MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 chromosome

Total Repeats: 28996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014392	ATG	2	6	127	132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870732
2	NC_014392	AGG	2	6	157	162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302870732
3	NC_014392	TGA	2	6	242	247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870732
4	NC_014392	TTC	2	6	373	378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870732
5	NC_014392	TGT	2	6	479	484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870732
6	NC_014392	AAC	3	9	489	497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870732
7	NC_014392	ACC	2	6	536	541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302870732
8	NC_014392	CGG	2	6	575	580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302870732
9	NC_014392	GAC	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302870732
10	NC_014392	AGG	2	6	802	807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302870732
11	NC_014392	AAG	2	6	846	851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870732
12	NC_014392	ATA	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870732
13	NC_014392	GCC	2	6	872	877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302870732
14	NC_014392	AGA	2	6	896	901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870732
15	NC_014392	GCC	2	6	947	952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302870732
16	NC_014392	AAG	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870732
17	NC_014392	AAG	2	6	1262	1267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870732
18	NC_014392	CAA	2	6	1415	1420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870732
19	NC_014392	AAT	3	9	1477	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870732
20	NC_014392	GCG	2	6	2365	2370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302870733
21	NC_014392	TGA	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870733
22	NC_014392	TGG	2	6	2591	2596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302870733
23	NC_014392	AGA	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870733
24	NC_014392	AAG	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870733
25	NC_014392	CGA	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302870733
26	NC_014392	GTA	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870733
27	NC_014392	TAG	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870733
28	NC_014392	ACT	2	6	3259	3264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302870733
29	NC_014392	ATG	2	6	3468	3473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870733
30	NC_014392	GGA	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302870733
31	NC_014392	GGT	2	6	3701	3706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302870733
32	NC_014392	CTG	2	6	3847	3852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302870733
33	NC_014392	TGT	2	6	3949	3954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870734
34	NC_014392	CAA	2	6	4008	4013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870734
35	NC_014392	AGA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870734
36	NC_014392	AGA	2	6	4236	4241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870734
37	NC_014392	TTG	2	6	4320	4325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870734
38	NC_014392	GAA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870734
39	NC_014392	TTG	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870734
40	NC_014392	TGA	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870734
41	NC_014392	ATA	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870734
42	NC_014392	CAA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870734
43	NC_014392	GAT	2	6	4807	4812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870734
44	NC_014392	ATA	2	6	5074	5079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870735
45	NC_014392	ATC	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302870735
46	NC_014392	AAT	2	6	5349	5354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870735
47	NC_014392	CGC	2	6	5464	5469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302870735
48	NC_014392	CTT	2	6	5539	5544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870735
49	NC_014392	ATA	2	6	5584	5589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870735
50	NC_014392	ACA	2	6	5815	5820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870735
51	NC_014392	TGC	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302870735
52	NC_014392	AGA	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870735
53	NC_014392	TCA	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302870736
54	NC_014392	CTT	2	6	6207	6212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870736
55	NC_014392	AGA	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870736
56	NC_014392	ACG	2	6	6304	6309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302870736
57	NC_014392	ATA	2	6	6324	6329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870736
58	NC_014392	AAT	2	6	6359	6364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870736
59	NC_014392	TCA	2	6	6605	6610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302870737
60	NC_014392	TTG	2	6	6625	6630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870737
61	NC_014392	TTA	2	6	6679	6684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302870737
62	NC_014392	TTC	2	6	6787	6792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870737
63	NC_014392	GGT	2	6	6798	6803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302870737
64	NC_014392	TGT	2	6	6860	6865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870737
65	NC_014392	TAT	2	6	6918	6923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302870737
66	NC_014392	TGA	3	9	7010	7018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870737
67	NC_014392	ATG	2	6	7153	7158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870737
68	NC_014392	ACA	2	6	7312	7317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870737
69	NC_014392	CTG	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302870737
70	NC_014392	CTT	2	6	7425	7430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870737
71	NC_014392	AGA	2	6	7580	7585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870737
72	NC_014392	AGA	2	6	7603	7608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870737
73	NC_014392	CTG	2	6	7780	7785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302870737
74	NC_014392	CTT	2	6	7899	7904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870737
75	NC_014392	CTT	3	9	8022	8030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870737
76	NC_014392	TCT	2	6	8035	8040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870737
77	NC_014392	AAG	2	6	8255	8260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870737
78	NC_014392	TTC	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870737
79	NC_014392	AGA	2	6	8300	8305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870737
80	NC_014392	AAG	2	6	8342	8347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870737
81	NC_014392	GAA	2	6	8437	8442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870738
82	NC_014392	AGA	2	6	8522	8527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870738
83	NC_014392	TTG	2	6	8612	8617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870739
84	NC_014392	GAG	2	6	8720	8725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302870739
85	NC_014392	ATA	2	6	8771	8776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870739
86	NC_014392	TAA	2	6	8800	8805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870739
87	NC_014392	CAA	2	6	8845	8850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870739
88	NC_014392	TAT	2	6	8851	8856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302870739
89	NC_014392	GTA	2	6	8910	8915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870739
90	NC_014392	TGT	2	6	8929	8934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870739
91	NC_014392	AGA	2	6	9129	9134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
92	NC_014392	ATC	2	6	9223	9228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302870740
93	NC_014392	TGC	2	6	9239	9244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302870740
94	NC_014392	TTG	2	6	9298	9303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870740
95	NC_014392	CTG	2	6	9343	9348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302870740
96	NC_014392	TGA	2	6	9440	9445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870740
97	NC_014392	CAA	2	6	9529	9534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870740
98	NC_014392	CCT	2	6	9540	9545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302870740
99	NC_014392	TGA	2	6	9608	9613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870740
100	NC_014392	ATA	2	6	9624	9629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870740
101	NC_014392	CGG	2	6	9650	9655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302870740
102	NC_014392	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870740
103	NC_014392	AGA	2	6	9841	9846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
104	NC_014392	TGT	2	6	9932	9937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870740
105	NC_014392	TTG	2	6	10000	10005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870740
106	NC_014392	AGA	2	6	10080	10085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
107	NC_014392	AGA	2	6	10109	10114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
108	NC_014392	ATA	2	6	10167	10172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870740
109	NC_014392	GTC	2	6	10184	10189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302870740
110	NC_014392	AGA	3	9	10310	10318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
111	NC_014392	GAT	2	6	10337	10342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870740
112	NC_014392	ATA	2	6	10389	10394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870740
113	NC_014392	AGA	2	6	10437	10442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
114	NC_014392	GAA	3	9	10476	10484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
115	NC_014392	GTA	2	6	10509	10514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870740
116	NC_014392	CAA	2	6	10603	10608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870740
117	NC_014392	GAT	2	6	10614	10619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870740
118	NC_014392	TTG	2	6	10621	10626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870740
119	NC_014392	ACA	3	9	10641	10649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870740
120	NC_014392	CAC	2	6	10650	10655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302870740
121	NC_014392	AAG	2	6	10813	10818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
122	NC_014392	ATG	2	6	10827	10832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870740
123	NC_014392	AAG	2	6	10854	10859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
124	NC_014392	GAT	3	9	10920	10928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870740
125	NC_014392	TGT	2	6	10997	11002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870740
126	NC_014392	ATG	2	6	11014	11019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870740
127	NC_014392	AGA	2	6	11066	11071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
128	NC_014392	TCT	2	6	11117	11122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870740
129	NC_014392	AAG	2	6	11150	11155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
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131	NC_014392	TTG	2	6	11236	11241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870740
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