MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 97259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014328	CAAG	2	8	28856	28863	50 %	0 %	25 %	25 %	300853254
502	NC_014328	AT	3	6	28865	28870	50 %	50 %	0 %	0 %	300853254
503	NC_014328	AGTT	2	8	28894	28901	25 %	50 %	25 %	0 %	300853254
504	NC_014328	TTA	2	6	28909	28914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853254
505	NC_014328	TATAGA	2	12	28932	28943	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	300853254
506	NC_014328	GAAA	2	8	28955	28962	75 %	0 %	25 %	0 %	300853254
507	NC_014328	ATGA	2	8	29004	29011	50 %	25 %	25 %	0 %	300853254
508	NC_014328	A	6	6	29048	29053	100 %	0 %	0 %	0 %	300853254
509	NC_014328	TGA	2	6	29060	29065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853254
510	NC_014328	AGT	2	6	29105	29110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853254
511	NC_014328	TAA	2	6	29131	29136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853254
512	NC_014328	GTT	2	6	29139	29144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853254
513	NC_014328	GAA	2	6	29145	29150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853254
514	NC_014328	A	6	6	29155	29160	100 %	0 %	0 %	0 %	300853254
515	NC_014328	GTA	2	6	29161	29166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853254
516	NC_014328	AGA	2	6	29667	29672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853255
517	NC_014328	AAG	2	6	29726	29731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853255
518	NC_014328	TAA	2	6	29742	29747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853255
519	NC_014328	A	7	7	29793	29799	100 %	0 %	0 %	0 %	300853255
520	NC_014328	ATGG	2	8	29801	29808	25 %	25 %	50 %	0 %	300853255
521	NC_014328	AT	3	6	29830	29835	50 %	50 %	0 %	0 %	300853255
522	NC_014328	ACA	2	6	29855	29860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853255
523	NC_014328	ATT	2	6	29901	29906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853255
524	NC_014328	AGA	2	6	29916	29921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853255
525	NC_014328	GA	3	6	29957	29962	50 %	0 %	50 %	0 %	300853255
526	NC_014328	ATA	2	6	30038	30043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853255
527	NC_014328	ATG	2	6	30047	30052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853255
528	NC_014328	ATA	2	6	30074	30079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853255
529	NC_014328	ATA	2	6	30116	30121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853255
530	NC_014328	CAA	2	6	30139	30144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853255
531	NC_014328	AGA	2	6	30174	30179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853255
532	NC_014328	TAA	2	6	30198	30203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853255
533	NC_014328	ATG	2	6	30224	30229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853255
534	NC_014328	AT	4	8	30230	30237	50 %	50 %	0 %	0 %	300853255
535	NC_014328	A	7	7	30288	30294	100 %	0 %	0 %	0 %	300853255
536	NC_014328	ATG	2	6	30353	30358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853255
537	NC_014328	ATA	2	6	30373	30378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853255
538	NC_014328	AAT	2	6	30379	30384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853255
539	NC_014328	T	6	6	30396	30401	0 %	100 %	0 %	0 %	300853255
540	NC_014328	CAA	2	6	30642	30647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853256
541	NC_014328	AT	3	6	30709	30714	50 %	50 %	0 %	0 %	300853256
542	NC_014328	TAG	2	6	30756	30761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853256
543	NC_014328	GCTAT	2	10	30791	30800	20 %	40 %	20 %	20 %	300853256
544	NC_014328	TTA	2	6	30839	30844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853256
545	NC_014328	AGG	2	6	30916	30921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853257
546	NC_014328	AAT	2	6	31017	31022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853257
547	NC_014328	AGG	2	6	31078	31083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853257
548	NC_014328	A	7	7	31088	31094	100 %	0 %	0 %	0 %	300853257
549	NC_014328	TAA	2	6	31178	31183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853257
550	NC_014328	AG	3	6	31202	31207	50 %	0 %	50 %	0 %	300853257
551	NC_014328	TAC	2	6	31223	31228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853257
552	NC_014328	GA	3	6	31271	31276	50 %	0 %	50 %	0 %	300853257
553	NC_014328	GAT	2	6	31323	31328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853257
554	NC_014328	AGA	2	6	31342	31347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853257
555	NC_014328	AGA	2	6	31579	31584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853258
556	NC_014328	AATA	2	8	31586	31593	75 %	25 %	0 %	0 %	300853258
557	NC_014328	ACT	2	6	31598	31603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853258
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559	NC_014328	TAA	2	6	31666	31671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853258
560	NC_014328	CAA	2	6	31689	31694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853258
561	NC_014328	TG	3	6	31746	31751	0 %	50 %	50 %	0 %	300853258
562	NC_014328	TAA	2	6	31856	31861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853259
563	NC_014328	ATT	2	6	31871	31876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853259
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565	NC_014328	AT	3	6	31938	31943	50 %	50 %	0 %	0 %	300853259
566	NC_014328	AT	3	6	31947	31952	50 %	50 %	0 %	0 %	300853259
567	NC_014328	AGA	2	6	32033	32038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853259
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569	NC_014328	TAA	2	6	32141	32146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853259
570	NC_014328	TAT	2	6	32149	32154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853259
571	NC_014328	A	7	7	32168	32174	100 %	0 %	0 %	0 %	300853259
572	NC_014328	AACTT	2	10	32184	32193	40 %	40 %	0 %	20 %	300853259
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574	NC_014328	AGAT	2	8	32458	32465	50 %	25 %	25 %	0 %	300853260
575	NC_014328	AAGT	2	8	32498	32505	50 %	25 %	25 %	0 %	300853260
576	NC_014328	ATGG	2	8	32548	32555	25 %	25 %	50 %	0 %	300853260
577	NC_014328	AAAG	2	8	32559	32566	75 %	0 %	25 %	0 %	300853260
578	NC_014328	A	7	7	32577	32583	100 %	0 %	0 %	0 %	300853260
579	NC_014328	CA	3	6	32590	32595	50 %	0 %	0 %	50 %	300853260
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581	NC_014328	A	7	7	32603	32609	100 %	0 %	0 %	0 %	300853260
582	NC_014328	CA	3	6	32624	32629	50 %	0 %	0 %	50 %	300853260
583	NC_014328	A	6	6	32634	32639	100 %	0 %	0 %	0 %	300853260
584	NC_014328	A	6	6	32652	32657	100 %	0 %	0 %	0 %	300853260
585	NC_014328	A	7	7	32673	32679	100 %	0 %	0 %	0 %	300853260
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588	NC_014328	TG	3	6	32769	32774	0 %	50 %	50 %	0 %	300853260
589	NC_014328	GCA	2	6	32841	32846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853260
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591	NC_014328	GAA	2	6	33042	33047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853260
592	NC_014328	CA	3	6	33051	33056	50 %	0 %	0 %	50 %	300853260
593	NC_014328	A	6	6	33156	33161	100 %	0 %	0 %	0 %	300853260
594	NC_014328	TTA	2	6	33195	33200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853260
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596	NC_014328	GAC	2	6	33276	33281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853260
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599	NC_014328	TAA	2	6	33524	33529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853261
600	NC_014328	T	6	6	33545	33550	0 %	100 %	0 %	0 %	300853261
601	NC_014328	TTG	2	6	33577	33582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853261
602	NC_014328	AAGT	2	8	33583	33590	50 %	25 %	25 %	0 %	300853261
603	NC_014328	ATA	2	6	33625	33630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853261
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607	NC_014328	AT	3	6	33781	33786	50 %	50 %	0 %	0 %	300853261
608	NC_014328	GTAA	2	8	33800	33807	50 %	25 %	25 %	0 %	300853261
609	NC_014328	T	7	7	33825	33831	0 %	100 %	0 %	0 %	300853261
610	NC_014328	TATG	2	8	33966	33973	25 %	50 %	25 %	0 %	300853261
611	NC_014328	CTA	2	6	34010	34015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853261
612	NC_014328	A	7	7	34342	34348	100 %	0 %	0 %	0 %	300853262
613	NC_014328	ATA	2	6	34364	34369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853262
614	NC_014328	AGTA	2	8	34407	34414	50 %	25 %	25 %	0 %	300853262
615	NC_014328	AT	3	6	34462	34467	50 %	50 %	0 %	0 %	300853262
616	NC_014328	AAG	2	6	34476	34481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853262
617	NC_014328	TTG	2	6	34492	34497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853262
618	NC_014328	AT	3	6	34514	34519	50 %	50 %	0 %	0 %	300853262
619	NC_014328	TAAA	2	8	34547	34554	75 %	25 %	0 %	0 %	300853262
620	NC_014328	TTTA	2	8	34919	34926	25 %	75 %	0 %	0 %	300853263
621	NC_014328	AT	4	8	34970	34977	50 %	50 %	0 %	0 %	300853263
622	NC_014328	CAC	2	6	34982	34987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853263
623	NC_014328	CTA	2	6	35026	35031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853263
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625	NC_014328	CTT	2	6	35117	35122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853263
626	NC_014328	ATC	2	6	35130	35135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853263
627	NC_014328	ATTT	2	8	35222	35229	25 %	75 %	0 %	0 %	300853263
628	NC_014328	TTTGA	2	10	35240	35249	20 %	60 %	20 %	0 %	300853263
629	NC_014328	ATT	2	6	35262	35267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853263
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