MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 55074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014652	AAC	2	6	26977	26982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126283
502	NC_014652	AAG	2	6	26995	27000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126283
503	NC_014652	GGCT	2	8	27005	27012	0 %	25 %	50 %	25 %	312126283
504	NC_014652	TTG	3	9	27018	27026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126283
505	NC_014652	TAA	2	6	27042	27047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126283
506	NC_014652	GAG	2	6	27197	27202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126283
507	NC_014652	AAG	2	6	27268	27273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126283
508	NC_014652	AT	3	6	27274	27279	50 %	50 %	0 %	0 %	312126283
509	NC_014652	AG	3	6	27338	27343	50 %	0 %	50 %	0 %	312126283
510	NC_014652	ATA	3	9	27347	27355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126283
511	NC_014652	GAC	2	6	27562	27567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126284
512	NC_014652	ATT	2	6	27573	27578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126284
513	NC_014652	CAT	2	6	27651	27656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126284
514	NC_014652	TTG	2	6	27668	27673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126284
515	NC_014652	ATT	2	6	27746	27751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126284
516	NC_014652	AG	3	6	27802	27807	50 %	0 %	50 %	0 %	312126284
517	NC_014652	TAT	2	6	27870	27875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126284
518	NC_014652	CATTA	2	10	27951	27960	40 %	40 %	0 %	20 %	312126284
519	NC_014652	CAA	2	6	28019	28024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126284
520	NC_014652	TA	3	6	28032	28037	50 %	50 %	0 %	0 %	312126284
521	NC_014652	A	6	6	28060	28065	100 %	0 %	0 %	0 %	312126284
522	NC_014652	GAAAA	2	10	28177	28186	80 %	0 %	20 %	0 %	312126284
523	NC_014652	GCT	2	6	28231	28236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126284
524	NC_014652	T	6	6	28269	28274	0 %	100 %	0 %	0 %	312126284
525	NC_014652	TTG	3	9	28301	28309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126284
526	NC_014652	A	6	6	28494	28499	100 %	0 %	0 %	0 %	312126284
527	NC_014652	GTT	2	6	28612	28617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126284
528	NC_014652	CAGG	2	8	28630	28637	25 %	0 %	50 %	25 %	312126284
529	NC_014652	TAA	2	6	28655	28660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126284
530	NC_014652	TCT	2	6	28662	28667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126284
531	NC_014652	TGA	2	6	28707	28712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126284
532	NC_014652	GAA	2	6	28748	28753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126284
533	NC_014652	AAT	3	9	28761	28769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126284
534	NC_014652	ATTT	2	8	28779	28786	25 %	75 %	0 %	0 %	312126284
535	NC_014652	T	6	6	28784	28789	0 %	100 %	0 %	0 %	312126284
536	NC_014652	AGA	3	9	28836	28844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126284
537	NC_014652	GTT	2	6	28915	28920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126284
538	NC_014652	GA	3	6	28924	28929	50 %	0 %	50 %	0 %	312126284
539	NC_014652	AATTGC	2	12	28962	28973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312126284
540	NC_014652	TGA	2	6	29010	29015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126284
541	NC_014652	GAA	2	6	29084	29089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126284
542	NC_014652	ATC	2	6	29095	29100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126284
543	NC_014652	TAA	2	6	29136	29141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126284
544	NC_014652	TTA	2	6	29145	29150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126284
545	NC_014652	TTG	2	6	29168	29173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126284
546	NC_014652	TGA	2	6	29195	29200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126284
547	NC_014652	ACA	2	6	29221	29226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126284
548	NC_014652	A	6	6	29230	29235	100 %	0 %	0 %	0 %	312126284
549	NC_014652	GC	3	6	29247	29252	0 %	0 %	50 %	50 %	312126284
550	NC_014652	AAG	2	6	29338	29343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126285
551	NC_014652	TCT	2	6	29393	29398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126285
552	NC_014652	A	6	6	29406	29411	100 %	0 %	0 %	0 %	312126285
553	NC_014652	A	6	6	29508	29513	100 %	0 %	0 %	0 %	312126285
554	NC_014652	A	6	6	29582	29587	100 %	0 %	0 %	0 %	312126285
555	NC_014652	AACAG	2	10	29604	29613	60 %	0 %	20 %	20 %	312126285
556	NC_014652	TTTG	2	8	29624	29631	0 %	75 %	25 %	0 %	312126285
557	NC_014652	TCTT	2	8	29666	29673	0 %	75 %	0 %	25 %	312126285
558	NC_014652	T	6	6	29679	29684	0 %	100 %	0 %	0 %	312126285
559	NC_014652	GAA	2	6	29701	29706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126285
560	NC_014652	AAC	2	6	29742	29747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126285
561	NC_014652	GCA	2	6	29802	29807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126285
562	NC_014652	ATA	2	6	29808	29813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126285
563	NC_014652	GTT	2	6	29856	29861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126285
564	NC_014652	T	7	7	29866	29872	0 %	100 %	0 %	0 %	312126285
565	NC_014652	AGT	2	6	29873	29878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126285
566	NC_014652	TA	3	6	29952	29957	50 %	50 %	0 %	0 %	312126285
567	NC_014652	TCA	2	6	30127	30132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126285
568	NC_014652	CTT	2	6	30153	30158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126285
569	NC_014652	GTT	2	6	30228	30233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126285
570	NC_014652	CTT	2	6	30258	30263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126285
571	NC_014652	CTGT	2	8	30300	30307	0 %	50 %	25 %	25 %	312126285
572	NC_014652	TCGA	2	8	30363	30370	25 %	25 %	25 %	25 %	312126285
573	NC_014652	TG	3	6	30380	30385	0 %	50 %	50 %	0 %	312126285
574	NC_014652	GAA	2	6	30402	30407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126285
575	NC_014652	A	6	6	30438	30443	100 %	0 %	0 %	0 %	312126285
576	NC_014652	ATG	2	6	30447	30452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126285
577	NC_014652	TCT	2	6	30500	30505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126285
578	NC_014652	CAG	2	6	30606	30611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126285
579	NC_014652	GC	3	6	30709	30714	0 %	0 %	50 %	50 %	312126285
580	NC_014652	AAT	2	6	30911	30916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126285
581	NC_014652	TAA	2	6	30976	30981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126285
582	NC_014652	A	6	6	31038	31043	100 %	0 %	0 %	0 %	312126285
583	NC_014652	TAT	2	6	31050	31055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126285
584	NC_014652	TAC	2	6	31591	31596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126286
585	NC_014652	GAA	2	6	31667	31672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126286
586	NC_014652	GCTGC	2	10	31700	31709	0 %	20 %	40 %	40 %	312126286
587	NC_014652	TAT	2	6	31711	31716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126286
588	NC_014652	TGC	2	6	31720	31725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126286
589	NC_014652	AACACA	2	12	31832	31843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126286
590	NC_014652	TGA	2	6	31875	31880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126286
591	NC_014652	TGT	2	6	31899	31904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126286
592	NC_014652	AAGA	2	8	31918	31925	75 %	0 %	25 %	0 %	312126286
593	NC_014652	TGA	2	6	31986	31991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126286
594	NC_014652	TCA	2	6	32003	32008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126286
595	NC_014652	CAA	2	6	32025	32030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126286
596	NC_014652	T	6	6	32082	32087	0 %	100 %	0 %	0 %	312126286
597	NC_014652	AAC	2	6	32104	32109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126286
598	NC_014652	AAGG	2	8	32487	32494	50 %	0 %	50 %	0 %	312126287
599	NC_014652	TAAAA	2	10	32516	32525	80 %	20 %	0 %	0 %	312126287
600	NC_014652	GAG	2	6	32566	32571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126287
601	NC_014652	GCA	2	6	32640	32645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126287
602	NC_014652	GGC	2	6	32694	32699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312126287
603	NC_014652	TA	3	6	32701	32706	50 %	50 %	0 %	0 %	312126287
604	NC_014652	TGAGAT	2	12	32861	32872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126287
605	NC_014652	TGC	2	6	32902	32907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126287
606	NC_014652	A	8	8	32945	32952	100 %	0 %	0 %	0 %	312126288
607	NC_014652	GAA	2	6	32957	32962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126288
608	NC_014652	GTGAAA	2	12	32992	33003	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312126288
609	NC_014652	TG	3	6	33063	33068	0 %	50 %	50 %	0 %	312126288
610	NC_014652	TGA	2	6	33076	33081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126288
611	NC_014652	AT	3	6	33165	33170	50 %	50 %	0 %	0 %	312126288
612	NC_014652	T	6	6	33191	33196	0 %	100 %	0 %	0 %	312126288
613	NC_014652	TGC	2	6	33220	33225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126288
614	NC_014652	AT	3	6	33242	33247	50 %	50 %	0 %	0 %	312126288
615	NC_014652	T	6	6	33258	33263	0 %	100 %	0 %	0 %	312126288
616	NC_014652	GCA	2	6	33264	33269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126288
617	NC_014652	T	6	6	33322	33327	0 %	100 %	0 %	0 %	312126288
618	NC_014652	TC	4	8	33387	33394	0 %	50 %	0 %	50 %	312126288
619	NC_014652	AGC	2	6	33425	33430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126288
620	NC_014652	GCCC	2	8	33453	33460	0 %	0 %	25 %	75 %	312126288
621	NC_014652	TTGGG	2	10	33485	33494	0 %	40 %	60 %	0 %	312126288
622	NC_014652	GCT	2	6	33596	33601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126288
623	NC_014652	AT	3	6	33671	33676	50 %	50 %	0 %	0 %	312126288
624	NC_014652	CTTG	2	8	33683	33690	0 %	50 %	25 %	25 %	312126288
625	NC_014652	GA	3	6	33719	33724	50 %	0 %	50 %	0 %	312126288
626	NC_014652	A	6	6	33724	33729	100 %	0 %	0 %	0 %	312126288
627	NC_014652	TTG	2	6	33757	33762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126288
628	NC_014652	T	6	6	33779	33784	0 %	100 %	0 %	0 %	312126288
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