MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782205

Total Repeats: 742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014504	GAT	2	6	50	55	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149646
2	NC_014504	T	7	7	55	61	0 %	100 %	0 %	0 %	307149646
3	NC_014504	ACAGC	2	10	62	71	40 %	0 %	20 %	40 %	307149646
4	NC_014504	CTTT	2	8	134	141	0 %	75 %	0 %	25 %	307149646
5	NC_014504	TAG	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149646
6	NC_014504	GGC	2	6	188	193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149646
7	NC_014504	CGA	2	6	306	311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149647
8	NC_014504	AGCC	2	8	315	322	25 %	0 %	25 %	50 %	307149647
9	NC_014504	ACA	2	6	881	886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149648
10	NC_014504	AGA	2	6	986	991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149648
11	NC_014504	TAC	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149648
12	NC_014504	TCA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149648
13	NC_014504	AGC	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149648
14	NC_014504	AGG	2	6	1154	1159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149648
15	NC_014504	ACA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149648
16	NC_014504	GAT	2	6	1247	1252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149648
17	NC_014504	CT	3	6	1270	1275	0 %	50 %	0 %	50 %	307149648
18	NC_014504	CCTAA	2	10	1298	1307	40 %	20 %	0 %	40 %	307149648
19	NC_014504	TGC	2	6	1366	1371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149649
20	NC_014504	CGG	2	6	1389	1394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149649
21	NC_014504	GGA	2	6	1403	1408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149649
22	NC_014504	ATT	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149649
23	NC_014504	AGC	2	6	1553	1558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149649
24	NC_014504	CAAA	2	8	1576	1583	75 %	0 %	0 %	25 %	307149649
25	NC_014504	A	6	6	1581	1586	100 %	0 %	0 %	0 %	307149649
26	NC_014504	GAA	2	6	1626	1631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149649
27	NC_014504	TAAA	2	8	1681	1688	75 %	25 %	0 %	0 %	307149649
28	NC_014504	ATT	3	9	1699	1707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149649
29	NC_014504	C	6	6	1749	1754	0 %	0 %	0 %	100 %	307149649
30	NC_014504	CATC	2	8	1833	1840	25 %	25 %	0 %	50 %	307149649
31	NC_014504	TTG	2	6	1888	1893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149649
32	NC_014504	TTTA	2	8	1967	1974	25 %	75 %	0 %	0 %	307149649
33	NC_014504	GAA	2	6	1998	2003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149649
34	NC_014504	AAAGG	2	10	2157	2166	60 %	0 %	40 %	0 %	307149649
35	NC_014504	AAG	2	6	2191	2196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149649
36	NC_014504	TCA	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149649
37	NC_014504	TAA	2	6	2257	2262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149649
38	NC_014504	TTACA	2	10	2271	2280	40 %	40 %	0 %	20 %	307149649
39	NC_014504	GGAA	2	8	2297	2304	50 %	0 %	50 %	0 %	307149649
40	NC_014504	AGA	2	6	2318	2323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149649
41	NC_014504	TGG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149649
42	NC_014504	AAC	2	6	2539	2544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149649
43	NC_014504	GAAC	2	8	2622	2629	50 %	0 %	25 %	25 %	307149649
44	NC_014504	A	7	7	2681	2687	100 %	0 %	0 %	0 %	307149649
45	NC_014504	TTAC	2	8	2770	2777	25 %	50 %	0 %	25 %	307149649
46	NC_014504	AGA	2	6	2878	2883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149649
47	NC_014504	TCA	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149649
48	NC_014504	TTA	2	6	3009	3014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149650
49	NC_014504	CAA	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149650
50	NC_014504	AAG	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149650
51	NC_014504	TC	4	8	3175	3182	0 %	50 %	0 %	50 %	307149650
52	NC_014504	T	6	6	3227	3232	0 %	100 %	0 %	0 %	307149650
53	NC_014504	A	6	6	3278	3283	100 %	0 %	0 %	0 %	307149650
54	NC_014504	GAGAAC	2	12	3284	3295	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307149650
55	NC_014504	A	6	6	3319	3324	100 %	0 %	0 %	0 %	307149650
56	NC_014504	GTC	2	6	3400	3405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149650
57	NC_014504	TC	3	6	3423	3428	0 %	50 %	0 %	50 %	307149650
58	NC_014504	AGT	2	6	3429	3434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149650
59	NC_014504	A	6	6	3456	3461	100 %	0 %	0 %	0 %	307149650
60	NC_014504	CGT	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149650
61	NC_014504	CAA	2	6	3476	3481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149650
62	NC_014504	GAA	2	6	3484	3489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149650
63	NC_014504	GCG	2	6	3502	3507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149650
64	NC_014504	T	6	6	3509	3514	0 %	100 %	0 %	0 %	307149650
65	NC_014504	AT	3	6	3546	3551	50 %	50 %	0 %	0 %	307149650
66	NC_014504	A	6	6	3581	3586	100 %	0 %	0 %	0 %	307149650
67	NC_014504	GATT	2	8	3618	3625	25 %	50 %	25 %	0 %	307149650
68	NC_014504	CTC	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149650
69	NC_014504	AGC	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149650
70	NC_014504	A	6	6	3707	3712	100 %	0 %	0 %	0 %	307149650
71	NC_014504	TGA	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149650
72	NC_014504	AGC	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149650
73	NC_014504	TAAT	2	8	3922	3929	50 %	50 %	0 %	0 %	307149650
74	NC_014504	AAT	2	6	4112	4117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149651
75	NC_014504	AGA	2	6	4126	4131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149651
76	NC_014504	TCT	2	6	4198	4203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149651
77	NC_014504	A	7	7	4281	4287	100 %	0 %	0 %	0 %	307149651
78	NC_014504	CGG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149651
79	NC_014504	TGA	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149651
80	NC_014504	TCA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149652
81	NC_014504	ATT	2	6	4512	4517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149652
82	NC_014504	CTTGT	2	10	4568	4577	0 %	60 %	20 %	20 %	307149652
83	NC_014504	ATT	2	6	4629	4634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149652
84	NC_014504	AAT	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149652
85	NC_014504	TTA	2	6	4734	4739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149652
86	NC_014504	T	8	8	4824	4831	0 %	100 %	0 %	0 %	307149652
87	NC_014504	TAA	2	6	5787	5792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149653
88	NC_014504	TCT	2	6	5861	5866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149653
89	NC_014504	TTC	2	6	5893	5898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149653
90	NC_014504	AAT	2	6	5917	5922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149653
91	NC_014504	TCA	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149653
92	NC_014504	TTGTTC	2	12	5974	5985	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307149653
93	NC_014504	ATG	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149653
94	NC_014504	TTTA	2	8	6065	6072	25 %	75 %	0 %	0 %	307149654
95	NC_014504	TCA	2	6	6123	6128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
96	NC_014504	CAA	2	6	6133	6138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149654
97	NC_014504	T	8	8	6153	6160	0 %	100 %	0 %	0 %	307149654
98	NC_014504	ATC	2	6	6168	6173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
99	NC_014504	TTC	2	6	6185	6190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149654
100	NC_014504	CTG	2	6	6233	6238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149654
101	NC_014504	CGG	2	6	6277	6282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149654
102	NC_014504	CCA	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149654
103	NC_014504	CCCAC	2	10	6336	6345	20 %	0 %	0 %	80 %	307149654
104	NC_014504	ATC	2	6	6405	6410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
105	NC_014504	GAG	2	6	6427	6432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149654
106	NC_014504	ATA	2	6	6446	6451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149654
107	NC_014504	TAT	2	6	6610	6615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149654
108	NC_014504	TCT	2	6	6705	6710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149654
109	NC_014504	CAC	2	6	6731	6736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149654
110	NC_014504	AGG	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149654
111	NC_014504	CAG	2	6	6760	6765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149654
112	NC_014504	TAA	2	6	6811	6816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149654
113	NC_014504	TCA	2	6	7098	7103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
114	NC_014504	TCA	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
115	NC_014504	ATG	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149654
116	NC_014504	TTTC	2	8	7279	7286	0 %	75 %	0 %	25 %	307149654
117	NC_014504	CTG	2	6	7339	7344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149654
118	NC_014504	TTA	2	6	7360	7365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149654
119	NC_014504	ATC	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
120	NC_014504	GTT	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149654
121	NC_014504	CAT	2	6	7547	7552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
122	NC_014504	GGC	2	6	7553	7558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149654
123	NC_014504	TCA	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
124	NC_014504	TGA	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149654
125	NC_014504	T	7	7	7686	7692	0 %	100 %	0 %	0 %	307149654
126	NC_014504	GGT	2	6	7777	7782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149654
127	NC_014504	GTATTG	2	12	7799	7810	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307149654
128	NC_014504	AAT	2	6	7811	7816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149654
129	NC_014504	CCA	2	6	7916	7921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149654
130	NC_014504	AAT	2	6	7928	7933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149654
131	NC_014504	TCT	2	6	7950	7955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149654
132	NC_014504	CTT	2	6	7990	7995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149654
133	NC_014504	GCA	2	6	8064	8069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149654
134	NC_014504	T	6	6	8117	8122	0 %	100 %	0 %	0 %	307149654
135	NC_014504	T	6	6	8137	8142	0 %	100 %	0 %	0 %	307149654
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267	NC_014504	G	6	6	14186	14191	0 %	0 %	100 %	0 %	307149658
268	NC_014504	TTC	2	6	14216	14221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149658
269	NC_014504	CTT	2	6	14239	14244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149658
270	NC_014504	TAAC	2	8	14272	14279	50 %	25 %	0 %	25 %	307149658
271	NC_014504	AGAA	2	8	14294	14301	75 %	0 %	25 %	0 %	307149658
272	NC_014504	TTC	2	6	14360	14365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149658
273	NC_014504	ATG	2	6	14367	14372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149658
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279	NC_014504	A	10	10	17493	17502	100 %	0 %	0 %	0 %	307149659
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281	NC_014504	CAA	2	6	17587	17592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149659
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300	NC_014504	G	6	6	18851	18856	0 %	0 %	100 %	0 %	307149659
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