MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 105775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014501	CTA	2	6	31325	31330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149971
502	NC_014501	TTG	2	6	31384	31389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149971
503	NC_014501	A	6	6	31472	31477	100 %	0 %	0 %	0 %	307149971
504	NC_014501	GCG	2	6	31486	31491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149971
505	NC_014501	GTGTAA	2	12	31552	31563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149971
506	NC_014501	TTC	2	6	31564	31569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149971
507	NC_014501	GCA	2	6	31631	31636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149971
508	NC_014501	A	8	8	31664	31671	100 %	0 %	0 %	0 %	307149971
509	NC_014501	GAT	2	6	31743	31748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149971
510	NC_014501	GCC	2	6	31840	31845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149972
511	NC_014501	TGT	2	6	31967	31972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149972
512	NC_014501	CTC	2	6	32292	32297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149972
513	NC_014501	CTC	2	6	32412	32417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149972
514	NC_014501	CTG	2	6	32473	32478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149972
515	NC_014501	GTT	2	6	32582	32587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149972
516	NC_014501	G	6	6	32868	32873	0 %	0 %	100 %	0 %	307149973
517	NC_014501	GGC	2	6	32880	32885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149973
518	NC_014501	CTT	2	6	32898	32903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149973
519	NC_014501	TTTAA	2	10	32921	32930	40 %	60 %	0 %	0 %	307149973
520	NC_014501	T	6	6	32950	32955	0 %	100 %	0 %	0 %	307149973
521	NC_014501	T	6	6	33052	33057	0 %	100 %	0 %	0 %	307149973
522	NC_014501	TGA	3	9	33082	33090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149973
523	NC_014501	A	8	8	33096	33103	100 %	0 %	0 %	0 %	307149973
524	NC_014501	TC	3	6	33104	33109	0 %	50 %	0 %	50 %	307149973
525	NC_014501	CCT	2	6	33146	33151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149973
526	NC_014501	T	7	7	33166	33172	0 %	100 %	0 %	0 %	307149973
527	NC_014501	A	6	6	33173	33178	100 %	0 %	0 %	0 %	307149973
528	NC_014501	GAG	2	6	33203	33208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149973
529	NC_014501	T	6	6	33211	33216	0 %	100 %	0 %	0 %	307149973
530	NC_014501	T	6	6	33231	33236	0 %	100 %	0 %	0 %	307149973
531	NC_014501	AAC	2	6	33312	33317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149973
532	NC_014501	GTT	2	6	33324	33329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149973
533	NC_014501	AGG	2	6	33417	33422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149973
534	NC_014501	TTG	2	6	33476	33481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149973
535	NC_014501	TAG	2	6	33501	33506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149973
536	NC_014501	ATT	2	6	33591	33596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149973
537	NC_014501	CTT	2	6	33600	33605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149973
538	NC_014501	CTA	2	6	33690	33695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149973
539	NC_014501	GTTT	2	8	33725	33732	0 %	75 %	25 %	0 %	307149973
540	NC_014501	GGTG	2	8	33766	33773	0 %	25 %	75 %	0 %	307149973
541	NC_014501	GAT	3	9	33812	33820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149973
542	NC_014501	T	6	6	33823	33828	0 %	100 %	0 %	0 %	307149973
543	NC_014501	GCA	2	6	33850	33855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149973
544	NC_014501	A	6	6	33879	33884	100 %	0 %	0 %	0 %	307149973
545	NC_014501	TTA	2	6	34020	34025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149973
546	NC_014501	GCC	2	6	34124	34129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149973
547	NC_014501	ATT	2	6	34234	34239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149973
548	NC_014501	TAG	2	6	34257	34262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149973
549	NC_014501	CG	3	6	34304	34309	0 %	0 %	50 %	50 %	307149973
550	NC_014501	AATT	2	8	34342	34349	50 %	50 %	0 %	0 %	307149973
551	NC_014501	GA	3	6	34383	34388	50 %	0 %	50 %	0 %	307149973
552	NC_014501	GGT	2	6	34411	34416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149973
553	NC_014501	GAA	2	6	34442	34447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149973
554	NC_014501	TAA	2	6	34453	34458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149973
555	NC_014501	AAT	2	6	34466	34471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149973
556	NC_014501	GAT	2	6	34592	34597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149973
557	NC_014501	AG	3	6	34715	34720	50 %	0 %	50 %	0 %	307149973
558	NC_014501	CAT	2	6	34757	34762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149973
559	NC_014501	GA	3	6	34769	34774	50 %	0 %	50 %	0 %	307149973
560	NC_014501	A	7	7	34774	34780	100 %	0 %	0 %	0 %	307149973
561	NC_014501	GGT	2	6	34885	34890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149973
562	NC_014501	T	6	6	35063	35068	0 %	100 %	0 %	0 %	307149973
563	NC_014501	ATT	2	6	35180	35185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149973
564	NC_014501	AATG	2	8	35209	35216	50 %	25 %	25 %	0 %	307149973
565	NC_014501	AGC	2	6	35290	35295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149973
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570	NC_014501	TGAT	2	8	35589	35596	25 %	50 %	25 %	0 %	307149973
571	NC_014501	CCG	2	6	35621	35626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149973
572	NC_014501	TC	5	10	35635	35644	0 %	50 %	0 %	50 %	307149973
573	NC_014501	GGA	2	6	35651	35656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149973
574	NC_014501	TGG	2	6	35705	35710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149973
575	NC_014501	AGA	2	6	35806	35811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149973
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577	NC_014501	A	6	6	35837	35842	100 %	0 %	0 %	0 %	307149973
578	NC_014501	ACAG	2	8	35854	35861	50 %	0 %	25 %	25 %	307149973
579	NC_014501	ATT	2	6	36199	36204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149974
580	NC_014501	ATT	2	6	36209	36214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149974
581	NC_014501	ACTCA	2	10	36281	36290	40 %	20 %	0 %	40 %	307149974
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583	NC_014501	A	7	7	36300	36306	100 %	0 %	0 %	0 %	307149974
584	NC_014501	CAA	2	6	36311	36316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149974
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589	NC_014501	ATG	2	6	37086	37091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149975
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592	NC_014501	TTA	2	6	37313	37318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149975
593	NC_014501	AAG	2	6	37335	37340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149975
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595	NC_014501	AATT	2	8	37596	37603	50 %	50 %	0 %	0 %	307149975
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597	NC_014501	ATT	2	6	37646	37651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149975
598	NC_014501	CAC	2	6	37705	37710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149975
599	NC_014501	TGA	2	6	37735	37740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149975
600	NC_014501	AGTG	2	8	37805	37812	25 %	25 %	50 %	0 %	307149975
601	NC_014501	TTA	2	6	37817	37822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149975
602	NC_014501	TGA	2	6	37843	37848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149975
603	NC_014501	CAA	2	6	37880	37885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149975
604	NC_014501	TAC	2	6	37965	37970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149975
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607	NC_014501	AAAC	2	8	38066	38073	75 %	0 %	0 %	25 %	307149975
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610	NC_014501	TCG	2	6	38127	38132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149975
611	NC_014501	TTA	2	6	38158	38163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149975
612	NC_014501	ACA	2	6	38179	38184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149975
613	NC_014501	GGC	2	6	38194	38199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149975
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616	NC_014501	GCG	2	6	38325	38330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149975
617	NC_014501	AAT	2	6	38408	38413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149975
618	NC_014501	GGTT	2	8	38414	38421	0 %	50 %	50 %	0 %	307149975
619	NC_014501	GAA	2	6	38555	38560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149975
620	NC_014501	GAT	2	6	38647	38652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149975
621	NC_014501	ATG	2	6	38678	38683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149975
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623	NC_014501	TAT	2	6	38725	38730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149975
624	NC_014501	CAT	2	6	38762	38767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149975
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626	NC_014501	TTCT	2	8	38953	38960	0 %	75 %	0 %	25 %	307149976
627	NC_014501	TAT	2	6	39001	39006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149976
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629	NC_014501	TAA	2	6	39065	39070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149976
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