MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 55074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_014652	AATCT	2	10	101282	101291	40 %	40 %	0 %	20 %	312126333
2004	NC_014652	CAA	2	6	101301	101306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126333
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2006	NC_014652	TCA	2	6	101327	101332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126333
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2010	NC_014652	CT	3	6	101509	101514	0 %	50 %	0 %	50 %	312126333
2011	NC_014652	TGAT	2	8	101531	101538	25 %	50 %	25 %	0 %	312126333
2012	NC_014652	TTC	2	6	101572	101577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126333
2013	NC_014652	TCA	2	6	101603	101608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126333
2014	NC_014652	TA	3	6	101619	101624	50 %	50 %	0 %	0 %	312126333
2015	NC_014652	T	6	6	101639	101644	0 %	100 %	0 %	0 %	312126333
2016	NC_014652	AATT	2	8	101658	101665	50 %	50 %	0 %	0 %	312126333
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2121	NC_014652	TTGA	2	8	106055	106062	25 %	50 %	25 %	0 %	312126336
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2123	NC_014652	TA	3	6	106091	106096	50 %	50 %	0 %	0 %	312126336
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2247	NC_014652	AT	3	6	111432	111437	50 %	50 %	0 %	0 %	312126341
2248	NC_014652	TTC	2	6	111447	111452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126341
2249	NC_014652	CTA	2	6	111494	111499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126341
2250	NC_014652	CT	3	6	111565	111570	0 %	50 %	0 %	50 %	312126341
2251	NC_014652	TAT	2	6	111576	111581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126341
2252	NC_014652	TA	3	6	111609	111614	50 %	50 %	0 %	0 %	312126341
2253	NC_014652	CAAG	2	8	111671	111678	50 %	0 %	25 %	25 %	312126341
2254	NC_014652	GTA	2	6	111682	111687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126341
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2256	NC_014652	CTA	2	6	111791	111796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126341
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2260	NC_014652	AAG	2	6	112011	112016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126341
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2262	NC_014652	TA	3	6	112074	112079	50 %	50 %	0 %	0 %	312126341
2263	NC_014652	CTTC	2	8	112213	112220	0 %	50 %	0 %	50 %	312126341
2264	NC_014652	TAA	2	6	112343	112348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126341
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2269	NC_014652	TTTC	2	8	112460	112467	0 %	75 %	0 %	25 %	312126341
2270	NC_014652	ATC	2	6	112518	112523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126341
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2272	NC_014652	TAC	2	6	112614	112619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126342
2273	NC_014652	TAC	2	6	112634	112639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126342
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2276	NC_014652	TG	3	6	112852	112857	0 %	50 %	50 %	0 %	312126342
2277	NC_014652	ATG	2	6	112981	112986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126342
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2279	NC_014652	CCCATG	2	12	113063	113074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312126342
2280	NC_014652	TCA	2	6	113143	113148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126342
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2282	NC_014652	A	6	6	113195	113200	100 %	0 %	0 %	0 %	312126342
2283	NC_014652	TAC	2	6	113259	113264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126342
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2285	NC_014652	CTT	2	6	113297	113302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126342
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2289	NC_014652	TCT	2	6	113428	113433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126342
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2293	NC_014652	T	6	6	113769	113774	0 %	100 %	0 %	0 %	312126342
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2331	NC_014652	A	6	6	116288	116293	100 %	0 %	0 %	0 %	312126344
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2345	NC_014652	AT	3	6	117177	117182	50 %	50 %	0 %	0 %	312126344
2346	NC_014652	GCA	2	6	117215	117220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126344
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2348	NC_014652	GT	3	6	117287	117292	0 %	50 %	50 %	0 %	312126344
2349	NC_014652	A	6	6	117352	117357	100 %	0 %	0 %	0 %	312126344
2350	NC_014652	GCA	2	6	117368	117373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126344
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2352	NC_014652	GAG	2	6	117425	117430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126344
2353	NC_014652	TGTT	2	8	117431	117438	0 %	75 %	25 %	0 %	312126344
2354	NC_014652	T	6	6	117442	117447	0 %	100 %	0 %	0 %	312126344
2355	NC_014652	GAA	2	6	117500	117505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126344
2356	NC_014652	TAT	2	6	117511	117516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126344
2357	NC_014652	ACT	2	6	117538	117543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126344
2358	NC_014652	ATA	2	6	117582	117587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126344
2359	NC_014652	TGT	2	6	117597	117602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126344
2360	NC_014652	GAA	2	6	117665	117670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126344
2361	NC_014652	CAG	2	6	117768	117773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126344
2362	NC_014652	TTA	2	6	117796	117801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126344
2363	NC_014652	AG	3	6	117820	117825	50 %	0 %	50 %	0 %	312126344
2364	NC_014652	AAGG	2	8	117830	117837	50 %	0 %	50 %	0 %	312126344
2365	NC_014652	TTG	2	6	117849	117854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126344
2366	NC_014652	GCA	2	6	117866	117871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126344
2367	NC_014652	GAA	2	6	117896	117901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126344
2368	NC_014652	A	6	6	117938	117943	100 %	0 %	0 %	0 %	312126345
2369	NC_014652	AGA	2	6	118004	118009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126345
2370	NC_014652	AAT	2	6	118013	118018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126345
2371	NC_014652	AAG	2	6	118030	118035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126345
2372	NC_014652	AGA	2	6	118068	118073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126345
2373	NC_014652	ATTTT	2	10	118075	118084	20 %	80 %	0 %	0 %	312126345
2374	NC_014652	TTG	2	6	118096	118101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126345
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2376	NC_014652	TGG	2	6	118121	118126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126345
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2378	NC_014652	TAC	2	6	118142	118147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126345
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2381	NC_014652	AAAG	2	8	118340	118347	75 %	0 %	25 %	0 %	312126345
2382	NC_014652	ATG	2	6	118354	118359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126345
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2392	NC_014652	AGC	2	6	118647	118652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126345
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2399	NC_014652	GCAG	2	8	118928	118935	25 %	0 %	50 %	25 %	312126345
2400	NC_014652	CTT	2	6	118956	118961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126345
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2403	NC_014652	AAGC	2	8	119087	119094	50 %	0 %	25 %	25 %	312126346
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2482	NC_014652	AAG	2	6	122184	122189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126347
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2491	NC_014652	A	6	6	122473	122478	100 %	0 %	0 %	0 %	312126347
2492	NC_014652	AAAG	2	8	122830	122837	75 %	0 %	25 %	0 %	312126348
2493	NC_014652	GTT	2	6	122849	122854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126348
2494	NC_014652	GCA	2	6	122870	122875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126348
2495	NC_014652	ACAA	2	8	123078	123085	75 %	0 %	0 %	25 %	312126348
2496	NC_014652	CAA	2	6	123105	123110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126348
2497	NC_014652	TTC	2	6	123152	123157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126348
2498	NC_014652	GCA	2	6	123182	123187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126348
2499	NC_014652	CT	3	6	123232	123237	0 %	50 %	0 %	50 %	312126348
2500	NC_014652	TAC	2	6	123302	123307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126348

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