MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 1076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014329	ACCAC	2	10	1693	1702	40 %	0 %	0 %	60 %	300857418
2	NC_014329	CACGC	2	10	5734	5743	20 %	0 %	20 %	60 %	300857422
3	NC_014329	CAGTG	2	10	15502	15511	20 %	20 %	40 %	20 %	300857431
4	NC_014329	AAAAT	2	10	16762	16771	80 %	20 %	0 %	0 %	300857432
5	NC_014329	CTTTT	2	10	19237	19246	0 %	80 %	0 %	20 %	300857436
6	NC_014329	GCTCT	2	10	19274	19283	0 %	40 %	20 %	40 %	300857436
7	NC_014329	TGGAT	2	10	23215	23224	20 %	40 %	40 %	0 %	300857445
8	NC_014329	TGCGT	2	10	24499	24508	0 %	40 %	40 %	20 %	300857446
9	NC_014329	CTGAT	2	10	28530	28539	20 %	40 %	20 %	20 %	300857450
10	NC_014329	GGAGC	2	10	29483	29492	20 %	0 %	60 %	20 %	300857451
11	NC_014329	TTGCT	2	10	30571	30580	0 %	60 %	20 %	20 %	300857452
12	NC_014329	TGAGG	2	10	37404	37413	20 %	20 %	60 %	0 %	300857456
13	NC_014329	TGCGG	2	10	40521	40530	0 %	20 %	60 %	20 %	300857460
14	NC_014329	GCCTC	2	10	47299	47308	0 %	20 %	20 %	60 %	300857466
15	NC_014329	GAAGG	2	10	47313	47322	40 %	0 %	60 %	0 %	300857466
16	NC_014329	CAGTG	2	10	49244	49253	20 %	20 %	40 %	20 %	300857468
17	NC_014329	TGAGA	2	10	49586	49595	40 %	20 %	40 %	0 %	300857468
18	NC_014329	AGTGA	2	10	49636	49645	40 %	20 %	40 %	0 %	300857468
19	NC_014329	CTGGC	2	10	53060	53069	0 %	20 %	40 %	40 %	300857472
20	NC_014329	GCAGC	2	10	53559	53568	20 %	0 %	40 %	40 %	300857472
21	NC_014329	GACTG	2	10	53575	53584	20 %	20 %	40 %	20 %	300857472
22	NC_014329	AAGGC	2	10	55816	55825	40 %	0 %	40 %	20 %	300857474
23	NC_014329	ATGGC	2	10	58676	58685	20 %	20 %	40 %	20 %	300857478
24	NC_014329	ATGTG	2	10	62845	62854	20 %	40 %	40 %	0 %	300857482
25	NC_014329	GCTGG	2	10	65006	65015	0 %	20 %	60 %	20 %	300857484
26	NC_014329	AGGGA	2	10	67614	67623	40 %	0 %	60 %	0 %	300857486
27	NC_014329	AAGAT	2	10	69421	69430	60 %	20 %	20 %	0 %	300857488
28	NC_014329	GGAGC	2	10	69528	69537	20 %	0 %	60 %	20 %	300857488
29	NC_014329	GGTCT	2	10	71242	71251	0 %	40 %	40 %	20 %	300857490
30	NC_014329	CAGCG	2	10	72698	72707	20 %	0 %	40 %	40 %	300857491
31	NC_014329	CAGGC	2	10	73104	73113	20 %	0 %	40 %	40 %	300857491
32	NC_014329	ATGGC	2	10	73949	73958	20 %	20 %	40 %	20 %	300857492
33	NC_014329	AGGCA	2	10	75269	75278	40 %	0 %	40 %	20 %	300857493
34	NC_014329	GCTTT	2	10	81110	81119	0 %	60 %	20 %	20 %	300857500
35	NC_014329	TGACC	2	10	81366	81375	20 %	20 %	20 %	40 %	300857500
36	NC_014329	CGTTA	2	10	82108	82117	20 %	40 %	20 %	20 %	300857501
37	NC_014329	TGCTG	2	10	82742	82751	0 %	40 %	40 %	20 %	300857501
38	NC_014329	TGGCC	2	10	84733	84742	0 %	20 %	40 %	40 %	300857502
39	NC_014329	GCGAC	2	10	85537	85546	20 %	0 %	40 %	40 %	300857502
40	NC_014329	TGGGA	2	10	88952	88961	20 %	20 %	60 %	0 %	300857508
41	NC_014329	CAAAA	2	10	90783	90792	80 %	0 %	0 %	20 %	300857510
42	NC_014329	TGCAA	2	10	96631	96640	40 %	20 %	20 %	20 %	300857515
43	NC_014329	TGCAG	2	10	96851	96860	20 %	20 %	40 %	20 %	300857515
44	NC_014329	AGGTC	2	10	99287	99296	20 %	20 %	40 %	20 %	300857518
45	NC_014329	ACCAA	2	10	101146	101155	60 %	0 %	0 %	40 %	300857518
46	NC_014329	TCATC	2	10	102409	102418	20 %	40 %	0 %	40 %	300857519
47	NC_014329	ACCTG	2	10	104439	104448	20 %	20 %	20 %	40 %	300857520
48	NC_014329	CGGTG	2	10	104648	104657	0 %	20 %	60 %	20 %	300857520
49	NC_014329	CGGCG	2	10	107267	107276	0 %	0 %	60 %	40 %	300857523
50	NC_014329	CGCGG	2	10	107327	107336	0 %	0 %	60 %	40 %	300857524
51	NC_014329	CAGCG	2	10	107863	107872	20 %	0 %	40 %	40 %	300857525
52	NC_014329	GGATC	2	10	118429	118438	20 %	20 %	40 %	20 %	300857537
53	NC_014329	CGGGA	2	10	125546	125555	20 %	0 %	60 %	20 %	300857542
54	NC_014329	GACTG	2	10	127807	127816	20 %	20 %	40 %	20 %	300857545
55	NC_014329	TTGGT	2	10	129116	129125	0 %	60 %	40 %	0 %	300857545
56	NC_014329	GTGCG	2	10	131440	131449	0 %	20 %	60 %	20 %	300857547
57	NC_014329	GTGGC	2	10	133177	133186	0 %	20 %	60 %	20 %	300857549
58	NC_014329	CGCGT	2	10	133497	133506	0 %	20 %	40 %	40 %	300857550
59	NC_014329	GGGGC	2	10	133625	133634	0 %	0 %	80 %	20 %	300857550
60	NC_014329	GGGGC	2	10	135648	135657	0 %	0 %	80 %	20 %	300857552
61	NC_014329	ACGGT	2	10	136804	136813	20 %	20 %	40 %	20 %	300857553
62	NC_014329	CGATC	2	10	137077	137086	20 %	20 %	20 %	40 %	300857553
63	NC_014329	TGGCC	2	10	137284	137293	0 %	20 %	40 %	40 %	300857553
64	NC_014329	TGGTG	2	10	137662	137671	0 %	40 %	60 %	0 %	300857553
65	NC_014329	GGAGT	2	10	138134	138143	20 %	20 %	60 %	0 %	300857553
66	NC_014329	ATTGC	2	10	142068	142077	20 %	40 %	20 %	20 %	300857556
67	NC_014329	TCACT	2	10	145939	145948	20 %	40 %	0 %	40 %	300857560
68	NC_014329	ATTTC	2	10	146556	146565	20 %	60 %	0 %	20 %	300857560
69	NC_014329	AATGG	2	10	150256	150265	40 %	20 %	40 %	0 %	300857563
70	NC_014329	GTGAG	2	10	151239	151248	20 %	20 %	60 %	0 %	300857565
71	NC_014329	CTGAA	2	10	152037	152046	40 %	20 %	20 %	20 %	300857565
72	NC_014329	CCAGC	2	10	153329	153338	20 %	0 %	20 %	60 %	300857566
73	NC_014329	TTGCC	2	10	153839	153848	0 %	40 %	20 %	40 %	300857567
74	NC_014329	TACGC	2	10	156355	156364	20 %	20 %	20 %	40 %	300857570
75	NC_014329	GCGAC	2	10	159849	159858	20 %	0 %	40 %	40 %	300857574
76	NC_014329	GGTTG	2	10	161125	161134	0 %	40 %	60 %	0 %	300857576
77	NC_014329	CCTTG	2	10	161501	161510	0 %	40 %	20 %	40 %	300857577
78	NC_014329	CGGTG	2	10	165471	165480	0 %	20 %	60 %	20 %	300857580
79	NC_014329	CATGG	2	10	167604	167613	20 %	20 %	40 %	20 %	300857582
80	NC_014329	CAGAT	2	10	167960	167969	40 %	20 %	20 %	20 %	300857582
81	NC_014329	GGATG	2	10	168858	168867	20 %	20 %	60 %	0 %	300857582
82	NC_014329	AAACT	2	10	172542	172551	60 %	20 %	0 %	20 %	300857584
83	NC_014329	ACCGG	2	10	172937	172946	20 %	0 %	40 %	40 %	300857584
84	NC_014329	ATTGA	2	10	178747	178756	40 %	40 %	20 %	0 %	300857588
85	NC_014329	GTGGA	2	10	181156	181165	20 %	20 %	60 %	0 %	300857589
86	NC_014329	TGACC	2	10	185406	185415	20 %	20 %	20 %	40 %	300857592
87	NC_014329	GTTTG	2	10	188631	188640	0 %	60 %	40 %	0 %	300857594
88	NC_014329	CGGAT	2	10	189571	189580	20 %	20 %	40 %	20 %	300857595
89	NC_014329	AGCGC	2	10	190729	190738	20 %	0 %	40 %	40 %	300857596
90	NC_014329	GCAGT	2	10	192216	192225	20 %	20 %	40 %	20 %	300857597
91	NC_014329	CAATG	2	10	192487	192496	40 %	20 %	20 %	20 %	300857597
92	NC_014329	TAACG	2	10	193462	193471	40 %	20 %	20 %	20 %	300857598
93	NC_014329	AAGCC	2	10	194789	194798	40 %	0 %	20 %	40 %	300857599
94	NC_014329	GGCCC	2	10	196861	196870	0 %	0 %	40 %	60 %	300857602
95	NC_014329	GAATT	2	10	200426	200435	40 %	40 %	20 %	0 %	300857607
96	NC_014329	CAAGG	2	10	201315	201324	40 %	0 %	40 %	20 %	300857607
97	NC_014329	GATGG	2	10	203764	203773	20 %	20 %	60 %	0 %	300857608
98	NC_014329	TGGCG	2	10	204498	204507	0 %	20 %	60 %	20 %	300857609
99	NC_014329	TGCCA	2	10	206521	206530	20 %	20 %	20 %	40 %	300857610
100	NC_014329	AAATA	2	10	206623	206632	80 %	20 %	0 %	0 %	300857610
101	NC_014329	ATTCT	2	10	207219	207228	20 %	60 %	0 %	20 %	300857611
102	NC_014329	CAGGC	2	10	212036	212045	20 %	0 %	40 %	40 %	300857616
103	NC_014329	TTGTA	2	10	212446	212455	20 %	60 %	20 %	0 %	300857617
104	NC_014329	GCGAC	2	10	216962	216971	20 %	0 %	40 %	40 %	300857622
105	NC_014329	AGATC	2	10	216987	216996	40 %	20 %	20 %	20 %	300857622
106	NC_014329	CAAGG	2	10	217901	217910	40 %	0 %	40 %	20 %	300857623
107	NC_014329	AGAAA	2	10	218630	218639	80 %	0 %	20 %	0 %	300857624
108	NC_014329	CGGGG	2	10	224664	224673	0 %	0 %	80 %	20 %	300857631
109	NC_014329	TGCGC	2	10	227104	227113	0 %	20 %	40 %	40 %	300857634
110	NC_014329	CACTG	2	10	228264	228273	20 %	20 %	20 %	40 %	300857635
111	NC_014329	CATTG	2	10	228953	228962	20 %	40 %	20 %	20 %	300857636
112	NC_014329	CGCAA	2	10	229767	229776	40 %	0 %	20 %	40 %	300857639
113	NC_014329	GATCG	2	10	230085	230094	20 %	20 %	40 %	20 %	300857640
114	NC_014329	CAAGA	2	10	231997	232006	60 %	0 %	20 %	20 %	300857640
115	NC_014329	TGGCT	2	10	232193	232202	0 %	40 %	40 %	20 %	300857640
116	NC_014329	CTGTG	2	10	233512	233521	0 %	40 %	40 %	20 %	300857642
117	NC_014329	GCCGT	2	10	234913	234922	0 %	20 %	40 %	40 %	300857642
118	NC_014329	AGAAA	2	10	235820	235829	80 %	0 %	20 %	0 %	300857642
119	NC_014329	AGAGT	2	10	239247	239256	40 %	20 %	40 %	0 %	300857644
120	NC_014329	TTTTG	2	10	241546	241555	0 %	80 %	20 %	0 %	300857646
121	NC_014329	GCCAT	2	10	244903	244912	20 %	20 %	20 %	40 %	300857649
122	NC_014329	CGCAG	2	10	247959	247968	20 %	0 %	40 %	40 %	300857652
123	NC_014329	CATGC	2	10	249730	249739	20 %	20 %	20 %	40 %	300857653
124	NC_014329	CCATG	2	10	249961	249970	20 %	20 %	20 %	40 %	300857653
125	NC_014329	AATTG	2	10	250134	250143	40 %	40 %	20 %	0 %	300857653
126	NC_014329	CCCCG	2	10	254786	254795	0 %	0 %	20 %	80 %	300857657
127	NC_014329	GAAGT	2	10	255327	255336	40 %	20 %	40 %	0 %	300857657
128	NC_014329	CCGTG	2	10	255513	255522	0 %	20 %	40 %	40 %	300857657
129	NC_014329	TGCTC	2	10	260453	260462	0 %	40 %	20 %	40 %	300857661
130	NC_014329	TTGGA	2	10	262371	262380	20 %	40 %	40 %	0 %	300857663
131	NC_014329	GGCTC	2	10	262693	262702	0 %	20 %	40 %	40 %	300857664
132	NC_014329	TCCTT	2	10	263423	263432	0 %	60 %	0 %	40 %	300857665
133	NC_014329	GGAAG	2	10	264109	264118	40 %	0 %	60 %	0 %	300857666
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383	NC_014329	GGTTG	2	10	779011	779020	0 %	40 %	60 %	0 %	300858154
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387	NC_014329	CGATC	2	10	792623	792632	20 %	20 %	20 %	40 %	300858166
388	NC_014329	AGCTG	2	10	792905	792914	20 %	20 %	40 %	20 %	300858166
389	NC_014329	GCGAT	2	10	795535	795544	20 %	20 %	40 %	20 %	300858168
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