MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 80394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_014376	ATT	2	6	229008	229013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384652
4003	NC_014376	A	6	6	229030	229035	100 %	0 %	0 %	0 %	302384652
4004	NC_014376	GTA	2	6	229052	229057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384652
4005	NC_014376	T	7	7	229063	229069	0 %	100 %	0 %	0 %	302384652
4006	NC_014376	TGTT	2	8	229122	229129	0 %	75 %	25 %	0 %	302384652
4007	NC_014376	AAG	2	6	229527	229532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384653
4008	NC_014376	GGT	2	6	229701	229706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384653
4009	NC_014376	ATA	2	6	229714	229719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384653
4010	NC_014376	ATCAGC	2	12	229747	229758	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302384653
4011	NC_014376	ATCC	2	8	229765	229772	25 %	25 %	0 %	50 %	302384653
4012	NC_014376	AAG	2	6	229777	229782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384653
4013	NC_014376	ATAC	2	8	229783	229790	50 %	25 %	0 %	25 %	302384653
4014	NC_014376	ATT	2	6	229803	229808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384653
4015	NC_014376	GAA	2	6	229823	229828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384653
4016	NC_014376	CAT	2	6	229844	229849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384653
4017	NC_014376	AT	3	6	229864	229869	50 %	50 %	0 %	0 %	302384653
4018	NC_014376	TTC	2	6	229908	229913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384653
4019	NC_014376	CTG	2	6	229920	229925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384653
4020	NC_014376	TCT	2	6	229961	229966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384653
4021	NC_014376	CAT	2	6	230010	230015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384653
4022	NC_014376	GT	3	6	230040	230045	0 %	50 %	50 %	0 %	302384653
4023	NC_014376	AGC	2	6	230062	230067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384653
4024	NC_014376	TGTA	2	8	230087	230094	25 %	50 %	25 %	0 %	302384653
4025	NC_014376	AGA	2	6	230115	230120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384653
4026	NC_014376	TTC	2	6	230224	230229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384653
4027	NC_014376	AGA	2	6	230284	230289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384653
4028	NC_014376	A	6	6	230337	230342	100 %	0 %	0 %	0 %	302384653
4029	NC_014376	T	7	7	230382	230388	0 %	100 %	0 %	0 %	302384653
4030	NC_014376	CAG	2	6	230409	230414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384653
4031	NC_014376	AAG	2	6	230601	230606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384653
4032	NC_014376	TCC	2	6	230610	230615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384653
4033	NC_014376	GTA	2	6	230622	230627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384653
4034	NC_014376	GA	3	6	230674	230679	50 %	0 %	50 %	0 %	302384653
4035	NC_014376	GAG	2	6	230691	230696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384653
4036	NC_014376	A	6	6	230709	230714	100 %	0 %	0 %	0 %	302384653
4037	NC_014376	TTCA	2	8	230748	230755	25 %	50 %	0 %	25 %	302384653
4038	NC_014376	TCC	2	6	230842	230847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384653
4039	NC_014376	T	7	7	230960	230966	0 %	100 %	0 %	0 %	302384653
4040	NC_014376	CCT	2	6	230981	230986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384654
4041	NC_014376	CTG	2	6	231103	231108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384654
4042	NC_014376	TGC	2	6	231128	231133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384654
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4044	NC_014376	GA	3	6	232644	232649	50 %	0 %	50 %	0 %	302384655
4045	NC_014376	AGG	2	6	232737	232742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384655
4046	NC_014376	A	7	7	232749	232755	100 %	0 %	0 %	0 %	302384655
4047	NC_014376	TGC	2	6	232761	232766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384655
4048	NC_014376	AGG	2	6	232767	232772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384655
4049	NC_014376	AC	3	6	232797	232802	50 %	0 %	0 %	50 %	302384655
4050	NC_014376	GATGC	2	10	232809	232818	20 %	20 %	40 %	20 %	302384655
4051	NC_014376	CTA	2	6	232888	232893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384655
4052	NC_014376	TAA	2	6	232987	232992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384655
4053	NC_014376	AGA	2	6	233018	233023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384655
4054	NC_014376	AGAA	2	8	233167	233174	75 %	0 %	25 %	0 %	302384655
4055	NC_014376	TAT	2	6	233176	233181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384655
4056	NC_014376	GTT	2	6	233297	233302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302384655
4057	NC_014376	TGA	2	6	233332	233337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384655
4058	NC_014376	TCCG	2	8	233387	233394	0 %	25 %	25 %	50 %	302384655
4059	NC_014376	T	6	6	233413	233418	0 %	100 %	0 %	0 %	302384655
4060	NC_014376	ATA	2	6	233457	233462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384655
4061	NC_014376	AC	3	6	233537	233542	50 %	0 %	0 %	50 %	302384655
4062	NC_014376	A	6	6	233552	233557	100 %	0 %	0 %	0 %	302384655
4063	NC_014376	CCA	2	6	233589	233594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384655
4064	NC_014376	GATA	2	8	233611	233618	50 %	25 %	25 %	0 %	302384655
4065	NC_014376	A	7	7	233697	233703	100 %	0 %	0 %	0 %	302384655
4066	NC_014376	TTA	2	6	233756	233761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384655
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4070	NC_014376	CGGT	2	8	234063	234070	0 %	25 %	50 %	25 %	302384656
4071	NC_014376	ATT	2	6	234076	234081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384656
4072	NC_014376	GTA	2	6	234111	234116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384656
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4074	NC_014376	ATG	2	6	234171	234176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384656
4075	NC_014376	TGA	2	6	234185	234190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384656
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4077	NC_014376	A	6	6	234349	234354	100 %	0 %	0 %	0 %	302384656
4078	NC_014376	GCA	2	6	234387	234392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384656
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4081	NC_014376	CTTAT	2	10	234523	234532	20 %	60 %	0 %	20 %	302384656
4082	NC_014376	CTG	2	6	234573	234578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384656
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4085	NC_014376	GCGT	2	8	234712	234719	0 %	25 %	50 %	25 %	302384656
4086	NC_014376	ATG	2	6	234720	234725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384656
4087	NC_014376	CTT	2	6	234865	234870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384656
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4090	NC_014376	GGCA	2	8	235054	235061	25 %	0 %	50 %	25 %	302384656
4091	NC_014376	ATCG	2	8	235092	235099	25 %	25 %	25 %	25 %	302384656
4092	NC_014376	TTCT	2	8	235213	235220	0 %	75 %	0 %	25 %	302384656
4093	NC_014376	GCC	2	6	235239	235244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302384656
4094	NC_014376	GTG	2	6	235275	235280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384656
4095	NC_014376	GGCA	2	8	235301	235308	25 %	0 %	50 %	25 %	302384656
4096	NC_014376	AGC	2	6	235319	235324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384656
4097	NC_014376	GCAG	2	8	235419	235426	25 %	0 %	50 %	25 %	302384656
4098	NC_014376	A	6	6	235451	235456	100 %	0 %	0 %	0 %	302384656
4099	NC_014376	GCT	2	6	235464	235469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384656
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4102	NC_014376	TTG	2	6	235615	235620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302384656
4103	NC_014376	ACAGA	2	10	235656	235665	60 %	0 %	20 %	20 %	302384656
4104	NC_014376	AGA	2	6	235881	235886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384657
4105	NC_014376	TAT	2	6	235943	235948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384657
4106	NC_014376	TGAA	2	8	235958	235965	50 %	25 %	25 %	0 %	302384657
4107	NC_014376	T	6	6	235984	235989	0 %	100 %	0 %	0 %	302384657
4108	NC_014376	AGAT	2	8	236055	236062	50 %	25 %	25 %	0 %	302384657
4109	NC_014376	ATC	2	6	236083	236088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384657
4110	NC_014376	ATC	2	6	236093	236098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384657
4111	NC_014376	CAT	2	6	236197	236202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384657
4112	NC_014376	GTG	2	6	236205	236210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384657
4113	NC_014376	GAATGG	2	12	236211	236222	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302384657
4114	NC_014376	TGCC	2	8	236343	236350	0 %	25 %	25 %	50 %	302384657
4115	NC_014376	A	6	6	236359	236364	100 %	0 %	0 %	0 %	302384657
4116	NC_014376	TC	3	6	236406	236411	0 %	50 %	0 %	50 %	302384657
4117	NC_014376	TTAA	2	8	236627	236634	50 %	50 %	0 %	0 %	302384658
4118	NC_014376	GCTTT	2	10	236639	236648	0 %	60 %	20 %	20 %	302384658
4119	NC_014376	AAT	2	6	236651	236656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384658
4120	NC_014376	TCC	2	6	236803	236808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384658
4121	NC_014376	CAAA	2	8	236832	236839	75 %	0 %	0 %	25 %	302384658
4122	NC_014376	CTT	2	6	236849	236854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384658
4123	NC_014376	TTC	2	6	236859	236864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384658
4124	NC_014376	CAA	2	6	237032	237037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302384658
4125	NC_014376	AAAGT	2	10	237101	237110	60 %	20 %	20 %	0 %	302384658
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4221	NC_014376	CAGG	2	8	243001	243008	25 %	0 %	50 %	25 %	302384664
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4230	NC_014376	GGCT	2	8	243730	243737	0 %	25 %	50 %	25 %	302384664
4231	NC_014376	CCA	2	6	243753	243758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384664
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4233	NC_014376	GGT	2	6	243786	243791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384664
4234	NC_014376	TCA	2	6	243848	243853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384664
4235	NC_014376	CTGT	2	8	243886	243893	0 %	50 %	25 %	25 %	302384664
4236	NC_014376	GATCTT	2	12	243919	243930	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302384664
4237	NC_014376	ATG	2	6	243950	243955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384664
4238	NC_014376	TGG	2	6	243965	243970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384664
4239	NC_014376	CAT	2	6	243971	243976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384664
4240	NC_014376	TGC	2	6	244032	244037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384664
4241	NC_014376	CTG	2	6	244123	244128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384664
4242	NC_014376	CAG	2	6	244306	244311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384664
4243	NC_014376	ATGA	2	8	244387	244394	50 %	25 %	25 %	0 %	302384664
4244	NC_014376	GCG	2	6	244501	244506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384664
4245	NC_014376	AGC	2	6	244512	244517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384664
4246	NC_014376	TGAGG	2	10	244560	244569	20 %	20 %	60 %	0 %	302384664
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4364	NC_014376	AGA	2	6	251259	251264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384674
4365	NC_014376	A	7	7	251264	251270	100 %	0 %	0 %	0 %	302384674
4366	NC_014376	GA	3	6	251287	251292	50 %	0 %	50 %	0 %	302384674
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4369	NC_014376	AG	3	6	251398	251403	50 %	0 %	50 %	0 %	302384674
4370	NC_014376	AG	3	6	251422	251427	50 %	0 %	50 %	0 %	302384674
4371	NC_014376	TTA	2	6	251809	251814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384675
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4373	NC_014376	TTC	2	6	251931	251936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384675
4374	NC_014376	TGC	2	6	251940	251945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384675
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4389	NC_014376	TA	3	6	252765	252770	50 %	50 %	0 %	0 %	302384675
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4402	NC_014376	CTG	2	6	253414	253419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384675
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4427	NC_014376	CTG	2	6	255211	255216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384677
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