MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782204

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014503	TATTT	2	10	975	984	20 %	80 %	0 %	0 %	307149681
2	NC_014503	ATTAT	2	10	2513	2522	40 %	60 %	0 %	0 %	307149681
3	NC_014503	AACGG	2	10	4939	4948	40 %	0 %	40 %	20 %	307149683
4	NC_014503	TTACC	2	10	5518	5527	20 %	40 %	0 %	40 %	307149683
5	NC_014503	TTGAG	2	10	12175	12184	20 %	40 %	40 %	0 %	307149685
6	NC_014503	TTGGC	2	10	14722	14731	0 %	40 %	40 %	20 %	307149688
7	NC_014503	CTTTT	2	10	15246	15255	0 %	80 %	0 %	20 %	307149688
8	NC_014503	TGCTT	2	10	24311	24320	0 %	60 %	20 %	20 %	307149692
9	NC_014503	ATTAG	2	10	24807	24816	40 %	40 %	20 %	0 %	307149692
10	NC_014503	TGTTC	2	10	27004	27013	0 %	60 %	20 %	20 %	307149692
11	NC_014503	ACAGA	2	10	28717	28726	60 %	0 %	20 %	20 %	307149695
12	NC_014503	ACAAG	2	10	30271	30280	60 %	0 %	20 %	20 %	307149697
13	NC_014503	CAGGG	2	10	34238	34247	20 %	0 %	60 %	20 %	307149700
14	NC_014503	ATTCT	2	10	36814	36823	20 %	60 %	0 %	20 %	307149701
15	NC_014503	GTAAA	2	10	38052	38061	60 %	20 %	20 %	0 %	307149702
16	NC_014503	AGTTC	2	10	41458	41467	20 %	40 %	20 %	20 %	307149705
17	NC_014503	ACAGC	2	10	41605	41614	40 %	0 %	20 %	40 %	307149705
18	NC_014503	ACTGT	2	10	43075	43084	20 %	40 %	20 %	20 %	307149705
19	NC_014503	GGCGG	2	10	43656	43665	0 %	0 %	80 %	20 %	307149705
20	NC_014503	AGGAA	2	10	44622	44631	60 %	0 %	40 %	0 %	307149705
21	NC_014503	TCTCT	2	10	44960	44969	0 %	60 %	0 %	40 %	307149706

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.