MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014329	TGA	2	6	30349	30354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857452
502	NC_014329	GCT	2	6	30412	30417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857452
503	NC_014329	TGC	2	6	30487	30492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857452
504	NC_014329	GCC	2	6	30521	30526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857452
505	NC_014329	TTGCT	2	10	30571	30580	0 %	60 %	20 %	20 %	300857452
506	NC_014329	GATC	2	8	30588	30595	25 %	25 %	25 %	25 %	300857452
507	NC_014329	TTC	2	6	30596	30601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857452
508	NC_014329	GTG	2	6	30711	30716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857452
509	NC_014329	AGC	2	6	30764	30769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857452
510	NC_014329	GCA	2	6	30888	30893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857452
511	NC_014329	GGA	2	6	30987	30992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857452
512	NC_014329	GA	3	6	31080	31085	50 %	0 %	50 %	0 %	300857452
513	NC_014329	TGG	2	6	31129	31134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857452
514	NC_014329	CGT	2	6	31135	31140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857452
515	NC_014329	GC	3	6	31144	31149	0 %	0 %	50 %	50 %	300857452
516	NC_014329	ATC	2	6	31194	31199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857452
517	NC_014329	CGT	2	6	31237	31242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857452
518	NC_014329	TCT	2	6	31311	31316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857452
519	NC_014329	CAA	2	6	31414	31419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857452
520	NC_014329	GCA	2	6	31504	31509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857452
521	NC_014329	CCT	2	6	31631	31636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857453
522	NC_014329	TGA	2	6	31718	31723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857453
523	NC_014329	GGAA	2	8	31726	31733	50 %	0 %	50 %	0 %	300857453
524	NC_014329	GGC	2	6	31787	31792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857453
525	NC_014329	AAC	2	6	31798	31803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857453
526	NC_014329	TTC	2	6	31882	31887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857453
527	NC_014329	ACT	2	6	31942	31947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857453
528	NC_014329	TCC	2	6	31960	31965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857453
529	NC_014329	CAA	2	6	31966	31971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857453
530	NC_014329	TGGC	2	8	31988	31995	0 %	25 %	50 %	25 %	300857453
531	NC_014329	TGC	2	6	32020	32025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857453
532	NC_014329	GAG	2	6	32026	32031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857453
533	NC_014329	TCC	2	6	32081	32086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857453
534	NC_014329	TTG	2	6	32094	32099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857453
535	NC_014329	GTG	2	6	32186	32191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857453
536	NC_014329	GGTT	2	8	32233	32240	0 %	50 %	50 %	0 %	300857453
537	NC_014329	CTG	2	6	32251	32256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857453
538	NC_014329	CTGA	2	8	32265	32272	25 %	25 %	25 %	25 %	300857453
539	NC_014329	GTA	2	6	32300	32305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857453
540	NC_014329	GTG	2	6	32418	32423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857453
541	NC_014329	GCC	3	9	32621	32629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857453
542	NC_014329	AGG	2	6	32678	32683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857453
543	NC_014329	AAT	2	6	32725	32730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857453
544	NC_014329	GCC	2	6	32744	32749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857453
545	NC_014329	GA	3	6	32812	32817	50 %	0 %	50 %	0 %	300857453
546	NC_014329	CAC	2	6	32820	32825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857453
547	NC_014329	GAT	2	6	32914	32919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857453
548	NC_014329	GTC	2	6	33025	33030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857453
549	NC_014329	GCC	2	6	33052	33057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857453
550	NC_014329	GTC	2	6	33085	33090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857453
551	NC_014329	GC	3	6	33157	33162	0 %	0 %	50 %	50 %	300857454
552	NC_014329	GCT	2	6	33168	33173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857454
553	NC_014329	GCT	2	6	33177	33182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857454
554	NC_014329	GGC	2	6	33206	33211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857454
555	NC_014329	ACC	2	6	33218	33223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857454
556	NC_014329	TGC	2	6	33227	33232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857454
557	NC_014329	ACC	2	6	33245	33250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857454
558	NC_014329	T	6	6	33252	33257	0 %	100 %	0 %	0 %	300857454
559	NC_014329	ACC	2	6	33258	33263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857454
560	NC_014329	CAG	2	6	33352	33357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857454
561	NC_014329	CAA	2	6	33511	33516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857454
562	NC_014329	GCC	2	6	33548	33553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857454
563	NC_014329	GGAC	2	8	33589	33596	25 %	0 %	50 %	25 %	300857454
564	NC_014329	AGA	2	6	33644	33649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857454
565	NC_014329	GCT	2	6	33720	33725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857454
566	NC_014329	CTT	2	6	33811	33816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857454
567	NC_014329	TGG	2	6	33965	33970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857454
568	NC_014329	GCA	2	6	34065	34070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857454
569	NC_014329	CTA	2	6	34129	34134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857454
570	NC_014329	CTT	2	6	34177	34182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857454
571	NC_014329	CAC	2	6	34248	34253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857454
572	NC_014329	ATC	2	6	34271	34276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857454
573	NC_014329	GATA	2	8	34335	34342	50 %	25 %	25 %	0 %	300857454
574	NC_014329	GTA	2	6	34391	34396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857454
575	NC_014329	GCC	2	6	34433	34438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857454
576	NC_014329	AGG	2	6	34551	34556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857454
577	NC_014329	GAA	2	6	34567	34572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857454
578	NC_014329	CCT	2	6	34617	34622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857455
579	NC_014329	AAC	2	6	34627	34632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857455
580	NC_014329	AGA	2	6	34648	34653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857455
581	NC_014329	GA	3	6	34707	34712	50 %	0 %	50 %	0 %	300857455
582	NC_014329	AAG	2	6	34729	34734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857455
583	NC_014329	GCC	2	6	34759	34764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857455
584	NC_014329	CGG	2	6	34818	34823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857455
585	NC_014329	CAC	2	6	34825	34830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857455
586	NC_014329	CGC	2	6	35061	35066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857455
587	NC_014329	GA	3	6	35091	35096	50 %	0 %	50 %	0 %	300857455
588	NC_014329	GTA	2	6	35183	35188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857455
589	NC_014329	CCG	2	6	35189	35194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857455
590	NC_014329	ACC	2	6	35198	35203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857455
591	NC_014329	TGG	2	6	35238	35243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857455
592	NC_014329	CAG	2	6	35275	35280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857455
593	NC_014329	TAA	2	6	35428	35433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857455
594	NC_014329	GAA	2	6	35440	35445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857455
595	NC_014329	CAG	2	6	35452	35457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857455
596	NC_014329	TGG	2	6	35532	35537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857455
597	NC_014329	AAG	2	6	35557	35562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857455
598	NC_014329	AT	3	6	35585	35590	50 %	50 %	0 %	0 %	300857455
599	NC_014329	GA	3	6	35598	35603	50 %	0 %	50 %	0 %	300857455
600	NC_014329	TAC	2	6	35632	35637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857455
601	NC_014329	ATC	2	6	35639	35644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857455
602	NC_014329	TAAC	2	8	35724	35731	50 %	25 %	0 %	25 %	300857455
603	NC_014329	CAAG	2	8	35928	35935	50 %	0 %	25 %	25 %	300857455
604	NC_014329	CGT	2	6	35948	35953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857455
605	NC_014329	CT	3	6	35989	35994	0 %	50 %	0 %	50 %	300857456
606	NC_014329	GA	3	6	36014	36019	50 %	0 %	50 %	0 %	300857456
607	NC_014329	CCGGCT	2	12	36024	36035	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300857456
608	NC_014329	CTCCTG	2	12	36055	36066	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	300857456
609	NC_014329	AGC	2	6	36070	36075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857456
610	NC_014329	CTT	2	6	36127	36132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857456
611	NC_014329	CTC	2	6	36133	36138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857456
612	NC_014329	GCA	2	6	36174	36179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857456
613	NC_014329	CTG	2	6	36193	36198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857456
614	NC_014329	TGC	2	6	36203	36208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857456
615	NC_014329	CGT	2	6	36213	36218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857456
616	NC_014329	GA	3	6	36323	36328	50 %	0 %	50 %	0 %	300857456
617	NC_014329	CAGG	2	8	36343	36350	25 %	0 %	50 %	25 %	300857456
618	NC_014329	CGC	2	6	36399	36404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857456
619	NC_014329	CTT	2	6	36432	36437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857456
620	NC_014329	TAA	2	6	36455	36460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857456
621	NC_014329	CCA	2	6	36484	36489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857456
622	NC_014329	GCA	2	6	36506	36511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857456
623	NC_014329	AAG	2	6	36517	36522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857456
624	NC_014329	TGA	2	6	36525	36530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857456
625	NC_014329	GCCC	2	8	36532	36539	0 %	0 %	25 %	75 %	300857456
626	NC_014329	TCT	2	6	36561	36566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857456
627	NC_014329	G	6	6	36577	36582	0 %	0 %	100 %	0 %	300857456
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