MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 79829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_014355	CTGC	2	8	94210	94217	0 %	25 %	25 %	50 %	302035509
2003	NC_014355	TCAG	2	8	94256	94263	25 %	25 %	25 %	25 %	302035509
2004	NC_014355	ACACC	2	10	94391	94400	40 %	0 %	0 %	60 %	302035509
2005	NC_014355	TGGC	2	8	94444	94451	0 %	25 %	50 %	25 %	302035509
2006	NC_014355	GC	3	6	94467	94472	0 %	0 %	50 %	50 %	302035509
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2009	NC_014355	GTG	2	6	94633	94638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035509
2010	NC_014355	CGCA	2	8	94675	94682	25 %	0 %	25 %	50 %	302035509
2011	NC_014355	GCA	2	6	94701	94706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035509
2012	NC_014355	GCA	2	6	94766	94771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035509
2013	NC_014355	GCT	2	6	94797	94802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035509
2014	NC_014355	CAC	2	6	94806	94811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035509
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2125	NC_014355	CTTTT	2	10	99869	99878	0 %	80 %	0 %	20 %	302035518
2126	NC_014355	CGC	2	6	99967	99972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035518
2127	NC_014355	CTT	2	6	99991	99996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035518
2128	NC_014355	TGG	2	6	100011	100016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035518
2129	NC_014355	CCTG	2	8	100056	100063	0 %	25 %	25 %	50 %	302035518
2130	NC_014355	CGC	2	6	100108	100113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035518
2131	NC_014355	GC	3	6	100148	100153	0 %	0 %	50 %	50 %	302035518
2132	NC_014355	ACG	2	6	100317	100322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035518
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2134	NC_014355	TCC	2	6	100407	100412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035518
2135	NC_014355	TGG	2	6	100432	100437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035518
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2139	NC_014355	TTGCCT	2	12	100650	100661	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302035518
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2141	NC_014355	GC	3	6	100745	100750	0 %	0 %	50 %	50 %	302035518
2142	NC_014355	GC	3	6	100820	100825	0 %	0 %	50 %	50 %	302035518
2143	NC_014355	TCA	2	6	100836	100841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035518
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2147	NC_014355	TCA	2	6	100980	100985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035518
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2149	NC_014355	ATC	2	6	101046	101051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035518
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2153	NC_014355	CAAA	2	8	101132	101139	75 %	0 %	0 %	25 %	302035518
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2157	NC_014355	CTG	2	6	101255	101260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035518
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2164	NC_014355	CAGC	2	8	101557	101564	25 %	0 %	25 %	50 %	302035518
2165	NC_014355	TGT	2	6	101602	101607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035518
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2238	NC_014355	GGCA	2	8	105462	105469	25 %	0 %	50 %	25 %	302035520
2239	NC_014355	GCTTT	2	10	105511	105520	0 %	60 %	20 %	20 %	302035520
2240	NC_014355	GCT	2	6	105528	105533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035520
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2243	NC_014355	GCA	2	6	105623	105628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035521
2244	NC_014355	CAC	2	6	105712	105717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035521
2245	NC_014355	TGC	2	6	105730	105735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035521
2246	NC_014355	TGA	2	6	105840	105845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035521
2247	NC_014355	GTG	2	6	105863	105868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035521
2248	NC_014355	TGGC	2	8	105897	105904	0 %	25 %	50 %	25 %	302035521
2249	NC_014355	CAA	2	6	105912	105917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035521
2250	NC_014355	TTG	2	6	105965	105970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035521
2251	NC_014355	TGG	2	6	106142	106147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035521
2252	NC_014355	GTCTT	2	10	106403	106412	0 %	60 %	20 %	20 %	302035521
2253	NC_014355	CCG	2	6	106499	106504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035521
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2256	NC_014355	ATC	2	6	106780	106785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035521
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2264	NC_014355	GCGTT	2	10	107216	107225	0 %	40 %	40 %	20 %	302035521
2265	NC_014355	TGA	2	6	107256	107261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035521
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2279	NC_014355	CTG	2	6	107962	107967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035521
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2285	NC_014355	TCG	2	6	108161	108166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035521
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2287	NC_014355	GTT	2	6	108310	108315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035521
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2348	NC_014355	CAA	2	6	112276	112281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035526
2349	NC_014355	GC	3	6	112321	112326	0 %	0 %	50 %	50 %	302035526
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2353	NC_014355	TGG	2	6	112585	112590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035526
2354	NC_014355	CGG	3	9	112591	112599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035526
2355	NC_014355	GAC	2	6	112601	112606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035526
2356	NC_014355	GA	3	6	112620	112625	50 %	0 %	50 %	0 %	302035526
2357	NC_014355	CGG	2	6	112627	112632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035526
2358	NC_014355	TCG	2	6	112717	112722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035526
2359	NC_014355	GAT	2	6	112726	112731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035526
2360	NC_014355	ACC	2	6	112815	112820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035526
2361	NC_014355	CCA	2	6	112900	112905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035526
2362	NC_014355	GC	3	6	112944	112949	0 %	0 %	50 %	50 %	302035526
2363	NC_014355	CAAC	2	8	112963	112970	50 %	0 %	0 %	50 %	302035526
2364	NC_014355	GCA	2	6	113033	113038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035526
2365	NC_014355	GGC	2	6	113039	113044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035526
2366	NC_014355	CGG	2	6	113098	113103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035526
2367	NC_014355	TGC	2	6	113112	113117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035526
2368	NC_014355	GC	4	8	113116	113123	0 %	0 %	50 %	50 %	302035526
2369	NC_014355	GACG	2	8	113134	113141	25 %	0 %	50 %	25 %	302035526
2370	NC_014355	GAAGG	2	10	113155	113164	40 %	0 %	60 %	0 %	302035526
2371	NC_014355	TCC	2	6	113221	113226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035527
2372	NC_014355	GGAC	2	8	113301	113308	25 %	0 %	50 %	25 %	302035527
2373	NC_014355	GAT	2	6	113331	113336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035527
2374	NC_014355	TTG	2	6	113386	113391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035527
2375	NC_014355	TGCT	2	8	113430	113437	0 %	50 %	25 %	25 %	302035527
2376	NC_014355	TCA	2	6	113463	113468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035527
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2380	NC_014355	TCAA	2	8	113596	113603	50 %	25 %	0 %	25 %	302035527
2381	NC_014355	CG	4	8	113701	113708	0 %	0 %	50 %	50 %	302035527
2382	NC_014355	GCG	2	6	113713	113718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035527
2383	NC_014355	CCG	2	6	113905	113910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035527
2384	NC_014355	GAC	2	6	114004	114009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035527
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2388	NC_014355	AATTG	2	10	114186	114195	40 %	40 %	20 %	0 %	302035527
2389	NC_014355	CAA	2	6	114211	114216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035527
2390	NC_014355	CAA	2	6	114321	114326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035527
2391	NC_014355	GGC	2	6	114330	114335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035527
2392	NC_014355	ACC	2	6	114345	114350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035527
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2395	NC_014355	TAC	2	6	114428	114433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035528
2396	NC_014355	GCC	2	6	114483	114488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035528
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2399	NC_014355	CAC	2	6	114628	114633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035528
2400	NC_014355	CAC	2	6	114657	114662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035528
2401	NC_014355	TCA	2	6	114664	114669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035528
2402	NC_014355	AGCG	2	8	114685	114692	25 %	0 %	50 %	25 %	302035528
2403	NC_014355	GGC	2	6	114767	114772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035528
2404	NC_014355	GCTGT	2	10	114813	114822	0 %	40 %	40 %	20 %	302035528
2405	NC_014355	T	6	6	114944	114949	0 %	100 %	0 %	0 %	302035528
2406	NC_014355	TGT	2	6	115030	115035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035528
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2422	NC_014355	CTG	2	6	115751	115756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035529
2423	NC_014355	CAT	2	6	115828	115833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035529
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2425	NC_014355	GCGGGT	2	12	115858	115869	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	302035529
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2427	NC_014355	GAC	2	6	115934	115939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035529
2428	NC_014355	CTT	2	6	115945	115950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035529
2429	NC_014355	CGG	2	6	116008	116013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035529
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2432	NC_014355	CTG	2	6	116095	116100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035529
2433	NC_014355	CGG	2	6	116107	116112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035529
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2435	NC_014355	T	6	6	116201	116206	0 %	100 %	0 %	0 %	302035529
2436	NC_014355	ATCG	2	8	116267	116274	25 %	25 %	25 %	25 %	302035529
2437	NC_014355	TGGCA	2	10	116285	116294	20 %	20 %	40 %	20 %	302035529
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2439	NC_014355	CGG	2	6	116380	116385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035529
2440	NC_014355	TGG	2	6	116562	116567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035529
2441	NC_014355	CTG	2	6	116619	116624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035529
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2444	NC_014355	TAC	2	6	116687	116692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035529
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2446	NC_014355	AAG	2	6	116717	116722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035529
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2452	NC_014355	GATG	2	8	116962	116969	25 %	25 %	50 %	0 %	302035529
2453	NC_014355	GGC	2	6	116971	116976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035529
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2456	NC_014355	CG	4	8	117094	117101	0 %	0 %	50 %	50 %	302035529
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2460	NC_014355	TGC	2	6	117286	117291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035529
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2469	NC_014355	CGT	2	6	117793	117798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035530
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2471	NC_014355	CGGAT	2	10	117818	117827	20 %	20 %	40 %	20 %	302035530
2472	NC_014355	CAC	2	6	117972	117977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035530
2473	NC_014355	CGG	2	6	118254	118259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035531
2474	NC_014355	TGT	2	6	118392	118397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035531
2475	NC_014355	ATG	2	6	118421	118426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035531
2476	NC_014355	TCA	2	6	118497	118502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035531
2477	NC_014355	GC	3	6	118511	118516	0 %	0 %	50 %	50 %	302035531
2478	NC_014355	GTC	2	6	118568	118573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035531
2479	NC_014355	AGT	2	6	118584	118589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035531
2480	NC_014355	ATT	2	6	118672	118677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302035532
2481	NC_014355	ACG	2	6	118679	118684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035532
2482	NC_014355	CCG	2	6	118698	118703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035532
2483	NC_014355	CGG	2	6	118727	118732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035532
2484	NC_014355	CGC	2	6	118740	118745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035532
2485	NC_014355	TCCC	2	8	118778	118785	0 %	25 %	0 %	75 %	302035532
2486	NC_014355	CTTG	2	8	118806	118813	0 %	50 %	25 %	25 %	302035532
2487	NC_014355	CGG	2	6	118820	118825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035532
2488	NC_014355	TCG	2	6	118828	118833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035532
2489	NC_014355	GTC	2	6	118894	118899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035532
2490	NC_014355	TCGG	2	8	118900	118907	0 %	25 %	50 %	25 %	302035532
2491	NC_014355	AGG	2	6	118992	118997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035533
2492	NC_014355	GGC	2	6	119011	119016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035533
2493	NC_014355	CTG	2	6	119140	119145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035533
2494	NC_014355	CG	3	6	119168	119173	0 %	0 %	50 %	50 %	302035533
2495	NC_014355	GAC	2	6	119182	119187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035533
2496	NC_014355	CGGC	2	8	119218	119225	0 %	0 %	50 %	50 %	302035533
2497	NC_014355	TCG	2	6	119231	119236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035533
2498	NC_014355	GCC	2	6	119272	119277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035533
2499	NC_014355	GC	5	10	119292	119301	0 %	0 %	50 %	50 %	302035533
2500	NC_014355	GCC	2	6	119354	119359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035533

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