MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 79829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014355	GA	3	6	254932	254937	50 %	0 %	50 %	0 %	302035673
5002	NC_014355	CTGC	2	8	254972	254979	0 %	25 %	25 %	50 %	302035673
5003	NC_014355	CTC	2	6	255016	255021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035673
5004	NC_014355	GCG	2	6	255029	255034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035673
5005	NC_014355	TCT	2	6	255164	255169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035673
5006	NC_014355	AGA	2	6	255403	255408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035674
5007	NC_014355	CGG	2	6	255477	255482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035674
5008	NC_014355	TCG	2	6	255490	255495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035674
5009	NC_014355	GTTGAT	2	12	255536	255547	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302035674
5010	NC_014355	TCG	2	6	255643	255648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035674
5011	NC_014355	TCA	2	6	255664	255669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035674
5012	NC_014355	GCA	2	6	255674	255679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035674
5013	NC_014355	TCA	2	6	255688	255693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035674
5014	NC_014355	AAGC	2	8	255717	255724	50 %	0 %	25 %	25 %	302035674
5015	NC_014355	TAA	2	6	255740	255745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302035674
5016	NC_014355	TCC	2	6	255754	255759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035674
5017	NC_014355	TGCG	2	8	255762	255769	0 %	25 %	50 %	25 %	302035674
5018	NC_014355	GTA	2	6	255905	255910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035674
5019	NC_014355	CTT	2	6	255926	255931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035674
5020	NC_014355	TAA	2	6	255944	255949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302035674
5021	NC_014355	GATT	2	8	256574	256581	25 %	50 %	25 %	0 %	302035675
5022	NC_014355	CGG	2	6	256634	256639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035675
5023	NC_014355	GGC	2	6	256659	256664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035675
5024	NC_014355	GTGGG	2	10	256708	256717	0 %	20 %	80 %	0 %	302035675
5025	NC_014355	GGC	2	6	256773	256778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035675
5026	NC_014355	GGTG	2	8	256822	256829	0 %	25 %	75 %	0 %	302035675
5027	NC_014355	ATTG	2	8	256857	256864	25 %	50 %	25 %	0 %	302035675
5028	NC_014355	TGA	2	6	256871	256876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035675
5029	NC_014355	GGC	2	6	256943	256948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035675
5030	NC_014355	GTGA	2	8	257375	257382	25 %	25 %	50 %	0 %	302035676
5031	NC_014355	GAA	2	6	257429	257434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035676
5032	NC_014355	ACC	2	6	257503	257508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035676
5033	NC_014355	CGG	2	6	257530	257535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035676
5034	NC_014355	TCT	2	6	257750	257755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035677
5035	NC_014355	ACC	2	6	257808	257813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035677
5036	NC_014355	AAC	2	6	257894	257899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035677
5037	NC_014355	TGG	2	6	257928	257933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035678
5038	NC_014355	ATCGA	2	10	257981	257990	40 %	20 %	20 %	20 %	302035678
5039	NC_014355	CAT	2	6	258005	258010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035678
5040	NC_014355	GAAGGT	2	12	258014	258025	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302035678
5041	NC_014355	GCGG	2	8	258053	258060	0 %	0 %	75 %	25 %	302035678
5042	NC_014355	CTT	2	6	258170	258175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035678
5043	NC_014355	TC	3	6	258354	258359	0 %	50 %	0 %	50 %	302035678
5044	NC_014355	CGA	2	6	258370	258375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035678
5045	NC_014355	GGA	2	6	258395	258400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035678
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5047	NC_014355	GTG	2	6	258450	258455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035678
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5049	NC_014355	GAG	2	6	258558	258563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035678
5050	NC_014355	CGG	2	6	258564	258569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035678
5051	NC_014355	CTC	2	6	258813	258818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035678
5052	NC_014355	CGC	2	6	258829	258834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035678
5053	NC_014355	CAT	2	6	258855	258860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035678
5054	NC_014355	TGGAG	2	10	258881	258890	20 %	20 %	60 %	0 %	302035678
5055	NC_014355	GT	3	6	258940	258945	0 %	50 %	50 %	0 %	302035678
5056	NC_014355	A	6	6	258973	258978	100 %	0 %	0 %	0 %	302035678
5057	NC_014355	TGG	2	6	258979	258984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035678
5058	NC_014355	GAAG	2	8	259021	259028	50 %	0 %	50 %	0 %	302035678
5059	NC_014355	ATC	2	6	259267	259272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035679
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5067	NC_014355	GCCG	2	8	259512	259519	0 %	0 %	50 %	50 %	302035679
5068	NC_014355	G	8	8	259800	259807	0 %	0 %	100 %	0 %	302035679
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5091	NC_014355	GAT	2	6	261015	261020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035680
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5093	NC_014355	TCC	2	6	261150	261155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035680
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5100	NC_014355	GCGA	2	8	261456	261463	25 %	0 %	50 %	25 %	302035680
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5104	NC_014355	GGTCA	2	10	261554	261563	20 %	20 %	40 %	20 %	302035681
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5111	NC_014355	G	6	6	261874	261879	0 %	0 %	100 %	0 %	302035681
5112	NC_014355	GCC	3	9	261893	261901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035681
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5118	NC_014355	CAG	2	6	262181	262186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035682
5119	NC_014355	TGA	2	6	262204	262209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035682
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5121	NC_014355	TCA	2	6	262302	262307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035682
5122	NC_014355	CAT	2	6	262363	262368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035682
5123	NC_014355	GCT	2	6	262459	262464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035682
5124	NC_014355	TCT	2	6	262468	262473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035682
5125	NC_014355	CCGTC	2	10	262487	262496	0 %	20 %	20 %	60 %	302035682
5126	NC_014355	AG	4	8	262639	262646	50 %	0 %	50 %	0 %	302035682
5127	NC_014355	CGG	2	6	262675	262680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035682
5128	NC_014355	GGA	2	6	262684	262689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035682
5129	NC_014355	GGC	2	6	262718	262723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035682
5130	NC_014355	GAA	2	6	262735	262740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035682
5131	NC_014355	GAT	2	6	262750	262755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035682
5132	NC_014355	GTC	2	6	262823	262828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035682
5133	NC_014355	GC	3	6	262903	262908	0 %	0 %	50 %	50 %	302035682
5134	NC_014355	CTG	2	6	262949	262954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035682
5135	NC_014355	GACC	2	8	263002	263009	25 %	0 %	25 %	50 %	302035682
5136	NC_014355	CGC	2	6	263023	263028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035682
5137	NC_014355	GAC	2	6	263120	263125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035682
5138	NC_014355	TGA	2	6	263215	263220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035682
5139	NC_014355	AACG	2	8	263258	263265	50 %	0 %	25 %	25 %	302035682
5140	NC_014355	GGC	2	6	263286	263291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035682
5141	NC_014355	CTG	2	6	263312	263317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035682
5142	NC_014355	GAAA	2	8	263347	263354	75 %	0 %	25 %	0 %	302035682
5143	NC_014355	TCG	2	6	263361	263366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035682
5144	NC_014355	GGC	2	6	263440	263445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035682
5145	NC_014355	A	6	6	263482	263487	100 %	0 %	0 %	0 %	302035683
5146	NC_014355	GCCCT	2	10	263506	263515	0 %	20 %	20 %	60 %	302035683
5147	NC_014355	GTC	2	6	263542	263547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035683
5148	NC_014355	G	6	6	263557	263562	0 %	0 %	100 %	0 %	302035683
5149	NC_014355	GTG	2	6	263608	263613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035683
5150	NC_014355	GGC	2	6	263653	263658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035683
5151	NC_014355	GCG	2	6	263734	263739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035683
5152	NC_014355	TCG	2	6	263789	263794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035683
5153	NC_014355	CGG	2	6	263811	263816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035683
5154	NC_014355	CGG	2	6	263844	263849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035683
5155	NC_014355	ATCG	2	8	263958	263965	25 %	25 %	25 %	25 %	302035683
5156	NC_014355	GCT	2	6	263973	263978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035683
5157	NC_014355	ACA	2	6	264050	264055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035683
5158	NC_014355	GGCG	2	8	264072	264079	0 %	0 %	75 %	25 %	302035683
5159	NC_014355	TGC	2	6	264084	264089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035683
5160	NC_014355	GCC	2	6	264152	264157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035683
5161	NC_014355	CGG	2	6	264261	264266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035683
5162	NC_014355	CAT	2	6	264282	264287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035683
5163	NC_014355	TCAC	2	8	264326	264333	25 %	25 %	0 %	50 %	302035683
5164	NC_014355	TCG	2	6	264353	264358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035683
5165	NC_014355	CAT	2	6	264584	264589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035684
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5167	NC_014355	CGG	2	6	264624	264629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035684
5168	NC_014355	CGA	2	6	264631	264636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035684
5169	NC_014355	CG	3	6	264647	264652	0 %	0 %	50 %	50 %	302035684
5170	NC_014355	CGA	2	6	264686	264691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035684
5171	NC_014355	GGC	2	6	264783	264788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035684
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5177	NC_014355	TG	3	6	265175	265180	0 %	50 %	50 %	0 %	302035684
5178	NC_014355	GTG	2	6	265190	265195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035684
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5180	NC_014355	CGTA	2	8	265230	265237	25 %	25 %	25 %	25 %	302035684
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5185	NC_014355	GAT	2	6	265622	265627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035685
5186	NC_014355	GT	3	6	265643	265648	0 %	50 %	50 %	0 %	302035685
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5188	NC_014355	GAC	2	6	265757	265762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035685
5189	NC_014355	CGG	2	6	265777	265782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035685
5190	NC_014355	CG	3	6	265955	265960	0 %	0 %	50 %	50 %	302035686
5191	NC_014355	GTT	2	6	265998	266003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035686
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5193	NC_014355	ATC	2	6	266096	266101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035686
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5196	NC_014355	CGT	2	6	266266	266271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035686
5197	NC_014355	CAG	2	6	266336	266341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035686
5198	NC_014355	CAT	2	6	266473	266478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035686
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5201	NC_014355	GGTT	2	8	266532	266539	0 %	50 %	50 %	0 %	302035686
5202	NC_014355	TCTA	2	8	266676	266683	25 %	50 %	0 %	25 %	302035686
5203	NC_014355	GCA	2	6	266764	266769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035686
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5212	NC_014355	CTG	2	6	267321	267326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035686
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5215	NC_014355	ACCAGC	2	12	267469	267480	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	302035687
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5223	NC_014355	GGCC	2	8	267917	267924	0 %	0 %	50 %	50 %	302035687
5224	NC_014355	CTT	2	6	267941	267946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035687
5225	NC_014355	GCC	2	6	268125	268130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035687
5226	NC_014355	GA	3	6	268136	268141	50 %	0 %	50 %	0 %	302035687
5227	NC_014355	C	6	6	268169	268174	0 %	0 %	0 %	100 %	302035687
5228	NC_014355	GC	3	6	268187	268192	0 %	0 %	50 %	50 %	302035687
5229	NC_014355	CGC	3	9	268190	268198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035687
5230	NC_014355	TGAA	2	8	268228	268235	50 %	25 %	25 %	0 %	302035687
5231	NC_014355	CAAAC	2	10	268308	268317	60 %	0 %	0 %	40 %	302035687
5232	NC_014355	CAGC	2	8	268328	268335	25 %	0 %	25 %	50 %	302035687
5233	NC_014355	GGC	2	6	268355	268360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035687
5234	NC_014355	CGA	2	6	268439	268444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035687
5235	NC_014355	GTGACG	2	12	268477	268488	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302035687
5236	NC_014355	ATAC	2	8	268523	268530	50 %	25 %	0 %	25 %	302035687
5237	NC_014355	ACG	2	6	268572	268577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035687
5238	NC_014355	CGG	2	6	268606	268611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035687
5239	NC_014355	CG	3	6	268649	268654	0 %	0 %	50 %	50 %	302035687
5240	NC_014355	CTT	2	6	268673	268678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035687
5241	NC_014355	GTG	2	6	268690	268695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035687
5242	NC_014355	ACG	2	6	268702	268707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035687
5243	NC_014355	TCT	2	6	268780	268785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035687
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5479	NC_014355	TC	3	6	280267	280272	0 %	50 %	0 %	50 %	302035696
5480	NC_014355	AT	3	6	280349	280354	50 %	50 %	0 %	0 %	302035696
5481	NC_014355	CGA	2	6	280372	280377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035696
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5486	NC_014355	GCGCG	2	10	280709	280718	0 %	0 %	60 %	40 %	302035697
5487	NC_014355	GGA	3	9	280725	280733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035697
5488	NC_014355	GGTCCA	2	12	280746	280757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302035697
5489	NC_014355	GAG	2	6	280798	280803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035697
5490	NC_014355	CCGT	2	8	280834	280841	0 %	25 %	25 %	50 %	302035697
5491	NC_014355	TG	3	6	280860	280865	0 %	50 %	50 %	0 %	302035697
5492	NC_014355	GAAT	2	8	280866	280873	50 %	25 %	25 %	0 %	302035697
5493	NC_014355	CCG	2	6	280878	280883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035697
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5495	NC_014355	G	6	6	280992	280997	0 %	0 %	100 %	0 %	302035697
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5499	NC_014355	GAC	2	6	281193	281198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035697
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