MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 79829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014355	CGA	2	6	51022	51027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035452
1002	NC_014355	GGC	2	6	51075	51080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035452
1003	NC_014355	TAC	2	6	51112	51117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035452
1004	NC_014355	CGG	2	6	51134	51139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035452
1005	NC_014355	CGC	2	6	51200	51205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035452
1006	NC_014355	GTC	2	6	51358	51363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035452
1007	NC_014355	CGA	2	6	51408	51413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035452
1008	NC_014355	TTG	2	6	51433	51438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035452
1009	NC_014355	CGC	2	6	51474	51479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035452
1010	NC_014355	GGT	2	6	51590	51595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035453
1011	NC_014355	TCG	2	6	51658	51663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035453
1012	NC_014355	GCT	2	6	51692	51697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035453
1013	NC_014355	CCG	2	6	51720	51725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035453
1014	NC_014355	GGC	2	6	51759	51764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035453
1015	NC_014355	CCG	2	6	51900	51905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035453
1016	NC_014355	CGA	2	6	51931	51936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035453
1017	NC_014355	GCG	2	6	51975	51980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035453
1018	NC_014355	TCG	2	6	52027	52032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035453
1019	NC_014355	GTT	2	6	52034	52039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035453
1020	NC_014355	GCGG	2	8	52047	52054	0 %	0 %	75 %	25 %	302035453
1021	NC_014355	TGC	2	6	52069	52074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035453
1022	NC_014355	TAT	2	6	52110	52115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302035453
1023	NC_014355	GCA	2	6	52118	52123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035453
1024	NC_014355	GGCGA	2	10	52188	52197	20 %	0 %	60 %	20 %	302035453
1025	NC_014355	GTG	2	6	52203	52208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035453
1026	NC_014355	GGA	2	6	52277	52282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035453
1027	NC_014355	CAC	2	6	52296	52301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035453
1028	NC_014355	TCGCGA	2	12	52310	52321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302035453
1029	NC_014355	CATC	2	8	52394	52401	25 %	25 %	0 %	50 %	302035453
1030	NC_014355	TGA	2	6	52580	52585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035454
1031	NC_014355	AGGC	2	8	52619	52626	25 %	0 %	50 %	25 %	302035454
1032	NC_014355	GTG	2	6	52720	52725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035454
1033	NC_014355	GGT	2	6	52756	52761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035454
1034	NC_014355	GGA	2	6	52815	52820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035454
1035	NC_014355	GT	3	6	52823	52828	0 %	50 %	50 %	0 %	302035454
1036	NC_014355	CGA	2	6	52853	52858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035454
1037	NC_014355	CGG	2	6	52883	52888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035454
1038	NC_014355	GGA	2	6	52998	53003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035454
1039	NC_014355	CGG	2	6	53010	53015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035454
1040	NC_014355	GGC	2	6	53017	53022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035454
1041	NC_014355	CA	3	6	53031	53036	50 %	0 %	0 %	50 %	302035454
1042	NC_014355	CTCC	2	8	53080	53087	0 %	25 %	0 %	75 %	302035454
1043	NC_014355	TGGACC	2	12	53146	53157	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302035454
1044	NC_014355	GGA	2	6	53295	53300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035455
1045	NC_014355	TCG	2	6	53361	53366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035455
1046	NC_014355	AGG	2	6	53439	53444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035455
1047	NC_014355	CGT	2	6	53445	53450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035455
1048	NC_014355	CAA	2	6	53480	53485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035455
1049	NC_014355	ATC	2	6	53604	53609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035456
1050	NC_014355	ATG	2	6	53655	53660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035456
1051	NC_014355	A	6	6	53670	53675	100 %	0 %	0 %	0 %	302035456
1052	NC_014355	TCT	2	6	53738	53743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035456
1053	NC_014355	CCA	2	6	54605	54610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035457
1054	NC_014355	CGG	2	6	54630	54635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035457
1055	NC_014355	CAG	2	6	54652	54657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035457
1056	NC_014355	AGC	2	6	54695	54700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035457
1057	NC_014355	AGC	2	6	54741	54746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035457
1058	NC_014355	CGA	2	6	54747	54752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035457
1059	NC_014355	AGG	2	6	54779	54784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035457
1060	NC_014355	CCT	2	6	54812	54817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035458
1061	NC_014355	ATC	2	6	54829	54834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035458
1062	NC_014355	GCG	2	6	54856	54861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035458
1063	NC_014355	CAG	2	6	54862	54867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035458
1064	NC_014355	GC	3	6	54922	54927	0 %	0 %	50 %	50 %	302035458
1065	NC_014355	TGA	2	6	55043	55048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035458
1066	NC_014355	CGG	2	6	55163	55168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035458
1067	NC_014355	GGTT	2	8	55200	55207	0 %	50 %	50 %	0 %	302035458
1068	NC_014355	GTT	2	6	55307	55312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035459
1069	NC_014355	GGT	2	6	55317	55322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035459
1070	NC_014355	GCC	2	6	55326	55331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035459
1071	NC_014355	CTG	2	6	55346	55351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035459
1072	NC_014355	CTG	2	6	55413	55418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035459
1073	NC_014355	TTC	2	6	55434	55439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035459
1074	NC_014355	GCG	2	6	55446	55451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035459
1075	NC_014355	TGC	2	6	55496	55501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035459
1076	NC_014355	GC	3	6	55522	55527	0 %	0 %	50 %	50 %	302035459
1077	NC_014355	GTT	2	6	55556	55561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035459
1078	NC_014355	GTG	2	6	55569	55574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035459
1079	NC_014355	A	6	6	55644	55649	100 %	0 %	0 %	0 %	302035460
1080	NC_014355	GGC	2	6	55661	55666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035460
1081	NC_014355	GAT	2	6	55839	55844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035460
1082	NC_014355	CCA	2	6	55876	55881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035460
1083	NC_014355	TGG	2	6	55906	55911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035460
1084	NC_014355	GCC	2	6	55914	55919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035460
1085	NC_014355	GACG	2	8	55993	56000	25 %	0 %	50 %	25 %	302035461
1086	NC_014355	CTG	2	6	56062	56067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035461
1087	NC_014355	CCG	2	6	56099	56104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035461
1088	NC_014355	TGC	2	6	56129	56134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035461
1089	NC_014355	GCT	2	6	56167	56172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035462
1090	NC_014355	ACG	2	6	56195	56200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035462
1091	NC_014355	CTTCAG	2	12	56314	56325	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302035462
1092	NC_014355	GTG	2	6	56375	56380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035462
1093	NC_014355	GC	4	8	56392	56399	0 %	0 %	50 %	50 %	302035462
1094	NC_014355	GCC	2	6	56421	56426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035462
1095	NC_014355	TCA	2	6	56428	56433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035462
1096	NC_014355	TCGC	2	8	56435	56442	0 %	25 %	25 %	50 %	302035462
1097	NC_014355	GCG	2	6	56467	56472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035462
1098	NC_014355	GCG	2	6	56479	56484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035462
1099	NC_014355	TGA	2	6	56485	56490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035462
1100	NC_014355	CTT	2	6	56495	56500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035462
1101	NC_014355	CGC	2	6	56548	56553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035462
1102	NC_014355	CAG	2	6	56554	56559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035462
1103	NC_014355	GCG	2	6	56563	56568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035462
1104	NC_014355	CTT	2	6	56609	56614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035462
1105	NC_014355	TCC	2	6	56624	56629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035463
1106	NC_014355	GCC	2	6	56706	56711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035463
1107	NC_014355	GCT	2	6	56715	56720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035463
1108	NC_014355	ATG	2	6	56741	56746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035463
1109	NC_014355	GCA	2	6	56769	56774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035463
1110	NC_014355	ACC	2	6	56783	56788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035463
1111	NC_014355	GTG	2	6	56791	56796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035463
1112	NC_014355	CAG	2	6	56848	56853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035463
1113	NC_014355	TGC	2	6	56855	56860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035463
1114	NC_014355	CGT	2	6	56898	56903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035463
1115	NC_014355	TCG	2	6	56915	56920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035463
1116	NC_014355	CAG	2	6	57003	57008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035464
1117	NC_014355	ATC	2	6	57124	57129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035464
1118	NC_014355	GTT	2	6	57177	57182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035464
1119	NC_014355	GGT	2	6	57204	57209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035464
1120	NC_014355	TCG	2	6	57214	57219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035464
1121	NC_014355	CGTTG	2	10	57230	57239	0 %	40 %	40 %	20 %	302035464
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1123	NC_014355	CCA	2	6	57299	57304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035464
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1242	NC_014355	CGCGC	2	10	63288	63297	0 %	0 %	40 %	60 %	302035472
1243	NC_014355	AAG	2	6	63372	63377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035472
1244	NC_014355	TCG	2	6	63421	63426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035472
1245	NC_014355	CGC	2	6	63521	63526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035472
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1247	NC_014355	ACC	2	6	63710	63715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035473
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1481	NC_014355	GCG	2	6	73189	73194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035484
1482	NC_014355	ACG	2	6	73216	73221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035484
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1492	NC_014355	AAG	2	6	73629	73634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035484
1493	NC_014355	AGA	2	6	73639	73644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035484
1494	NC_014355	CGA	2	6	73657	73662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035484
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1497	NC_014355	GTG	2	6	73719	73724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035484
1498	NC_014355	CGG	2	6	73736	73741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035484
1499	NC_014355	ACG	2	6	73749	73754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035484
1500	NC_014355	GC	3	6	73785	73790	0 %	0 %	50 %	50 %	302035484

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