MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 55074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014652	TTG	2	6	49565	49570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126302
1002	NC_014652	A	7	7	50379	50385	100 %	0 %	0 %	0 %	312126304
1003	NC_014652	TA	3	6	50387	50392	50 %	50 %	0 %	0 %	312126304
1004	NC_014652	AAG	2	6	50511	50516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126304
1005	NC_014652	CAA	2	6	50536	50541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126304
1006	NC_014652	ATT	2	6	50585	50590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126304
1007	NC_014652	GCA	2	6	50643	50648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126304
1008	NC_014652	GGC	2	6	50728	50733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312126304
1009	NC_014652	AAT	2	6	50794	50799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126304
1010	NC_014652	TTTCTG	2	12	50862	50873	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312126304
1011	NC_014652	AG	3	6	50887	50892	50 %	0 %	50 %	0 %	312126304
1012	NC_014652	ATT	2	6	50900	50905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126304
1013	NC_014652	ATAA	2	8	50942	50949	75 %	25 %	0 %	0 %	312126304
1014	NC_014652	AAAC	2	8	50985	50992	75 %	0 %	0 %	25 %	312126304
1015	NC_014652	A	6	6	51057	51062	100 %	0 %	0 %	0 %	312126304
1016	NC_014652	GAA	2	6	51074	51079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126304
1017	NC_014652	AAT	3	9	51092	51100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126304
1018	NC_014652	A	6	6	51147	51152	100 %	0 %	0 %	0 %	312126304
1019	NC_014652	CAG	2	6	51161	51166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126304
1020	NC_014652	CAA	2	6	51207	51212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126304
1021	NC_014652	AGA	2	6	51238	51243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126304
1022	NC_014652	GT	3	6	51354	51359	0 %	50 %	50 %	0 %	312126304
1023	NC_014652	CAA	2	6	51525	51530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126304
1024	NC_014652	AATT	2	8	51558	51565	50 %	50 %	0 %	0 %	312126304
1025	NC_014652	TTAT	2	8	51810	51817	25 %	75 %	0 %	0 %	312126304
1026	NC_014652	TTG	3	9	51861	51869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126304
1027	NC_014652	ACA	3	9	51872	51880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126304
1028	NC_014652	GAT	2	6	51986	51991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1029	NC_014652	AAC	2	6	52010	52015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126304
1030	NC_014652	CAAA	2	8	52032	52039	75 %	0 %	0 %	25 %	312126304
1031	NC_014652	A	6	6	52154	52159	100 %	0 %	0 %	0 %	312126304
1032	NC_014652	ACATTT	2	12	52163	52174	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312126304
1033	NC_014652	AACTT	2	10	52187	52196	40 %	40 %	0 %	20 %	312126304
1034	NC_014652	AG	3	6	52204	52209	50 %	0 %	50 %	0 %	312126304
1035	NC_014652	TGA	2	6	52249	52254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1036	NC_014652	TAA	2	6	52321	52326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126304
1037	NC_014652	TGA	2	6	52396	52401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1038	NC_014652	GTT	2	6	52454	52459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126304
1039	NC_014652	ATG	2	6	52470	52475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1040	NC_014652	AC	3	6	52532	52537	50 %	0 %	0 %	50 %	312126304
1041	NC_014652	TGT	2	6	52555	52560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126304
1042	NC_014652	AACAT	2	10	52613	52622	60 %	20 %	0 %	20 %	312126304
1043	NC_014652	CAA	2	6	52662	52667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126304
1044	NC_014652	CAG	2	6	52719	52724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126304
1045	NC_014652	CTG	2	6	52899	52904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126304
1046	NC_014652	ATG	2	6	52905	52910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1047	NC_014652	ATG	2	6	53072	53077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1048	NC_014652	AAGA	2	8	53106	53113	75 %	0 %	25 %	0 %	312126304
1049	NC_014652	AAG	2	6	53119	53124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126304
1050	NC_014652	ATGT	2	8	53342	53349	25 %	50 %	25 %	0 %	312126304
1051	NC_014652	TTG	2	6	53379	53384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126304
1052	NC_014652	GCAA	2	8	53408	53415	50 %	0 %	25 %	25 %	312126304
1053	NC_014652	GCAT	2	8	53422	53429	25 %	25 %	25 %	25 %	312126304
1054	NC_014652	GAT	2	6	53480	53485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1055	NC_014652	GGA	2	6	53498	53503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126304
1056	NC_014652	GAT	3	9	53537	53545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1057	NC_014652	TGG	2	6	53561	53566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126304
1058	NC_014652	AACT	2	8	53596	53603	50 %	25 %	0 %	25 %	312126304
1059	NC_014652	TAC	2	6	53618	53623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126304
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1061	NC_014652	TTG	2	6	53679	53684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126304
1062	NC_014652	TAC	2	6	53746	53751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126304
1063	NC_014652	TGA	2	6	53758	53763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1064	NC_014652	ATTTA	2	10	53917	53926	40 %	60 %	0 %	0 %	312126304
1065	NC_014652	ATGGA	2	10	53964	53973	40 %	20 %	40 %	0 %	312126304
1066	NC_014652	ATG	2	6	53988	53993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1067	NC_014652	GTA	2	6	54059	54064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
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1069	NC_014652	AGA	2	6	54097	54102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126304
1070	NC_014652	AT	4	8	54120	54127	50 %	50 %	0 %	0 %	312126304
1071	NC_014652	ATG	2	6	54156	54161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1072	NC_014652	TTG	2	6	54225	54230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126304
1073	NC_014652	ATT	2	6	54263	54268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126304
1074	NC_014652	TATGCA	2	12	54329	54340	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312126304
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1081	NC_014652	TAA	2	6	54900	54905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126304
1082	NC_014652	TGAA	2	8	54918	54925	50 %	25 %	25 %	0 %	312126304
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1088	NC_014652	GGT	2	6	55109	55114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126304
1089	NC_014652	AAG	2	6	55120	55125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126304
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1091	NC_014652	A	6	6	55180	55185	100 %	0 %	0 %	0 %	312126304
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1094	NC_014652	TA	3	6	55530	55535	50 %	50 %	0 %	0 %	312126305
1095	NC_014652	TGA	2	6	55640	55645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126305
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1097	NC_014652	AG	4	8	55704	55711	50 %	0 %	50 %	0 %	312126305
1098	NC_014652	TGG	2	6	55727	55732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126305
1099	NC_014652	AG	3	6	55772	55777	50 %	0 %	50 %	0 %	312126305
1100	NC_014652	TGT	2	6	55811	55816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126305
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1106	NC_014652	TTG	2	6	56287	56292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126305
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1108	NC_014652	AAAAT	2	10	56518	56527	80 %	20 %	0 %	0 %	312126305
1109	NC_014652	T	6	6	56532	56537	0 %	100 %	0 %	0 %	312126305
1110	NC_014652	TGA	2	6	56621	56626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126305
1111	NC_014652	CAT	2	6	56651	56656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126305
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1114	NC_014652	CAAG	2	8	56822	56829	50 %	0 %	25 %	25 %	312126305
1115	NC_014652	CAGA	2	8	56857	56864	50 %	0 %	25 %	25 %	312126305
1116	NC_014652	ATA	2	6	56877	56882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126305
1117	NC_014652	CCAT	2	8	56894	56901	25 %	25 %	0 %	50 %	312126305
1118	NC_014652	A	6	6	57003	57008	100 %	0 %	0 %	0 %	312126305
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1120	NC_014652	TA	3	6	57146	57151	50 %	50 %	0 %	0 %	312126306
1121	NC_014652	ATGTAA	2	12	57197	57208	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312126306
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1123	NC_014652	A	6	6	57279	57284	100 %	0 %	0 %	0 %	312126306
1124	NC_014652	ATAA	2	8	57329	57336	75 %	25 %	0 %	0 %	312126306
1125	NC_014652	ATA	2	6	57356	57361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126306
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1127	NC_014652	TGT	2	6	57388	57393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126306
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1240	NC_014652	GGCAAT	2	12	63137	63148	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312126312
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1243	NC_014652	AAT	3	9	63197	63205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126312
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1249	NC_014652	CTT	2	6	63342	63347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126312
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1252	NC_014652	ATA	2	6	63630	63635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126312
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1254	NC_014652	TAT	2	6	63755	63760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126312
1255	NC_014652	CTT	2	6	63948	63953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126312
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1285	NC_014652	AT	3	6	65552	65557	50 %	50 %	0 %	0 %	312126314
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1373	NC_014652	CAC	2	6	69732	69737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126316
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1379	NC_014652	AAAGA	2	10	70005	70014	80 %	0 %	20 %	0 %	312126316
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