MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 105775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014501	AAGC	2	8	231052	231059	50 %	0 %	25 %	25 %	307150149
4002	NC_014501	AGG	2	6	231149	231154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150149
4003	NC_014501	AAG	2	6	231199	231204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150149
4004	NC_014501	TAA	2	6	231209	231214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150149
4005	NC_014501	CAT	2	6	231242	231247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150149
4006	NC_014501	TGA	2	6	231307	231312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150149
4007	NC_014501	CTC	2	6	231409	231414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150149
4008	NC_014501	CTA	2	6	231419	231424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150149
4009	NC_014501	AAG	2	6	231439	231444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150149
4010	NC_014501	CTAA	2	8	231516	231523	50 %	25 %	0 %	25 %	307150150
4011	NC_014501	CTC	2	6	231635	231640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150150
4012	NC_014501	A	6	6	231652	231657	100 %	0 %	0 %	0 %	307150150
4013	NC_014501	A	6	6	231723	231728	100 %	0 %	0 %	0 %	307150150
4014	NC_014501	ATA	2	6	231730	231735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150150
4015	NC_014501	GTT	2	6	231744	231749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150150
4016	NC_014501	AAG	2	6	231940	231945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150150
4017	NC_014501	GGA	2	6	232032	232037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150150
4018	NC_014501	GGA	2	6	232080	232085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150150
4019	NC_014501	TTA	2	6	232089	232094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150150
4020	NC_014501	GGA	2	6	232253	232258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150150
4021	NC_014501	CAA	2	6	232311	232316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150150
4022	NC_014501	TAA	2	6	232363	232368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150150
4023	NC_014501	AAG	2	6	232375	232380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150150
4024	NC_014501	CGG	2	6	232402	232407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150150
4025	NC_014501	CAA	2	6	232533	232538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150150
4026	NC_014501	GTTT	2	8	232576	232583	0 %	75 %	25 %	0 %	307150150
4027	NC_014501	GAA	3	9	232590	232598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150150
4028	NC_014501	TTTG	2	8	232614	232621	0 %	75 %	25 %	0 %	307150150
4029	NC_014501	TTG	2	6	232659	232664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150150
4030	NC_014501	GGA	2	6	232770	232775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150150
4031	NC_014501	GCG	2	6	232780	232785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150150
4032	NC_014501	TC	3	6	232799	232804	0 %	50 %	0 %	50 %	307150150
4033	NC_014501	ATG	2	6	232852	232857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150150
4034	NC_014501	TTTAG	2	10	232890	232899	20 %	60 %	20 %	0 %	307150150
4035	NC_014501	TAA	2	6	232931	232936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150150
4036	NC_014501	CTC	3	9	232975	232983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150150
4037	NC_014501	ATTT	2	8	233024	233031	25 %	75 %	0 %	0 %	307150150
4038	NC_014501	CCGC	2	8	233040	233047	0 %	0 %	25 %	75 %	307150150
4039	NC_014501	TTAT	2	8	233071	233078	25 %	75 %	0 %	0 %	307150150
4040	NC_014501	TAAA	2	8	233098	233105	75 %	25 %	0 %	0 %	307150150
4041	NC_014501	GGCTT	2	10	233181	233190	0 %	40 %	40 %	20 %	307150150
4042	NC_014501	ACTCA	2	10	233244	233253	40 %	20 %	0 %	40 %	307150150
4043	NC_014501	TAGA	2	8	233305	233312	50 %	25 %	25 %	0 %	307150150
4044	NC_014501	ATCA	2	8	233338	233345	50 %	25 %	0 %	25 %	307150150
4045	NC_014501	AT	3	6	233365	233370	50 %	50 %	0 %	0 %	307150150
4046	NC_014501	AAT	2	6	233463	233468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150150
4047	NC_014501	AT	3	6	233496	233501	50 %	50 %	0 %	0 %	307150150
4048	NC_014501	CAA	2	6	233505	233510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150150
4049	NC_014501	AAT	2	6	233769	233774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150150
4050	NC_014501	A	7	7	233815	233821	100 %	0 %	0 %	0 %	307150150
4051	NC_014501	ATT	2	6	233839	233844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150150
4052	NC_014501	ATT	2	6	233944	233949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150150
4053	NC_014501	ACA	2	6	233966	233971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150150
4054	NC_014501	AAT	2	6	233973	233978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150150
4055	NC_014501	GAG	2	6	233998	234003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150150
4056	NC_014501	GCC	2	6	234159	234164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150150
4057	NC_014501	A	6	6	234244	234249	100 %	0 %	0 %	0 %	307150150
4058	NC_014501	T	6	6	234265	234270	0 %	100 %	0 %	0 %	307150151
4059	NC_014501	ATA	2	6	234272	234277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150151
4060	NC_014501	CTT	2	6	234285	234290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150151
4061	NC_014501	TTC	2	6	234319	234324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150151
4062	NC_014501	CCA	2	6	234358	234363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307150151
4063	NC_014501	ACA	2	6	234373	234378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150151
4064	NC_014501	TCT	2	6	234440	234445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150151
4065	NC_014501	GGC	2	6	234481	234486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150151
4066	NC_014501	TGA	2	6	234560	234565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150151
4067	NC_014501	CCG	2	6	234582	234587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150151
4068	NC_014501	TTG	2	6	234592	234597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150151
4069	NC_014501	CAT	2	6	234633	234638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150151
4070	NC_014501	GAT	2	6	234664	234669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150151
4071	NC_014501	GCA	2	6	234811	234816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150152
4072	NC_014501	GTA	2	6	234817	234822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150152
4073	NC_014501	AAC	2	6	234861	234866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150152
4074	NC_014501	GTT	2	6	234871	234876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150152
4075	NC_014501	AAG	2	6	234877	234882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150152
4076	NC_014501	ATG	2	6	234914	234919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150152
4077	NC_014501	TGA	2	6	234953	234958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150152
4078	NC_014501	TAAC	2	8	234998	235005	50 %	25 %	0 %	25 %	307150152
4079	NC_014501	CCG	2	6	235080	235085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150152
4080	NC_014501	GGC	2	6	235113	235118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150152
4081	NC_014501	TAC	2	6	235225	235230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150153
4082	NC_014501	TCA	2	6	235245	235250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150153
4083	NC_014501	ATA	2	6	235414	235419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150153
4084	NC_014501	CACTT	2	10	235558	235567	20 %	40 %	0 %	40 %	307150154
4085	NC_014501	T	6	6	235645	235650	0 %	100 %	0 %	0 %	307150154
4086	NC_014501	TTC	2	6	235791	235796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150154
4087	NC_014501	ATA	2	6	235812	235817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150154
4088	NC_014501	AAC	2	6	235851	235856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150154
4089	NC_014501	GGC	2	6	235884	235889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150154
4090	NC_014501	CAA	2	6	235925	235930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150154
4091	NC_014501	ATA	2	6	235968	235973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150154
4092	NC_014501	TTA	2	6	235997	236002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150154
4093	NC_014501	GAAG	2	8	236069	236076	50 %	0 %	50 %	0 %	307150154
4094	NC_014501	ACCC	2	8	236114	236121	25 %	0 %	0 %	75 %	307150154
4095	NC_014501	AGA	2	6	236128	236133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150154
4096	NC_014501	ATT	2	6	236171	236176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150154
4097	NC_014501	TTTA	2	8	236191	236198	25 %	75 %	0 %	0 %	307150154
4098	NC_014501	AAG	2	6	236213	236218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150154
4099	NC_014501	TCA	2	6	236233	236238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150154
4100	NC_014501	ACA	3	9	236239	236247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150154
4101	NC_014501	TAAT	2	8	236265	236272	50 %	50 %	0 %	0 %	307150154
4102	NC_014501	AAC	2	6	236402	236407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150154
4103	NC_014501	CAT	2	6	236420	236425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150154
4104	NC_014501	ATC	2	6	236436	236441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150154
4105	NC_014501	CAT	2	6	236444	236449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150154
4106	NC_014501	ATA	2	6	236518	236523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150154
4107	NC_014501	TCG	2	6	236952	236957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150155
4108	NC_014501	GGC	2	6	236962	236967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150155
4109	NC_014501	GAG	2	6	236990	236995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150155
4110	NC_014501	GGA	2	6	237136	237141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150156
4111	NC_014501	CAAA	2	8	237224	237231	75 %	0 %	0 %	25 %	307150156
4112	NC_014501	CTT	2	6	237320	237325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150156
4113	NC_014501	TAA	2	6	237378	237383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150156
4114	NC_014501	TCA	2	6	237427	237432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150156
4115	NC_014501	CAT	2	6	237534	237539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150156
4116	NC_014501	GGC	2	6	237573	237578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150156
4117	NC_014501	TCT	2	6	237595	237600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150156
4118	NC_014501	TTG	2	6	237642	237647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150156
4119	NC_014501	GGC	2	6	237684	237689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150156
4120	NC_014501	AC	3	6	237882	237887	50 %	0 %	0 %	50 %	307150156
4121	NC_014501	TGA	2	6	238259	238264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150157
4122	NC_014501	CAG	2	6	238267	238272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150157
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4124	NC_014501	CAGC	2	8	238338	238345	25 %	0 %	25 %	50 %	307150157
4125	NC_014501	TCA	2	6	238423	238428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150157
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4143	NC_014501	CGG	2	6	239614	239619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150158
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4233	NC_014501	CT	3	6	244591	244596	0 %	50 %	0 %	50 %	307150162
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4241	NC_014501	A	6	6	244949	244954	100 %	0 %	0 %	0 %	307150162
4242	NC_014501	TTGG	2	8	245055	245062	0 %	50 %	50 %	0 %	307150162
4243	NC_014501	ATG	2	6	245064	245069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150162
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4370	NC_014501	CAA	2	6	253123	253128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150169
4371	NC_014501	GCG	2	6	253199	253204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150169
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4373	NC_014501	GGGGA	2	10	253221	253230	20 %	0 %	80 %	0 %	307150169
4374	NC_014501	ATA	2	6	253242	253247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150169
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4485	NC_014501	GGC	2	6	259163	259168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150174
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4490	NC_014501	ATC	2	6	259263	259268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150174
4491	NC_014501	CAA	2	6	259278	259283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150174
4492	NC_014501	CAA	2	6	259305	259310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150174
4493	NC_014501	GCA	2	6	259323	259328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150174
4494	NC_014501	GCAA	2	8	259367	259374	50 %	0 %	25 %	25 %	307150174
4495	NC_014501	TCA	2	6	259379	259384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150174
4496	NC_014501	CTC	2	6	259386	259391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150174
4497	NC_014501	GAA	2	6	259431	259436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150174
4498	NC_014501	TTAT	2	8	259440	259447	25 %	75 %	0 %	0 %	307150174
4499	NC_014501	TAT	2	6	259471	259476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150174
4500	NC_014501	CAA	2	6	259515	259520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150174

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