MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 4426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014502	ATT	2	6	29591	29596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149735
502	NC_014502	AAT	2	6	29700	29705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149735
503	NC_014502	CT	3	6	29714	29719	0 %	50 %	0 %	50 %	307149735
504	NC_014502	GTT	2	6	29746	29751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149735
505	NC_014502	AGTC	2	8	29776	29783	25 %	25 %	25 %	25 %	307149735
506	NC_014502	ATT	2	6	29825	29830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149735
507	NC_014502	TTC	2	6	29831	29836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149735
508	NC_014502	ACTG	2	8	30002	30009	25 %	25 %	25 %	25 %	307149736
509	NC_014502	AAG	2	6	30012	30017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149736
510	NC_014502	TTC	2	6	30081	30086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149736
511	NC_014502	CTT	3	9	30126	30134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149736
512	NC_014502	CCGA	2	8	30141	30148	25 %	0 %	25 %	50 %	307149736
513	NC_014502	CTC	2	6	30194	30199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149737
514	NC_014502	GGGGAA	2	12	30252	30263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149737
515	NC_014502	A	6	6	30262	30267	100 %	0 %	0 %	0 %	307149737
516	NC_014502	CCA	2	6	30294	30299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149737
517	NC_014502	TGT	2	6	30350	30355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149737
518	NC_014502	T	6	6	30378	30383	0 %	100 %	0 %	0 %	307149737
519	NC_014502	TCTT	2	8	30433	30440	0 %	75 %	0 %	25 %	307149737
520	NC_014502	GT	4	8	30450	30457	0 %	50 %	50 %	0 %	307149737
521	NC_014502	ATC	2	6	30612	30617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149737
522	NC_014502	GA	4	8	30659	30666	50 %	0 %	50 %	0 %	307149737
523	NC_014502	ACA	2	6	30808	30813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149737
524	NC_014502	CAG	2	6	30815	30820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149737
525	NC_014502	AGC	2	6	30828	30833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149737
526	NC_014502	TGT	2	6	30859	30864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149737
527	NC_014502	TG	3	6	30877	30882	0 %	50 %	50 %	0 %	307149737
528	NC_014502	ATTG	2	8	30918	30925	25 %	50 %	25 %	0 %	307149737
529	NC_014502	GAG	2	6	30949	30954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149737
530	NC_014502	AATAC	2	10	30986	30995	60 %	20 %	0 %	20 %	307149737
531	NC_014502	TAT	2	6	31050	31055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149737
532	NC_014502	ATC	2	6	31075	31080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149737
533	NC_014502	TGG	2	6	31120	31125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149738
534	NC_014502	T	6	6	31133	31138	0 %	100 %	0 %	0 %	307149738
535	NC_014502	AGA	3	9	31226	31234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149738
536	NC_014502	TA	3	6	31302	31307	50 %	50 %	0 %	0 %	307149738
537	NC_014502	AGC	2	6	31519	31524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149739
538	NC_014502	T	6	6	31532	31537	0 %	100 %	0 %	0 %	307149739
539	NC_014502	CAG	2	6	31587	31592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149739
540	NC_014502	TCT	2	6	31649	31654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149739
541	NC_014502	ATA	2	6	31714	31719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149739
542	NC_014502	ATG	2	6	31778	31783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149739
543	NC_014502	A	6	6	31813	31818	100 %	0 %	0 %	0 %	307149739
544	NC_014502	AGC	2	6	31930	31935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149739
545	NC_014502	TGTTT	2	10	32092	32101	0 %	80 %	20 %	0 %	307149740
546	NC_014502	CG	3	6	32120	32125	0 %	0 %	50 %	50 %	307149740
547	NC_014502	AT	3	6	32223	32228	50 %	50 %	0 %	0 %	307149740
548	NC_014502	GAA	2	6	32457	32462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149740
549	NC_014502	TCAGG	2	10	32463	32472	20 %	20 %	40 %	20 %	307149740
550	NC_014502	CGTAA	2	10	32481	32490	40 %	20 %	20 %	20 %	307149740
551	NC_014502	AGT	2	6	32519	32524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149740
552	NC_014502	CAA	2	6	32553	32558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149740
553	NC_014502	CCA	2	6	32575	32580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149740
554	NC_014502	GCG	2	6	32604	32609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149740
555	NC_014502	TAA	2	6	32620	32625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149740
556	NC_014502	CGC	2	6	32635	32640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149740
557	NC_014502	T	7	7	32676	32682	0 %	100 %	0 %	0 %	307149740
558	NC_014502	TCA	2	6	32717	32722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149740
559	NC_014502	TTGA	2	8	32737	32744	25 %	50 %	25 %	0 %	307149740
560	NC_014502	TAG	2	6	32867	32872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149741
561	NC_014502	TGG	2	6	32873	32878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149741
562	NC_014502	TA	3	6	33151	33156	50 %	50 %	0 %	0 %	307149741
563	NC_014502	AT	3	6	33226	33231	50 %	50 %	0 %	0 %	307149741
564	NC_014502	TCA	2	6	33277	33282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149741
565	NC_014502	TTC	2	6	33321	33326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149741
566	NC_014502	CGA	2	6	33356	33361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149741
567	NC_014502	CCAG	2	8	33381	33388	25 %	0 %	25 %	50 %	307149741
568	NC_014502	AAT	2	6	33464	33469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149741
569	NC_014502	ATTA	2	8	33483	33490	50 %	50 %	0 %	0 %	307149741
570	NC_014502	TTGT	2	8	33570	33577	0 %	75 %	25 %	0 %	307149741
571	NC_014502	TGATG	2	10	33657	33666	20 %	40 %	40 %	0 %	307149741
572	NC_014502	CCAG	2	8	33785	33792	25 %	0 %	25 %	50 %	307149742
573	NC_014502	TTTCTG	2	12	33821	33832	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307149742
574	NC_014502	CCAT	2	8	33876	33883	25 %	25 %	0 %	50 %	307149742
575	NC_014502	AATT	2	8	33899	33906	50 %	50 %	0 %	0 %	307149742
576	NC_014502	AAT	2	6	34058	34063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149742
577	NC_014502	AGTT	2	8	34070	34077	25 %	50 %	25 %	0 %	307149742
578	NC_014502	T	7	7	34180	34186	0 %	100 %	0 %	0 %	307149742
579	NC_014502	ATT	2	6	34307	34312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149742
580	NC_014502	CT	3	6	34328	34333	0 %	50 %	0 %	50 %	307149743
581	NC_014502	CTT	2	6	34360	34365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149743
582	NC_014502	TTA	2	6	34445	34450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149743
583	NC_014502	ACCGCC	2	12	34597	34608	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	307149743
584	NC_014502	AATTA	2	10	34666	34675	60 %	40 %	0 %	0 %	307149743
585	NC_014502	GTC	2	6	34721	34726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149743
586	NC_014502	TTG	3	9	34742	34750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149744
587	NC_014502	A	7	7	34762	34768	100 %	0 %	0 %	0 %	307149744
588	NC_014502	CGT	2	6	34780	34785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149744
589	NC_014502	AGA	2	6	34894	34899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149744
590	NC_014502	AAT	2	6	34921	34926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149744
591	NC_014502	TTC	2	6	34931	34936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149744
592	NC_014502	ACA	2	6	35110	35115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149745
593	NC_014502	T	6	6	35147	35152	0 %	100 %	0 %	0 %	307149745
594	NC_014502	CGA	2	6	35153	35158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149745
595	NC_014502	GTA	2	6	35259	35264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149745
596	NC_014502	AAT	2	6	35265	35270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149745
597	NC_014502	TGC	2	6	35284	35289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149745
598	NC_014502	C	6	6	35344	35349	0 %	0 %	0 %	100 %	307149745
599	NC_014502	GCA	2	6	35590	35595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149746
600	NC_014502	GAC	2	6	35748	35753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149746
601	NC_014502	CAG	2	6	35761	35766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149746
602	NC_014502	GTC	3	9	35840	35848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149746
603	NC_014502	TGT	2	6	35954	35959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149746
604	NC_014502	TGAT	2	8	35968	35975	25 %	50 %	25 %	0 %	307149746
605	NC_014502	GGCT	2	8	36328	36335	0 %	25 %	50 %	25 %	307149747
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607	NC_014502	GCC	2	6	36350	36355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149747
608	NC_014502	ATT	2	6	36442	36447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149747
609	NC_014502	GGA	2	6	36478	36483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149747
610	NC_014502	GAA	2	6	36853	36858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149748
611	NC_014502	TGA	2	6	37004	37009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149748
612	NC_014502	GAA	2	6	37027	37032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149748
613	NC_014502	GGCT	2	8	37067	37074	0 %	25 %	50 %	25 %	307149748
614	NC_014502	CAG	2	6	37097	37102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149748
615	NC_014502	ATAG	2	8	37108	37115	50 %	25 %	25 %	0 %	307149748
616	NC_014502	AGA	2	6	37194	37199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149748
617	NC_014502	ATT	2	6	37205	37210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149748
618	NC_014502	ATC	2	6	37234	37239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149748
619	NC_014502	TAT	2	6	37283	37288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149748
620	NC_014502	AAC	2	6	37408	37413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149748
621	NC_014502	ATT	2	6	37571	37576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149748
622	NC_014502	CGA	2	6	37632	37637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149748
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624	NC_014502	CT	3	6	37739	37744	0 %	50 %	0 %	50 %	307149748
625	NC_014502	GGC	2	6	37862	37867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149748
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627	NC_014502	ATT	2	6	37990	37995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149748
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629	NC_014502	TGA	2	6	38223	38228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149748
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