MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 79829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014355	GTCG	2	8	24804	24811	0 %	25 %	50 %	25 %	302035423
502	NC_014355	TCG	2	6	24824	24829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035423
503	NC_014355	CGGCG	2	10	24850	24859	0 %	0 %	60 %	40 %	302035423
504	NC_014355	TGCG	2	8	24878	24885	0 %	25 %	50 %	25 %	302035423
505	NC_014355	CAT	2	6	24900	24905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035423
506	NC_014355	CGG	2	6	24906	24911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035423
507	NC_014355	GCCG	2	8	24936	24943	0 %	0 %	50 %	50 %	302035423
508	NC_014355	CAG	2	6	24961	24966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035423
509	NC_014355	CGA	2	6	25078	25083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035423
510	NC_014355	GTGGCG	2	12	25168	25179	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	302035423
511	NC_014355	TGC	2	6	25259	25264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035423
512	NC_014355	GGCC	2	8	25473	25480	0 %	0 %	50 %	50 %	302035423
513	NC_014355	TGT	2	6	25601	25606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035423
514	NC_014355	CG	3	6	25607	25612	0 %	0 %	50 %	50 %	302035423
515	NC_014355	TCA	2	6	25644	25649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035423
516	NC_014355	GGA	2	6	25788	25793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035423
517	NC_014355	CGA	2	6	25818	25823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035423
518	NC_014355	ATC	2	6	25825	25830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035423
519	NC_014355	CCGA	2	8	25882	25889	25 %	0 %	25 %	50 %	302035423
520	NC_014355	CACG	3	12	25969	25980	25 %	0 %	25 %	50 %	302035423
521	NC_014355	CTG	2	6	26017	26022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035423
522	NC_014355	GCT	2	6	26160	26165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035423
523	NC_014355	GT	3	6	26168	26173	0 %	50 %	50 %	0 %	302035423
524	NC_014355	TGG	2	6	26234	26239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035423
525	NC_014355	GAG	2	6	26272	26277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035423
526	NC_014355	TAC	2	6	26299	26304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035423
527	NC_014355	GCC	2	6	26331	26336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035423
528	NC_014355	GCA	2	6	26385	26390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035423
529	NC_014355	CG	3	6	26397	26402	0 %	0 %	50 %	50 %	302035423
530	NC_014355	GAA	2	6	26406	26411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035423
531	NC_014355	ATCGA	2	10	26416	26425	40 %	20 %	20 %	20 %	302035423
532	NC_014355	TGG	2	6	26561	26566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035423
533	NC_014355	GC	3	6	26574	26579	0 %	0 %	50 %	50 %	302035423
534	NC_014355	CAG	2	6	26614	26619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035423
535	NC_014355	TTC	2	6	26621	26626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035423
536	NC_014355	GA	3	6	26636	26641	50 %	0 %	50 %	0 %	302035423
537	NC_014355	CGG	2	6	26655	26660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035423
538	NC_014355	GCG	2	6	26671	26676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035423
539	NC_014355	CAC	2	6	26697	26702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035423
540	NC_014355	GA	3	6	26742	26747	50 %	0 %	50 %	0 %	302035423
541	NC_014355	GCA	2	6	26841	26846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035424
542	NC_014355	GAGC	2	8	26942	26949	25 %	0 %	50 %	25 %	302035424
543	NC_014355	GAT	2	6	26990	26995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035424
544	NC_014355	CAG	2	6	26996	27001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035424
545	NC_014355	GCC	2	6	27014	27019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035424
546	NC_014355	CG	3	6	27044	27049	0 %	0 %	50 %	50 %	302035424
547	NC_014355	AGC	2	6	27144	27149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035424
548	NC_014355	TGGA	2	8	27260	27267	25 %	25 %	50 %	0 %	302035424
549	NC_014355	TCG	2	6	27342	27347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035425
550	NC_014355	GC	3	6	27479	27484	0 %	0 %	50 %	50 %	302035425
551	NC_014355	GAC	2	6	27527	27532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035425
552	NC_014355	CG	3	6	27562	27567	0 %	0 %	50 %	50 %	302035425
553	NC_014355	TGG	2	6	27570	27575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035425
554	NC_014355	GC	3	6	27679	27684	0 %	0 %	50 %	50 %	302035425
555	NC_014355	CCG	2	6	27721	27726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035425
556	NC_014355	ACCG	2	8	27731	27738	25 %	0 %	25 %	50 %	302035425
557	NC_014355	GCA	3	9	27772	27780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035425
558	NC_014355	CGC	2	6	27838	27843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035425
559	NC_014355	AAG	2	6	27906	27911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035425
560	NC_014355	CGA	2	6	27982	27987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035425
561	NC_014355	CGA	2	6	28005	28010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035425
562	NC_014355	TGG	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035425
563	NC_014355	GC	3	6	28062	28067	0 %	0 %	50 %	50 %	302035425
564	NC_014355	TGCC	2	8	28152	28159	0 %	25 %	25 %	50 %	302035425
565	NC_014355	AAG	2	6	28242	28247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035425
566	NC_014355	GAT	2	6	28348	28353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035425
567	NC_014355	GAC	2	6	28364	28369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035425
568	NC_014355	CCG	2	6	28411	28416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035426
569	NC_014355	GT	3	6	28430	28435	0 %	50 %	50 %	0 %	302035426
570	NC_014355	AGC	2	6	28457	28462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035426
571	NC_014355	AGC	2	6	28543	28548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035426
572	NC_014355	TGA	2	6	28550	28555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035426
573	NC_014355	CCG	2	6	28592	28597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035426
574	NC_014355	GC	3	6	28626	28631	0 %	0 %	50 %	50 %	302035426
575	NC_014355	GAA	2	6	28708	28713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035426
576	NC_014355	CTT	2	6	28722	28727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035426
577	NC_014355	CGCAAG	2	12	28762	28773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035426
578	NC_014355	TGA	2	6	28820	28825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035426
579	NC_014355	AGC	2	6	28826	28831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035426
580	NC_014355	CGA	2	6	28910	28915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035426
581	NC_014355	CGG	2	6	28936	28941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035426
582	NC_014355	TC	4	8	29046	29053	0 %	50 %	0 %	50 %	302035426
583	NC_014355	GCA	2	6	29083	29088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035426
584	NC_014355	GTC	2	6	29113	29118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035426
585	NC_014355	GCC	2	6	29233	29238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035426
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587	NC_014355	GCT	2	6	29325	29330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035426
588	NC_014355	GAA	2	6	29344	29349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035426
589	NC_014355	GT	3	6	29357	29362	0 %	50 %	50 %	0 %	302035426
590	NC_014355	GCAG	2	8	29396	29403	25 %	0 %	50 %	25 %	302035426
591	NC_014355	GAC	2	6	29538	29543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035426
592	NC_014355	TCA	2	6	29546	29551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035426
593	NC_014355	CGG	2	6	29618	29623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035426
594	NC_014355	GCG	2	6	29624	29629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035426
595	NC_014355	GGCC	2	8	29775	29782	0 %	0 %	50 %	50 %	302035426
596	NC_014355	GC	3	6	29852	29857	0 %	0 %	50 %	50 %	302035426
597	NC_014355	CGG	2	6	29923	29928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035426
598	NC_014355	GCT	2	6	29937	29942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035426
599	NC_014355	ACG	2	6	29983	29988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035426
600	NC_014355	CGGCG	2	10	30171	30180	0 %	0 %	60 %	40 %	302035426
601	NC_014355	CGA	2	6	30225	30230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035426
602	NC_014355	GGA	2	6	30303	30308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035426
603	NC_014355	GGC	2	6	30342	30347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035426
604	NC_014355	AGG	2	6	30353	30358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035426
605	NC_014355	ACC	2	6	30414	30419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035427
606	NC_014355	CTG	2	6	30435	30440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035427
607	NC_014355	TTG	2	6	30450	30455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035427
608	NC_014355	TGGT	2	8	30465	30472	0 %	50 %	50 %	0 %	302035427
609	NC_014355	CGA	2	6	30608	30613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035427
610	NC_014355	CAT	2	6	30662	30667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035427
611	NC_014355	GGC	2	6	30695	30700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035427
612	NC_014355	GAG	2	6	30801	30806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035427
613	NC_014355	CTCGC	2	10	30963	30972	0 %	20 %	20 %	60 %	302035427
614	NC_014355	CTG	2	6	30975	30980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035427
615	NC_014355	ACA	2	6	31024	31029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035427
616	NC_014355	GCT	2	6	31073	31078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035427
617	NC_014355	CTTC	2	8	31163	31170	0 %	50 %	0 %	50 %	302035427
618	NC_014355	CTG	2	6	31221	31226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035427
619	NC_014355	CTG	2	6	31233	31238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035427
620	NC_014355	GGC	2	6	31253	31258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035427
621	NC_014355	GAT	2	6	31283	31288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035427
622	NC_014355	GACC	2	8	31436	31443	25 %	0 %	25 %	50 %	302035427
623	NC_014355	GCTGGC	2	12	31445	31456	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302035427
624	NC_014355	GCA	2	6	31542	31547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035428
625	NC_014355	GCG	2	6	31563	31568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035428
626	NC_014355	GGAA	2	8	31586	31593	50 %	0 %	50 %	0 %	302035428
627	NC_014355	CG	3	6	31607	31612	0 %	0 %	50 %	50 %	302035428
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753	NC_014355	CCG	2	6	38673	38678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035437
754	NC_014355	CGG	2	6	38811	38816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035437
755	NC_014355	CG	3	6	38863	38868	0 %	0 %	50 %	50 %	302035437
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877	NC_014355	GATC	2	8	44787	44794	25 %	25 %	25 %	25 %	302035445
878	NC_014355	TGA	2	6	44798	44803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035445
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881	NC_014355	GGC	2	6	45054	45059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035445
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999	NC_014355	GATC	2	8	50934	50941	25 %	25 %	25 %	25 %	302035452
1000	NC_014355	CAG	2	6	50956	50961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035452

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