MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Zinderia insecticola CARI chromosome

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014497	TAAATA	2	12	978	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
2	NC_014497	TTTATT	2	12	2136	2147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069506
3	NC_014497	ACTAAT	2	12	2518	2529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307069506
4	NC_014497	TAAATT	2	12	3327	3338	50 %	50 %	0 %	0 %	307069506
5	NC_014497	AATAAA	2	12	3481	3492	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069506
6	NC_014497	TAATAT	2	12	3857	3868	50 %	50 %	0 %	0 %	307069507
7	NC_014497	TAAATA	2	12	4972	4983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069508
8	NC_014497	TATTGA	2	12	10365	10376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307069510
9	NC_014497	TTAAAA	2	12	10878	10889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069511
10	NC_014497	ATATTT	2	12	11580	11591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069511
11	NC_014497	TAAAAA	2	12	15602	15613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069512
12	NC_014497	AATTTT	2	12	16269	16280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069513
13	NC_014497	TAATAT	2	12	16382	16393	50 %	50 %	0 %	0 %	307069513
14	NC_014497	TAAAAA	2	12	18120	18131	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069515
15	NC_014497	AAATTT	2	12	18359	18370	50 %	50 %	0 %	0 %	307069516
16	NC_014497	AAAATA	2	12	19009	19020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069516
17	NC_014497	TTAATT	2	12	19186	19197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069516
18	NC_014497	TAATTA	2	12	19265	19276	50 %	50 %	0 %	0 %	307069516
19	NC_014497	TAAATA	2	12	19372	19383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069516
20	NC_014497	TTTTAT	2	12	19401	19412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069516
21	NC_014497	ATTTAA	2	12	20258	20269	50 %	50 %	0 %	0 %	307069518
22	NC_014497	TAAAAA	2	12	20363	20374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069518
23	NC_014497	TAAATA	2	12	20615	20626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069518
24	NC_014497	TAAAAA	2	12	20834	20845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069518
25	NC_014497	TAAAAT	2	12	21271	21282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069519
26	NC_014497	TAGAAT	2	12	21703	21714	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307069519
27	NC_014497	AAATTA	2	12	24310	24321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069522
28	NC_014497	TTATAT	2	12	25033	25044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069523
29	NC_014497	AAATTT	2	12	25110	25121	50 %	50 %	0 %	0 %	307069523
30	NC_014497	ATATTA	2	12	25314	25325	50 %	50 %	0 %	0 %	307069523
31	NC_014497	TTTTTA	2	12	25614	25625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069523
32	NC_014497	ATTTTT	3	18	26130	26147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069523
33	NC_014497	ATTTTT	2	12	26838	26849	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069523
34	NC_014497	ATATTT	2	12	27493	27504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069524
35	NC_014497	TTTTTA	2	12	27898	27909	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069524
36	NC_014497	AATTTA	2	12	29620	29631	50 %	50 %	0 %	0 %	307069528
37	NC_014497	TAAAAT	2	12	29869	29880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069528
38	NC_014497	TAAAAA	2	12	31629	31640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069529
39	NC_014497	AATAAA	2	12	32531	32542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069531
40	NC_014497	TATTAA	2	12	34567	34578	50 %	50 %	0 %	0 %	307069532
41	NC_014497	TATAAA	2	12	36157	36168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069534
42	NC_014497	TCATAT	2	12	37462	37473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307069534
43	NC_014497	AAAATT	2	12	38475	38486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069535
44	NC_014497	AATATT	2	12	38775	38786	50 %	50 %	0 %	0 %	307069535
45	NC_014497	ATTATA	2	12	38839	38850	50 %	50 %	0 %	0 %	307069535
46	NC_014497	ATTTTT	2	12	39459	39470	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069536
47	NC_014497	TTTTTA	2	12	39775	39786	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069536
48	NC_014497	ATTTTT	2	12	39924	39935	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069536
49	NC_014497	AGATAA	2	12	40185	40196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307069536
50	NC_014497	TAAATT	2	12	41112	41123	50 %	50 %	0 %	0 %	307069536
51	NC_014497	ATATTT	2	12	41458	41469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069536
52	NC_014497	TTTTTA	2	12	41621	41632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069536
53	NC_014497	ATATTT	2	12	41980	41991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069536
54	NC_014497	ATAAAA	2	12	43391	43402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069537
55	NC_014497	TATAAA	2	12	43506	43517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069537
56	NC_014497	CTACTC	2	12	44100	44111	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307069538
57	NC_014497	TAAAAA	2	12	46217	46228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069542
58	NC_014497	TTATAA	2	12	46742	46753	50 %	50 %	0 %	0 %	307069542
59	NC_014497	ATATTT	2	12	46998	47009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069542
60	NC_014497	TAAAAA	2	12	47273	47284	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069542
61	NC_014497	TAAAAA	2	12	48704	48715	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069542
62	NC_014497	AAAATT	2	12	49014	49025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069542
63	NC_014497	AATTTA	2	12	49327	49338	50 %	50 %	0 %	0 %	307069542
64	NC_014497	TAAAGT	2	12	50168	50179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307069543
65	NC_014497	AAAATT	2	12	50966	50977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069543
66	NC_014497	ATATAA	2	12	51912	51923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069544
67	NC_014497	GTTATG	2	12	52542	52553	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307069544
68	NC_014497	AACTAA	2	12	53635	53646	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307069544
69	NC_014497	CTGGTA	2	12	53913	53924	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307069544
70	NC_014497	GAAATT	2	12	54234	54245	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307069545
71	NC_014497	ATAAAA	2	12	54996	55007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069545
72	NC_014497	TAAATA	2	12	55450	55461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069545
73	NC_014497	TAATAT	2	12	56370	56381	50 %	50 %	0 %	0 %	307069546
74	NC_014497	TTTTAA	2	12	59934	59945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069548
75	NC_014497	ATTTTT	2	12	60178	60189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069548
76	NC_014497	AATTAA	2	12	60598	60609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069549
77	NC_014497	TATTAA	2	12	61767	61778	50 %	50 %	0 %	0 %	307069551
78	NC_014497	TTTTAA	2	12	63078	63089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069553
79	NC_014497	TTTATA	2	12	63218	63229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069553
80	NC_014497	AATAAA	2	12	63605	63616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069554
81	NC_014497	TTTTAA	2	12	64426	64437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069556
82	NC_014497	ATAAAA	2	12	64466	64477	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069556
83	NC_014497	TAAAAT	2	12	65152	65163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069557
84	NC_014497	AAATTT	2	12	66672	66683	50 %	50 %	0 %	0 %	307069558
85	NC_014497	ATTTAA	2	12	68263	68274	50 %	50 %	0 %	0 %	307069559
86	NC_014497	AATTAA	2	12	70339	70350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069560
87	NC_014497	ACTAGG	2	12	70505	70516	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307069560
88	NC_014497	TAAAAA	2	12	71400	71411	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069561
89	NC_014497	CTAAAA	2	12	71555	71566	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307069561
90	NC_014497	TTAAAT	2	12	71599	71610	50 %	50 %	0 %	0 %	307069561
91	NC_014497	TATTTT	2	12	72130	72141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069561
92	NC_014497	TAAATT	2	12	72540	72551	50 %	50 %	0 %	0 %	307069562
93	NC_014497	TTTATA	2	12	72568	72579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069562
94	NC_014497	TTTATA	2	12	73281	73292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069563
95	NC_014497	ATTTAT	2	12	75735	75746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069565
96	NC_014497	ATATTT	2	12	76393	76404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069565
97	NC_014497	ATTTTT	2	12	78244	78255	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069567
98	NC_014497	ATAAAA	2	12	78709	78720	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069568
99	NC_014497	AAATAA	2	12	78988	78999	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069568
100	NC_014497	ATTAGG	2	12	79630	79641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069569
101	NC_014497	CTGGTG	2	12	79980	79991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	307069569
102	NC_014497	AAATAA	2	12	80424	80435	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069569
103	NC_014497	ATAAAT	2	12	81122	81133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069570
104	NC_014497	TAAAAA	2	12	81363	81374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069570
105	NC_014497	TTAATT	2	12	81468	81479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069570
106	NC_014497	TTATAA	2	12	82656	82667	50 %	50 %	0 %	0 %	307069573
107	NC_014497	TAAAAA	2	12	82785	82796	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069573
108	NC_014497	TATTAA	2	12	86196	86207	50 %	50 %	0 %	0 %	307069577
109	NC_014497	ATTTTT	2	12	86636	86647	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069577
110	NC_014497	AATTTT	2	12	86963	86974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069578
111	NC_014497	AATATT	2	12	87349	87360	50 %	50 %	0 %	0 %	307069578
112	NC_014497	ATTTTA	2	12	87435	87446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069578
113	NC_014497	ATATAG	2	12	88622	88633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307069579
114	NC_014497	ATATTT	2	12	88882	88893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069579
115	NC_014497	TAAATT	2	12	88922	88933	50 %	50 %	0 %	0 %	307069579
116	NC_014497	TAAAAA	2	12	89701	89712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069581
117	NC_014497	TAAAAA	2	12	90306	90317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069582
118	NC_014497	AATTTT	2	12	90892	90903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069582
119	NC_014497	ATTTAT	2	12	90921	90932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069582
120	NC_014497	ATTTAA	2	12	91143	91154	50 %	50 %	0 %	0 %	307069582
121	NC_014497	ATAAAA	2	12	91352	91363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069582
122	NC_014497	AATTAA	2	12	91520	91531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069582
123	NC_014497	ATTTAA	2	12	91730	91741	50 %	50 %	0 %	0 %	307069583
124	NC_014497	TAAAAT	2	12	92812	92823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069583
125	NC_014497	ATATAA	2	12	92884	92895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069583
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.