MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 4426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014502	GATT	2	8	165281	165288	25 %	50 %	25 %	0 %	307149831
2502	NC_014502	T	6	6	165465	165470	0 %	100 %	0 %	0 %	307149831
2503	NC_014502	CTA	2	6	165574	165579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149831
2504	NC_014502	TGA	2	6	165605	165610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149831
2505	NC_014502	TCA	2	6	165638	165643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149831
2506	NC_014502	GAG	2	6	165720	165725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149831
2507	NC_014502	TCA	2	6	165743	165748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149831
2508	NC_014502	TAA	2	6	165791	165796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149831
2509	NC_014502	TGA	2	6	165815	165820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149831
2510	NC_014502	TGA	2	6	165824	165829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149831
2511	NC_014502	CAT	2	6	165877	165882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149831
2512	NC_014502	AT	3	6	165897	165902	50 %	50 %	0 %	0 %	307149831
2513	NC_014502	A	6	6	165978	165983	100 %	0 %	0 %	0 %	307149831
2514	NC_014502	TAA	2	6	166625	166630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149832
2515	NC_014502	ATTT	2	8	166676	166683	25 %	75 %	0 %	0 %	307149832
2516	NC_014502	A	6	6	166697	166702	100 %	0 %	0 %	0 %	307149832
2517	NC_014502	AC	3	6	166710	166715	50 %	0 %	0 %	50 %	307149832
2518	NC_014502	ATG	2	6	166718	166723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149832
2519	NC_014502	A	6	6	166731	166736	100 %	0 %	0 %	0 %	307149832
2520	NC_014502	CATCT	2	10	166741	166750	20 %	40 %	0 %	40 %	307149832
2521	NC_014502	GAT	2	6	166753	166758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149832
2522	NC_014502	ATG	2	6	166777	166782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149832
2523	NC_014502	AGA	2	6	166803	166808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149832
2524	NC_014502	ATT	2	6	166903	166908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149832
2525	NC_014502	ATG	2	6	166910	166915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149832
2526	NC_014502	A	6	6	166961	166966	100 %	0 %	0 %	0 %	307149832
2527	NC_014502	T	6	6	166974	166979	0 %	100 %	0 %	0 %	307149832
2528	NC_014502	ATC	2	6	167009	167014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149832
2529	NC_014502	TCTA	2	8	167172	167179	25 %	50 %	0 %	25 %	307149833
2530	NC_014502	T	6	6	167186	167191	0 %	100 %	0 %	0 %	307149833
2531	NC_014502	TTG	2	6	167196	167201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149833
2532	NC_014502	GTTT	2	8	167218	167225	0 %	75 %	25 %	0 %	307149833
2533	NC_014502	TCT	2	6	167266	167271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149833
2534	NC_014502	GACT	2	8	167285	167292	25 %	25 %	25 %	25 %	307149833
2535	NC_014502	CAAT	2	8	167305	167312	50 %	25 %	0 %	25 %	307149833
2536	NC_014502	ATC	2	6	167347	167352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149833
2537	NC_014502	TAA	2	6	167405	167410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149833
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2539	NC_014502	T	7	7	167480	167486	0 %	100 %	0 %	0 %	307149833
2540	NC_014502	AAT	2	6	167494	167499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149833
2541	NC_014502	TGT	3	9	167533	167541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149833
2542	NC_014502	TTG	3	9	167586	167594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149834
2543	NC_014502	C	6	6	167639	167644	0 %	0 %	0 %	100 %	307149834
2544	NC_014502	GCT	3	9	167723	167731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149834
2545	NC_014502	GTT	2	6	167781	167786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149834
2546	NC_014502	TAA	2	6	168036	168041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149834
2547	NC_014502	TTG	2	6	168078	168083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149834
2548	NC_014502	AT	3	6	168103	168108	50 %	50 %	0 %	0 %	307149834
2549	NC_014502	CCG	2	6	168140	168145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149834
2550	NC_014502	ACA	2	6	168232	168237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149834
2551	NC_014502	TCA	3	9	168322	168330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149834
2552	NC_014502	GT	3	6	168398	168403	0 %	50 %	50 %	0 %	307149834
2553	NC_014502	CAT	2	6	168536	168541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149834
2554	NC_014502	TCT	3	9	168617	168625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149834
2555	NC_014502	AT	3	6	168686	168691	50 %	50 %	0 %	0 %	307149834
2556	NC_014502	ATT	2	6	168777	168782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149834
2557	NC_014502	TTG	2	6	168789	168794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149834
2558	NC_014502	TCC	2	6	168825	168830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149834
2559	NC_014502	T	7	7	168875	168881	0 %	100 %	0 %	0 %	307149834
2560	NC_014502	TAT	2	6	168908	168913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149834
2561	NC_014502	TCT	2	6	168938	168943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149834
2562	NC_014502	AAT	2	6	168947	168952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149834
2563	NC_014502	TGT	2	6	168973	168978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149834
2564	NC_014502	GGA	2	6	169018	169023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149834
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2566	NC_014502	CTT	2	6	169067	169072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149834
2567	NC_014502	ATCT	2	8	169128	169135	25 %	50 %	0 %	25 %	307149834
2568	NC_014502	GATT	2	8	169233	169240	25 %	50 %	25 %	0 %	307149834
2569	NC_014502	GTT	2	6	169241	169246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149834
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2571	NC_014502	ATA	2	6	169320	169325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149834
2572	NC_014502	TA	3	6	169419	169424	50 %	50 %	0 %	0 %	307149834
2573	NC_014502	CCA	2	6	169427	169432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149834
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2579	NC_014502	ATG	2	6	169705	169710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149834
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2582	NC_014502	TTC	2	6	169918	169923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149834
2583	NC_014502	CCT	2	6	169978	169983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149834
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2587	NC_014502	AAT	2	6	170149	170154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149834
2588	NC_014502	CAG	2	6	170210	170215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149834
2589	NC_014502	TGA	2	6	170281	170286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149834
2590	NC_014502	GTTA	2	8	170379	170386	25 %	50 %	25 %	0 %	307149834
2591	NC_014502	GCC	2	6	170389	170394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149834
2592	NC_014502	TGA	2	6	170420	170425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149834
2593	NC_014502	GA	3	6	170445	170450	50 %	0 %	50 %	0 %	307149834
2594	NC_014502	TTTA	2	8	170460	170467	25 %	75 %	0 %	0 %	307149834
2595	NC_014502	TAT	2	6	170468	170473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149834
2596	NC_014502	GGTG	2	8	170478	170485	0 %	25 %	75 %	0 %	307149834
2597	NC_014502	CAG	2	6	170540	170545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149834
2598	NC_014502	ATT	2	6	170556	170561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149834
2599	NC_014502	TAT	2	6	170588	170593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149834
2600	NC_014502	ATTT	2	8	170649	170656	25 %	75 %	0 %	0 %	307149834
2601	NC_014502	TTC	2	6	170673	170678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149834
2602	NC_014502	ATT	2	6	170784	170789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149834
2603	NC_014502	T	7	7	170845	170851	0 %	100 %	0 %	0 %	307149834
2604	NC_014502	GAT	3	9	170854	170862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149834
2605	NC_014502	TAT	2	6	170885	170890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149834
2606	NC_014502	TGA	2	6	170997	171002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149834
2607	NC_014502	TAA	2	6	171003	171008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149834
2608	NC_014502	TG	3	6	171016	171021	0 %	50 %	50 %	0 %	307149834
2609	NC_014502	GTTG	2	8	171026	171033	0 %	50 %	50 %	0 %	307149834
2610	NC_014502	GCA	2	6	171043	171048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149834
2611	NC_014502	TTTA	2	8	171051	171058	25 %	75 %	0 %	0 %	307149834
2612	NC_014502	GGC	2	6	171177	171182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149834
2613	NC_014502	ATCC	2	8	171194	171201	25 %	25 %	0 %	50 %	307149834
2614	NC_014502	TGA	2	6	171218	171223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149834
2615	NC_014502	GTC	2	6	171230	171235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149834
2616	NC_014502	GAT	2	6	171251	171256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149834
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2618	NC_014502	TTGATT	2	12	171409	171420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307149834
2619	NC_014502	TGG	2	6	171482	171487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149834
2620	NC_014502	ATG	2	6	171521	171526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149834
2621	NC_014502	CAA	2	6	171533	171538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149834
2622	NC_014502	GAC	2	6	171564	171569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149834
2623	NC_014502	TCC	3	9	171675	171683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149834
2624	NC_014502	GGT	2	6	171720	171725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149834
2625	NC_014502	CGT	2	6	171741	171746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149834
2626	NC_014502	GTT	2	6	171750	171755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149834
2627	NC_014502	TCA	2	6	171838	171843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149834
2628	NC_014502	G	6	6	171945	171950	0 %	0 %	100 %	0 %	307149834
2629	NC_014502	TATTG	2	10	171956	171965	20 %	60 %	20 %	0 %	307149834
2630	NC_014502	GTC	2	6	172330	172335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149834
2631	NC_014502	TGA	2	6	172345	172350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149834
2632	NC_014502	TCA	2	6	172369	172374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149834
2633	NC_014502	GTA	2	6	172480	172485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149834
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2636	NC_014502	GAAA	2	8	172613	172620	75 %	0 %	25 %	0 %	307149834
2637	NC_014502	ACGG	2	8	172637	172644	25 %	0 %	50 %	25 %	307149834
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2639	NC_014502	CTG	2	6	172749	172754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149834
2640	NC_014502	TCTA	2	8	172812	172819	25 %	50 %	0 %	25 %	307149834
2641	NC_014502	TCA	2	6	172891	172896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149834
2642	NC_014502	TGT	2	6	172981	172986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149834
2643	NC_014502	TA	3	6	172988	172993	50 %	50 %	0 %	0 %	307149834
2644	NC_014502	GTC	2	6	173143	173148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149834
2645	NC_014502	TTG	2	6	173155	173160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149834
2646	NC_014502	ATAA	2	8	173185	173192	75 %	25 %	0 %	0 %	307149834
2647	NC_014502	TGC	2	6	173280	173285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149834
2648	NC_014502	ATCC	2	8	173343	173350	25 %	25 %	0 %	50 %	307149834
2649	NC_014502	T	6	6	173420	173425	0 %	100 %	0 %	0 %	307149834
2650	NC_014502	TTCCC	2	10	173454	173463	0 %	40 %	0 %	60 %	307149834
2651	NC_014502	TTG	2	6	173478	173483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149834
2652	NC_014502	GTG	2	6	173539	173544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149834
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2654	NC_014502	TCCT	2	8	173646	173653	0 %	50 %	0 %	50 %	307149834
2655	NC_014502	TCG	2	6	173666	173671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149834
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2657	NC_014502	TCG	2	6	173725	173730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149834
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2662	NC_014502	TCA	2	6	173965	173970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149834
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2664	NC_014502	TTC	2	6	173994	173999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149834
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2691	NC_014502	AGCAT	2	10	175668	175677	40 %	20 %	20 %	20 %	307149836
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2699	NC_014502	TA	3	6	176114	176119	50 %	50 %	0 %	0 %	307149837
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2739	NC_014502	AGT	2	6	177811	177816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149840
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2745	NC_014502	T	6	6	177892	177897	0 %	100 %	0 %	0 %	307149840
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2991	NC_014502	TCA	2	6	192390	192395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149860
2992	NC_014502	TCT	2	6	192519	192524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149860
2993	NC_014502	TAA	2	6	192563	192568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149860
2994	NC_014502	TCT	2	6	192582	192587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149860
2995	NC_014502	T	7	7	192587	192593	0 %	100 %	0 %	0 %	307149860
2996	NC_014502	A	6	6	192699	192704	100 %	0 %	0 %	0 %	307149860
2997	NC_014502	TTA	2	6	192744	192749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149860
2998	NC_014502	TTTTTA	2	12	192778	192789	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307149861
2999	NC_014502	TCA	2	6	192800	192805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149861
3000	NC_014502	AAT	2	6	192844	192849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149861

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