MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 3607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014328	AAATT	2	10	1831	1840	60 %	40 %	0 %	0 %	300853234
2	NC_014328	AATTT	2	10	2455	2464	40 %	60 %	0 %	0 %	300853234
3	NC_014328	AATTT	2	10	4211	4220	40 %	60 %	0 %	0 %	300853236
4	NC_014328	ATAAA	2	10	4695	4704	80 %	20 %	0 %	0 %	300853238
5	NC_014328	AAAAC	2	10	5531	5540	80 %	0 %	0 %	20 %	300853238
6	NC_014328	AATAA	2	10	5990	5999	80 %	20 %	0 %	0 %	300853238
7	NC_014328	TGAAA	2	10	6489	6498	60 %	20 %	20 %	0 %	300853239
8	NC_014328	TTAAT	2	10	8195	8204	40 %	60 %	0 %	0 %	300853239
9	NC_014328	TTATA	2	10	15981	15990	40 %	60 %	0 %	0 %	300853242
10	NC_014328	ATATA	2	10	16736	16745	60 %	40 %	0 %	0 %	300853242
11	NC_014328	ATATA	2	10	16952	16961	60 %	40 %	0 %	0 %	300853242
12	NC_014328	TATAG	2	10	19188	19197	40 %	40 %	20 %	0 %	300853243
13	NC_014328	GAAAA	2	10	19330	19339	80 %	0 %	20 %	0 %	300853243
14	NC_014328	GAGAA	2	10	20818	20827	60 %	0 %	40 %	0 %	300853245
15	NC_014328	TTATC	2	10	22814	22823	20 %	60 %	0 %	20 %	300853246
16	NC_014328	CAATA	2	10	23489	23498	60 %	20 %	0 %	20 %	300853246
17	NC_014328	GCTAT	2	10	30791	30800	20 %	40 %	20 %	20 %	300853256
18	NC_014328	AACTT	2	10	32184	32193	40 %	40 %	0 %	20 %	300853259
19	NC_014328	TTTGA	2	10	35240	35249	20 %	60 %	20 %	0 %	300853263
20	NC_014328	ATTTT	2	10	35543	35552	20 %	80 %	0 %	0 %	300853264
21	NC_014328	ACCAG	2	10	37836	37845	40 %	0 %	20 %	40 %	300853265
22	NC_014328	TTTCA	2	10	42719	42728	20 %	60 %	0 %	20 %	300853268
23	NC_014328	TTAGT	2	10	42976	42985	20 %	60 %	20 %	0 %	300853268
24	NC_014328	TTACT	2	10	42994	43003	20 %	60 %	0 %	20 %	300853268
25	NC_014328	TCTGC	2	10	43513	43522	0 %	40 %	20 %	40 %	300853268
26	NC_014328	AATTA	2	10	43967	43976	60 %	40 %	0 %	0 %	300853268
27	NC_014328	AATTT	2	10	44371	44380	40 %	60 %	0 %	0 %	300853268
28	NC_014328	GAAAT	2	10	44976	44985	60 %	20 %	20 %	0 %	300853268
29	NC_014328	GCCAT	2	10	45138	45147	20 %	20 %	20 %	40 %	300853269
30	NC_014328	TGGAA	2	10	45721	45730	40 %	20 %	40 %	0 %	300853270
31	NC_014328	TTTCT	2	10	45735	45744	0 %	80 %	0 %	20 %	300853270
32	NC_014328	AAAGT	2	10	47108	47117	60 %	20 %	20 %	0 %	300853273
33	NC_014328	TTTAA	2	10	47489	47498	40 %	60 %	0 %	0 %	300853273
34	NC_014328	GTATT	2	10	47682	47691	20 %	60 %	20 %	0 %	300853273
35	NC_014328	TAAAT	2	10	50809	50818	60 %	40 %	0 %	0 %	300853276
36	NC_014328	AAACA	2	10	52266	52275	80 %	0 %	0 %	20 %	300853278
37	NC_014328	ATACA	2	10	52442	52451	60 %	20 %	0 %	20 %	300853278
38	NC_014328	TGAAT	2	10	54145	54154	40 %	40 %	20 %	0 %	300853279
39	NC_014328	GCAAT	2	10	55141	55150	40 %	20 %	20 %	20 %	300853280
40	NC_014328	CTATG	2	10	59042	59051	20 %	40 %	20 %	20 %	300853285
41	NC_014328	CAATT	2	10	59750	59759	40 %	40 %	0 %	20 %	300853285
42	NC_014328	ATGGG	2	10	60020	60029	20 %	20 %	60 %	0 %	300853286
43	NC_014328	TCAAT	2	10	63622	63631	40 %	40 %	0 %	20 %	300853288
44	NC_014328	AATAT	2	10	65748	65757	60 %	40 %	0 %	0 %	300853290
45	NC_014328	ATATT	2	10	65844	65853	40 %	60 %	0 %	0 %	300853290
46	NC_014328	TACAT	2	10	66521	66530	40 %	40 %	0 %	20 %	300853291
47	NC_014328	ATCTG	2	10	68007	68016	20 %	40 %	20 %	20 %	300853292
48	NC_014328	TATAA	2	10	68022	68031	60 %	40 %	0 %	0 %	300853292
49	NC_014328	AAATG	2	10	72165	72174	60 %	20 %	20 %	0 %	300853295
50	NC_014328	TTTAT	2	10	73889	73898	20 %	80 %	0 %	0 %	300853297
51	NC_014328	CACCT	2	10	75914	75923	20 %	20 %	0 %	60 %	300853300
52	NC_014328	GTAGA	2	10	82998	83007	40 %	20 %	40 %	0 %	300853307
53	NC_014328	TATAA	2	10	83128	83137	60 %	40 %	0 %	0 %	300853308
54	NC_014328	AATAA	2	10	84173	84182	80 %	20 %	0 %	0 %	300853310
55	NC_014328	AAAAT	2	10	84865	84874	80 %	20 %	0 %	0 %	300853311
56	NC_014328	TGAAA	2	10	85154	85163	60 %	20 %	20 %	0 %	300853311
57	NC_014328	ATGGA	2	10	89147	89156	40 %	20 %	40 %	0 %	300853317
58	NC_014328	TGGAA	2	10	89991	90000	40 %	20 %	40 %	0 %	300853317
59	NC_014328	TTAGT	2	10	91657	91666	20 %	60 %	20 %	0 %	300853319
60	NC_014328	ATAGA	2	10	92419	92428	60 %	20 %	20 %	0 %	300853319
61	NC_014328	GTAAC	2	10	98636	98645	40 %	20 %	20 %	20 %	300853320
62	NC_014328	GATTT	2	10	98958	98967	20 %	60 %	20 %	0 %	300853321
63	NC_014328	GTTTT	2	10	101065	101074	0 %	80 %	20 %	0 %	300853323
64	NC_014328	ATTTT	2	10	101961	101970	20 %	80 %	0 %	0 %	300853324
65	NC_014328	TGTAC	2	10	102755	102764	20 %	40 %	20 %	20 %	300853324
66	NC_014328	ATAAA	2	10	103110	103119	80 %	20 %	0 %	0 %	300853324
67	NC_014328	GAAAA	2	10	104448	104457	80 %	0 %	20 %	0 %	300853325
68	NC_014328	AAGGC	2	10	105668	105677	40 %	0 %	40 %	20 %	300853326
69	NC_014328	GTAAT	2	10	106338	106347	40 %	40 %	20 %	0 %	300853327
70	NC_014328	ATGGA	2	10	115149	115158	40 %	20 %	40 %	0 %	300853330
71	NC_014328	TTTAG	2	10	115652	115661	20 %	60 %	20 %	0 %	300853330
72	NC_014328	TATAA	2	10	123428	123437	60 %	40 %	0 %	0 %	300853336
73	NC_014328	GAAAT	2	10	123453	123462	60 %	20 %	20 %	0 %	300853336
74	NC_014328	GAATG	2	10	123815	123824	40 %	20 %	40 %	0 %	300853336
75	NC_014328	ATTAT	2	10	125789	125798	40 %	60 %	0 %	0 %	300853337
76	NC_014328	AGCAA	2	10	126539	126548	60 %	0 %	20 %	20 %	300853338
77	NC_014328	AATTT	2	10	127685	127694	40 %	60 %	0 %	0 %	300853339
78	NC_014328	GAATG	2	10	129779	129788	40 %	20 %	40 %	0 %	300853340
79	NC_014328	TATTT	2	10	138250	138259	20 %	80 %	0 %	0 %	300853343
80	NC_014328	ATATT	2	10	139002	139011	40 %	60 %	0 %	0 %	300853344
81	NC_014328	TCATT	2	10	139233	139242	20 %	60 %	0 %	20 %	300853344
82	NC_014328	AGATA	2	10	141183	141192	60 %	20 %	20 %	0 %	300853346
83	NC_014328	GAAAA	2	10	149714	149723	80 %	0 %	20 %	0 %	300853357
84	NC_014328	CAGAT	2	10	150246	150255	40 %	20 %	20 %	20 %	300853357
85	NC_014328	GAAAA	2	10	151198	151207	80 %	0 %	20 %	0 %	300853358
86	NC_014328	CATAT	2	10	153441	153450	40 %	40 %	0 %	20 %	300853360
87	NC_014328	GGTAA	2	10	153509	153518	40 %	20 %	40 %	0 %	300853360
88	NC_014328	ATGAA	2	10	153666	153675	60 %	20 %	20 %	0 %	300853360
89	NC_014328	TTTTC	2	10	155488	155497	0 %	80 %	0 %	20 %	300853362
90	NC_014328	TTATT	2	10	156852	156861	20 %	80 %	0 %	0 %	300853364
91	NC_014328	AGGTT	2	10	159931	159940	20 %	40 %	40 %	0 %	300853369
92	NC_014328	TATGG	2	10	160521	160530	20 %	40 %	40 %	0 %	300853369
93	NC_014328	ATGGA	2	10	161121	161130	40 %	20 %	40 %	0 %	300853370
94	NC_014328	TTATT	2	10	161344	161353	20 %	80 %	0 %	0 %	300853370
95	NC_014328	TAATG	2	10	161366	161375	40 %	40 %	20 %	0 %	300853370
96	NC_014328	TTGTA	2	10	161384	161393	20 %	60 %	20 %	0 %	300853370
97	NC_014328	TAGTT	2	10	164409	164418	20 %	60 %	20 %	0 %	300853374
98	NC_014328	GTACA	2	10	166032	166041	40 %	20 %	20 %	20 %	300853375
99	NC_014328	TAATG	2	10	166379	166388	40 %	40 %	20 %	0 %	300853375
100	NC_014328	ATGCT	2	10	166612	166621	20 %	40 %	20 %	20 %	300853375
101	NC_014328	TTAAT	2	10	167281	167290	40 %	60 %	0 %	0 %	300853377
102	NC_014328	TAGAT	2	10	174123	174132	40 %	40 %	20 %	0 %	300853383
103	NC_014328	ATAAA	2	10	174428	174437	80 %	20 %	0 %	0 %	300853384
104	NC_014328	AAATA	2	10	174492	174501	80 %	20 %	0 %	0 %	300853384
105	NC_014328	AAGTA	2	10	174831	174840	60 %	20 %	20 %	0 %	300853384
106	NC_014328	TATAA	2	10	176821	176830	60 %	40 %	0 %	0 %	300853386
107	NC_014328	ATAGA	2	10	178316	178325	60 %	20 %	20 %	0 %	300853388
108	NC_014328	AAAAC	2	10	180063	180072	80 %	0 %	0 %	20 %	300853391
109	NC_014328	TAACT	2	10	180970	180979	40 %	40 %	0 %	20 %	300853392
110	NC_014328	AGAAT	2	10	181061	181070	60 %	20 %	20 %	0 %	300853392
111	NC_014328	TAATA	2	10	181453	181462	60 %	40 %	0 %	0 %	300853392
112	NC_014328	ATATT	2	10	184378	184387	40 %	60 %	0 %	0 %	300853395
113	NC_014328	TATTT	2	10	184469	184478	20 %	80 %	0 %	0 %	300853395
114	NC_014328	GGATG	2	10	185068	185077	20 %	20 %	60 %	0 %	300853396
115	NC_014328	TAATT	2	10	185125	185134	40 %	60 %	0 %	0 %	300853396
116	NC_014328	TACTT	2	10	187167	187176	20 %	60 %	0 %	20 %	300853397
117	NC_014328	AGTTA	2	10	188528	188537	40 %	40 %	20 %	0 %	300853397
118	NC_014328	TGAAT	2	10	189578	189587	40 %	40 %	20 %	0 %	300853397
119	NC_014328	AGATA	2	10	189974	189983	60 %	20 %	20 %	0 %	300853397
120	NC_014328	TATAA	2	10	190584	190593	60 %	40 %	0 %	0 %	300853398
121	NC_014328	ATATT	2	10	191635	191644	40 %	60 %	0 %	0 %	300853399
122	NC_014328	TGTAT	2	10	191980	191989	20 %	60 %	20 %	0 %	300853399
123	NC_014328	AATTT	2	10	192771	192780	40 %	60 %	0 %	0 %	300853400
124	NC_014328	GTAAA	2	10	194149	194158	60 %	20 %	20 %	0 %	300853400
125	NC_014328	TAAGA	2	10	196202	196211	60 %	20 %	20 %	0 %	300853400
126	NC_014328	AGAAA	2	10	196867	196876	80 %	0 %	20 %	0 %	300853401
127	NC_014328	CCTTT	2	10	197764	197773	0 %	60 %	0 %	40 %	300853402
128	NC_014328	TATCT	2	10	199211	199220	20 %	60 %	0 %	20 %	300853404
129	NC_014328	GATAA	2	10	200822	200831	60 %	20 %	20 %	0 %	300853405
130	NC_014328	CAGAG	2	10	201117	201126	40 %	0 %	40 %	20 %	300853405
131	NC_014328	TAGGA	2	10	204856	204865	40 %	20 %	40 %	0 %	300853408
132	NC_014328	ATGAA	2	10	205044	205053	60 %	20 %	20 %	0 %	300853408
133	NC_014328	AAAGT	2	10	205574	205583	60 %	20 %	20 %	0 %	300853409
134	NC_014328	AGGAA	2	10	205945	205954	60 %	0 %	40 %	0 %	300853410
135	NC_014328	AAAGG	2	10	206277	206286	60 %	0 %	40 %	0 %	300853410
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