MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782206

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014535	TAA	2	6	1105	1110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
2	NC_014535	TAC	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
3	NC_014535	TGT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591244
4	NC_014535	AAT	2	6	1219	1224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
5	NC_014535	TAT	2	6	1365	1370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
6	NC_014535	TAA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
7	NC_014535	TAA	2	6	1424	1429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
8	NC_014535	AAT	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
9	NC_014535	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
10	NC_014535	TCA	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
11	NC_014535	TAG	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
12	NC_014535	TAA	2	6	1786	1791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
13	NC_014535	AGT	2	6	1899	1904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
14	NC_014535	TAA	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
15	NC_014535	CAT	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
16	NC_014535	GTT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591244
17	NC_014535	TAA	2	6	2143	2148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
18	NC_014535	ATT	2	6	2290	2295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
19	NC_014535	CTT	2	6	2355	2360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591244
20	NC_014535	ATA	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
21	NC_014535	CTA	2	6	2475	2480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
22	NC_014535	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
23	NC_014535	TCA	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
24	NC_014535	TCA	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
25	NC_014535	TAA	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
26	NC_014535	ATA	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
27	NC_014535	ATT	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
28	NC_014535	CTT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591244
29	NC_014535	TAG	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
30	NC_014535	TAA	2	6	3037	3042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
31	NC_014535	CCT	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307591244
32	NC_014535	ATA	2	6	3115	3120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
33	NC_014535	CAT	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
34	NC_014535	TAG	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
35	NC_014535	TAA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
36	NC_014535	TCA	2	6	3464	3469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
37	NC_014535	TAG	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
38	NC_014535	TAA	2	6	3645	3650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
39	NC_014535	TAA	2	6	3676	3681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
40	NC_014535	TAA	2	6	3844	3849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
41	NC_014535	ATC	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
42	NC_014535	ATT	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
43	NC_014535	ATT	2	6	4168	4173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
44	NC_014535	TTA	2	6	4220	4225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
45	NC_014535	AAT	2	6	4534	4539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591245
46	NC_014535	TCA	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591245
47	NC_014535	ATC	3	9	4803	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591246
48	NC_014535	ATA	2	6	4821	4826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591246
49	NC_014535	TTA	2	6	4879	4884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591246
50	NC_014535	CTA	2	6	5122	5127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591247
51	NC_014535	TAC	2	6	5179	5184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591247
52	NC_014535	ATA	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591247
53	NC_014535	CAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591247
54	NC_014535	TAG	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591247
55	NC_014535	GAA	2	6	5469	5474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591247
56	NC_014535	ATA	2	6	5494	5499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591247
57	NC_014535	ATT	2	6	5520	5525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591247
58	NC_014535	ATG	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591247
59	NC_014535	TCA	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591248
60	NC_014535	ATT	2	6	6234	6239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591248
61	NC_014535	CAT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591249
62	NC_014535	TTA	3	9	6344	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591249
63	NC_014535	GTT	2	6	6369	6374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591249
64	NC_014535	AAT	2	6	6765	6770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591249
65	NC_014535	TCA	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591249
66	NC_014535	TTA	2	6	8114	8119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591250
67	NC_014535	TTA	2	6	8132	8137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591250
68	NC_014535	ATG	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591250
69	NC_014535	TCA	2	6	8807	8812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591250
70	NC_014535	GAC	2	6	9018	9023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591251
71	NC_014535	AAT	2	6	9064	9069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591251
72	NC_014535	AAG	2	6	9119	9124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591251
73	NC_014535	ATT	2	6	9163	9168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591251
74	NC_014535	TTA	2	6	9305	9310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591251
75	NC_014535	ACA	2	6	9414	9419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591252
76	NC_014535	ATT	2	6	9451	9456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591252
77	NC_014535	ACG	2	6	9484	9489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591252
78	NC_014535	TAA	2	6	9621	9626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591252
79	NC_014535	CTA	2	6	9802	9807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591252
80	NC_014535	AAC	2	6	9944	9949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591252
81	NC_014535	AAG	2	6	10036	10041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591252
82	NC_014535	TAA	2	6	10116	10121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591252
83	NC_014535	ATT	2	6	10137	10142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591252
84	NC_014535	ACT	2	6	10174	10179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591252
85	NC_014535	GTG	2	6	10490	10495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307591253
86	NC_014535	ATA	2	6	10525	10530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
87	NC_014535	TCA	2	6	10531	10536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591253
88	NC_014535	ATA	2	6	10597	10602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
89	NC_014535	ATT	2	6	10621	10626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591253
90	NC_014535	ATT	2	6	10663	10668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591253
91	NC_014535	ACA	2	6	10713	10718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591253
92	NC_014535	ATA	2	6	10737	10742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
93	NC_014535	TAT	2	6	10874	10879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591253
94	NC_014535	ATA	2	6	10944	10949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
95	NC_014535	TGA	2	6	11010	11015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591253
96	NC_014535	ATA	2	6	11065	11070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
97	NC_014535	TTG	2	6	11121	11126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591253
98	NC_014535	ATG	2	6	11314	11319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591253
99	NC_014535	AGT	2	6	11343	11348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591253
100	NC_014535	TCA	2	6	11383	11388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591253
101	NC_014535	TCA	2	6	11401	11406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591253
102	NC_014535	ATA	2	6	11465	11470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
103	NC_014535	GTC	2	6	11549	11554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591253
104	NC_014535	ATG	2	6	11703	11708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591253
105	NC_014535	TAA	2	6	11759	11764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
106	NC_014535	ATC	2	6	11811	11816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591253
107	NC_014535	TAA	2	6	11820	11825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591253
108	NC_014535	TCT	2	6	11886	11891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591253
109	NC_014535	ATA	2	6	11926	11931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591254
110	NC_014535	TAA	2	6	11956	11961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591254
111	NC_014535	TAA	2	6	12072	12077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591254
112	NC_014535	TGC	2	6	12178	12183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591254
113	NC_014535	ATT	2	6	12259	12264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591254
114	NC_014535	AAT	2	6	12268	12273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591254
115	NC_014535	GTT	2	6	12293	12298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591254
116	NC_014535	ATT	2	6	12320	12325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591254
117	NC_014535	ATG	2	6	12377	12382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591254
118	NC_014535	ACT	2	6	12489	12494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591255
119	NC_014535	TAA	2	6	12559	12564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591255
120	NC_014535	ATG	2	6	12592	12597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591255
121	NC_014535	ATG	2	6	12604	12609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591255
122	NC_014535	AGA	2	6	12641	12646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591255
123	NC_014535	ATA	2	6	12710	12715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591255
124	NC_014535	TAA	2	6	13448	13453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591256
125	NC_014535	TTG	2	6	13462	13467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591256
126	NC_014535	TAA	3	9	13472	13480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591256
127	NC_014535	TAC	2	6	13486	13491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591256
128	NC_014535	TAA	2	6	13519	13524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591256
129	NC_014535	TAA	2	6	13551	13556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591256

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.