	6	14050	14055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126272
157	NC_014652	TAT	2	6	14144	14149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126272
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161	NC_014652	TGA	2	6	14590	14595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126273
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163	NC_014652	TAG	2	6	14892	14897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126273
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253	NC_014652	TGT	2	6	23449	23454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126280
254	NC_014652	ATC	2	6	23490	23495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126280
255	NC_014652	TGA	2	6	23536	23541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126280
256	NC_014652	TGG	2	6	23638	23643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126280
257	NC_014652	CAA	2	6	23693	23698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126280
258	NC_014652	AAC	2	6	23777	23782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126280
259	NC_014652	TCA	2	6	23923	23928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126280
260	NC_014652	AAG	2	6	23950	23955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126280
261	NC_014652	AGA	2	6	23959	23964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126280
262	NC_014652	GCA	2	6	24075	24080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126280
263	NC_014652	GTA	2	6	24158	24163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126280
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272	NC_014652	TGA	2	6	25209	25214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126281
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280	NC_014652	GCA	2	6	26086	26091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126283
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285	NC_014652	CAA	2	6	26466	26471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126283
286	NC_014652	TGA	2	6	26539	26544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126283
287	NC_014652	CAA	2	6	26757	26762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126283
288	NC_014652	CAT	2	6	26799	26804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126283
289	NC_014652	TGG	2	6	26818	26823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126283
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303	NC_014652	TAT	2	6	27870	27875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126284
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377	NC_014652	GAA	2	6	35299	35304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126289
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