MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 97259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014328	GTA	2	6	281146	281151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853478
5502	NC_014328	TTC	2	6	281160	281165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853478
5503	NC_014328	TCT	2	6	281236	281241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853478
5504	NC_014328	T	6	6	281373	281378	0 %	100 %	0 %	0 %	300853478
5505	NC_014328	CTT	2	6	281387	281392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853478
5506	NC_014328	CTT	2	6	281396	281401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853478
5507	NC_014328	ATC	2	6	281434	281439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853478
5508	NC_014328	TAAGG	2	10	281455	281464	40 %	20 %	40 %	0 %	300853478
5509	NC_014328	TGCAAA	2	12	281511	281522	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300853478
5510	NC_014328	T	6	6	281657	281662	0 %	100 %	0 %	0 %	300853478
5511	NC_014328	ATTG	2	8	281671	281678	25 %	50 %	25 %	0 %	300853478
5512	NC_014328	TTC	2	6	281739	281744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853478
5513	NC_014328	T	6	6	281918	281923	0 %	100 %	0 %	0 %	300853478
5514	NC_014328	GAA	2	6	281951	281956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853478
5515	NC_014328	TTC	2	6	281958	281963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853478
5516	NC_014328	AAT	2	6	281966	281971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853478
5517	NC_014328	GAA	2	6	281982	281987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853478
5518	NC_014328	T	6	6	282103	282108	0 %	100 %	0 %	0 %	300853478
5519	NC_014328	TA	3	6	282128	282133	50 %	50 %	0 %	0 %	300853478
5520	NC_014328	GAC	2	6	282173	282178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853478
5521	NC_014328	GTT	2	6	282227	282232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853478
5522	NC_014328	TAG	2	6	282239	282244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853478
5523	NC_014328	T	7	7	282250	282256	0 %	100 %	0 %	0 %	300853478
5524	NC_014328	TTGG	2	8	282332	282339	0 %	50 %	50 %	0 %	300853478
5525	NC_014328	TAC	2	6	282422	282427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853478
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5527	NC_014328	TTC	2	6	282504	282509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853478
5528	NC_014328	T	6	6	282525	282530	0 %	100 %	0 %	0 %	300853478
5529	NC_014328	ATA	2	6	282550	282555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853478
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5531	NC_014328	TAT	2	6	283138	283143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853479
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5533	NC_014328	ATAG	2	8	283185	283192	50 %	25 %	25 %	0 %	300853479
5534	NC_014328	AT	3	6	283195	283200	50 %	50 %	0 %	0 %	300853479
5535	NC_014328	TTATTT	2	12	283242	283253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	300853479
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5537	NC_014328	AT	3	6	283305	283310	50 %	50 %	0 %	0 %	300853479
5538	NC_014328	A	7	7	283312	283318	100 %	0 %	0 %	0 %	300853479
5539	NC_014328	CAA	2	6	283362	283367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853479
5540	NC_014328	TTA	2	6	283374	283379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853479
5541	NC_014328	A	6	6	283393	283398	100 %	0 %	0 %	0 %	300853479
5542	NC_014328	AAG	2	6	283521	283526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853479
5543	NC_014328	AGA	2	6	283535	283540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853479
5544	NC_014328	A	6	6	283601	283606	100 %	0 %	0 %	0 %	300853479
5545	NC_014328	CCT	2	6	283607	283612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300853479
5546	NC_014328	TCT	2	6	283754	283759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853480
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5548	NC_014328	ATA	2	6	283769	283774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853480
5549	NC_014328	ATT	2	6	283790	283795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853480
5550	NC_014328	ATT	2	6	283835	283840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853480
5551	NC_014328	ACT	2	6	283973	283978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853480
5552	NC_014328	TGC	2	6	284029	284034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853480
5553	NC_014328	ATT	2	6	284057	284062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853480
5554	NC_014328	TCA	2	6	284086	284091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853480
5555	NC_014328	TC	3	6	284115	284120	0 %	50 %	0 %	50 %	300853480
5556	NC_014328	GAT	2	6	284170	284175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853480
5557	NC_014328	T	6	6	284202	284207	0 %	100 %	0 %	0 %	300853480
5558	NC_014328	ATTT	2	8	284231	284238	25 %	75 %	0 %	0 %	300853480
5559	NC_014328	AT	3	6	284321	284326	50 %	50 %	0 %	0 %	300853481
5560	NC_014328	GTA	2	6	284330	284335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853481
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5562	NC_014328	GCA	2	6	284386	284391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853481
5563	NC_014328	T	7	7	284426	284432	0 %	100 %	0 %	0 %	300853481
5564	NC_014328	ATTT	2	8	284471	284478	25 %	75 %	0 %	0 %	300853481
5565	NC_014328	ATC	2	6	284505	284510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853481
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5567	NC_014328	ATATC	2	10	284645	284654	40 %	40 %	0 %	20 %	300853481
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5570	NC_014328	TATG	2	8	284714	284721	25 %	50 %	25 %	0 %	300853481
5571	NC_014328	T	6	6	284727	284732	0 %	100 %	0 %	0 %	300853481
5572	NC_014328	GTC	2	6	284802	284807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853481
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5574	NC_014328	A	7	7	284887	284893	100 %	0 %	0 %	0 %	300853481
5575	NC_014328	T	6	6	284894	284899	0 %	100 %	0 %	0 %	300853481
5576	NC_014328	T	8	8	284924	284931	0 %	100 %	0 %	0 %	300853481
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5582	NC_014328	AT	3	6	285155	285160	50 %	50 %	0 %	0 %	300853482
5583	NC_014328	GTA	2	6	285171	285176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853482
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5587	NC_014328	AAGT	2	8	285341	285348	50 %	25 %	25 %	0 %	300853482
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5590	NC_014328	AGT	2	6	285452	285457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853482
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5593	NC_014328	AT	4	8	285551	285558	50 %	50 %	0 %	0 %	300853482
5594	NC_014328	TTTG	2	8	285561	285568	0 %	75 %	25 %	0 %	300853482
5595	NC_014328	GTTTTA	2	12	285601	285612	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	300853482
5596	NC_014328	TAT	2	6	285638	285643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853482
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5599	NC_014328	CTA	2	6	285839	285844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853483
5600	NC_014328	CAG	3	9	285926	285934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853483
5601	NC_014328	TACA	2	8	285971	285978	50 %	25 %	0 %	25 %	300853483
5602	NC_014328	GAA	2	6	285985	285990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853483
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5605	NC_014328	CTATAG	2	12	286202	286213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300853483
5606	NC_014328	TCT	2	6	286246	286251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853483
5607	NC_014328	TA	4	8	286268	286275	50 %	50 %	0 %	0 %	300853483
5608	NC_014328	CAT	2	6	286292	286297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853483
5609	NC_014328	ACT	3	9	286333	286341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853483
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5611	NC_014328	AC	3	6	286444	286449	50 %	0 %	0 %	50 %	300853483
5612	NC_014328	AAGTG	2	10	286483	286492	40 %	20 %	40 %	0 %	300853483
5613	NC_014328	TCT	2	6	286510	286515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853483
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5622	NC_014328	TTC	2	6	287148	287153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853484
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5997	NC_014328	GCA	2	6	305708	305713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853501
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5999	NC_014328	TGGGGT	2	12	305854	305865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853502
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