MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014329	GCA	2	6	87834	87839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857505
1502	NC_014329	TTA	2	6	88081	88086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300857505
1503	NC_014329	CG	3	6	88090	88095	0 %	0 %	50 %	50 %	300857505
1504	NC_014329	TAC	3	9	88217	88225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857506
1505	NC_014329	GTT	2	6	88230	88235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857506
1506	NC_014329	CTG	2	6	88315	88320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857506
1507	NC_014329	TGG	2	6	88333	88338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857506
1508	NC_014329	A	6	6	88370	88375	100 %	0 %	0 %	0 %	300857506
1509	NC_014329	ATG	3	9	88485	88493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857506
1510	NC_014329	CAT	2	6	88564	88569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857507
1511	NC_014329	TTA	2	6	88620	88625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300857507
1512	NC_014329	CGG	2	6	88648	88653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857507
1513	NC_014329	GAAG	2	8	88660	88667	50 %	0 %	50 %	0 %	300857507
1514	NC_014329	CGC	2	6	88712	88717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857507
1515	NC_014329	AAG	2	6	88721	88726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857507
1516	NC_014329	GAA	2	6	88787	88792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857507
1517	NC_014329	GAC	2	6	88793	88798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857507
1518	NC_014329	TGA	2	6	88804	88809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857507
1519	NC_014329	TGA	2	6	88819	88824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857507
1520	NC_014329	GGA	2	6	88845	88850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857507
1521	NC_014329	TGGGA	2	10	88952	88961	20 %	20 %	60 %	0 %	300857508
1522	NC_014329	ATT	2	6	88982	88987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300857508
1523	NC_014329	CAA	2	6	89047	89052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857508
1524	NC_014329	TGGG	2	8	89120	89127	0 %	25 %	75 %	0 %	300857508
1525	NC_014329	CTG	2	6	89216	89221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857508
1526	NC_014329	GGA	2	6	89223	89228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857508
1527	NC_014329	CAG	2	6	89378	89383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857508
1528	NC_014329	CGG	2	6	89514	89519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857508
1529	NC_014329	TGA	2	6	89558	89563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857508
1530	NC_014329	CAT	2	6	89565	89570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857508
1531	NC_014329	AGA	2	6	89610	89615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857508
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1533	NC_014329	TAAA	2	8	89680	89687	75 %	25 %	0 %	0 %	300857508
1534	NC_014329	GAT	2	6	89699	89704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857509
1535	NC_014329	TGG	2	6	89843	89848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857509
1536	NC_014329	GA	3	6	90345	90350	50 %	0 %	50 %	0 %	300857510
1537	NC_014329	GCA	2	6	90353	90358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857510
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1539	NC_014329	TGC	2	6	90550	90555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857510
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1541	NC_014329	ACC	2	6	90625	90630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857510
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1543	NC_014329	TCG	2	6	90689	90694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857510
1544	NC_014329	GAA	2	6	90704	90709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857510
1545	NC_014329	ACG	2	6	90730	90735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857510
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1547	NC_014329	CAAAA	2	10	90783	90792	80 %	0 %	0 %	20 %	300857510
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1549	NC_014329	GAA	2	6	90830	90835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857510
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1552	NC_014329	TGG	2	6	91017	91022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857510
1553	NC_014329	AG	3	6	91025	91030	50 %	0 %	50 %	0 %	300857510
1554	NC_014329	GT	3	6	91034	91039	0 %	50 %	50 %	0 %	300857510
1555	NC_014329	AAC	2	6	91056	91061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857510
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1558	NC_014329	ACC	2	6	91149	91154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857510
1559	NC_014329	AGA	2	6	91172	91177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857510
1560	NC_014329	AG	3	6	91206	91211	50 %	0 %	50 %	0 %	300857510
1561	NC_014329	GAA	2	6	91253	91258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857510
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1571	NC_014329	CGA	2	6	91737	91742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857511
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1597	NC_014329	GCT	2	6	93261	93266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857512
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1609	NC_014329	GAG	2	6	94038	94043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857513
1610	NC_014329	GA	3	6	94075	94080	50 %	0 %	50 %	0 %	300857513
1611	NC_014329	CCA	2	6	94140	94145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857513
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1613	NC_014329	GGT	2	6	94224	94229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857513
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1615	NC_014329	GGCG	2	8	94319	94326	0 %	0 %	75 %	25 %	300857513
1616	NC_014329	TATG	2	8	94407	94414	25 %	50 %	25 %	0 %	300857513
1617	NC_014329	GTT	2	6	94430	94435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857513
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1625	NC_014329	TCC	2	6	94924	94929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857514
1626	NC_014329	CCA	2	6	94935	94940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857514
1627	NC_014329	GCCGTC	2	12	94953	94964	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300857514
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1629	NC_014329	CGG	2	6	95039	95044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857514
1630	NC_014329	CCG	2	6	95048	95053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857514
1631	NC_014329	GCG	2	6	95138	95143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857514
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1646	NC_014329	TAC	2	6	95811	95816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857514
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1655	NC_014329	TGG	2	6	96477	96482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857515
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1657	NC_014329	TCC	2	6	96514	96519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857515
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1746	NC_014329	TAA	2	6	101159	101164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857518
1747	NC_014329	GCA	2	6	101186	101191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857518
1748	NC_014329	CAT	2	6	101217	101222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857518
1749	NC_014329	ACA	2	6	101267	101272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857518
1750	NC_014329	GGA	2	6	101310	101315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857518
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1753	NC_014329	TGC	2	6	101410	101415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857518
1754	NC_014329	GGT	2	6	101425	101430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857518
1755	NC_014329	GC	3	6	101463	101468	0 %	0 %	50 %	50 %	300857518
1756	NC_014329	CAG	2	6	101481	101486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857518
1757	NC_014329	AGT	2	6	101572	101577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857518
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1760	NC_014329	T	6	6	101623	101628	0 %	100 %	0 %	0 %	300857518
1761	NC_014329	CCG	2	6	101684	101689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857518
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1764	NC_014329	TCC	2	6	101735	101740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857518
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1770	NC_014329	GATA	2	8	102148	102155	50 %	25 %	25 %	0 %	300857519
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1782	NC_014329	GGA	2	6	102964	102969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857519
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1788	NC_014329	ACG	2	6	103241	103246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857519
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1793	NC_014329	TAG	2	6	103324	103329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857519
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1805	NC_014329	CAG	2	6	104032	104037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857519
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1845	NC_014329	TAAT	2	8	106981	106988	50 %	50 %	0 %	0 %	300857523
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1851	NC_014329	CGGCG	2	10	107267	107276	0 %	0 %	60 %	40 %	300857523
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1855	NC_014329	TCCT	2	8	107377	107384	0 %	50 %	0 %	50 %	300857524
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1858	NC_014329	TCG	2	6	107622	107627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857524
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1860	NC_014329	GAT	2	6	107713	107718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857524
1861	NC_014329	GGAT	2	8	107735	107742	25 %	25 %	50 %	0 %	300857524
1862	NC_014329	GCA	2	6	107743	107748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857524
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1864	NC_014329	CAGCG	2	10	107863	107872	20 %	0 %	40 %	40 %	300857525
1865	NC_014329	CGT	2	6	107902	107907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857525
1866	NC_014329	ATA	2	6	107950	107955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857525
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1868	NC_014329	GTTTTG	2	12	108059	108070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857525
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1870	NC_014329	GCG	2	6	108101	108106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857525
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1987	NC_014329	TG	3	6	114248	114253	0 %	50 %	50 %	0 %	300857533
1988	NC_014329	GTT	2	6	114279	114284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857533
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1991	NC_014329	ACA	2	6	114358	114363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857533
1992	NC_014329	AGA	2	6	114364	114369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857533
1993	NC_014329	CGA	2	6	114371	114376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857533
1994	NC_014329	GCT	2	6	114639	114644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857533
1995	NC_014329	CT	3	6	114689	114694	0 %	50 %	0 %	50 %	300857533
1996	NC_014329	TGC	3	9	114755	114763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857533
1997	NC_014329	GGT	2	6	114917	114922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857534
1998	NC_014329	AAT	2	6	115012	115017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857534
1999	NC_014329	TGG	2	6	115112	115117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857534
2000	NC_014329	AGT	2	6	115185	115190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857534

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