MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 97259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014328	TAC	2	6	55314	55319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853281
1002	NC_014328	TCT	2	6	55357	55362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853281
1003	NC_014328	GCA	2	6	55372	55377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853281
1004	NC_014328	CAA	2	6	55394	55399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853281
1005	NC_014328	ACA	2	6	55408	55413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853281
1006	NC_014328	AGT	2	6	55452	55457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853281
1007	NC_014328	TGG	2	6	55458	55463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853281
1008	NC_014328	AAT	2	6	55504	55509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853281
1009	NC_014328	AAC	2	6	55529	55534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853281
1010	NC_014328	TGT	2	6	55542	55547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853281
1011	NC_014328	ACA	2	6	55561	55566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853281
1012	NC_014328	A	7	7	55853	55859	100 %	0 %	0 %	0 %	300853282
1013	NC_014328	TAT	4	12	55874	55885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853282
1014	NC_014328	TTCC	2	8	55908	55915	0 %	50 %	0 %	50 %	300853282
1015	NC_014328	T	6	6	55977	55982	0 %	100 %	0 %	0 %	300853282
1016	NC_014328	TGC	2	6	55985	55990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853282
1017	NC_014328	T	6	6	55994	55999	0 %	100 %	0 %	0 %	300853282
1018	NC_014328	TAC	2	6	56051	56056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853282
1019	NC_014328	A	7	7	56058	56064	100 %	0 %	0 %	0 %	300853282
1020	NC_014328	T	6	6	56085	56090	0 %	100 %	0 %	0 %	300853282
1021	NC_014328	TAT	2	6	56099	56104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853282
1022	NC_014328	ATT	2	6	56169	56174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853282
1023	NC_014328	TTA	2	6	56178	56183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853282
1024	NC_014328	TAT	2	6	56195	56200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853282
1025	NC_014328	CTA	2	6	56230	56235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853282
1026	NC_014328	CAG	2	6	56256	56261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853282
1027	NC_014328	AAC	2	6	56267	56272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853282
1028	NC_014328	TTA	2	6	56316	56321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853282
1029	NC_014328	TTA	2	6	56325	56330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853282
1030	NC_014328	CTC	2	6	56335	56340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300853282
1031	NC_014328	TAC	2	6	56365	56370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853282
1032	NC_014328	TCT	2	6	56375	56380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853282
1033	NC_014328	AT	3	6	56395	56400	50 %	50 %	0 %	0 %	300853282
1034	NC_014328	GAA	2	6	56418	56423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853282
1035	NC_014328	ATA	2	6	56672	56677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853283
1036	NC_014328	AT	3	6	56712	56717	50 %	50 %	0 %	0 %	300853283
1037	NC_014328	TAA	2	6	56788	56793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853283
1038	NC_014328	TGA	2	6	56881	56886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853283
1039	NC_014328	A	7	7	56977	56983	100 %	0 %	0 %	0 %	300853283
1040	NC_014328	AT	3	6	57058	57063	50 %	50 %	0 %	0 %	300853283
1041	NC_014328	AAG	2	6	57087	57092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853283
1042	NC_014328	AT	3	6	57130	57135	50 %	50 %	0 %	0 %	300853283
1043	NC_014328	AG	3	6	57149	57154	50 %	0 %	50 %	0 %	300853283
1044	NC_014328	TA	3	6	57156	57161	50 %	50 %	0 %	0 %	300853283
1045	NC_014328	AT	3	6	57183	57188	50 %	50 %	0 %	0 %	300853283
1046	NC_014328	AT	3	6	57252	57257	50 %	50 %	0 %	0 %	300853283
1047	NC_014328	ATA	2	6	57273	57278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853283
1048	NC_014328	AATT	2	8	57403	57410	50 %	50 %	0 %	0 %	300853283
1049	NC_014328	AT	3	6	57435	57440	50 %	50 %	0 %	0 %	300853283
1050	NC_014328	CTG	2	6	57450	57455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853283
1051	NC_014328	ATA	2	6	57519	57524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853283
1052	NC_014328	AGA	2	6	57550	57555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853283
1053	NC_014328	TA	5	10	57567	57576	50 %	50 %	0 %	0 %	300853283
1054	NC_014328	TAA	3	9	57729	57737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853284
1055	NC_014328	GTTT	2	8	57749	57756	0 %	75 %	25 %	0 %	300853284
1056	NC_014328	GTT	2	6	57805	57810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853284
1057	NC_014328	AGC	2	6	57839	57844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853284
1058	NC_014328	T	6	6	57898	57903	0 %	100 %	0 %	0 %	300853284
1059	NC_014328	TTC	2	6	57984	57989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853284
1060	NC_014328	AATATC	2	12	58071	58082	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	300853284
1061	NC_014328	TCT	2	6	58093	58098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853284
1062	NC_014328	AT	3	6	58103	58108	50 %	50 %	0 %	0 %	300853284
1063	NC_014328	TTC	2	6	58171	58176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853284
1064	NC_014328	ATT	2	6	58177	58182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853284
1065	NC_014328	T	6	6	58181	58186	0 %	100 %	0 %	0 %	300853284
1066	NC_014328	AG	3	6	58264	58269	50 %	0 %	50 %	0 %	300853284
1067	NC_014328	T	6	6	58271	58276	0 %	100 %	0 %	0 %	300853284
1068	NC_014328	AGAA	2	8	58281	58288	75 %	0 %	25 %	0 %	300853284
1069	NC_014328	ATA	2	6	58312	58317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853284
1070	NC_014328	TGTTAA	2	12	58362	58373	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	300853284
1071	NC_014328	TGAC	2	8	58385	58392	25 %	25 %	25 %	25 %	300853284
1072	NC_014328	AT	3	6	58403	58408	50 %	50 %	0 %	0 %	300853284
1073	NC_014328	AT	3	6	58892	58897	50 %	50 %	0 %	0 %	300853285
1074	NC_014328	A	6	6	58899	58904	100 %	0 %	0 %	0 %	300853285
1075	NC_014328	GTT	2	6	58923	58928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853285
1076	NC_014328	TAAA	2	8	58966	58973	75 %	25 %	0 %	0 %	300853285
1077	NC_014328	TTA	2	6	59017	59022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853285
1078	NC_014328	CTATG	2	10	59042	59051	20 %	40 %	20 %	20 %	300853285
1079	NC_014328	AGGA	2	8	59064	59071	50 %	0 %	50 %	0 %	300853285
1080	NC_014328	TAAA	2	8	59098	59105	75 %	25 %	0 %	0 %	300853285
1081	NC_014328	TTA	2	6	59116	59121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853285
1082	NC_014328	AGA	2	6	59144	59149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853285
1083	NC_014328	GAT	2	6	59190	59195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853285
1084	NC_014328	ATC	2	6	59202	59207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853285
1085	NC_014328	ATTT	2	8	59286	59293	25 %	75 %	0 %	0 %	300853285
1086	NC_014328	TTG	2	6	59371	59376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853285
1087	NC_014328	AATT	2	8	59416	59423	50 %	50 %	0 %	0 %	300853285
1088	NC_014328	TGA	2	6	59471	59476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853285
1089	NC_014328	TTCT	2	8	59494	59501	0 %	75 %	0 %	25 %	300853285
1090	NC_014328	AGC	2	6	59594	59599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853285
1091	NC_014328	AGC	2	6	59627	59632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853285
1092	NC_014328	A	7	7	59669	59675	100 %	0 %	0 %	0 %	300853285
1093	NC_014328	ATG	2	6	59679	59684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853285
1094	NC_014328	CTC	2	6	59719	59724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300853285
1095	NC_014328	CAATT	2	10	59750	59759	40 %	40 %	0 %	20 %	300853285
1096	NC_014328	AAT	2	6	59797	59802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853285
1097	NC_014328	TTA	2	6	59862	59867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853286
1098	NC_014328	GAA	2	6	59891	59896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853286
1099	NC_014328	ATGGG	2	10	60020	60029	20 %	20 %	60 %	0 %	300853286
1100	NC_014328	GTG	2	6	60048	60053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853286
1101	NC_014328	AGG	2	6	60076	60081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853286
1102	NC_014328	ATG	2	6	60093	60098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853286
1103	NC_014328	TACA	2	8	60120	60127	50 %	25 %	0 %	25 %	300853286
1104	NC_014328	AGC	3	9	60157	60165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1105	NC_014328	GAA	2	6	60167	60172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853286
1106	NC_014328	A	7	7	60175	60181	100 %	0 %	0 %	0 %	300853286
1107	NC_014328	TGC	2	6	60199	60204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1108	NC_014328	CGT	2	6	60323	60328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1109	NC_014328	CTGC	2	8	60362	60369	0 %	25 %	25 %	50 %	300853286
1110	NC_014328	ATG	3	9	60371	60379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853286
1111	NC_014328	TAT	2	6	60409	60414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853286
1112	NC_014328	GGA	2	6	60451	60456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853286
1113	NC_014328	AAT	2	6	60494	60499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853286
1114	NC_014328	AGA	2	6	60511	60516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853286
1115	NC_014328	CTG	2	6	60549	60554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1116	NC_014328	GGA	2	6	60557	60562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853286
1117	NC_014328	GAAA	2	8	60664	60671	75 %	0 %	25 %	0 %	300853286
1118	NC_014328	ATT	2	6	60734	60739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853286
1119	NC_014328	GCT	2	6	60776	60781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1120	NC_014328	CAA	2	6	60792	60797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853286
1121	NC_014328	CTT	2	6	60803	60808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853286
1122	NC_014328	TGC	2	6	60829	60834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1123	NC_014328	TAA	2	6	60874	60879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853286
1124	NC_014328	AGTG	2	8	60895	60902	25 %	25 %	50 %	0 %	300853286
1125	NC_014328	TTC	2	6	60903	60908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853286
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1127	NC_014328	TGG	2	6	61052	61057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853286
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