MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 79829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014355	CCCG	2	8	225995	226002	0 %	0 %	25 %	75 %	302035644
4502	NC_014355	CTG	2	6	226091	226096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035644
4503	NC_014355	CGA	2	6	226123	226128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035644
4504	NC_014355	CTT	2	6	226186	226191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035644
4505	NC_014355	GGA	2	6	226193	226198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035644
4506	NC_014355	GCC	2	6	226260	226265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035645
4507	NC_014355	G	6	6	226285	226290	0 %	0 %	100 %	0 %	302035645
4508	NC_014355	A	6	6	226402	226407	100 %	0 %	0 %	0 %	302035645
4509	NC_014355	GAC	2	6	226552	226557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035646
4510	NC_014355	CG	4	8	226632	226639	0 %	0 %	50 %	50 %	302035646
4511	NC_014355	TG	3	6	226649	226654	0 %	50 %	50 %	0 %	302035646
4512	NC_014355	TCG	2	6	226787	226792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035646
4513	NC_014355	CGA	2	6	226809	226814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035646
4514	NC_014355	TCT	2	6	226862	226867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035646
4515	NC_014355	GCA	2	6	226881	226886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035646
4516	NC_014355	GAT	2	6	226963	226968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035646
4517	NC_014355	CGC	2	6	226992	226997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035646
4518	NC_014355	TGAA	2	8	227027	227034	50 %	25 %	25 %	0 %	302035646
4519	NC_014355	GGC	2	6	227066	227071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035646
4520	NC_014355	CTG	2	6	227110	227115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035646
4521	NC_014355	CTA	2	6	227165	227170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035646
4522	NC_014355	TCG	2	6	227183	227188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035646
4523	NC_014355	CGG	2	6	227229	227234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035646
4524	NC_014355	GTG	2	6	227297	227302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035646
4525	NC_014355	TGCCGG	2	12	227364	227375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302035646
4526	NC_014355	TCG	2	6	227417	227422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035646
4527	NC_014355	CAC	2	6	227503	227508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035646
4528	NC_014355	GGT	2	6	227520	227525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035646
4529	NC_014355	TTC	2	6	227543	227548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035646
4530	NC_014355	TCC	2	6	227564	227569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035646
4531	NC_014355	CCT	2	6	227574	227579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035646
4532	NC_014355	TCC	2	6	227585	227590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035646
4533	NC_014355	ATG	2	6	227594	227599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035646
4534	NC_014355	TGC	2	6	227730	227735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035646
4535	NC_014355	GCC	2	6	227766	227771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035647
4536	NC_014355	TGA	2	6	227825	227830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035647
4537	NC_014355	CTT	2	6	227858	227863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035647
4538	NC_014355	TC	3	6	227969	227974	0 %	50 %	0 %	50 %	302035647
4539	NC_014355	TCC	2	6	228012	228017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035647
4540	NC_014355	AGG	2	6	228085	228090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035647
4541	NC_014355	ATCGT	2	10	228154	228163	20 %	40 %	20 %	20 %	302035647
4542	NC_014355	ATCG	2	8	228285	228292	25 %	25 %	25 %	25 %	302035647
4543	NC_014355	AAGA	2	8	228300	228307	75 %	0 %	25 %	0 %	302035647
4544	NC_014355	AGG	2	6	228322	228327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035647
4545	NC_014355	CGC	2	6	228353	228358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035647
4546	NC_014355	GTC	2	6	228588	228593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035648
4547	NC_014355	CTT	2	6	228632	228637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035648
4548	NC_014355	GCC	2	6	228718	228723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035648
4549	NC_014355	AGGT	2	8	228815	228822	25 %	25 %	50 %	0 %	302035648
4550	NC_014355	TTG	2	6	228867	228872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035648
4551	NC_014355	ATG	2	6	228924	228929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035648
4552	NC_014355	TCTT	2	8	228979	228986	0 %	75 %	0 %	25 %	302035648
4553	NC_014355	TCG	2	6	229066	229071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035648
4554	NC_014355	GT	3	6	229155	229160	0 %	50 %	50 %	0 %	302035648
4555	NC_014355	CCTT	2	8	229195	229202	0 %	50 %	0 %	50 %	302035648
4556	NC_014355	CTT	2	6	229274	229279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035648
4557	NC_014355	TGT	2	6	229353	229358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035648
4558	NC_014355	CGG	2	6	229361	229366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035648
4559	NC_014355	AG	3	6	229456	229461	50 %	0 %	50 %	0 %	302035648
4560	NC_014355	T	6	6	229542	229547	0 %	100 %	0 %	0 %	302035648
4561	NC_014355	GGA	2	6	229567	229572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035648
4562	NC_014355	ATA	2	6	229620	229625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302035648
4563	NC_014355	GGAGC	2	10	229691	229700	20 %	0 %	60 %	20 %	302035648
4564	NC_014355	CTTT	2	8	230329	230336	0 %	75 %	0 %	25 %	302035649
4565	NC_014355	ACT	2	6	230398	230403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035649
4566	NC_014355	GGT	2	6	230456	230461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035649
4567	NC_014355	GTC	3	9	230574	230582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035649
4568	NC_014355	CGG	2	6	230623	230628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035649
4569	NC_014355	CGGA	2	8	230739	230746	25 %	0 %	50 %	25 %	302035649
4570	NC_014355	G	6	6	230783	230788	0 %	0 %	100 %	0 %	302035649
4571	NC_014355	CTT	2	6	230852	230857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035649
4572	NC_014355	GA	3	6	230953	230958	50 %	0 %	50 %	0 %	302035649
4573	NC_014355	TGG	2	6	230959	230964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035649
4574	NC_014355	GCG	2	6	231024	231029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035649
4575	NC_014355	AGG	2	6	231052	231057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035649
4576	NC_014355	CGG	2	6	231115	231120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035649
4577	NC_014355	CCG	2	6	231171	231176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035649
4578	NC_014355	CTT	2	6	231177	231182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035649
4579	NC_014355	CGAC	2	8	231254	231261	25 %	0 %	25 %	50 %	302035649
4580	NC_014355	AGA	2	6	231301	231306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035649
4581	NC_014355	C	6	6	231318	231323	0 %	0 %	0 %	100 %	302035649
4582	NC_014355	AAG	2	6	231336	231341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035649
4583	NC_014355	AGG	2	6	231346	231351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035649
4584	NC_014355	GCG	2	6	231814	231819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035650
4585	NC_014355	ATG	2	6	231952	231957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035650
4586	NC_014355	GT	3	6	232003	232008	0 %	50 %	50 %	0 %	302035650
4587	NC_014355	GGT	2	6	232019	232024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035650
4588	NC_014355	GAT	2	6	232038	232043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035650
4589	NC_014355	GAA	2	6	232160	232165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035650
4590	NC_014355	GAT	2	6	232262	232267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035650
4591	NC_014355	GTC	2	6	232278	232283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035650
4592	NC_014355	GAC	2	6	232325	232330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035650
4593	NC_014355	CGGC	2	8	232372	232379	0 %	0 %	50 %	50 %	302035650
4594	NC_014355	GCG	2	6	232443	232448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035650
4595	NC_014355	GCC	2	6	232455	232460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035650
4596	NC_014355	TGG	2	6	232480	232485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035650
4597	NC_014355	TGGG	2	8	232499	232506	0 %	25 %	75 %	0 %	302035650
4598	NC_014355	GTGG	2	8	232566	232573	0 %	25 %	75 %	0 %	302035650
4599	NC_014355	GAT	2	6	232574	232579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035650
4600	NC_014355	GCT	2	6	232726	232731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035650
4601	NC_014355	GCC	2	6	232743	232748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035650
4602	NC_014355	ACG	2	6	232785	232790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035650
4603	NC_014355	ATC	2	6	232873	232878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035650
4604	NC_014355	GGAA	2	8	232915	232922	50 %	0 %	50 %	0 %	302035650
4605	NC_014355	GCG	2	6	232974	232979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035650
4606	NC_014355	GAT	2	6	233158	233163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035651
4607	NC_014355	GGC	2	6	233172	233177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035651
4608	NC_014355	CTGC	2	8	233185	233192	0 %	25 %	25 %	50 %	302035651
4609	NC_014355	CGG	2	6	233256	233261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035651
4610	NC_014355	T	6	6	233337	233342	0 %	100 %	0 %	0 %	302035651
4611	NC_014355	GT	3	6	233372	233377	0 %	50 %	50 %	0 %	302035651
4612	NC_014355	CAGCG	2	10	233458	233467	20 %	0 %	40 %	40 %	302035651
4613	NC_014355	TTC	2	6	233578	233583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035651
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4615	NC_014355	TTCCG	2	10	233601	233610	0 %	40 %	20 %	40 %	302035651
4616	NC_014355	GGC	2	6	233674	233679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035651
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4618	NC_014355	TCC	2	6	233755	233760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035651
4619	NC_014355	CTG	2	6	233771	233776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035651
4620	NC_014355	GCG	2	6	233799	233804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035651
4621	NC_014355	TC	3	6	233810	233815	0 %	50 %	0 %	50 %	302035651
4622	NC_014355	TGC	2	6	233842	233847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035651
4623	NC_014355	GCCTG	2	10	233856	233865	0 %	20 %	40 %	40 %	302035651
4624	NC_014355	ATC	2	6	233879	233884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035651
4625	NC_014355	GCT	2	6	233964	233969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035651
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4630	NC_014355	GTC	2	6	234257	234262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035651
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4632	NC_014355	ATG	2	6	234348	234353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035651
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4641	NC_014355	GGCC	2	8	235054	235061	0 %	0 %	50 %	50 %	302035652
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4660	NC_014355	CT	3	6	235846	235851	0 %	50 %	0 %	50 %	302035652
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4679	NC_014355	GCGA	2	8	236767	236774	25 %	0 %	50 %	25 %	302035654
4680	NC_014355	TCCT	2	8	236781	236788	0 %	50 %	0 %	50 %	302035654
4681	NC_014355	CGC	2	6	236813	236818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035654
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4703	NC_014355	CT	3	6	238284	238289	0 %	50 %	0 %	50 %	302035656
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4705	NC_014355	CTG	2	6	238370	238375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035656
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4720	NC_014355	CGA	2	6	238972	238977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035657
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4731	NC_014355	CCA	2	6	239407	239412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035657
4732	NC_014355	CCAG	2	8	239638	239645	25 %	0 %	25 %	50 %	302035657
4733	NC_014355	GCC	2	6	239650	239655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035657
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4743	NC_014355	TGC	2	6	239979	239984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035657
4744	NC_014355	GGA	2	6	240010	240015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035657
4745	NC_014355	GGC	2	6	240064	240069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035657
4746	NC_014355	CTC	2	6	240110	240115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035657
4747	NC_014355	GCT	2	6	240124	240129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035657
4748	NC_014355	GTC	2	6	240155	240160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035657
4749	NC_014355	CGG	2	6	240281	240286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035657
4750	NC_014355	GAT	2	6	240293	240298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035657
4751	NC_014355	CGGG	2	8	240383	240390	0 %	0 %	75 %	25 %	302035657
4752	NC_014355	GTT	2	6	240406	240411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035658
4753	NC_014355	CCT	2	6	240470	240475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035658
4754	NC_014355	GCCCT	2	10	240480	240489	0 %	20 %	20 %	60 %	302035658
4755	NC_014355	TGA	2	6	240587	240592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035658
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4757	NC_014355	CTG	2	6	240623	240628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035658
4758	NC_014355	CGC	2	6	240667	240672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035658
4759	NC_014355	GCG	2	6	240720	240725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035658
4760	NC_014355	TCT	2	6	240742	240747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035658
4761	NC_014355	CGGCC	2	10	240776	240785	0 %	0 %	40 %	60 %	302035658
4762	NC_014355	GTT	2	6	240826	240831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035658
4763	NC_014355	GCG	2	6	240864	240869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035658
4764	NC_014355	T	9	9	240914	240922	0 %	100 %	0 %	0 %	302035658
4765	NC_014355	GGC	2	6	240999	241004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035659
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4767	NC_014355	ACCG	2	8	241096	241103	25 %	0 %	25 %	50 %	302035659
4768	NC_014355	ACG	2	6	241147	241152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035659
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4770	NC_014355	GTT	2	6	241253	241258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035659
4771	NC_014355	TCG	2	6	241271	241276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035659
4772	NC_014355	CGA	2	6	241343	241348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035659
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4774	NC_014355	GTC	2	6	241356	241361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035659
4775	NC_014355	GC	3	6	241386	241391	0 %	0 %	50 %	50 %	302035659
4776	NC_014355	GTA	2	6	241533	241538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035659
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4784	NC_014355	GC	3	6	241804	241809	0 %	0 %	50 %	50 %	302035659
4785	NC_014355	CAC	2	6	241880	241885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035659
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4788	NC_014355	ACA	2	6	242105	242110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035659
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4794	NC_014355	TGC	2	6	242339	242344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035659
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4801	NC_014355	CG	3	6	242858	242863	0 %	0 %	50 %	50 %	302035660
4802	NC_014355	TCG	2	6	242898	242903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035660
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4804	NC_014355	CTG	2	6	243029	243034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035660
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4807	NC_014355	GCT	2	6	243195	243200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035660
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4809	NC_014355	CTG	2	6	243348	243353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035660
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4811	NC_014355	CTGC	2	8	243395	243402	0 %	25 %	25 %	50 %	302035660
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4823	NC_014355	GCG	2	6	244097	244102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035661
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4830	NC_014355	CCTTG	2	10	244391	244400	0 %	40 %	20 %	40 %	302035662
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4833	NC_014355	GCCG	2	8	244599	244606	0 %	0 %	50 %	50 %	302035662
4834	NC_014355	TCT	2	6	244610	244615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035662
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4849	NC_014355	GGA	2	6	245587	245592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035662
4850	NC_014355	ATT	2	6	245916	245921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302035662
4851	NC_014355	TCGG	2	8	245932	245939	0 %	25 %	50 %	25 %	302035662
4852	NC_014355	TCGA	2	8	245980	245987	25 %	25 %	25 %	25 %	302035662
4853	NC_014355	CGG	2	6	246069	246074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035662
4854	NC_014355	TGA	2	6	246137	246142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035662
4855	NC_014355	CCTCGA	2	12	246164	246175	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302035662
4856	NC_014355	AGC	2	6	246187	246192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035662
4857	NC_014355	GCA	2	6	246194	246199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035662
4858	NC_014355	AG	3	6	246222	246227	50 %	0 %	50 %	0 %	302035662
4859	NC_014355	GTC	2	6	246258	246263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035662
4860	NC_014355	GCC	2	6	246276	246281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035662
4861	NC_014355	CGA	2	6	246413	246418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035662
4862	NC_014355	AGC	2	6	246430	246435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035662
4863	NC_014355	TCA	2	6	246467	246472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035662
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4865	NC_014355	GAC	2	6	247259	247264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035663
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4991	NC_014355	TTC	2	6	254247	254252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035671
4992	NC_014355	CTT	2	6	254270	254275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035671
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