MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 105775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014501	TGC	2	6	290227	290232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150201
5002	NC_014501	GGC	2	6	290253	290258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150201
5003	NC_014501	TTGT	2	8	290259	290266	0 %	75 %	25 %	0 %	307150201
5004	NC_014501	TCTG	2	8	290271	290278	0 %	50 %	25 %	25 %	307150201
5005	NC_014501	TG	3	6	290277	290282	0 %	50 %	50 %	0 %	307150201
5006	NC_014501	ACT	2	6	290448	290453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150201
5007	NC_014501	AAT	2	6	290648	290653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150202
5008	NC_014501	AGAA	2	8	290686	290693	75 %	0 %	25 %	0 %	307150202
5009	NC_014501	AGA	2	6	290695	290700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150202
5010	NC_014501	T	7	7	290746	290752	0 %	100 %	0 %	0 %	307150202
5011	NC_014501	ACC	2	6	290792	290797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307150202
5012	NC_014501	ATT	2	6	290839	290844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150202
5013	NC_014501	GTC	2	6	290871	290876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150202
5014	NC_014501	CTG	2	6	290922	290927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150202
5015	NC_014501	CGG	2	6	290986	290991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150202
5016	NC_014501	CGAG	2	8	291002	291009	25 %	0 %	50 %	25 %	307150202
5017	NC_014501	GGA	2	6	291023	291028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150202
5018	NC_014501	T	7	7	291076	291082	0 %	100 %	0 %	0 %	307150202
5019	NC_014501	ATG	2	6	291123	291128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150202
5020	NC_014501	ATG	2	6	291176	291181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150202
5021	NC_014501	A	7	7	291242	291248	100 %	0 %	0 %	0 %	307150202
5022	NC_014501	CAT	2	6	291257	291262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150202
5023	NC_014501	AAG	2	6	291270	291275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150202
5024	NC_014501	ATTT	2	8	291328	291335	25 %	75 %	0 %	0 %	307150202
5025	NC_014501	GAA	2	6	291380	291385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150202
5026	NC_014501	A	6	6	291464	291469	100 %	0 %	0 %	0 %	307150202
5027	NC_014501	GAA	2	6	291506	291511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150202
5028	NC_014501	TGA	3	9	291516	291524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150202
5029	NC_014501	TTA	2	6	291559	291564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150202
5030	NC_014501	GCG	2	6	291574	291579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150202
5031	NC_014501	TTG	2	6	291638	291643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150202
5032	NC_014501	TAG	2	6	291673	291678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150202
5033	NC_014501	GAA	2	6	291782	291787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150202
5034	NC_014501	TTC	2	6	291807	291812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150202
5035	NC_014501	A	6	6	291817	291822	100 %	0 %	0 %	0 %	307150202
5036	NC_014501	A	6	6	291888	291893	100 %	0 %	0 %	0 %	307150202
5037	NC_014501	GAG	2	6	291932	291937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150202
5038	NC_014501	ATTGA	2	10	291941	291950	40 %	40 %	20 %	0 %	307150202
5039	NC_014501	T	7	7	291964	291970	0 %	100 %	0 %	0 %	307150202
5040	NC_014501	TGA	2	6	291973	291978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150202
5041	NC_014501	CAA	2	6	291986	291991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150202
5042	NC_014501	TCA	2	6	291994	291999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150202
5043	NC_014501	TG	4	8	292064	292071	0 %	50 %	50 %	0 %	307150202
5044	NC_014501	CTT	2	6	292549	292554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150203
5045	NC_014501	TCA	2	6	292641	292646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150203
5046	NC_014501	CAC	2	6	292685	292690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307150203
5047	NC_014501	CAC	2	6	292841	292846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307150203
5048	NC_014501	CGG	2	6	292903	292908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150203
5049	NC_014501	GAG	2	6	292981	292986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150203
5050	NC_014501	TAATCC	2	12	293003	293014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150203
5051	NC_014501	GA	3	6	293036	293041	50 %	0 %	50 %	0 %	307150203
5052	NC_014501	TGT	2	6	293139	293144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150203
5053	NC_014501	TGC	2	6	293223	293228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150203
5054	NC_014501	GCG	2	6	293244	293249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150203
5055	NC_014501	TTG	2	6	293354	293359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150203
5056	NC_014501	CAG	2	6	293410	293415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150203
5057	NC_014501	GCA	2	6	293448	293453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150203
5058	NC_014501	GTT	2	6	293727	293732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150203
5059	NC_014501	CCT	2	6	293962	293967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150204
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5061	NC_014501	TG	3	6	294270	294275	0 %	50 %	50 %	0 %	307150204
5062	NC_014501	A	6	6	294288	294293	100 %	0 %	0 %	0 %	307150204
5063	NC_014501	AAG	2	6	294310	294315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150204
5064	NC_014501	AGT	2	6	294354	294359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150204
5065	NC_014501	A	7	7	294778	294784	100 %	0 %	0 %	0 %	307150205
5066	NC_014501	CAG	2	6	294893	294898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150205
5067	NC_014501	GA	3	6	294924	294929	50 %	0 %	50 %	0 %	307150205
5068	NC_014501	G	6	6	294982	294987	0 %	0 %	100 %	0 %	307150205
5069	NC_014501	ATG	2	6	295056	295061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150205
5070	NC_014501	AAC	2	6	295143	295148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150205
5071	NC_014501	AATA	2	8	295199	295206	75 %	25 %	0 %	0 %	307150205
5072	NC_014501	GTC	2	6	295676	295681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150206
5073	NC_014501	CCG	2	6	295715	295720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150206
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5076	NC_014501	TTG	2	6	295816	295821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150206
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5078	NC_014501	AATT	2	8	295885	295892	50 %	50 %	0 %	0 %	307150206
5079	NC_014501	A	6	6	295950	295955	100 %	0 %	0 %	0 %	307150206
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5081	NC_014501	A	6	6	296119	296124	100 %	0 %	0 %	0 %	307150206
5082	NC_014501	CTT	2	6	296148	296153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150206
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5087	NC_014501	GCC	2	6	296430	296435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150206
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5091	NC_014501	AG	3	6	296670	296675	50 %	0 %	50 %	0 %	307150206
5092	NC_014501	TAA	2	6	296689	296694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150206
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5103	NC_014501	A	6	6	297537	297542	100 %	0 %	0 %	0 %	307150207
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5106	NC_014501	AG	3	6	297832	297837	50 %	0 %	50 %	0 %	307150207
5107	NC_014501	TATGTT	2	12	297887	297898	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307150207
5108	NC_014501	GTCT	2	8	298008	298015	0 %	50 %	25 %	25 %	307150207
5109	NC_014501	TAAT	2	8	298718	298725	50 %	50 %	0 %	0 %	307150208
5110	NC_014501	TCTT	2	8	298766	298773	0 %	75 %	0 %	25 %	307150208
5111	NC_014501	TTTGT	2	10	298837	298846	0 %	80 %	20 %	0 %	307150208
5112	NC_014501	TC	3	6	298879	298884	0 %	50 %	0 %	50 %	307150208
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5116	NC_014501	T	6	6	298998	299003	0 %	100 %	0 %	0 %	307150208
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5119	NC_014501	TTGT	2	8	299125	299132	0 %	75 %	25 %	0 %	307150208
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5123	NC_014501	GTT	2	6	299562	299567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150208
5124	NC_014501	T	6	6	299651	299656	0 %	100 %	0 %	0 %	307150208
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5128	NC_014501	CT	3	6	299865	299870	0 %	50 %	0 %	50 %	307150208
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5233	NC_014501	GTCC	2	8	308191	308198	0 %	25 %	25 %	50 %	307150218
5234	NC_014501	ATAA	2	8	308251	308258	75 %	25 %	0 %	0 %	307150218
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5237	NC_014501	TTTG	2	8	308547	308554	0 %	75 %	25 %	0 %	307150219
5238	NC_014501	CGA	2	6	308561	308566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150219
5239	NC_014501	TC	3	6	308570	308575	0 %	50 %	0 %	50 %	307150219
5240	NC_014501	AG	3	6	308726	308731	50 %	0 %	50 %	0 %	307150219
5241	NC_014501	CTG	3	9	308760	308768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150219
5242	NC_014501	CTG	2	6	308802	308807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150219
5243	NC_014501	GGC	2	6	308852	308857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150219
5244	NC_014501	TCA	2	6	309222	309227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150220
5245	NC_014501	T	7	7	309268	309274	0 %	100 %	0 %	0 %	307150220
5246	NC_014501	GAT	2	6	309324	309329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150220
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5248	NC_014501	T	7	7	309444	309450	0 %	100 %	0 %	0 %	307150220
5249	NC_014501	GTTT	2	8	309555	309562	0 %	75 %	25 %	0 %	307150220
5250	NC_014501	ATTCC	2	10	309592	309601	20 %	40 %	0 %	40 %	307150220
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5253	NC_014501	AACT	2	8	309749	309756	50 %	25 %	0 %	25 %	307150220
5254	NC_014501	A	9	9	309894	309902	100 %	0 %	0 %	0 %	307150221
5255	NC_014501	AATT	2	8	309913	309920	50 %	50 %	0 %	0 %	307150221
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5261	NC_014501	TTC	2	6	310197	310202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150221
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5359	NC_014501	A	6	6	316216	316221	100 %	0 %	0 %	0 %	307150229
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5363	NC_014501	A	7	7	316527	316533	100 %	0 %	0 %	0 %	307150229
5364	NC_014501	GAA	2	6	316557	316562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150229
5365	NC_014501	GGC	2	6	316563	316568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150229
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5367	NC_014501	TCG	3	9	316781	316789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150229
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5489	NC_014501	TTAA	2	8	322552	322559	50 %	50 %	0 %	0 %	307150235
5490	NC_014501	GCCACC	2	12	322570	322581	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	307150235
5491	NC_014501	ACC	2	6	322612	322617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307150235
5492	NC_014501	CGGGC	2	10	322691	322700	0 %	0 %	60 %	40 %	307150235
5493	NC_014501	AAG	2	6	322766	322771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150235
5494	NC_014501	TTA	2	6	322882	322887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150235
5495	NC_014501	ATT	2	6	322945	322950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150235
5496	NC_014501	A	7	7	323023	323029	100 %	0 %	0 %	0 %	307150235
5497	NC_014501	AGA	2	6	323046	323051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150235
5498	NC_014501	A	6	6	323097	323102	100 %	0 %	0 %	0 %	307150235
5499	NC_014501	CGC	2	6	323271	323276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150235
5500	NC_014501	A	6	6	323390	323395	100 %	0 %	0 %	0 %	307150235

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