MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 55074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_014652	GCA	2	6	123371	123376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126348
2503	NC_014652	TTG	2	6	123459	123464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126348
2504	NC_014652	GAAA	2	8	123466	123473	75 %	0 %	25 %	0 %	312126348
2505	NC_014652	ATG	2	6	123495	123500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126348
2506	NC_014652	A	6	6	123509	123514	100 %	0 %	0 %	0 %	312126348
2507	NC_014652	AGC	2	6	123544	123549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126348
2508	NC_014652	TTG	2	6	123597	123602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126348
2509	NC_014652	GCA	2	6	123617	123622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126348
2510	NC_014652	AGC	2	6	123646	123651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126348
2511	NC_014652	TAT	2	6	123656	123661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126348
2512	NC_014652	GCA	2	6	123686	123691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126348
2513	NC_014652	AAT	2	6	123745	123750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126348
2514	NC_014652	TGG	2	6	123754	123759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126348
2515	NC_014652	AGAC	2	8	123771	123778	50 %	0 %	25 %	25 %	312126348
2516	NC_014652	GCATG	2	10	123785	123794	20 %	20 %	40 %	20 %	312126348
2517	NC_014652	CTT	3	9	123848	123856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126348
2518	NC_014652	ATG	2	6	123860	123865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126348
2519	NC_014652	CAA	2	6	123870	123875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126348
2520	NC_014652	TTGG	2	8	123888	123895	0 %	50 %	50 %	0 %	312126348
2521	NC_014652	CAG	2	6	123896	123901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126348
2522	NC_014652	TTG	2	6	123906	123911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126348
2523	NC_014652	TTC	2	6	123957	123962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126348
2524	NC_014652	TTG	2	6	124074	124079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126348
2525	NC_014652	AGA	2	6	124117	124122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126348
2526	NC_014652	AGT	2	6	124143	124148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126348
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2529	NC_014652	CTT	2	6	124448	124453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126349
2530	NC_014652	GGA	2	6	124520	124525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126349
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2532	NC_014652	GTT	2	6	124577	124582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126349
2533	NC_014652	CAG	2	6	124673	124678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126349
2534	NC_014652	TAC	2	6	124760	124765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126349
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2538	NC_014652	TTTA	2	8	124929	124936	25 %	75 %	0 %	0 %	312126349
2539	NC_014652	GGT	2	6	124946	124951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126349
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2541	NC_014652	AGT	2	6	125150	125155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126350
2542	NC_014652	CAA	2	6	125158	125163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126350
2543	NC_014652	A	7	7	125162	125168	100 %	0 %	0 %	0 %	312126350
2544	NC_014652	CTT	2	6	125180	125185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126350
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2547	NC_014652	TTG	2	6	125397	125402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126350
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2550	NC_014652	TGA	2	6	125616	125621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126350
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2553	NC_014652	GAAT	2	8	125770	125777	50 %	25 %	25 %	0 %	312126350
2554	NC_014652	TTA	2	6	125778	125783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126350
2555	NC_014652	GCA	2	6	125786	125791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126350
2556	NC_014652	CAGTT	2	10	125871	125880	20 %	40 %	20 %	20 %	312126350
2557	NC_014652	TAG	2	6	125895	125900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126350
2558	NC_014652	TA	3	6	125919	125924	50 %	50 %	0 %	0 %	312126350
2559	NC_014652	GAAC	2	8	125932	125939	50 %	0 %	25 %	25 %	312126350
2560	NC_014652	TGG	2	6	126281	126286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126351
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2562	NC_014652	AAG	2	6	126353	126358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126351
2563	NC_014652	TGA	2	6	126446	126451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126351
2564	NC_014652	TGG	2	6	126614	126619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126351
2565	NC_014652	A	7	7	126639	126645	100 %	0 %	0 %	0 %	312126351
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2568	NC_014652	GAA	3	9	126771	126779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126351
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2570	NC_014652	CAA	2	6	126860	126865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126351
2571	NC_014652	CAT	2	6	126869	126874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126351
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2573	NC_014652	GCT	2	6	126912	126917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126351
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2575	NC_014652	GGA	2	6	126951	126956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126351
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2588	NC_014652	CATCT	2	10	127797	127806	20 %	40 %	0 %	40 %	312126352
2589	NC_014652	ATGT	2	8	127807	127814	25 %	50 %	25 %	0 %	312126352
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2592	NC_014652	A	6	6	127902	127907	100 %	0 %	0 %	0 %	312126352
2593	NC_014652	ATC	2	6	127911	127916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126352
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2605	NC_014652	T	7	7	128443	128449	0 %	100 %	0 %	0 %	312126352
2606	NC_014652	AT	3	6	128577	128582	50 %	50 %	0 %	0 %	312126352
2607	NC_014652	CAA	2	6	128585	128590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126352
2608	NC_014652	ATAA	2	8	128599	128606	75 %	25 %	0 %	0 %	312126352
2609	NC_014652	CTT	2	6	128642	128647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126352
2610	NC_014652	CAA	2	6	128679	128684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126352
2611	NC_014652	ATTT	2	8	128724	128731	25 %	75 %	0 %	0 %	312126352
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2615	NC_014652	AAAG	2	8	128908	128915	75 %	0 %	25 %	0 %	312126352
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2621	NC_014652	TAT	2	6	129021	129026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126352
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2623	NC_014652	T	6	6	129075	129080	0 %	100 %	0 %	0 %	312126352
2624	NC_014652	AT	3	6	129201	129206	50 %	50 %	0 %	0 %	312126352
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2731	NC_014652	CAA	2	6	135428	135433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126356
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2736	NC_014652	ATT	2	6	135770	135775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126357
2737	NC_014652	T	6	6	135801	135806	0 %	100 %	0 %	0 %	312126357
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2742	NC_014652	TTA	2	6	135970	135975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126357
2743	NC_014652	TGTTTT	2	12	136021	136032	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312126357
2744	NC_014652	TTTTC	2	10	136098	136107	0 %	80 %	0 %	20 %	312126357
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2746	NC_014652	GGA	2	6	136161	136166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126357
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2751	NC_014652	GTT	2	6	136377	136382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126357
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2994	NC_014652	ATA	2	6	148100	148105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126366
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2996	NC_014652	TTA	2	6	148172	148177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126366
2997	NC_014652	T	6	6	148207	148212	0 %	100 %	0 %	0 %	312126366
2998	NC_014652	AAT	2	6	148213	148218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126366
2999	NC_014652	T	7	7	148358	148364	0 %	100 %	0 %	0 %	312126366
3000	NC_014652	CCTG	2	8	148433	148440	0 %	25 %	25 %	50 %	312126366

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