MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014329	AGA	2	6	234661	234666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857642
4002	NC_014329	TCG	2	6	234699	234704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4003	NC_014329	GAT	2	6	234720	234725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857642
4004	NC_014329	CGC	2	6	234728	234733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857642
4005	NC_014329	CGG	2	6	234824	234829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857642
4006	NC_014329	CG	3	6	234869	234874	0 %	0 %	50 %	50 %	300857642
4007	NC_014329	GCCGT	2	10	234913	234922	0 %	20 %	40 %	40 %	300857642
4008	NC_014329	GC	3	6	235001	235006	0 %	0 %	50 %	50 %	300857642
4009	NC_014329	TC	3	6	235010	235015	0 %	50 %	0 %	50 %	300857642
4010	NC_014329	ACC	3	9	235020	235028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857642
4011	NC_014329	AAGG	2	8	235131	235138	50 %	0 %	50 %	0 %	300857642
4012	NC_014329	GAT	2	6	235173	235178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857642
4013	NC_014329	TCG	2	6	235213	235218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4014	NC_014329	AGC	2	6	235243	235248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4015	NC_014329	TGC	2	6	235250	235255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4016	NC_014329	AGAA	2	8	235303	235310	75 %	0 %	25 %	0 %	300857642
4017	NC_014329	TCG	2	6	235327	235332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4018	NC_014329	AGCC	2	8	235378	235385	25 %	0 %	25 %	50 %	300857642
4019	NC_014329	CGCT	2	8	235518	235525	0 %	25 %	25 %	50 %	300857642
4020	NC_014329	CCG	2	6	235568	235573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857642
4021	NC_014329	ACG	2	6	235592	235597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4022	NC_014329	CGTG	2	8	235670	235677	0 %	25 %	50 %	25 %	300857642
4023	NC_014329	CTT	2	6	235720	235725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857642
4024	NC_014329	CGA	2	6	235728	235733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4025	NC_014329	CGA	2	6	235736	235741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
4026	NC_014329	AGG	2	6	235798	235803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857642
4027	NC_014329	AGAAA	2	10	235820	235829	80 %	0 %	20 %	0 %	300857642
4028	NC_014329	A	6	6	235836	235841	100 %	0 %	0 %	0 %	300857642
4029	NC_014329	GAA	2	6	235847	235852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857642
4030	NC_014329	CCA	2	6	235855	235860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857642
4031	NC_014329	A	6	6	235875	235880	100 %	0 %	0 %	0 %	300857642
4032	NC_014329	A	6	6	235887	235892	100 %	0 %	0 %	0 %	300857642
4033	NC_014329	TGC	2	6	236089	236094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4034	NC_014329	GAAC	2	8	236125	236132	50 %	0 %	25 %	25 %	300857643
4035	NC_014329	ATG	2	6	236136	236141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4036	NC_014329	TCC	2	6	236204	236209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857643
4037	NC_014329	ATG	2	6	236358	236363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4038	NC_014329	ATGCCC	2	12	236388	236399	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300857643
4039	NC_014329	GA	3	6	236403	236408	50 %	0 %	50 %	0 %	300857643
4040	NC_014329	TCG	2	6	236445	236450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4041	NC_014329	ATG	3	9	236451	236459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4042	NC_014329	AGT	2	6	236541	236546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4043	NC_014329	GCC	2	6	236547	236552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857643
4044	NC_014329	GAG	2	6	236554	236559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857643
4045	NC_014329	CAAAGC	2	12	236596	236607	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	300857643
4046	NC_014329	GGGA	2	8	236630	236637	25 %	0 %	75 %	0 %	300857643
4047	NC_014329	TGA	2	6	236638	236643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4048	NC_014329	GAT	2	6	236663	236668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4049	NC_014329	CTG	2	6	236678	236683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4050	NC_014329	ACC	2	6	236763	236768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857643
4051	NC_014329	ACC	2	6	236832	236837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857643
4052	NC_014329	AAC	2	6	236861	236866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857643
4053	NC_014329	GAT	2	6	236867	236872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4054	NC_014329	TG	3	6	236993	236998	0 %	50 %	50 %	0 %	300857643
4055	NC_014329	TGAA	2	8	237018	237025	50 %	25 %	25 %	0 %	300857643
4056	NC_014329	GCA	2	6	237049	237054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4057	NC_014329	CAA	2	6	237073	237078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857643
4058	NC_014329	CCT	2	6	237120	237125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857643
4059	NC_014329	GAT	2	6	237182	237187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4060	NC_014329	GCACCG	2	12	237222	237233	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300857643
4061	NC_014329	CGA	2	6	237250	237255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4062	NC_014329	CGC	2	6	237283	237288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857643
4063	NC_014329	AGC	2	6	237302	237307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4064	NC_014329	ATA	2	6	237322	237327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857643
4065	NC_014329	CCA	2	6	237435	237440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857643
4066	NC_014329	AGT	2	6	237455	237460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4067	NC_014329	CAG	2	6	237494	237499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4068	NC_014329	AG	3	6	237498	237503	50 %	0 %	50 %	0 %	300857643
4069	NC_014329	T	6	6	237548	237553	0 %	100 %	0 %	0 %	300857643
4070	NC_014329	TTC	2	6	237566	237571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857643
4071	NC_014329	CGT	2	6	237583	237588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4072	NC_014329	CGC	2	6	237694	237699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857643
4073	NC_014329	CCA	2	6	237743	237748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857643
4074	NC_014329	ATG	2	6	237756	237761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4075	NC_014329	GGA	2	6	237769	237774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857643
4076	NC_014329	ACG	2	6	237822	237827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4077	NC_014329	ACG	2	6	237857	237862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4078	NC_014329	CAG	2	6	237883	237888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857643
4079	NC_014329	GGC	2	6	237941	237946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857643
4080	NC_014329	GCC	2	6	237968	237973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857643
4081	NC_014329	GAT	2	6	237974	237979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857643
4082	NC_014329	GC	3	6	237984	237989	0 %	0 %	50 %	50 %	300857643
4083	NC_014329	AAGT	2	8	237991	237998	50 %	25 %	25 %	0 %	300857643
4084	NC_014329	TCA	2	6	238303	238308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857644
4085	NC_014329	TGC	2	6	238309	238314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857644
4086	NC_014329	GC	3	6	238349	238354	0 %	0 %	50 %	50 %	300857644
4087	NC_014329	CTT	2	6	238373	238378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857644
4088	NC_014329	CCG	2	6	238491	238496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857644
4089	NC_014329	CAA	2	6	238507	238512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857644
4090	NC_014329	GCG	2	6	238581	238586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857644
4091	NC_014329	GCG	2	6	238644	238649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857644
4092	NC_014329	TGC	2	6	238669	238674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857644
4093	NC_014329	A	6	6	238709	238714	100 %	0 %	0 %	0 %	300857644
4094	NC_014329	GGT	2	6	238763	238768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857644
4095	NC_014329	TTC	2	6	238832	238837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857644
4096	NC_014329	CAT	2	6	238916	238921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857644
4097	NC_014329	GCCT	2	8	238931	238938	0 %	25 %	25 %	50 %	300857644
4098	NC_014329	ACA	2	6	239040	239045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857644
4099	NC_014329	GTA	2	6	239153	239158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857644
4100	NC_014329	CGA	2	6	239182	239187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857644
4101	NC_014329	AAC	2	6	239205	239210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857644
4102	NC_014329	GGC	2	6	239238	239243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857644
4103	NC_014329	AGAGT	2	10	239247	239256	40 %	20 %	40 %	0 %	300857644
4104	NC_014329	CGG	2	6	239265	239270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857644
4105	NC_014329	GCT	2	6	239283	239288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857644
4106	NC_014329	ACA	2	6	239334	239339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857644
4107	NC_014329	CGA	2	6	239359	239364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857644
4108	NC_014329	AAC	2	6	239544	239549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857644
4109	NC_014329	CAC	2	6	239558	239563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857644
4110	NC_014329	CCA	2	6	239581	239586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857644
4111	NC_014329	GGT	2	6	239717	239722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857644
4112	NC_014329	GC	3	6	239763	239768	0 %	0 %	50 %	50 %	300857644
4113	NC_014329	TCT	2	6	239846	239851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857645
4114	NC_014329	GAGC	2	8	239865	239872	25 %	0 %	50 %	25 %	300857645
4115	NC_014329	GCG	2	6	239896	239901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857645
4116	NC_014329	GCG	2	6	239905	239910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857645
4117	NC_014329	GTT	2	6	239949	239954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857645
4118	NC_014329	GGC	2	6	239985	239990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857645
4119	NC_014329	CGGT	2	8	240042	240049	0 %	25 %	50 %	25 %	300857645
4120	NC_014329	TGCG	2	8	240137	240144	0 %	25 %	50 %	25 %	300857645
4121	NC_014329	GCC	2	6	240232	240237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857645
4122	NC_014329	AGA	2	6	240258	240263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857645
4123	NC_014329	C	6	6	240265	240270	0 %	0 %	0 %	100 %	300857645
4124	NC_014329	GCT	2	6	240330	240335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857645
4125	NC_014329	GCC	2	6	240344	240349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857645
4126	NC_014329	AGT	2	6	240381	240386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857645
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4128	NC_014329	GCA	2	6	240436	240441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857645
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4130	NC_014329	GGGC	2	8	240463	240470	0 %	0 %	75 %	25 %	300857645
4131	NC_014329	GCC	2	6	240503	240508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857645
4132	NC_014329	ACG	2	6	240626	240631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857645
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4134	NC_014329	GGA	2	6	240749	240754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857645
4135	NC_014329	CGCA	2	8	240833	240840	25 %	0 %	25 %	50 %	300857645
4136	NC_014329	GTT	2	6	241355	241360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857646
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4142	NC_014329	GA	3	6	241770	241775	50 %	0 %	50 %	0 %	300857647
4143	NC_014329	ATT	2	6	241818	241823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300857647
4144	NC_014329	T	6	6	241822	241827	0 %	100 %	0 %	0 %	300857647
4145	NC_014329	CGC	2	6	241928	241933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857647
4146	NC_014329	TGCC	2	8	241952	241959	0 %	25 %	25 %	50 %	300857647
4147	NC_014329	CTT	2	6	241973	241978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857647
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4160	NC_014329	TG	3	6	242647	242652	0 %	50 %	50 %	0 %	300857647
4161	NC_014329	TGC	2	6	242741	242746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857647
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4187	NC_014329	CGCT	2	8	244789	244796	0 %	25 %	25 %	50 %	300857649
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4228	NC_014329	TGA	2	6	247401	247406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857651
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4232	NC_014329	CGA	2	6	247558	247563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857651
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4234	NC_014329	CGG	2	6	247689	247694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857651
4235	NC_014329	GCC	2	6	247721	247726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857651
4236	NC_014329	TTCT	2	8	247740	247747	0 %	75 %	0 %	25 %	300857651
4237	NC_014329	CTT	2	6	247854	247859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857652
4238	NC_014329	CTA	2	6	247890	247895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857652
4239	NC_014329	GCC	2	6	247910	247915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857652
4240	NC_014329	GAA	2	6	247936	247941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857652
4241	NC_014329	CGCAG	2	10	247959	247968	20 %	0 %	40 %	40 %	300857652
4242	NC_014329	ATC	2	6	248005	248010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857652
4243	NC_014329	GCA	2	6	248060	248065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857652
4244	NC_014329	AACCAT	2	12	248126	248137	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	300857652
4245	NC_014329	ACT	2	6	248333	248338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857652
4246	NC_014329	CTG	2	6	248398	248403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857652
4247	NC_014329	GAG	2	6	248436	248441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857652
4248	NC_014329	GTG	2	6	248465	248470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857652
4249	NC_014329	GGA	2	6	248474	248479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857652
4250	NC_014329	TTC	2	6	248494	248499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857652
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4252	NC_014329	GTA	2	6	248567	248572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857652
4253	NC_014329	TTA	2	6	248595	248600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300857652
4254	NC_014329	TCA	2	6	248666	248671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857652
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4261	NC_014329	CTG	2	6	248907	248912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857652
4262	NC_014329	AT	3	6	248990	248995	50 %	50 %	0 %	0 %	300857652
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4266	NC_014329	ATG	2	6	249146	249151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857652
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4275	NC_014329	CGGT	2	8	249704	249711	0 %	25 %	50 %	25 %	300857653
4276	NC_014329	CATGC	2	10	249730	249739	20 %	20 %	20 %	40 %	300857653
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4282	NC_014329	TG	3	6	250053	250058	0 %	50 %	50 %	0 %	300857653
4283	NC_014329	TCA	2	6	250083	250088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857653
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4309	NC_014329	CGT	2	6	251776	251781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857654
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4313	NC_014329	GAT	2	6	251840	251845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857654
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4480	NC_014329	GCT	2	6	262320	262325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857663
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4482	NC_014329	GGT	3	9	262483	262491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857664
4483	NC_014329	TGA	2	6	262519	262524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857664
4484	NC_014329	GCA	2	6	262604	262609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857664
4485	NC_014329	CAT	2	6	262667	262672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857664
4486	NC_014329	GGCTC	2	10	262693	262702	0 %	20 %	40 %	40 %	300857664
4487	NC_014329	CAC	2	6	262762	262767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857664
4488	NC_014329	GA	3	6	262785	262790	50 %	0 %	50 %	0 %	300857664
4489	NC_014329	GCA	2	6	262796	262801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857664
4490	NC_014329	CGA	2	6	262843	262848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857664
4491	NC_014329	GGT	2	6	262915	262920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857664
4492	NC_014329	TC	3	6	263100	263105	0 %	50 %	0 %	50 %	300857665
4493	NC_014329	CTA	2	6	263133	263138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857665
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4496	NC_014329	GCT	2	6	263309	263314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857665
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4498	NC_014329	TCCTT	2	10	263423	263432	0 %	60 %	0 %	40 %	300857665
4499	NC_014329	T	6	6	263472	263477	0 %	100 %	0 %	0 %	300857665
4500	NC_014329	AGG	2	6	263489	263494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857665

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