MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 97259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_014328	GAA	2	6	214988	214993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853418
4003	NC_014328	AGA	2	6	215014	215019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853418
4004	NC_014328	ACTT	2	8	215024	215031	25 %	50 %	0 %	25 %	300853418
4005	NC_014328	AAT	2	6	215069	215074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853418
4006	NC_014328	TGCT	2	8	215086	215093	0 %	50 %	25 %	25 %	300853418
4007	NC_014328	GTG	2	6	215115	215120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853418
4008	NC_014328	TA	3	6	215129	215134	50 %	50 %	0 %	0 %	300853418
4009	NC_014328	AT	3	6	215135	215140	50 %	50 %	0 %	0 %	300853418
4010	NC_014328	TA	3	6	215148	215153	50 %	50 %	0 %	0 %	300853418
4011	NC_014328	AGC	2	6	215167	215172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853418
4012	NC_014328	TAA	2	6	215193	215198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853418
4013	NC_014328	AAAG	2	8	215251	215258	75 %	0 %	25 %	0 %	300853418
4014	NC_014328	GAA	2	6	215270	215275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853418
4015	NC_014328	AG	3	6	215316	215321	50 %	0 %	50 %	0 %	300853418
4016	NC_014328	CCA	2	6	215397	215402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853418
4017	NC_014328	ATA	2	6	215409	215414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853418
4018	NC_014328	AGCTGT	2	12	215419	215430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300853418
4019	NC_014328	AT	3	6	215433	215438	50 %	50 %	0 %	0 %	300853418
4020	NC_014328	AAG	2	6	215509	215514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853418
4021	NC_014328	TATAAA	2	12	215602	215613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853418
4022	NC_014328	AT	3	6	215643	215648	50 %	50 %	0 %	0 %	300853418
4023	NC_014328	A	7	7	215653	215659	100 %	0 %	0 %	0 %	300853418
4024	NC_014328	A	7	7	215679	215685	100 %	0 %	0 %	0 %	300853418
4025	NC_014328	TG	3	6	215711	215716	0 %	50 %	50 %	0 %	300853418
4026	NC_014328	A	6	6	215745	215750	100 %	0 %	0 %	0 %	300853418
4027	NC_014328	TAA	2	6	215796	215801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853418
4028	NC_014328	A	6	6	215800	215805	100 %	0 %	0 %	0 %	300853418
4029	NC_014328	TAAA	2	8	215808	215815	75 %	25 %	0 %	0 %	300853418
4030	NC_014328	GAA	2	6	215870	215875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853418
4031	NC_014328	GTAA	2	8	215888	215895	50 %	25 %	25 %	0 %	300853418
4032	NC_014328	ATA	2	6	215942	215947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853418
4033	NC_014328	AGG	2	6	215971	215976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853418
4034	NC_014328	ATA	2	6	215999	216004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853418
4035	NC_014328	AGC	2	6	216034	216039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853418
4036	NC_014328	TG	4	8	216058	216065	0 %	50 %	50 %	0 %	300853418
4037	NC_014328	AT	3	6	216072	216077	50 %	50 %	0 %	0 %	300853418
4038	NC_014328	GCA	2	6	216137	216142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853418
4039	NC_014328	TAG	2	6	216204	216209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853418
4040	NC_014328	ATG	2	6	216212	216217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853418
4041	NC_014328	ACTACA	2	12	216272	216283	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	300853418
4042	NC_014328	ACT	2	6	216332	216337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853418
4043	NC_014328	AT	3	6	216347	216352	50 %	50 %	0 %	0 %	300853418
4044	NC_014328	ATA	2	6	216357	216362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853418
4045	NC_014328	TAC	2	6	216382	216387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853418
4046	NC_014328	GCA	2	6	216434	216439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853418
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4048	NC_014328	ATC	2	6	216528	216533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853418
4049	NC_014328	ATAC	2	8	216548	216555	50 %	25 %	0 %	25 %	300853418
4050	NC_014328	A	7	7	216601	216607	100 %	0 %	0 %	0 %	300853418
4051	NC_014328	AGTA	2	8	216640	216647	50 %	25 %	25 %	0 %	300853418
4052	NC_014328	TAAT	2	8	216654	216661	50 %	50 %	0 %	0 %	300853418
4053	NC_014328	A	6	6	216718	216723	100 %	0 %	0 %	0 %	300853418
4054	NC_014328	TA	3	6	216747	216752	50 %	50 %	0 %	0 %	300853418
4055	NC_014328	ATA	2	6	216759	216764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853418
4056	NC_014328	TATG	2	8	216766	216773	25 %	50 %	25 %	0 %	300853418
4057	NC_014328	A	6	6	216777	216782	100 %	0 %	0 %	0 %	300853418
4058	NC_014328	A	6	6	216786	216791	100 %	0 %	0 %	0 %	300853418
4059	NC_014328	GCT	2	6	216869	216874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853418
4060	NC_014328	CTATT	2	10	216904	216913	20 %	60 %	0 %	20 %	300853418
4061	NC_014328	AGT	2	6	216997	217002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853418
4062	NC_014328	ATA	2	6	217068	217073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853418
4063	NC_014328	A	6	6	217125	217130	100 %	0 %	0 %	0 %	300853418
4064	NC_014328	AGA	2	6	217174	217179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853418
4065	NC_014328	AGA	2	6	217187	217192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853418
4066	NC_014328	ATA	3	9	217334	217342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853418
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4072	NC_014328	AAAAG	2	10	217588	217597	80 %	0 %	20 %	0 %	300853419
4073	NC_014328	ATC	2	6	217604	217609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853419
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4077	NC_014328	AGC	2	6	217737	217742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853419
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4079	NC_014328	ATATA	2	10	217761	217770	60 %	40 %	0 %	0 %	300853419
4080	NC_014328	TGG	2	6	217827	217832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853419
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4085	NC_014328	ATTA	2	8	218028	218035	50 %	50 %	0 %	0 %	300853419
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4089	NC_014328	TAAAA	2	10	218088	218097	80 %	20 %	0 %	0 %	300853419
4090	NC_014328	A	7	7	218196	218202	100 %	0 %	0 %	0 %	300853419
4091	NC_014328	T	7	7	218292	218298	0 %	100 %	0 %	0 %	300853419
4092	NC_014328	GAT	2	6	218299	218304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853419
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4094	NC_014328	AG	3	6	218350	218355	50 %	0 %	50 %	0 %	300853419
4095	NC_014328	TTA	2	6	218360	218365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853419
4096	NC_014328	T	7	7	218800	218806	0 %	100 %	0 %	0 %	300853420
4097	NC_014328	CATT	2	8	218838	218845	25 %	50 %	0 %	25 %	300853420
4098	NC_014328	A	7	7	218851	218857	100 %	0 %	0 %	0 %	300853420
4099	NC_014328	TC	3	6	218923	218928	0 %	50 %	0 %	50 %	300853420
4100	NC_014328	TCTA	2	8	218948	218955	25 %	50 %	0 %	25 %	300853420
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4103	NC_014328	TCT	2	6	219006	219011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853421
4104	NC_014328	GAT	2	6	219054	219059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853421
4105	NC_014328	TA	3	6	219084	219089	50 %	50 %	0 %	0 %	300853421
4106	NC_014328	ATA	2	6	219199	219204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853421
4107	NC_014328	ATG	2	6	219216	219221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853421
4108	NC_014328	A	6	6	219255	219260	100 %	0 %	0 %	0 %	300853421
4109	NC_014328	TA	3	6	219321	219326	50 %	50 %	0 %	0 %	300853421
4110	NC_014328	CTA	2	6	219331	219336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853421
4111	NC_014328	AGA	3	9	219441	219449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853421
4112	NC_014328	TAA	2	6	219514	219519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853421
4113	NC_014328	TA	3	6	219522	219527	50 %	50 %	0 %	0 %	300853421
4114	NC_014328	A	6	6	219565	219570	100 %	0 %	0 %	0 %	300853421
4115	NC_014328	AGA	2	6	219629	219634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853421
4116	NC_014328	GTA	2	6	219684	219689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853421
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4120	NC_014328	AT	3	6	219810	219815	50 %	50 %	0 %	0 %	300853421
4121	NC_014328	CTA	2	6	219820	219825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853421
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4124	NC_014328	CTT	2	6	219892	219897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853421
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4496	NC_014328	AGT	2	6	236215	236220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853436
4497	NC_014328	AACA	2	8	236339	236346	75 %	0 %	0 %	25 %	300853436
4498	NC_014328	CTT	2	6	236367	236372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853436
4499	NC_014328	TAA	2	6	236406	236411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853436
4500	NC_014328	GCA	2	6	236426	236431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853436

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