MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 55074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014652	GA	4	8	76854	76861	50 %	0 %	50 %	0 %	312126318
1502	NC_014652	T	6	6	76869	76874	0 %	100 %	0 %	0 %	312126318
1503	NC_014652	ATT	2	6	76891	76896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126318
1504	NC_014652	T	6	6	76950	76955	0 %	100 %	0 %	0 %	312126318
1505	NC_014652	AGA	2	6	77096	77101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126318
1506	NC_014652	A	7	7	77105	77111	100 %	0 %	0 %	0 %	312126318
1507	NC_014652	TTAC	2	8	77272	77279	25 %	50 %	0 %	25 %	312126318
1508	NC_014652	AT	3	6	77310	77315	50 %	50 %	0 %	0 %	312126318
1509	NC_014652	GCT	2	6	77333	77338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126318
1510	NC_014652	TAT	2	6	77352	77357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126318
1511	NC_014652	AAG	2	6	77387	77392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126318
1512	NC_014652	AGAA	2	8	77393	77400	75 %	0 %	25 %	0 %	312126318
1513	NC_014652	CTGG	2	8	77629	77636	0 %	25 %	50 %	25 %	312126318
1514	NC_014652	TG	3	6	77678	77683	0 %	50 %	50 %	0 %	312126318
1515	NC_014652	T	6	6	77787	77792	0 %	100 %	0 %	0 %	312126318
1516	NC_014652	A	7	7	77801	77807	100 %	0 %	0 %	0 %	312126318
1517	NC_014652	AGA	2	6	77831	77836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126318
1518	NC_014652	TAA	2	6	77861	77866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126318
1519	NC_014652	AGA	2	6	77873	77878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126318
1520	NC_014652	A	6	6	77887	77892	100 %	0 %	0 %	0 %	312126318
1521	NC_014652	ACTT	2	8	78024	78031	25 %	50 %	0 %	25 %	312126318
1522	NC_014652	ATG	2	6	78058	78063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126318
1523	NC_014652	GATTAA	2	12	78077	78088	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312126318
1524	NC_014652	AAG	2	6	78102	78107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126318
1525	NC_014652	GAT	2	6	78153	78158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126318
1526	NC_014652	GAAAA	2	10	78167	78176	80 %	0 %	20 %	0 %	312126318
1527	NC_014652	ACAAA	2	10	78229	78238	80 %	0 %	0 %	20 %	312126318
1528	NC_014652	CTGG	2	8	78292	78299	0 %	25 %	50 %	25 %	312126318
1529	NC_014652	TACT	2	8	78339	78346	25 %	50 %	0 %	25 %	312126318
1530	NC_014652	T	6	6	78378	78383	0 %	100 %	0 %	0 %	312126318
1531	NC_014652	TTG	2	6	78508	78513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126318
1532	NC_014652	CAA	2	6	78529	78534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126318
1533	NC_014652	A	6	6	78574	78579	100 %	0 %	0 %	0 %	312126318
1534	NC_014652	GAA	3	9	78648	78656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126318
1535	NC_014652	AAAC	2	8	78687	78694	75 %	0 %	0 %	25 %	312126318
1536	NC_014652	GCA	2	6	78720	78725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126318
1537	NC_014652	GTT	2	6	78747	78752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126318
1538	NC_014652	CTT	2	6	79081	79086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126319
1539	NC_014652	TCT	2	6	79104	79109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126319
1540	NC_014652	TGA	2	6	79206	79211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126319
1541	NC_014652	ATT	2	6	79360	79365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126319
1542	NC_014652	CAGT	2	8	79366	79373	25 %	25 %	25 %	25 %	312126319
1543	NC_014652	AAG	2	6	79394	79399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126319
1544	NC_014652	TCT	2	6	79406	79411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126319
1545	NC_014652	T	6	6	79464	79469	0 %	100 %	0 %	0 %	312126319
1546	NC_014652	AAG	2	6	79487	79492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126319
1547	NC_014652	TGTA	2	8	79532	79539	25 %	50 %	25 %	0 %	312126319
1548	NC_014652	GAT	2	6	79587	79592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126319
1549	NC_014652	ATC	2	6	79637	79642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126319
1550	NC_014652	TAA	2	6	79680	79685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126319
1551	NC_014652	ACA	2	6	79699	79704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126319
1552	NC_014652	T	8	8	79772	79779	0 %	100 %	0 %	0 %	312126319
1553	NC_014652	GAA	2	6	79780	79785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126319
1554	NC_014652	AAT	2	6	79809	79814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126319
1555	NC_014652	TCT	2	6	79836	79841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126319
1556	NC_014652	TTTTC	2	10	79882	79891	0 %	80 %	0 %	20 %	312126319
1557	NC_014652	GAA	2	6	80098	80103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126319
1558	NC_014652	ACA	2	6	80168	80173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126319
1559	NC_014652	AATA	2	8	80271	80278	75 %	25 %	0 %	0 %	312126319
1560	NC_014652	CAA	2	6	80282	80287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126319
1561	NC_014652	TA	3	6	80375	80380	50 %	50 %	0 %	0 %	312126319
1562	NC_014652	GAA	2	6	80386	80391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126319
1563	NC_014652	GGT	2	6	80529	80534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126319
1564	NC_014652	A	6	6	80577	80582	100 %	0 %	0 %	0 %	312126319
1565	NC_014652	TA	3	6	80636	80641	50 %	50 %	0 %	0 %	312126319
1566	NC_014652	AAAGT	2	10	80666	80675	60 %	20 %	20 %	0 %	312126319
1567	NC_014652	ATT	2	6	80692	80697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126319
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1570	NC_014652	GAA	2	6	80771	80776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126319
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1572	NC_014652	TAA	2	6	80827	80832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126320
1573	NC_014652	ATGG	2	8	80924	80931	25 %	25 %	50 %	0 %	312126320
1574	NC_014652	A	7	7	81079	81085	100 %	0 %	0 %	0 %	312126320
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1580	NC_014652	A	6	6	81314	81319	100 %	0 %	0 %	0 %	312126320
1581	NC_014652	A	6	6	81413	81418	100 %	0 %	0 %	0 %	312126320
1582	NC_014652	GAA	2	6	81445	81450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126320
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1585	NC_014652	CAA	2	6	81679	81684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126321
1586	NC_014652	TCTGAC	2	12	81711	81722	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312126321
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1588	NC_014652	ACAAA	2	10	81820	81829	80 %	0 %	0 %	20 %	312126321
1589	NC_014652	GCA	2	6	81846	81851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126321
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1591	NC_014652	CAT	2	6	81938	81943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126321
1592	NC_014652	GGC	2	6	82005	82010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312126321
1593	NC_014652	TA	3	6	82049	82054	50 %	50 %	0 %	0 %	312126321
1594	NC_014652	ACA	2	6	82057	82062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126321
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1596	NC_014652	AAG	2	6	82296	82301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126321
1597	NC_014652	CAA	2	6	82342	82347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126321
1598	NC_014652	GCA	2	6	82362	82367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126321
1599	NC_014652	ATGT	2	8	82398	82405	25 %	50 %	25 %	0 %	312126321
1600	NC_014652	AAC	2	6	82509	82514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126321
1601	NC_014652	AACA	2	8	82563	82570	75 %	0 %	0 %	25 %	312126321
1602	NC_014652	GCT	3	9	82572	82580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126321
1603	NC_014652	AGTAAA	2	12	82655	82666	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312126321
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1605	NC_014652	TTA	2	6	82713	82718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126321
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1607	NC_014652	ATG	2	6	82753	82758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126321
1608	NC_014652	AAC	2	6	82791	82796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126321
1609	NC_014652	A	6	6	82863	82868	100 %	0 %	0 %	0 %	312126321
1610	NC_014652	A	6	6	82875	82880	100 %	0 %	0 %	0 %	312126321
1611	NC_014652	TTGCTA	2	12	83008	83019	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312126322
1612	NC_014652	CATT	2	8	83076	83083	25 %	50 %	0 %	25 %	312126322
1613	NC_014652	CA	3	6	83190	83195	50 %	0 %	0 %	50 %	312126322
1614	NC_014652	ATA	2	6	83268	83273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126322
1615	NC_014652	AGGA	2	8	83276	83283	50 %	0 %	50 %	0 %	312126322
1616	NC_014652	T	7	7	83300	83306	0 %	100 %	0 %	0 %	312126322
1617	NC_014652	T	6	6	83349	83354	0 %	100 %	0 %	0 %	312126322
1618	NC_014652	GCA	2	6	83417	83422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126322
1619	NC_014652	AGC	2	6	83546	83551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126322
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1621	NC_014652	ATA	2	6	83592	83597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126322
1622	NC_014652	CATGG	2	10	83669	83678	20 %	20 %	40 %	20 %	312126322
1623	NC_014652	AT	3	6	83726	83731	50 %	50 %	0 %	0 %	312126322
1624	NC_014652	TGTT	2	8	83791	83798	0 %	75 %	25 %	0 %	312126322
1625	NC_014652	TGC	2	6	83834	83839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126322
1626	NC_014652	AGA	2	6	83846	83851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126322
1627	NC_014652	AAT	2	6	83924	83929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126323
1628	NC_014652	ATT	2	6	83963	83968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126323
1629	NC_014652	CAA	2	6	84005	84010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126323
1630	NC_014652	ATG	2	6	84073	84078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126323
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1632	NC_014652	T	6	6	84145	84150	0 %	100 %	0 %	0 %	312126323
1633	NC_014652	TTA	2	6	84154	84159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126323
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