MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 55074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014652	T	7	7	254522	254528	0 %	100 %	0 %	0 %	312126451
5002	NC_014652	GTC	2	6	254557	254562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126451
5003	NC_014652	TA	3	6	254662	254667	50 %	50 %	0 %	0 %	312126451
5004	NC_014652	GCT	2	6	254687	254692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126451
5005	NC_014652	ATAG	2	8	254752	254759	50 %	25 %	25 %	0 %	312126451
5006	NC_014652	CAA	2	6	254832	254837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126451
5007	NC_014652	CTC	2	6	254863	254868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312126451
5008	NC_014652	TTC	2	6	254905	254910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126451
5009	NC_014652	TC	3	6	254920	254925	0 %	50 %	0 %	50 %	312126451
5010	NC_014652	AACTC	2	10	254966	254975	40 %	20 %	0 %	40 %	312126451
5011	NC_014652	TGT	2	6	255051	255056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126451
5012	NC_014652	T	6	6	255079	255084	0 %	100 %	0 %	0 %	312126451
5013	NC_014652	CTT	2	6	255123	255128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126451
5014	NC_014652	T	6	6	255136	255141	0 %	100 %	0 %	0 %	312126451
5015	NC_014652	CAT	2	6	255156	255161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126451
5016	NC_014652	TCA	2	6	255218	255223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126451
5017	NC_014652	ACA	2	6	255236	255241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126451
5018	NC_014652	GAA	2	6	255242	255247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126451
5019	NC_014652	TCAA	2	8	255371	255378	50 %	25 %	0 %	25 %	312126451
5020	NC_014652	TGT	2	6	255522	255527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126451
5021	NC_014652	TAA	2	6	255538	255543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126451
5022	NC_014652	ATA	2	6	255547	255552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126451
5023	NC_014652	TTTG	2	8	255593	255600	0 %	75 %	25 %	0 %	312126451
5024	NC_014652	TCA	2	6	255611	255616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126451
5025	NC_014652	ATT	2	6	255650	255655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126451
5026	NC_014652	GGTAT	2	10	255656	255665	20 %	40 %	40 %	0 %	312126451
5027	NC_014652	CAG	2	6	255669	255674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126451
5028	NC_014652	AT	3	6	255721	255726	50 %	50 %	0 %	0 %	312126451
5029	NC_014652	T	6	6	255731	255736	0 %	100 %	0 %	0 %	312126451
5030	NC_014652	CAAA	2	8	255738	255745	75 %	0 %	0 %	25 %	312126451
5031	NC_014652	TTA	2	6	255750	255755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126451
5032	NC_014652	TGAG	2	8	255769	255776	25 %	25 %	50 %	0 %	312126451
5033	NC_014652	TTCT	2	8	255865	255872	0 %	75 %	0 %	25 %	312126451
5034	NC_014652	TGC	2	6	256217	256222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126452
5035	NC_014652	GGT	2	6	256301	256306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126452
5036	NC_014652	GTT	2	6	256339	256344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126452
5037	NC_014652	ACCTC	2	10	256379	256388	20 %	20 %	0 %	60 %	312126452
5038	NC_014652	TACTT	2	10	256608	256617	20 %	60 %	0 %	20 %	312126452
5039	NC_014652	TGG	2	6	256642	256647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126452
5040	NC_014652	ACA	2	6	256676	256681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126452
5041	NC_014652	AGG	2	6	256824	256829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126452
5042	NC_014652	ACC	2	6	256834	256839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126452
5043	NC_014652	C	6	6	256838	256843	0 %	0 %	0 %	100 %	312126452
5044	NC_014652	TCT	2	6	256850	256855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126452
5045	NC_014652	TTA	2	6	256952	256957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126452
5046	NC_014652	CTT	2	6	256963	256968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126452
5047	NC_014652	TA	3	6	257063	257068	50 %	50 %	0 %	0 %	312126452
5048	NC_014652	TAA	2	6	257126	257131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126452
5049	NC_014652	ATT	2	6	257158	257163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126452
5050	NC_014652	AT	3	6	257239	257244	50 %	50 %	0 %	0 %	312126453
5051	NC_014652	CCCAG	2	10	257249	257258	20 %	0 %	20 %	60 %	312126453
5052	NC_014652	GA	3	6	257260	257265	50 %	0 %	50 %	0 %	312126453
5053	NC_014652	T	6	6	257266	257271	0 %	100 %	0 %	0 %	312126453
5054	NC_014652	AAAG	2	8	257323	257330	75 %	0 %	25 %	0 %	312126453
5055	NC_014652	TGA	2	6	257366	257371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126453
5056	NC_014652	AAG	2	6	257414	257419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126453
5057	NC_014652	CAA	2	6	257422	257427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126453
5058	NC_014652	GCAA	2	8	257441	257448	50 %	0 %	25 %	25 %	312126453
5059	NC_014652	AGA	2	6	257472	257477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126453
5060	NC_014652	AGAA	2	8	257495	257502	75 %	0 %	25 %	0 %	312126453
5061	NC_014652	AGA	2	6	257514	257519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126453
5062	NC_014652	TCT	2	6	257540	257545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126453
5063	NC_014652	A	6	6	257856	257861	100 %	0 %	0 %	0 %	312126453
5064	NC_014652	CAG	2	6	257902	257907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126453
5065	NC_014652	TGT	2	6	258020	258025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126453
5066	NC_014652	AAC	2	6	258026	258031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126453
5067	NC_014652	AAC	2	6	258071	258076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126453
5068	NC_014652	TGTA	2	8	258082	258089	25 %	50 %	25 %	0 %	312126453
5069	NC_014652	AAG	2	6	258119	258124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126453
5070	NC_014652	T	7	7	258148	258154	0 %	100 %	0 %	0 %	312126453
5071	NC_014652	AGCC	2	8	258263	258270	25 %	0 %	25 %	50 %	312126453
5072	NC_014652	TGCC	2	8	258314	258321	0 %	25 %	25 %	50 %	312126453
5073	NC_014652	A	6	6	258753	258758	100 %	0 %	0 %	0 %	312126454
5074	NC_014652	A	6	6	258886	258891	100 %	0 %	0 %	0 %	312126454
5075	NC_014652	AAG	2	6	258924	258929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126454
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5079	NC_014652	AAG	2	6	259061	259066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126454
5080	NC_014652	TTAT	2	8	259082	259089	25 %	75 %	0 %	0 %	312126454
5081	NC_014652	TG	4	8	259107	259114	0 %	50 %	50 %	0 %	312126454
5082	NC_014652	GCT	2	6	259157	259162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126454
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5087	NC_014652	AAT	2	6	259350	259355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126454
5088	NC_014652	TA	3	6	259366	259371	50 %	50 %	0 %	0 %	312126454
5089	NC_014652	TAA	2	6	259406	259411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126454
5090	NC_014652	TGA	2	6	259434	259439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126454
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5093	NC_014652	TGAT	2	8	259523	259530	25 %	50 %	25 %	0 %	312126454
5094	NC_014652	A	6	6	259581	259586	100 %	0 %	0 %	0 %	312126454
5095	NC_014652	AAG	2	6	259742	259747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126454
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5098	NC_014652	T	6	6	260213	260218	0 %	100 %	0 %	0 %	312126455
5099	NC_014652	GAA	2	6	260252	260257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126455
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5106	NC_014652	CCAG	2	8	260500	260507	25 %	0 %	25 %	50 %	312126455
5107	NC_014652	CAA	2	6	260521	260526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126455
5108	NC_014652	AC	3	6	260540	260545	50 %	0 %	0 %	50 %	312126455
5109	NC_014652	GCA	2	6	260557	260562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126455
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5112	NC_014652	TGA	2	6	260632	260637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126455
5113	NC_014652	TTG	2	6	260649	260654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126455
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5122	NC_014652	GAA	2	6	261083	261088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126455
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5124	NC_014652	TTGA	2	8	261209	261216	25 %	50 %	25 %	0 %	312126455
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5242	NC_014652	A	6	6	267537	267542	100 %	0 %	0 %	0 %	312126462
5243	NC_014652	GAA	2	6	267543	267548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126462
5244	NC_014652	A	6	6	267598	267603	100 %	0 %	0 %	0 %	312126462
5245	NC_014652	TTGGA	2	10	267611	267620	20 %	40 %	40 %	0 %	312126462
5246	NC_014652	AT	3	6	267681	267686	50 %	50 %	0 %	0 %	312126462
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5249	NC_014652	TCA	2	6	267804	267809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126463
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5252	NC_014652	TCCT	2	8	267962	267969	0 %	50 %	0 %	50 %	312126463
5253	NC_014652	A	6	6	268060	268065	100 %	0 %	0 %	0 %	312126464
5254	NC_014652	GCA	2	6	268137	268142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126464
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5257	NC_014652	T	8	8	268307	268314	0 %	100 %	0 %	0 %	312126464
5258	NC_014652	TC	3	6	268341	268346	0 %	50 %	0 %	50 %	312126464
5259	NC_014652	A	6	6	268352	268357	100 %	0 %	0 %	0 %	312126464
5260	NC_014652	A	6	6	268392	268397	100 %	0 %	0 %	0 %	312126464
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5273	NC_014652	T	6	6	269089	269094	0 %	100 %	0 %	0 %	312126464
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5363	NC_014652	A	6	6	273795	273800	100 %	0 %	0 %	0 %	312126469
5364	NC_014652	GAT	2	6	273811	273816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126469
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5366	NC_014652	GAAG	2	8	273832	273839	50 %	0 %	50 %	0 %	312126469
5367	NC_014652	GAT	2	6	273876	273881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126469
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5369	NC_014652	TGA	2	6	273936	273941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126469
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5373	NC_014652	A	6	6	274027	274032	100 %	0 %	0 %	0 %	312126469
5374	NC_014652	GCA	2	6	274033	274038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126469
5375	NC_014652	TTCAA	2	10	274125	274134	40 %	40 %	0 %	20 %	312126469
5376	NC_014652	A	8	8	274145	274152	100 %	0 %	0 %	0 %	312126469
5377	NC_014652	GC	3	6	274213	274218	0 %	0 %	50 %	50 %	312126469
5378	NC_014652	A	6	6	274233	274238	100 %	0 %	0 %	0 %	312126469
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5381	NC_014652	TCC	2	6	274363	274368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312126470
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5389	NC_014652	CAT	2	6	274904	274909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126470
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5392	NC_014652	TCCT	2	8	275028	275035	0 %	50 %	0 %	50 %	312126470
5393	NC_014652	CTT	2	6	275084	275089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126470
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5401	NC_014652	TA	3	6	275583	275588	50 %	50 %	0 %	0 %	312126470
5402	NC_014652	TCT	2	6	275649	275654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126471
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5405	NC_014652	GT	3	6	275757	275762	0 %	50 %	50 %	0 %	312126471
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5412	NC_014652	GGT	2	6	276060	276065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126471
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5497	NC_014652	ACA	2	6	280904	280909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126478
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