MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium cellulovorans 743B chromosome

Total Repeats: 2097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014393	GATGAA	2	12	2078	2089	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302872924
2	NC_014393	TGCAAT	2	12	2143	2154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302872924
3	NC_014393	GATGGT	2	12	7117	7128	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302872929
4	NC_014393	TGCATT	2	12	16243	16254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302872931
5	NC_014393	GATATA	2	12	17686	17697	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302872932
6	NC_014393	TTAATG	2	12	23026	23037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302872936
7	NC_014393	TTATTT	2	12	25536	25547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302872938
8	NC_014393	ATATTT	2	12	26091	26102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302872938
9	NC_014393	GGTATA	2	12	26706	26717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302872938
10	NC_014393	AGATGA	2	12	28518	28529	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302872939
11	NC_014393	CAGTAA	2	12	30543	30554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302872941
12	NC_014393	TAATGG	2	12	32145	32156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302872942
13	NC_014393	AAAACA	2	12	33466	33477	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	302872942
14	NC_014393	TCAGGC	2	12	33913	33924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302872942
15	NC_014393	TCATTA	2	12	34120	34131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302872942
16	NC_014393	GATACT	2	12	36805	36816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302872942
17	NC_014393	AGCTAC	2	12	36942	36953	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302872942
18	NC_014393	AAAGAA	2	12	38709	38720	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302872943
19	NC_014393	TAACTT	2	12	41259	41270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302872943
20	NC_014393	TTCAGG	2	12	42010	42021	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302872943
21	NC_014393	GATGGA	2	12	42068	42079	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302872943
22	NC_014393	TTAATT	2	12	47815	47826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302872945
23	NC_014393	TTTAAT	2	12	49053	49064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302872945
24	NC_014393	AAGTCC	2	12	52768	52779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302872947
25	NC_014393	ATTACT	2	12	52814	52825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302872947
26	NC_014393	ATGGGG	2	12	53816	53827	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	302872948
27	NC_014393	ATGAAA	2	12	54498	54509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302872948
28	NC_014393	ATTTTG	2	12	57186	57197	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302872950
29	NC_014393	AAAAAT	2	12	57262	57273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	302872950
30	NC_014393	AGATAT	2	12	60913	60924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302872952
31	NC_014393	CTTAAA	2	12	62196	62207	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302872952
32	NC_014393	AATGAA	2	12	62470	62481	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302872952
33	NC_014393	AGAGGT	2	12	67171	67182	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302872955
34	NC_014393	GATGTA	2	12	67381	67392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302872955
35	NC_014393	TAGAAT	2	12	68780	68791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302872955
36	NC_014393	CAGAAG	2	12	69303	69314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302872956
37	NC_014393	TATAAT	2	12	70054	70065	50 %	50 %	0 %	0 %	302872956
38	NC_014393	AAATTA	2	12	70650	70661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302872956
39	NC_014393	AGATGA	2	12	71234	71245	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302872957
40	NC_014393	ATCTTA	2	12	71308	71319	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302872957
41	NC_014393	ATGGTG	2	12	73893	73904	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302872958
42	NC_014393	AAACTC	2	12	76240	76251	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	302872960
43	NC_014393	AAAGGG	2	12	79103	79114	50 %	0 %	50 %	0 %	302872962
44	NC_014393	CATCTG	2	12	83484	83495	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302872966
45	NC_014393	TACAGA	2	12	91157	91168	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302872972
46	NC_014393	GTTATA	2	12	91717	91728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302872973
47	NC_014393	AAGAGG	2	12	93024	93035	50 %	0 %	50 %	0 %	302872975
48	NC_014393	ATTTAG	2	12	94280	94291	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302872977
49	NC_014393	ATATTT	2	12	94523	94534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302872977
50	NC_014393	ATGATA	2	12	96687	96698	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302872979
51	NC_014393	TGGGAA	2	12	96979	96990	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302872979
52	NC_014393	AGAAGG	2	12	116875	116886	50 %	0 %	50 %	0 %	302872987
53	NC_014393	GACAGG	2	12	119183	119194	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302872989
54	NC_014393	CTGGAA	2	12	120567	120578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302872991
55	NC_014393	ACTAAA	2	12	130142	130153	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302872995
56	NC_014393	AGTTTA	2	12	136374	136385	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302872999
57	NC_014393	AAACAG	2	12	142723	142734	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302873004
58	NC_014393	TAAGGC	2	12	145443	145454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302873006
59	NC_014393	AGCAAA	2	12	146082	146093	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302873006
60	NC_014393	CAACTA	2	12	146303	146314	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	302873006
61	NC_014393	AAATAT	2	12	152677	152688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302873007
62	NC_014393	TATAGT	2	12	153304	153315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302873008
63	NC_014393	ATATTA	2	12	168206	168217	50 %	50 %	0 %	0 %	302873014
64	NC_014393	CTATTA	2	12	170264	170275	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302873016
65	NC_014393	TGATAA	2	12	173201	173212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302873019
66	NC_014393	AGGATG	2	12	173922	173933	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302873020
67	NC_014393	AAATAA	2	12	175180	175191	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	302873021
68	NC_014393	TTGAAG	2	12	176177	176188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302873022
69	NC_014393	ATAGAT	2	12	179844	179855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302873027
70	NC_014393	AATTCC	2	12	186124	186135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302873032
71	NC_014393	TTAAGT	2	12	186576	186587	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302873033
72	NC_014393	ATTCAA	2	12	192424	192435	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302873038
73	NC_014393	TTGCTG	2	12	206433	206444	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	302873048
74	NC_014393	TATTTT	2	12	207660	207671	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302873049
75	NC_014393	ACATAG	2	12	208766	208777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302873051
76	NC_014393	AGTTAC	2	12	214527	214538	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302873060
77	NC_014393	TGATTT	2	12	214588	214599	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302873060
78	NC_014393	GCTGAA	2	12	222908	222919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302873063
79	NC_014393	ATATGA	2	12	227793	227804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302873067
80	NC_014393	AACTAT	2	12	229283	229294	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302873068
81	NC_014393	TAAATG	2	12	229564	229575	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302873068
82	NC_014393	ATGCAT	2	12	230890	230901	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302873068
83	NC_014393	AGGGGT	2	12	237361	237372	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	302873070
84	NC_014393	AAGGAT	2	12	239589	239600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302873071
85	NC_014393	TTGCTT	2	12	243893	243904	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302873077
86	NC_014393	TAATGA	2	12	244757	244768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302873077
87	NC_014393	AAATAT	2	12	247196	247207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302873080
88	NC_014393	ACTATA	2	12	253978	253989	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302873087
89	NC_014393	GATAAA	2	12	256071	256082	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302873088
90	NC_014393	AAAATG	2	12	257814	257825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302873089
91	NC_014393	CTTATT	2	12	263209	263220	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302873095
92	NC_014393	TATGAA	2	12	266086	266097	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302873099
93	NC_014393	ATATTT	2	12	266511	266522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302873099
94	NC_014393	TTGGAA	2	12	268390	268401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302873101
95	NC_014393	TAAAGC	2	12	275605	275616	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302873107
96	NC_014393	GTTAAT	2	12	275828	275839	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302873107
97	NC_014393	AATCAA	2	12	279451	279462	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302873109
98	NC_014393	GTTTCT	2	12	284555	284566	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302873115
99	NC_014393	TGTTTT	2	12	284854	284865	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	302873115
100	NC_014393	TGAAAA	2	12	287100	287111	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302873116
101	NC_014393	AATTTT	2	12	299598	299609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302873128
102	NC_014393	AAAGTT	2	12	303555	303566	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302873132
103	NC_014393	CTAGAG	2	12	308208	308219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302873138
104	NC_014393	ATTTTC	2	12	314190	314201	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302873141
105	NC_014393	ATGATA	2	12	314237	314248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302873141
106	NC_014393	TATAAA	2	12	315103	315114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302873142
107	NC_014393	ACAAAT	2	12	315371	315382	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302873142
108	NC_014393	TAAGCC	2	12	318460	318471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302873145
109	NC_014393	TGGTGC	2	12	319264	319275	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302873145
110	NC_014393	AACAAT	2	12	319570	319581	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302873145
111	NC_014393	AATTTT	2	12	320413	320424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302873146
112	NC_014393	ATTTTT	2	12	321543	321554	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302873148
113	NC_014393	ATTAAA	2	12	324189	324200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302873150
114	NC_014393	TTATAG	2	12	324746	324757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302873150
115	NC_014393	TACAGA	2	12	331808	331819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302873158
116	NC_014393	AAAGTA	2	12	332116	332127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302873159
117	NC_014393	GAAAAA	2	12	335538	335549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302873162
118	NC_014393	CTAAAG	2	12	337428	337439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302873164
119	NC_014393	AGTATT	2	12	339939	339950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302873167
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231	NC_014393	TCATGA	2	12	604200	604211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302873392
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233	NC_014393	TTCATT	2	12	614461	614472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302873400
234	NC_014393	GTTTTT	2	12	616558	616569	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	302873402
235	NC_014393	GCAAGA	2	12	624783	624794	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302873410
236	NC_014393	AATCTT	2	12	627540	627551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302873414
237	NC_014393	ACTGTA	2	12	629300	629311	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302873416
238	NC_014393	TTATGA	2	12	629835	629846	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302873416
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343	NC_014393	TATCAT	2	12	902527	902538	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302873625
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345	NC_014393	ATATAA	2	12	909457	909468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302873628
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