MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 10845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014328	AATG	2	8	100	107	50 %	25 %	25 %	0 %	300853233
2	NC_014328	ATTA	2	8	304	311	50 %	50 %	0 %	0 %	300853233
3	NC_014328	ATGC	2	8	587	594	25 %	25 %	25 %	25 %	300853233
4	NC_014328	AAAT	2	8	712	719	75 %	25 %	0 %	0 %	300853233
5	NC_014328	AAAG	2	8	770	777	75 %	0 %	25 %	0 %	300853233
6	NC_014328	TCTA	2	8	838	845	25 %	50 %	0 %	25 %	300853233
7	NC_014328	AAAT	2	8	1876	1883	75 %	25 %	0 %	0 %	300853234
8	NC_014328	ATGA	2	8	2841	2848	50 %	25 %	25 %	0 %	300853235
9	NC_014328	TAAA	2	8	3430	3437	75 %	25 %	0 %	0 %	300853236
10	NC_014328	GAAA	2	8	3603	3610	75 %	0 %	25 %	0 %	300853236
11	NC_014328	AAAT	2	8	3707	3714	75 %	25 %	0 %	0 %	300853236
12	NC_014328	AAAC	2	8	3719	3726	75 %	0 %	0 %	25 %	300853236
13	NC_014328	TCAT	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	300853237
14	NC_014328	TAAA	2	8	4414	4421	75 %	25 %	0 %	0 %	300853237
15	NC_014328	ATTT	2	8	4431	4438	25 %	75 %	0 %	0 %	300853237
16	NC_014328	AATG	2	8	5872	5879	50 %	25 %	25 %	0 %	300853238
17	NC_014328	TAAA	2	8	5973	5980	75 %	25 %	0 %	0 %	300853238
18	NC_014328	ACTT	2	8	6049	6056	25 %	50 %	0 %	25 %	300853238
19	NC_014328	TATG	2	8	6597	6604	25 %	50 %	25 %	0 %	300853239
20	NC_014328	AATA	2	8	6855	6862	75 %	25 %	0 %	0 %	300853239
21	NC_014328	AGAT	2	8	7292	7299	50 %	25 %	25 %	0 %	300853239
22	NC_014328	AATT	2	8	7850	7857	50 %	50 %	0 %	0 %	300853239
23	NC_014328	TATT	2	8	8078	8085	25 %	75 %	0 %	0 %	300853239
24	NC_014328	TAAA	2	8	15592	15599	75 %	25 %	0 %	0 %	300853241
25	NC_014328	TTTA	2	8	15950	15957	25 %	75 %	0 %	0 %	300853242
26	NC_014328	TTAT	2	8	16260	16267	25 %	75 %	0 %	0 %	300853242
27	NC_014328	TATT	2	8	16582	16589	25 %	75 %	0 %	0 %	300853242
28	NC_014328	ATAA	2	8	16848	16855	75 %	25 %	0 %	0 %	300853242
29	NC_014328	ATAG	2	8	16944	16951	50 %	25 %	25 %	0 %	300853242
30	NC_014328	GGAT	2	8	17971	17978	25 %	25 %	50 %	0 %	300853242
31	NC_014328	ATTG	2	8	18662	18669	25 %	50 %	25 %	0 %	300853243
32	NC_014328	TACT	2	8	18834	18841	25 %	50 %	0 %	25 %	300853243
33	NC_014328	AAAG	2	8	18855	18862	75 %	0 %	25 %	0 %	300853243
34	NC_014328	TGTA	2	8	18879	18886	25 %	50 %	25 %	0 %	300853243
35	NC_014328	AAAG	2	8	18977	18984	75 %	0 %	25 %	0 %	300853243
36	NC_014328	CTAT	2	8	18985	18992	25 %	50 %	0 %	25 %	300853243
37	NC_014328	AAAC	2	8	19589	19596	75 %	0 %	0 %	25 %	300853243
38	NC_014328	GAAA	2	8	19671	19678	75 %	0 %	25 %	0 %	300853243
39	NC_014328	GGTA	2	8	19934	19941	25 %	25 %	50 %	0 %	300853243
40	NC_014328	TAAA	2	8	23594	23601	75 %	25 %	0 %	0 %	300853246
41	NC_014328	TACA	2	8	23756	23763	50 %	25 %	0 %	25 %	300853246
42	NC_014328	AGTT	2	8	23948	23955	25 %	50 %	25 %	0 %	300853246
43	NC_014328	CATA	2	8	24732	24739	50 %	25 %	0 %	25 %	300853247
44	NC_014328	ATTA	2	8	24912	24919	50 %	50 %	0 %	0 %	300853247
45	NC_014328	TTAA	2	8	25072	25079	50 %	50 %	0 %	0 %	300853247
46	NC_014328	TAAG	2	8	25158	25165	50 %	25 %	25 %	0 %	300853247
47	NC_014328	AATT	2	8	27737	27744	50 %	50 %	0 %	0 %	300853252
48	NC_014328	ATAA	2	8	27891	27898	75 %	25 %	0 %	0 %	300853252
49	NC_014328	AGAA	2	8	28064	28071	75 %	0 %	25 %	0 %	300853252
50	NC_014328	ACAA	2	8	28304	28311	75 %	0 %	0 %	25 %	300853253
51	NC_014328	AATG	2	8	28436	28443	50 %	25 %	25 %	0 %	300853254
52	NC_014328	GAAA	2	8	28523	28530	75 %	0 %	25 %	0 %	300853254
53	NC_014328	TAAA	2	8	28681	28688	75 %	25 %	0 %	0 %	300853254
54	NC_014328	CAAG	2	8	28856	28863	50 %	0 %	25 %	25 %	300853254
55	NC_014328	AGTT	2	8	28894	28901	25 %	50 %	25 %	0 %	300853254
56	NC_014328	GAAA	2	8	28955	28962	75 %	0 %	25 %	0 %	300853254
57	NC_014328	ATGA	2	8	29004	29011	50 %	25 %	25 %	0 %	300853254
58	NC_014328	ATGG	2	8	29801	29808	25 %	25 %	50 %	0 %	300853255
59	NC_014328	AATA	2	8	31586	31593	75 %	25 %	0 %	0 %	300853258
60	NC_014328	TAAA	2	8	32440	32447	75 %	25 %	0 %	0 %	300853260
61	NC_014328	AGAT	2	8	32458	32465	50 %	25 %	25 %	0 %	300853260
62	NC_014328	AAGT	2	8	32498	32505	50 %	25 %	25 %	0 %	300853260
63	NC_014328	ATGG	2	8	32548	32555	25 %	25 %	50 %	0 %	300853260
64	NC_014328	AAAG	2	8	32559	32566	75 %	0 %	25 %	0 %	300853260
65	NC_014328	GCAG	2	8	33260	33267	25 %	0 %	50 %	25 %	300853260
66	NC_014328	ATGA	2	8	33309	33316	50 %	25 %	25 %	0 %	300853260
67	NC_014328	AAGT	2	8	33583	33590	50 %	25 %	25 %	0 %	300853261
68	NC_014328	GTAA	2	8	33800	33807	50 %	25 %	25 %	0 %	300853261
69	NC_014328	TATG	2	8	33966	33973	25 %	50 %	25 %	0 %	300853261
70	NC_014328	AGTA	2	8	34407	34414	50 %	25 %	25 %	0 %	300853262
71	NC_014328	TAAA	2	8	34547	34554	75 %	25 %	0 %	0 %	300853262
72	NC_014328	TTTA	2	8	34919	34926	25 %	75 %	0 %	0 %	300853263
73	NC_014328	ATTT	2	8	35222	35229	25 %	75 %	0 %	0 %	300853263
74	NC_014328	GTTT	2	8	35338	35345	0 %	75 %	25 %	0 %	300853263
75	NC_014328	ATTT	2	8	35766	35773	25 %	75 %	0 %	0 %	300853264
76	NC_014328	TTAA	2	8	35774	35781	50 %	50 %	0 %	0 %	300853264
77	NC_014328	CTTT	2	8	35874	35881	0 %	75 %	0 %	25 %	300853264
78	NC_014328	AATA	2	8	36151	36158	75 %	25 %	0 %	0 %	300853264
79	NC_014328	TAAA	2	8	36836	36843	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
80	NC_014328	AATA	2	8	36900	36907	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
81	NC_014328	TAAA	2	8	36932	36939	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
82	NC_014328	TAAA	2	8	37004	37011	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
83	NC_014328	AATT	2	8	37640	37647	50 %	50 %	0 %	0 %	300853265
84	NC_014328	TAAA	2	8	37721	37728	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
85	NC_014328	ATGA	2	8	37909	37916	50 %	25 %	25 %	0 %	300853265
86	NC_014328	TAAA	2	8	37934	37941	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
87	NC_014328	TAGA	2	8	39053	39060	50 %	25 %	25 %	0 %	300853265
88	NC_014328	GAAG	2	8	39193	39200	50 %	0 %	50 %	0 %	300853265
89	NC_014328	GTTG	2	8	39590	39597	0 %	50 %	50 %	0 %	300853265
90	NC_014328	ATAC	2	8	39653	39660	50 %	25 %	0 %	25 %	300853265
91	NC_014328	CATC	2	8	39682	39689	25 %	25 %	0 %	50 %	300853265
92	NC_014328	AACA	2	8	41336	41343	75 %	0 %	0 %	25 %	300853266
93	NC_014328	AATA	2	8	42058	42065	75 %	25 %	0 %	0 %	300853266
94	NC_014328	ACAT	2	8	42577	42584	50 %	25 %	0 %	25 %	300853267
95	NC_014328	AGCA	2	8	42986	42993	50 %	0 %	25 %	25 %	300853268
96	NC_014328	AAAG	2	8	43007	43014	75 %	0 %	25 %	0 %	300853268
97	NC_014328	AATT	2	8	43349	43356	50 %	50 %	0 %	0 %	300853268
98	NC_014328	AATT	2	8	43495	43502	50 %	50 %	0 %	0 %	300853268
99	NC_014328	ATTC	2	8	43552	43559	25 %	50 %	0 %	25 %	300853268
100	NC_014328	TTTC	2	8	44194	44201	0 %	75 %	0 %	25 %	300853268
101	NC_014328	CAAT	2	8	44319	44326	50 %	25 %	0 %	25 %	300853268
102	NC_014328	AAAT	2	8	45235	45242	75 %	25 %	0 %	0 %	300853269
103	NC_014328	AAAT	2	8	46583	46590	75 %	25 %	0 %	0 %	300853272
104	NC_014328	AAAT	2	8	48205	48212	75 %	25 %	0 %	0 %	300853273
105	NC_014328	TATT	2	8	48372	48379	25 %	75 %	0 %	0 %	300853273
106	NC_014328	AGGA	2	8	49119	49126	50 %	0 %	50 %	0 %	300853274
107	NC_014328	CAAG	2	8	49207	49214	50 %	0 %	25 %	25 %	300853274
108	NC_014328	ATTT	2	8	49838	49845	25 %	75 %	0 %	0 %	300853275
109	NC_014328	TAGA	2	8	49982	49989	50 %	25 %	25 %	0 %	300853275
110	NC_014328	AATT	2	8	50080	50087	50 %	50 %	0 %	0 %	300853275
111	NC_014328	TAAG	2	8	50980	50987	50 %	25 %	25 %	0 %	300853276
112	NC_014328	TTTA	2	8	51359	51366	25 %	75 %	0 %	0 %	300853277
113	NC_014328	ATGT	2	8	51526	51533	25 %	50 %	25 %	0 %	300853277
114	NC_014328	TTGA	2	8	52466	52473	25 %	50 %	25 %	0 %	300853278
115	NC_014328	ATAA	2	8	52872	52879	75 %	25 %	0 %	0 %	300853278
116	NC_014328	AGAA	2	8	53869	53876	75 %	0 %	25 %	0 %	300853279
117	NC_014328	GCAA	2	8	55179	55186	50 %	0 %	25 %	25 %	300853280
118	NC_014328	TTCC	2	8	55908	55915	0 %	50 %	0 %	50 %	300853282
119	NC_014328	AATT	2	8	57403	57410	50 %	50 %	0 %	0 %	300853283
120	NC_014328	GTTT	2	8	57749	57756	0 %	75 %	25 %	0 %	300853284
121	NC_014328	AGAA	2	8	58281	58288	75 %	0 %	25 %	0 %	300853284
122	NC_014328	TGAC	2	8	58385	58392	25 %	25 %	25 %	25 %	300853284
123	NC_014328	TAAA	2	8	58966	58973	75 %	25 %	0 %	0 %	300853285
124	NC_014328	AGGA	2	8	59064	59071	50 %	0 %	50 %	0 %	300853285
125	NC_014328	TAAA	2	8	59098	59105	75 %	25 %	0 %	0 %	300853285
126	NC_014328	ATTT	2	8	59286	59293	25 %	75 %	0 %	0 %	300853285
127	NC_014328	AATT	2	8	59416	59423	50 %	50 %	0 %	0 %	300853285
128	NC_014328	TTCT	2	8	59494	59501	0 %	75 %	0 %	25 %	300853285
129	NC_014328	TACA	2	8	60120	60127	50 %	25 %	0 %	25 %	300853286
130	NC_014328	CTGC	2	8	60362	60369	0 %	25 %	25 %	50 %	300853286
131	NC_014328	GAAA	2	8	60664	60671	75 %	0 %	25 %	0 %	300853286
132	NC_014328	AGTG	2	8	60895	60902	25 %	25 %	50 %	0 %	300853286
133	NC_014328	AAAG	2	8	61151	61158	75 %	0 %	25 %	0 %	300853286
134	NC_014328	AATT	2	8	61606	61613	50 %	50 %	0 %	0 %	300853286
135	NC_014328	TTTC	2	8	61959	61966	0 %	75 %	0 %	25 %	300853287
136	NC_014328	TTAA	2	8	62148	62155	50 %	50 %	0 %	0 %	300853287
137	NC_014328	TGCT	2	8	62314	62321	0 %	50 %	25 %	25 %	300853287
138	NC_014328	TGCT	2	8	63019	63026	0 %	50 %	25 %	25 %	300853287
139	NC_014328	TGTT	2	8	63226	63233	0 %	75 %	25 %	0 %	300853287
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