MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014329	CTG	2	6	204521	204526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857609
3502	NC_014329	GAA	2	6	204627	204632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857609
3503	NC_014329	TGT	2	6	204677	204682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857609
3504	NC_014329	GCC	2	6	204747	204752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857609
3505	NC_014329	GCC	2	6	204795	204800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857609
3506	NC_014329	ACC	2	6	204811	204816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857609
3507	NC_014329	GCG	2	6	204927	204932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857609
3508	NC_014329	CTG	2	6	205038	205043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857609
3509	NC_014329	TG	3	6	205088	205093	0 %	50 %	50 %	0 %	300857609
3510	NC_014329	AT	3	6	205117	205122	50 %	50 %	0 %	0 %	300857609
3511	NC_014329	GA	3	6	205150	205155	50 %	0 %	50 %	0 %	300857609
3512	NC_014329	GAG	2	6	205323	205328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857609
3513	NC_014329	TAA	2	6	205355	205360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857609
3514	NC_014329	GCT	2	6	205361	205366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857609
3515	NC_014329	TCT	2	6	205414	205419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857609
3516	NC_014329	ATG	2	6	205495	205500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857609
3517	NC_014329	TCG	2	6	205594	205599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857609
3518	NC_014329	GAG	2	6	205669	205674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857609
3519	NC_014329	AGA	2	6	205677	205682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857609
3520	NC_014329	GAA	2	6	206260	206265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857610
3521	NC_014329	CAG	2	6	206284	206289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857610
3522	NC_014329	TAC	3	9	206305	206313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857610
3523	NC_014329	CCA	2	6	206355	206360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857610
3524	NC_014329	GTG	2	6	206367	206372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857610
3525	NC_014329	CTG	2	6	206385	206390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857610
3526	NC_014329	A	6	6	206455	206460	100 %	0 %	0 %	0 %	300857610
3527	NC_014329	AGT	2	6	206490	206495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857610
3528	NC_014329	TGCCA	2	10	206521	206530	20 %	20 %	20 %	40 %	300857610
3529	NC_014329	AAATA	2	10	206623	206632	80 %	20 %	0 %	0 %	300857610
3530	NC_014329	GAA	2	6	206633	206638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857610
3531	NC_014329	CTG	2	6	206640	206645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857610
3532	NC_014329	AGTT	2	8	206662	206669	25 %	50 %	25 %	0 %	300857610
3533	NC_014329	ATA	2	6	206681	206686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857610
3534	NC_014329	TCA	2	6	206717	206722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857610
3535	NC_014329	GAA	2	6	206732	206737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857610
3536	NC_014329	AGA	2	6	206738	206743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857610
3537	NC_014329	CAA	2	6	206748	206753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857610
3538	NC_014329	TAG	2	6	206788	206793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857610
3539	NC_014329	TCA	2	6	206802	206807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857610
3540	NC_014329	ATAA	2	8	206834	206841	75 %	25 %	0 %	0 %	300857610
3541	NC_014329	ACA	2	6	206849	206854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857610
3542	NC_014329	AAC	2	6	206890	206895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857610
3543	NC_014329	GAA	2	6	206903	206908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857610
3544	NC_014329	AAG	2	6	206980	206985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857610
3545	NC_014329	CT	3	6	206989	206994	0 %	50 %	0 %	50 %	300857610
3546	NC_014329	CCA	2	6	207000	207005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857610
3547	NC_014329	AAG	2	6	207088	207093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857611
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3549	NC_014329	ATTCT	2	10	207219	207228	20 %	60 %	0 %	20 %	300857611
3550	NC_014329	T	6	6	207384	207389	0 %	100 %	0 %	0 %	300857611
3551	NC_014329	AGA	2	6	207452	207457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857611
3552	NC_014329	CAA	2	6	207514	207519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857611
3553	NC_014329	GAAT	2	8	207527	207534	50 %	25 %	25 %	0 %	300857611
3554	NC_014329	TCA	2	6	207710	207715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857611
3555	NC_014329	TTC	2	6	207730	207735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857611
3556	NC_014329	AT	3	6	207740	207745	50 %	50 %	0 %	0 %	300857611
3557	NC_014329	AGT	2	6	207841	207846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857611
3558	NC_014329	AAGC	2	8	207864	207871	50 %	0 %	25 %	25 %	300857611
3559	NC_014329	CGC	2	6	207885	207890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857611
3560	NC_014329	AAGC	2	8	207961	207968	50 %	0 %	25 %	25 %	300857611
3561	NC_014329	CGG	2	6	209245	209250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857612
3562	NC_014329	GTG	2	6	209268	209273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857612
3563	NC_014329	CGG	2	6	209294	209299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857612
3564	NC_014329	ATTG	2	8	209349	209356	25 %	50 %	25 %	0 %	300857612
3565	NC_014329	CTC	2	6	209390	209395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857612
3566	NC_014329	TGC	2	6	209399	209404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857612
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3569	NC_014329	TGG	2	6	209663	209668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857613
3570	NC_014329	TTG	2	6	209734	209739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857613
3571	NC_014329	CTT	2	6	209834	209839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857613
3572	NC_014329	GGT	2	6	209906	209911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857613
3573	NC_014329	TGA	2	6	209951	209956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857613
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3576	NC_014329	GCA	2	6	210196	210201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857614
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3578	NC_014329	TCA	2	6	210277	210282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857614
3579	NC_014329	GCAA	2	8	210869	210876	50 %	0 %	25 %	25 %	300857615
3580	NC_014329	ACA	2	6	210908	210913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857615
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3584	NC_014329	GTG	2	6	211032	211037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857615
3585	NC_014329	GTC	2	6	211041	211046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857615
3586	NC_014329	GC	3	6	211135	211140	0 %	0 %	50 %	50 %	300857615
3587	NC_014329	AAT	2	6	211226	211231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857615
3588	NC_014329	TAA	2	6	211334	211339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857615
3589	NC_014329	TTC	2	6	211384	211389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857615
3590	NC_014329	AGA	2	6	211646	211651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857616
3591	NC_014329	ACC	2	6	211666	211671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857616
3592	NC_014329	GGA	2	6	211737	211742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857616
3593	NC_014329	TCGC	2	8	211793	211800	0 %	25 %	25 %	50 %	300857616
3594	NC_014329	GAC	2	6	211918	211923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857616
3595	NC_014329	CGC	2	6	211932	211937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857616
3596	NC_014329	GAA	2	6	211957	211962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857616
3597	NC_014329	CAGGC	2	10	212036	212045	20 %	0 %	40 %	40 %	300857616
3598	NC_014329	GCG	2	6	212077	212082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857616
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3601	NC_014329	GTC	2	6	212153	212158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857617
3602	NC_014329	GTT	2	6	212174	212179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857617
3603	NC_014329	TGG	2	6	212215	212220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857617
3604	NC_014329	TCT	2	6	212421	212426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857617
3605	NC_014329	TTGTA	2	10	212446	212455	20 %	60 %	20 %	0 %	300857617
3606	NC_014329	TGC	2	6	212474	212479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857617
3607	NC_014329	GCG	2	6	212496	212501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857617
3608	NC_014329	CGGG	2	8	212514	212521	0 %	0 %	75 %	25 %	300857617
3609	NC_014329	TCG	2	6	212523	212528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857617
3610	NC_014329	CCG	2	6	212529	212534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857617
3611	NC_014329	GA	3	6	212557	212562	50 %	0 %	50 %	0 %	300857617
3612	NC_014329	GTT	2	6	212589	212594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857617
3613	NC_014329	AT	3	6	212607	212612	50 %	50 %	0 %	0 %	300857617
3614	NC_014329	GTG	2	6	212670	212675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857617
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3616	NC_014329	TGA	2	6	212740	212745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857617
3617	NC_014329	GGTC	2	8	212842	212849	0 %	25 %	50 %	25 %	300857617
3618	NC_014329	CAC	2	6	212874	212879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857617
3619	NC_014329	AGC	2	6	212900	212905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857617
3620	NC_014329	GCC	2	6	213200	213205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857617
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3622	NC_014329	CCA	2	6	213325	213330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857617
3623	NC_014329	GGA	2	6	213332	213337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857617
3624	NC_014329	GAA	2	6	213346	213351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857617
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3626	NC_014329	GAT	2	6	213434	213439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857617
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3631	NC_014329	CTT	3	9	213703	213711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857617
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3642	NC_014329	TGG	2	6	214309	214314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857617
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3644	NC_014329	GTGC	2	8	214374	214381	0 %	25 %	50 %	25 %	300857617
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3719	NC_014329	TGCC	2	8	219076	219083	0 %	25 %	25 %	50 %	300857625
3720	NC_014329	GGT	2	6	219089	219094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857625
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3866	NC_014329	CTG	2	6	227159	227164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857634
3867	NC_014329	TGCT	2	8	227172	227179	0 %	50 %	25 %	25 %	300857634
3868	NC_014329	GTG	2	6	227249	227254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857634
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3897	NC_014329	GA	3	6	228879	228884	50 %	0 %	50 %	0 %	300857636
3898	NC_014329	CATTG	2	10	228953	228962	20 %	40 %	20 %	20 %	300857636
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3978	NC_014329	GCT	2	6	233415	233420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
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3982	NC_014329	CTG	2	6	233545	233550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
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3986	NC_014329	AGA	2	6	233849	233854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857642
3987	NC_014329	TCG	2	6	233867	233872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
3988	NC_014329	GCA	2	6	233903	233908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
3989	NC_014329	ACG	2	6	234009	234014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
3990	NC_014329	CGT	2	6	234093	234098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
3991	NC_014329	AGG	2	6	234124	234129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857642
3992	NC_014329	TCCG	2	8	234142	234149	0 %	25 %	25 %	50 %	300857642
3993	NC_014329	GC	3	6	234350	234355	0 %	0 %	50 %	50 %	300857642
3994	NC_014329	CGA	2	6	234467	234472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857642
3995	NC_014329	CCA	2	6	234478	234483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857642
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3997	NC_014329	CGT	2	6	234508	234513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857642
3998	NC_014329	A	7	7	234519	234525	100 %	0 %	0 %	0 %	300857642
3999	NC_014329	GGA	2	6	234527	234532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857642
4000	NC_014329	ATC	2	6	234567	234572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857642

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