MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 55074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014652	TA	3	6	171736	171741	50 %	50 %	0 %	0 %	312126389
3502	NC_014652	AAAAG	2	10	171742	171751	80 %	0 %	20 %	0 %	312126389
3503	NC_014652	ATTT	2	8	171766	171773	25 %	75 %	0 %	0 %	312126389
3504	NC_014652	AG	3	6	171794	171799	50 %	0 %	50 %	0 %	312126389
3505	NC_014652	TCT	2	6	171802	171807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126389
3506	NC_014652	GGA	2	6	171867	171872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126389
3507	NC_014652	T	7	7	171895	171901	0 %	100 %	0 %	0 %	312126389
3508	NC_014652	A	6	6	171969	171974	100 %	0 %	0 %	0 %	312126389
3509	NC_014652	AAG	2	6	172101	172106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126389
3510	NC_014652	TTTG	2	8	172176	172183	0 %	75 %	25 %	0 %	312126389
3511	NC_014652	CAAA	2	8	172192	172199	75 %	0 %	0 %	25 %	312126389
3512	NC_014652	GA	3	6	172213	172218	50 %	0 %	50 %	0 %	312126389
3513	NC_014652	AAG	3	9	172233	172241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126389
3514	NC_014652	T	6	6	172264	172269	0 %	100 %	0 %	0 %	312126389
3515	NC_014652	TGA	2	6	172281	172286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126389
3516	NC_014652	A	6	6	172308	172313	100 %	0 %	0 %	0 %	312126389
3517	NC_014652	TA	3	6	172373	172378	50 %	50 %	0 %	0 %	312126389
3518	NC_014652	ACAT	2	8	172423	172430	50 %	25 %	0 %	25 %	312126389
3519	NC_014652	ATG	2	6	172519	172524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126389
3520	NC_014652	TTGA	2	8	172628	172635	25 %	50 %	25 %	0 %	312126390
3521	NC_014652	GGT	2	6	172697	172702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126390
3522	NC_014652	AGA	2	6	172772	172777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126390
3523	NC_014652	GA	3	6	172776	172781	50 %	0 %	50 %	0 %	312126390
3524	NC_014652	GCA	2	6	172800	172805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126390
3525	NC_014652	TGT	2	6	172813	172818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126390
3526	NC_014652	AAGA	2	8	172847	172854	75 %	0 %	25 %	0 %	312126390
3527	NC_014652	CATC	2	8	173047	173054	25 %	25 %	0 %	50 %	312126390
3528	NC_014652	AGG	2	6	173147	173152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126390
3529	NC_014652	AGA	2	6	173182	173187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126390
3530	NC_014652	GTTT	2	8	173191	173198	0 %	75 %	25 %	0 %	312126390
3531	NC_014652	ATT	2	6	173234	173239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126390
3532	NC_014652	ATCA	2	8	173337	173344	50 %	25 %	0 %	25 %	312126390
3533	NC_014652	AAACA	2	10	173552	173561	80 %	0 %	0 %	20 %	312126391
3534	NC_014652	AGA	2	6	173581	173586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126391
3535	NC_014652	AAT	2	6	173683	173688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126391
3536	NC_014652	GAT	2	6	173740	173745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126391
3537	NC_014652	TCT	2	6	173777	173782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126391
3538	NC_014652	GCA	3	9	173788	173796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126391
3539	NC_014652	GGC	2	6	173821	173826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312126391
3540	NC_014652	ATA	2	6	173830	173835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126391
3541	NC_014652	CTTT	2	8	173851	173858	0 %	75 %	0 %	25 %	312126391
3542	NC_014652	CAT	2	6	173879	173884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126391
3543	NC_014652	GCAA	2	8	173890	173897	50 %	0 %	25 %	25 %	312126391
3544	NC_014652	TCAATG	2	12	173954	173965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312126391
3545	NC_014652	ATA	2	6	173993	173998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126391
3546	NC_014652	CAG	2	6	174053	174058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126391
3547	NC_014652	AGA	2	6	174075	174080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126391
3548	NC_014652	TGT	2	6	174093	174098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126391
3549	NC_014652	CAT	2	6	174107	174112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126391
3550	NC_014652	GGC	2	6	174154	174159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312126391
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3552	NC_014652	GTGTT	2	10	174498	174507	0 %	60 %	40 %	0 %	312126392
3553	NC_014652	TGA	2	6	174541	174546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126392
3554	NC_014652	TA	3	6	174560	174565	50 %	50 %	0 %	0 %	312126392
3555	NC_014652	TGA	2	6	174589	174594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126392
3556	NC_014652	ACA	2	6	174630	174635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126392
3557	NC_014652	TA	3	6	174672	174677	50 %	50 %	0 %	0 %	312126392
3558	NC_014652	GAA	2	6	174689	174694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126392
3559	NC_014652	GCA	2	6	174707	174712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126392
3560	NC_014652	CTT	2	6	174716	174721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126392
3561	NC_014652	A	7	7	174773	174779	100 %	0 %	0 %	0 %	312126392
3562	NC_014652	GCAG	2	8	174966	174973	25 %	0 %	50 %	25 %	312126392
3563	NC_014652	GCT	2	6	174999	175004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126392
3564	NC_014652	ATCA	2	8	175083	175090	50 %	25 %	0 %	25 %	312126392
3565	NC_014652	GTT	2	6	175175	175180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126392
3566	NC_014652	GCTTCA	2	12	175214	175225	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312126392
3567	NC_014652	AAT	2	6	175315	175320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126392
3568	NC_014652	TTG	2	6	175329	175334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126392
3569	NC_014652	TGG	2	6	175377	175382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126392
3570	NC_014652	TAT	2	6	175424	175429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126392
3571	NC_014652	TAAT	2	8	175514	175521	50 %	50 %	0 %	0 %	312126392
3572	NC_014652	GAG	2	6	175621	175626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126393
3573	NC_014652	CAG	2	6	175661	175666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126393
3574	NC_014652	TA	3	6	175668	175673	50 %	50 %	0 %	0 %	312126393
3575	NC_014652	TA	3	6	175772	175777	50 %	50 %	0 %	0 %	312126393
3576	NC_014652	AT	3	6	175819	175824	50 %	50 %	0 %	0 %	312126393
3577	NC_014652	AGT	2	6	175848	175853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126393
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3579	NC_014652	CAA	2	6	175956	175961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126393
3580	NC_014652	TGA	2	6	176145	176150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126393
3581	NC_014652	TG	3	6	176152	176157	0 %	50 %	50 %	0 %	312126393
3582	NC_014652	CATCAC	2	12	176208	176219	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	312126393
3583	NC_014652	GTT	2	6	176251	176256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126393
3584	NC_014652	TGT	2	6	176289	176294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126393
3585	NC_014652	CAGA	2	8	176321	176328	50 %	0 %	25 %	25 %	312126393
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3587	NC_014652	GGA	2	6	176359	176364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126393
3588	NC_014652	GTT	2	6	176365	176370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126393
3589	NC_014652	TGA	2	6	176396	176401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126393
3590	NC_014652	ATGTG	2	10	176405	176414	20 %	40 %	40 %	0 %	312126393
3591	NC_014652	TAT	2	6	176434	176439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126393
3592	NC_014652	GAAAA	2	10	176456	176465	80 %	0 %	20 %	0 %	312126393
3593	NC_014652	TGA	2	6	176496	176501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126393
3594	NC_014652	AGG	2	6	176518	176523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126393
3595	NC_014652	TA	3	6	176527	176532	50 %	50 %	0 %	0 %	312126393
3596	NC_014652	AG	3	6	176548	176553	50 %	0 %	50 %	0 %	312126393
3597	NC_014652	AGC	3	9	176559	176567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126393
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3599	NC_014652	CTGAGC	2	12	176648	176659	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312126393
3600	NC_014652	ATG	2	6	176668	176673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126393
3601	NC_014652	TGA	2	6	176750	176755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126393
3602	NC_014652	TGC	2	6	176766	176771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126393
3603	NC_014652	CAG	2	6	176828	176833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126393
3604	NC_014652	ATT	2	6	176834	176839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126393
3605	NC_014652	ACAAT	2	10	176858	176867	60 %	20 %	0 %	20 %	312126393
3606	NC_014652	T	6	6	177124	177129	0 %	100 %	0 %	0 %	312126394
3607	NC_014652	GTAT	2	8	177148	177155	25 %	50 %	25 %	0 %	312126394
3608	NC_014652	CCA	2	6	177209	177214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126394
3609	NC_014652	A	7	7	177216	177222	100 %	0 %	0 %	0 %	312126394
3610	NC_014652	TGC	2	6	177354	177359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126394
3611	NC_014652	CTG	2	6	177362	177367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126394
3612	NC_014652	ATA	2	6	177415	177420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126394
3613	NC_014652	GATGG	2	10	177428	177437	20 %	20 %	60 %	0 %	312126394
3614	NC_014652	CAT	2	6	177462	177467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126394
3615	NC_014652	CTT	2	6	177529	177534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126394
3616	NC_014652	TCAAA	2	10	177546	177555	60 %	20 %	0 %	20 %	312126394
3617	NC_014652	TGC	2	6	177783	177788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126394
3618	NC_014652	CTT	2	6	177852	177857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126394
3619	NC_014652	TGG	2	6	177931	177936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126394
3620	NC_014652	TTGA	2	8	177946	177953	25 %	50 %	25 %	0 %	312126394
3621	NC_014652	CAA	2	6	177976	177981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126394
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3623	NC_014652	AAAG	2	8	178065	178072	75 %	0 %	25 %	0 %	312126394
3624	NC_014652	A	6	6	178114	178119	100 %	0 %	0 %	0 %	312126394
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3853	NC_014652	T	6	6	193163	193168	0 %	100 %	0 %	0 %	312126403
3854	NC_014652	TCG	2	6	193201	193206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126403
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3993	NC_014652	TCT	2	6	199806	199811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126409
3994	NC_014652	GGA	2	6	199865	199870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126409
3995	NC_014652	TTTG	2	8	199877	199884	0 %	75 %	25 %	0 %	312126409
3996	NC_014652	T	6	6	199894	199899	0 %	100 %	0 %	0 %	312126409
3997	NC_014652	GT	3	6	199901	199906	0 %	50 %	50 %	0 %	312126409
3998	NC_014652	TCA	2	6	199929	199934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126409
3999	NC_014652	TTA	2	6	199956	199961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126409
4000	NC_014652	TCA	2	6	200004	200009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126409

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