MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 55074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014652	TAGT	2	8	228608	228615	25 %	50 %	25 %	0 %	312126430
4502	NC_014652	A	6	6	228809	228814	100 %	0 %	0 %	0 %	312126430
4503	NC_014652	TAG	2	6	228815	228820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126430
4504	NC_014652	A	6	6	228886	228891	100 %	0 %	0 %	0 %	312126430
4505	NC_014652	T	6	6	229379	229384	0 %	100 %	0 %	0 %	312126431
4506	NC_014652	T	6	6	229397	229402	0 %	100 %	0 %	0 %	312126431
4507	NC_014652	GGT	2	6	229546	229551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126431
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4509	NC_014652	A	6	6	229592	229597	100 %	0 %	0 %	0 %	312126431
4510	NC_014652	GTAT	2	8	229646	229653	25 %	50 %	25 %	0 %	312126431
4511	NC_014652	GTA	2	6	229677	229682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126431
4512	NC_014652	TTG	2	6	229800	229805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126431
4513	NC_014652	GTA	2	6	229866	229871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126431
4514	NC_014652	T	6	6	229926	229931	0 %	100 %	0 %	0 %	312126431
4515	NC_014652	TGT	2	6	229945	229950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126431
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4520	NC_014652	GA	3	6	230234	230239	50 %	0 %	50 %	0 %	312126431
4521	NC_014652	CAG	2	6	230288	230293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126431
4522	NC_014652	ATGA	2	8	230297	230304	50 %	25 %	25 %	0 %	312126431
4523	NC_014652	TGT	2	6	230342	230347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126431
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4527	NC_014652	GA	4	8	230464	230471	50 %	0 %	50 %	0 %	312126431
4528	NC_014652	TGAGT	2	10	230525	230534	20 %	40 %	40 %	0 %	312126431
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4532	NC_014652	TA	3	6	230669	230674	50 %	50 %	0 %	0 %	312126431
4533	NC_014652	AG	3	6	230728	230733	50 %	0 %	50 %	0 %	312126431
4534	NC_014652	GAAA	2	8	230765	230772	75 %	0 %	25 %	0 %	312126431
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4549	NC_014652	TA	3	6	231924	231929	50 %	50 %	0 %	0 %	312126432
4550	NC_014652	AAAT	2	8	232031	232038	75 %	25 %	0 %	0 %	312126432
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4554	NC_014652	CA	3	6	232422	232427	50 %	0 %	0 %	50 %	312126433
4555	NC_014652	TATT	2	8	232431	232438	25 %	75 %	0 %	0 %	312126433
4556	NC_014652	ATT	2	6	232464	232469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126433
4557	NC_014652	CA	3	6	232521	232526	50 %	0 %	0 %	50 %	312126433
4558	NC_014652	A	6	6	232536	232541	100 %	0 %	0 %	0 %	312126433
4559	NC_014652	CAT	2	6	232568	232573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126433
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4562	NC_014652	GCA	2	6	232641	232646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126433
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4564	NC_014652	GTAT	2	8	232676	232683	25 %	50 %	25 %	0 %	312126433
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4568	NC_014652	T	7	7	232935	232941	0 %	100 %	0 %	0 %	312126433
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4574	NC_014652	TAAAC	2	10	233316	233325	60 %	20 %	0 %	20 %	312126434
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4582	NC_014652	TATT	2	8	233514	233521	25 %	75 %	0 %	0 %	312126434
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4595	NC_014652	A	6	6	233946	233951	100 %	0 %	0 %	0 %	312126435
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4604	NC_014652	TAG	2	6	234569	234574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126436
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4610	NC_014652	TAAGA	2	10	234843	234852	60 %	20 %	20 %	0 %	312126436
4611	NC_014652	AATA	2	8	234867	234874	75 %	25 %	0 %	0 %	312126436
4612	NC_014652	A	6	6	234925	234930	100 %	0 %	0 %	0 %	312126436
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4615	NC_014652	AAT	2	6	235019	235024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126437
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4621	NC_014652	A	6	6	235142	235147	100 %	0 %	0 %	0 %	312126437
4622	NC_014652	TTTTTA	2	12	235194	235205	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312126437
4623	NC_014652	T	6	6	235218	235223	0 %	100 %	0 %	0 %	312126437
4624	NC_014652	AGA	2	6	235240	235245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126437
4625	NC_014652	CTGT	2	8	235281	235288	0 %	50 %	25 %	25 %	312126437
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4749	NC_014652	GAA	2	6	241861	241866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126440
4750	NC_014652	AGA	2	6	241928	241933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126440
4751	NC_014652	ACC	2	6	241982	241987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126440
4752	NC_014652	GCA	2	6	241995	242000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126440
4753	NC_014652	TGA	2	6	242023	242028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126440
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4755	NC_014652	A	6	6	242074	242079	100 %	0 %	0 %	0 %	312126440
4756	NC_014652	CAA	2	6	242089	242094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126440
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4759	NC_014652	CATCGG	2	12	242238	242249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312126441
4760	NC_014652	GAT	2	6	242251	242256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126441
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4781	NC_014652	TTC	2	6	243475	243480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126442
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4784	NC_014652	GTT	2	6	243732	243737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126442
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4786	NC_014652	AAC	2	6	243828	243833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126442
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4790	NC_014652	GAT	2	6	244083	244088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126443
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4822	NC_014652	CAAT	2	8	245782	245789	50 %	25 %	0 %	25 %	312126445
4823	NC_014652	TTG	2	6	245816	245821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126445
4824	NC_014652	CAA	2	6	245852	245857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126445
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4844	NC_014652	T	6	6	246839	246844	0 %	100 %	0 %	0 %	312126446
4845	NC_014652	CA	3	6	247005	247010	50 %	0 %	0 %	50 %	312126446
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4851	NC_014652	TGC	2	6	247344	247349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126447
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4859	NC_014652	T	6	6	247822	247827	0 %	100 %	0 %	0 %	312126447
4860	NC_014652	GTA	2	6	247852	247857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126447
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4863	NC_014652	TA	3	6	247891	247896	50 %	50 %	0 %	0 %	312126447
4864	NC_014652	GT	3	6	247898	247903	0 %	50 %	50 %	0 %	312126447
4865	NC_014652	TATCC	2	10	247909	247918	20 %	40 %	0 %	40 %	312126447
4866	NC_014652	AGA	2	6	248068	248073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126447
4867	NC_014652	CTTTT	2	10	248152	248161	0 %	80 %	0 %	20 %	312126448
4868	NC_014652	T	6	6	248184	248189	0 %	100 %	0 %	0 %	312126448
4869	NC_014652	TTA	2	6	248197	248202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126448
4870	NC_014652	AAG	2	6	248218	248223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126448
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4872	NC_014652	TCA	2	6	248372	248377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126448
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4874	NC_014652	TTG	2	6	248411	248416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126448
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4945	NC_014652	AG	3	6	251961	251966	50 %	0 %	50 %	0 %	312126450
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4981	NC_014652	AG	3	6	253488	253493	50 %	0 %	50 %	0 %	312126450
4982	NC_014652	A	6	6	253510	253515	100 %	0 %	0 %	0 %	312126450
4983	NC_014652	T	6	6	253620	253625	0 %	100 %	0 %	0 %	312126451
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4992	NC_014652	TTGTGC	2	12	253962	253973	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312126451
4993	NC_014652	TCT	2	6	253999	254004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126451
4994	NC_014652	TGG	2	6	254095	254100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126451
4995	NC_014652	TGCAA	2	10	254111	254120	40 %	20 %	20 %	20 %	312126451
4996	NC_014652	TGT	2	6	254121	254126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126451
4997	NC_014652	GCT	2	6	254147	254152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126451
4998	NC_014652	CTTTC	2	10	254200	254209	0 %	60 %	0 %	40 %	312126451
4999	NC_014652	CAG	2	6	254265	254270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126451
5000	NC_014652	CA	4	8	254463	254470	50 %	0 %	0 %	50 %	312126451

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