MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782201

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014533	TTG	2	6	236701	236706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592108
4002	NC_014533	TCT	2	6	236741	236746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592108
4003	NC_014533	ACA	2	6	236747	236752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307592108
4004	NC_014533	AAATA	2	10	236754	236763	80 %	20 %	0 %	0 %	307592108
4005	NC_014533	ATT	2	6	236824	236829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592108
4006	NC_014533	TGA	2	6	236831	236836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592108
4007	NC_014533	TTG	2	6	236873	236878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592108
4008	NC_014533	TCA	2	6	236915	236920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592108
4009	NC_014533	CGG	2	6	237042	237047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307592108
4010	NC_014533	TTG	2	6	237070	237075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592108
4011	NC_014533	TTG	2	6	237103	237108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592108
4012	NC_014533	TTG	2	6	237124	237129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592108
4013	NC_014533	CTG	2	6	237138	237143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307592108
4014	NC_014533	CTT	2	6	237153	237158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592108
4015	NC_014533	AAT	2	6	237211	237216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592108
4016	NC_014533	TAA	2	6	237225	237230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592108
4017	NC_014533	TAA	2	6	237282	237287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592108
4018	NC_014533	T	6	6	237297	237302	0 %	100 %	0 %	0 %	307592108
4019	NC_014533	TTC	2	6	237334	237339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592108
4020	NC_014533	ATG	2	6	237344	237349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592108
4021	NC_014533	GTT	2	6	237360	237365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592108
4022	NC_014533	TTG	2	6	237427	237432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592108
4023	NC_014533	GTGA	2	8	237436	237443	25 %	25 %	50 %	0 %	307592108
4024	NC_014533	GTT	2	6	237456	237461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592108
4025	NC_014533	TTG	2	6	237469	237474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592108
4026	NC_014533	TCAA	2	8	237557	237564	50 %	25 %	0 %	25 %	307592108
4027	NC_014533	AATA	2	8	237611	237618	75 %	25 %	0 %	0 %	307592108
4028	NC_014533	AAT	2	6	237660	237665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592108
4029	NC_014533	GAGT	2	8	237689	237696	25 %	25 %	50 %	0 %	307592108
4030	NC_014533	ATA	2	6	237714	237719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592108
4031	NC_014533	ATA	2	6	237767	237772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592108
4032	NC_014533	ATG	2	6	237779	237784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592108
4033	NC_014533	TCA	2	6	237837	237842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592108
4034	NC_014533	CAA	3	9	237902	237910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307592109
4035	NC_014533	AGC	2	6	237913	237918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592109
4036	NC_014533	CCA	2	6	238070	238075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307592109
4037	NC_014533	A	6	6	238075	238080	100 %	0 %	0 %	0 %	307592109
4038	NC_014533	A	7	7	238140	238146	100 %	0 %	0 %	0 %	307592109
4039	NC_014533	AGT	2	6	238815	238820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592110
4040	NC_014533	TCA	2	6	238821	238826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592110
4041	NC_014533	GTC	2	6	238837	238842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307592110
4042	NC_014533	CAG	2	6	238891	238896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592110
4043	NC_014533	TAA	2	6	238910	238915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592110
4044	NC_014533	GCC	2	6	238989	238994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307592110
4045	NC_014533	ACA	2	6	239037	239042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307592110
4046	NC_014533	A	6	6	239044	239049	100 %	0 %	0 %	0 %	307592110
4047	NC_014533	T	6	6	239130	239135	0 %	100 %	0 %	0 %	307592110
4048	NC_014533	AAC	2	6	239487	239492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307592111
4049	NC_014533	GCA	2	6	239574	239579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592111
4050	NC_014533	CCA	2	6	239734	239739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307592111
4051	NC_014533	ATTA	2	8	239828	239835	50 %	50 %	0 %	0 %	307592111
4052	NC_014533	TTG	2	6	239875	239880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592111
4053	NC_014533	GGC	2	6	239997	240002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307592111
4054	NC_014533	CAG	2	6	240004	240009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592111
4055	NC_014533	TGA	2	6	240056	240061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592111
4056	NC_014533	GAG	2	6	240095	240100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592111
4057	NC_014533	AAT	2	6	240153	240158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592111
4058	NC_014533	AAT	3	9	240234	240242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592111
4059	NC_014533	TAGAC	2	10	240248	240257	40 %	20 %	20 %	20 %	307592111
4060	NC_014533	TTA	2	6	240327	240332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592111
4061	NC_014533	ACTT	2	8	240360	240367	25 %	50 %	0 %	25 %	307592111
4062	NC_014533	CTT	2	6	240969	240974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592112
4063	NC_014533	T	7	7	240980	240986	0 %	100 %	0 %	0 %	307592112
4064	NC_014533	TCA	2	6	241140	241145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592112
4065	NC_014533	TGA	2	6	241221	241226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592112
4066	NC_014533	ATG	2	6	241302	241307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592112
4067	NC_014533	TC	3	6	241408	241413	0 %	50 %	0 %	50 %	307592112
4068	NC_014533	CAA	2	6	241430	241435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307592112
4069	NC_014533	TCA	2	6	241443	241448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592112
4070	NC_014533	TCA	2	6	241500	241505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592112
4071	NC_014533	CAG	2	6	241532	241537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592112
4072	NC_014533	TAA	2	6	241570	241575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592112
4073	NC_014533	GGA	2	6	241622	241627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592112
4074	NC_014533	GAA	2	6	241652	241657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592112
4075	NC_014533	AATACT	2	12	241661	241672	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307592112
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4078	NC_014533	GAC	2	6	241819	241824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592112
4079	NC_014533	GCA	2	6	241883	241888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592112
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4081	NC_014533	GAA	2	6	241991	241996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592112
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4083	NC_014533	AAAG	2	8	242218	242225	75 %	0 %	25 %	0 %	307592112
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4088	NC_014533	A	6	6	243126	243131	100 %	0 %	0 %	0 %	307592113
4089	NC_014533	TCC	2	6	243132	243137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307592113
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4091	NC_014533	A	6	6	243159	243164	100 %	0 %	0 %	0 %	307592113
4092	NC_014533	ATGCTA	2	12	243266	243277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307592113
4093	NC_014533	CT	3	6	243282	243287	0 %	50 %	0 %	50 %	307592113
4094	NC_014533	ATC	2	6	243294	243299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592113
4095	NC_014533	A	8	8	243305	243312	100 %	0 %	0 %	0 %	307592113
4096	NC_014533	CAC	2	6	243326	243331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307592113
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4099	NC_014533	ATC	2	6	243593	243598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592113
4100	NC_014533	GTTCTA	2	12	243784	243795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307592113
4101	NC_014533	CGA	2	6	243819	243824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592113
4102	NC_014533	TGA	2	6	243888	243893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592113
4103	NC_014533	A	6	6	243903	243908	100 %	0 %	0 %	0 %	307592113
4104	NC_014533	GGC	2	6	244058	244063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307592113
4105	NC_014533	GAG	2	6	244132	244137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592113
4106	NC_014533	CAA	2	6	244143	244148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307592113
4107	NC_014533	GCC	2	6	244209	244214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307592113
4108	NC_014533	ATTCC	2	10	244216	244225	20 %	40 %	0 %	40 %	307592113
4109	NC_014533	ATG	2	6	244238	244243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592113
4110	NC_014533	GTT	2	6	244315	244320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592113
4111	NC_014533	TG	3	6	244342	244347	0 %	50 %	50 %	0 %	307592113
4112	NC_014533	GAT	2	6	244351	244356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592113
4113	NC_014533	TTGC	2	8	244405	244412	0 %	50 %	25 %	25 %	307592113
4114	NC_014533	TAAAG	2	10	244413	244422	60 %	20 %	20 %	0 %	307592113
4115	NC_014533	CAA	2	6	244475	244480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307592113
4116	NC_014533	ATT	2	6	244495	244500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592113
4117	NC_014533	A	7	7	244512	244518	100 %	0 %	0 %	0 %	307592113
4118	NC_014533	TCA	2	6	244571	244576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592113
4119	NC_014533	GAA	2	6	244630	244635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592113
4120	NC_014533	AAT	2	6	244681	244686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592113
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4122	NC_014533	TAT	2	6	244697	244702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592113
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4250	NC_014533	CTG	2	6	251119	251124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307592116
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4253	NC_014533	ATTTA	2	10	251273	251282	40 %	60 %	0 %	0 %	307592117
4254	NC_014533	TA	3	6	251297	251302	50 %	50 %	0 %	0 %	307592117
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4365	NC_014533	A	6	6	257984	257989	100 %	0 %	0 %	0 %	307592121
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