MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 105775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014501	TCC	2	6	175865	175870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150100
3002	NC_014501	ATT	2	6	175924	175929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3003	NC_014501	ATG	2	6	175936	175941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150100
3004	NC_014501	TTAT	2	8	175971	175978	25 %	75 %	0 %	0 %	307150100
3005	NC_014501	AAT	2	6	175980	175985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150100
3006	NC_014501	TTA	2	6	175990	175995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3007	NC_014501	TCA	2	6	176065	176070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150100
3008	NC_014501	AT	3	6	176243	176248	50 %	50 %	0 %	0 %	307150100
3009	NC_014501	T	6	6	176309	176314	0 %	100 %	0 %	0 %	307150100
3010	NC_014501	GAT	2	6	176367	176372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150100
3011	NC_014501	GTG	2	6	176524	176529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150100
3012	NC_014501	TTA	2	6	176544	176549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3013	NC_014501	TTG	2	6	176556	176561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150100
3014	NC_014501	AAT	2	6	176616	176621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150100
3015	NC_014501	T	6	6	176701	176706	0 %	100 %	0 %	0 %	307150100
3016	NC_014501	TCC	2	6	176726	176731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150100
3017	NC_014501	AGA	2	6	176744	176749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150100
3018	NC_014501	A	6	6	176758	176763	100 %	0 %	0 %	0 %	307150100
3019	NC_014501	GAGT	2	8	176836	176843	25 %	25 %	50 %	0 %	307150100
3020	NC_014501	TTA	2	6	176856	176861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3021	NC_014501	ATT	2	6	176873	176878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3022	NC_014501	CTT	2	6	176879	176884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150100
3023	NC_014501	ACCT	2	8	176891	176898	25 %	25 %	0 %	50 %	307150100
3024	NC_014501	GAT	2	6	176927	176932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150100
3025	NC_014501	TTG	2	6	176937	176942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150100
3026	NC_014501	AAG	2	6	176956	176961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150100
3027	NC_014501	AGG	2	6	177035	177040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150100
3028	NC_014501	T	6	6	177081	177086	0 %	100 %	0 %	0 %	307150100
3029	NC_014501	AT	3	6	177191	177196	50 %	50 %	0 %	0 %	307150100
3030	NC_014501	CAA	2	6	177267	177272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150100
3031	NC_014501	AGAT	2	8	177314	177321	50 %	25 %	25 %	0 %	307150100
3032	NC_014501	TTA	2	6	177339	177344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3033	NC_014501	ATT	2	6	177402	177407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3034	NC_014501	CTT	2	6	177484	177489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150100
3035	NC_014501	AAG	2	6	177529	177534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150100
3036	NC_014501	AG	3	6	177549	177554	50 %	0 %	50 %	0 %	307150100
3037	NC_014501	ATT	2	6	177596	177601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3038	NC_014501	TGC	2	6	177622	177627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150100
3039	NC_014501	TTA	2	6	177633	177638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3040	NC_014501	TTA	2	6	177729	177734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3041	NC_014501	CGG	2	6	177763	177768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150100
3042	NC_014501	AAT	2	6	177792	177797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150100
3043	NC_014501	ATT	2	6	177825	177830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3044	NC_014501	T	6	6	177829	177834	0 %	100 %	0 %	0 %	307150100
3045	NC_014501	AGTT	2	8	177871	177878	25 %	50 %	25 %	0 %	307150100
3046	NC_014501	TAG	2	6	177925	177930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150100
3047	NC_014501	TGA	2	6	177965	177970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150100
3048	NC_014501	TAA	2	6	178010	178015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150100
3049	NC_014501	TTA	2	6	178062	178067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3050	NC_014501	TAT	2	6	178076	178081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150100
3051	NC_014501	TTAT	3	12	178078	178089	25 %	75 %	0 %	0 %	307150100
3052	NC_014501	TGT	2	6	178360	178365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150101
3053	NC_014501	CAT	2	6	178367	178372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150101
3054	NC_014501	CAAC	2	8	178416	178423	50 %	0 %	0 %	50 %	307150101
3055	NC_014501	TGA	2	6	178428	178433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150101
3056	NC_014501	GTC	2	6	178434	178439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150101
3057	NC_014501	GGA	2	6	178493	178498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150101
3058	NC_014501	CAAC	2	8	178512	178519	50 %	0 %	0 %	50 %	307150101
3059	NC_014501	GCG	2	6	178654	178659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150101
3060	NC_014501	CAA	2	6	178667	178672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150101
3061	NC_014501	GGC	2	6	178673	178678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150101
3062	NC_014501	ATG	2	6	178713	178718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150101
3063	NC_014501	ATT	2	6	178892	178897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150101
3064	NC_014501	CAA	2	6	179036	179041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150101
3065	NC_014501	CGG	2	6	179059	179064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150101
3066	NC_014501	AT	3	6	179074	179079	50 %	50 %	0 %	0 %	307150101
3067	NC_014501	G	6	6	179147	179152	0 %	0 %	100 %	0 %	307150101
3068	NC_014501	TTA	2	6	179423	179428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150102
3069	NC_014501	GAT	2	6	179477	179482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150102
3070	NC_014501	A	6	6	179530	179535	100 %	0 %	0 %	0 %	307150102
3071	NC_014501	TAA	2	6	179648	179653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150102
3072	NC_014501	CAT	2	6	179665	179670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150102
3073	NC_014501	GGT	2	6	179672	179677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150102
3074	NC_014501	TCC	2	6	179699	179704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150102
3075	NC_014501	TTG	2	6	179765	179770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150102
3076	NC_014501	TTG	2	6	179816	179821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150102
3077	NC_014501	CACT	2	8	180079	180086	25 %	25 %	0 %	50 %	307150103
3078	NC_014501	CTT	2	6	180203	180208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150103
3079	NC_014501	AAAAT	2	10	180243	180252	80 %	20 %	0 %	0 %	307150103
3080	NC_014501	TGG	2	6	180296	180301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150103
3081	NC_014501	TCT	2	6	180310	180315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150103
3082	NC_014501	TTC	2	6	180506	180511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150104
3083	NC_014501	TCA	2	6	180554	180559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150104
3084	NC_014501	TTA	2	6	180669	180674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150104
3085	NC_014501	TGG	2	6	180694	180699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150104
3086	NC_014501	GA	4	8	180715	180722	50 %	0 %	50 %	0 %	307150104
3087	NC_014501	TTA	2	6	180723	180728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150104
3088	NC_014501	CTG	2	6	180819	180824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150104
3089	NC_014501	AGA	2	6	180920	180925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150104
3090	NC_014501	ATT	2	6	180937	180942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150104
3091	NC_014501	TCA	2	6	180995	181000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150104
3092	NC_014501	ATC	2	6	181051	181056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150104
3093	NC_014501	AAC	2	6	181087	181092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150104
3094	NC_014501	GAC	2	6	181101	181106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150104
3095	NC_014501	CTG	2	6	181125	181130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150104
3096	NC_014501	TGA	2	6	181142	181147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150104
3097	NC_014501	TTTAC	2	10	181233	181242	20 %	60 %	0 %	20 %	307150104
3098	NC_014501	TAG	2	6	181244	181249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150104
3099	NC_014501	GCA	2	6	181286	181291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150104
3100	NC_014501	GGA	2	6	181311	181316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150104
3101	NC_014501	CTA	2	6	181339	181344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150104
3102	NC_014501	ATTAGG	2	12	181358	181369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150104
3103	NC_014501	GCA	2	6	181402	181407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150104
3104	NC_014501	TTA	2	6	181414	181419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150104
3105	NC_014501	AGA	2	6	181544	181549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150104
3106	NC_014501	GCC	2	6	181584	181589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150104
3107	NC_014501	ATT	2	6	181700	181705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150104
3108	NC_014501	TAG	2	6	181747	181752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150104
3109	NC_014501	TTA	2	6	181766	181771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150104
3110	NC_014501	A	6	6	181779	181784	100 %	0 %	0 %	0 %	307150104
3111	NC_014501	TTTA	2	8	181801	181808	25 %	75 %	0 %	0 %	307150104
3112	NC_014501	TACC	2	8	181810	181817	25 %	25 %	0 %	50 %	307150104
3113	NC_014501	TTA	2	6	181878	181883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150104
3114	NC_014501	AATT	2	8	181949	181956	50 %	50 %	0 %	0 %	307150104
3115	NC_014501	GGTT	2	8	181968	181975	0 %	50 %	50 %	0 %	307150104
3116	NC_014501	TTG	2	6	182228	182233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150105
3117	NC_014501	CAA	2	6	182283	182288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150105
3118	NC_014501	AAG	2	6	182346	182351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150105
3119	NC_014501	T	6	6	182377	182382	0 %	100 %	0 %	0 %	307150105
3120	NC_014501	TGG	2	6	182434	182439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150105
3121	NC_014501	GTG	2	6	182502	182507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150105
3122	NC_014501	CAAA	2	8	182548	182555	75 %	0 %	0 %	25 %	307150105
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3245	NC_014501	ATC	2	6	189167	189172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150110
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3344	NC_014501	AG	3	6	194790	194795	50 %	0 %	50 %	0 %	307150116
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3347	NC_014501	AGAA	2	8	194924	194931	75 %	0 %	25 %	0 %	307150116
3348	NC_014501	TTC	2	6	194974	194979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150116
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3350	NC_014501	GGC	2	6	195069	195074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150117
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3352	NC_014501	GGT	2	6	195101	195106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150117
3353	NC_014501	GCG	3	9	195113	195121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150117
3354	NC_014501	GGGTT	2	10	195152	195161	0 %	40 %	60 %	0 %	307150117
3355	NC_014501	AAT	2	6	195176	195181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150117
3356	NC_014501	ATC	2	6	195191	195196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150117
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3360	NC_014501	TTAA	2	8	195543	195550	50 %	50 %	0 %	0 %	307150117
3361	NC_014501	CTG	2	6	195625	195630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150117
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3364	NC_014501	GCG	2	6	195719	195724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150117
3365	NC_014501	GA	3	6	195740	195745	50 %	0 %	50 %	0 %	307150117
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3489	NC_014501	GTA	2	6	201235	201240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150121
3490	NC_014501	TTA	2	6	201299	201304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150121
3491	NC_014501	GTAGAG	2	12	201754	201765	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307150122
3492	NC_014501	ATTTT	2	10	201896	201905	20 %	80 %	0 %	0 %	307150122
3493	NC_014501	GTA	2	6	201982	201987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150122
3494	NC_014501	ATT	2	6	202152	202157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150122
3495	NC_014501	T	6	6	202203	202208	0 %	100 %	0 %	0 %	307150122
3496	NC_014501	TGA	2	6	202227	202232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150122
3497	NC_014501	A	6	6	202238	202243	100 %	0 %	0 %	0 %	307150122
3498	NC_014501	AGT	2	6	202438	202443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150122
3499	NC_014501	GAT	2	6	202476	202481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150122
3500	NC_014501	C	6	6	202888	202893	0 %	0 %	0 %	100 %	307150123

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