MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 97259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_014328	CAC	2	6	236505	236510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853436
4503	NC_014328	CTG	2	6	236643	236648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853436
4504	NC_014328	AAT	2	6	236656	236661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853436
4505	NC_014328	GA	3	6	236679	236684	50 %	0 %	50 %	0 %	300853436
4506	NC_014328	TTG	2	6	236944	236949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853437
4507	NC_014328	AAG	2	6	236950	236955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853437
4508	NC_014328	AAG	2	6	236971	236976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853437
4509	NC_014328	A	8	8	237047	237054	100 %	0 %	0 %	0 %	300853437
4510	NC_014328	AT	3	6	237100	237105	50 %	50 %	0 %	0 %	300853437
4511	NC_014328	AGA	2	6	237113	237118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853437
4512	NC_014328	GAA	2	6	237167	237172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853437
4513	NC_014328	TTC	2	6	237199	237204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853437
4514	NC_014328	TAATA	2	10	237272	237281	60 %	40 %	0 %	0 %	300853437
4515	NC_014328	TAA	2	6	237292	237297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853437
4516	NC_014328	TGC	2	6	237317	237322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853437
4517	NC_014328	AT	3	6	237334	237339	50 %	50 %	0 %	0 %	300853437
4518	NC_014328	AGA	2	6	237377	237382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853437
4519	NC_014328	TG	3	6	237421	237426	0 %	50 %	50 %	0 %	300853437
4520	NC_014328	CAA	2	6	237442	237447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853437
4521	NC_014328	AGG	2	6	237488	237493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853437
4522	NC_014328	AGAT	2	8	237517	237524	50 %	25 %	25 %	0 %	300853437
4523	NC_014328	TA	4	8	237530	237537	50 %	50 %	0 %	0 %	300853437
4524	NC_014328	A	8	8	237650	237657	100 %	0 %	0 %	0 %	300853437
4525	NC_014328	A	6	6	237664	237669	100 %	0 %	0 %	0 %	300853437
4526	NC_014328	TA	3	6	237690	237695	50 %	50 %	0 %	0 %	300853437
4527	NC_014328	GGTA	2	8	237710	237717	25 %	25 %	50 %	0 %	300853437
4528	NC_014328	ATA	2	6	237784	237789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853437
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4530	NC_014328	AAG	2	6	237824	237829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853437
4531	NC_014328	TGA	2	6	237833	237838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853437
4532	NC_014328	TGA	2	6	237872	237877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853437
4533	NC_014328	TGA	2	6	237898	237903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853437
4534	NC_014328	TAAA	2	8	237910	237917	75 %	25 %	0 %	0 %	300853437
4535	NC_014328	CTG	2	6	237919	237924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853437
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4537	NC_014328	TTTG	2	8	238015	238022	0 %	75 %	25 %	0 %	300853438
4538	NC_014328	ATT	2	6	238067	238072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853438
4539	NC_014328	TG	3	6	238073	238078	0 %	50 %	50 %	0 %	300853438
4540	NC_014328	CAG	2	6	238103	238108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853438
4541	NC_014328	AGT	2	6	238116	238121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853438
4542	NC_014328	CAAA	2	8	238161	238168	75 %	0 %	0 %	25 %	300853438
4543	NC_014328	AGC	2	6	238186	238191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853438
4544	NC_014328	TA	3	6	238258	238263	50 %	50 %	0 %	0 %	300853438
4545	NC_014328	AGA	2	6	238277	238282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853438
4546	NC_014328	TA	3	6	238307	238312	50 %	50 %	0 %	0 %	300853438
4547	NC_014328	AGA	2	6	238371	238376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853438
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4549	NC_014328	TAT	2	6	238415	238420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853438
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4551	NC_014328	A	7	7	238601	238607	100 %	0 %	0 %	0 %	300853439
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4554	NC_014328	ATA	2	6	238852	238857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853439
4555	NC_014328	ACTA	2	8	238868	238875	50 %	25 %	0 %	25 %	300853439
4556	NC_014328	AG	3	6	238882	238887	50 %	0 %	50 %	0 %	300853439
4557	NC_014328	GACA	2	8	238950	238957	50 %	0 %	25 %	25 %	300853439
4558	NC_014328	GATA	2	8	238967	238974	50 %	25 %	25 %	0 %	300853439
4559	NC_014328	AAAT	2	8	239004	239011	75 %	25 %	0 %	0 %	300853439
4560	NC_014328	AT	4	8	239130	239137	50 %	50 %	0 %	0 %	300853440
4561	NC_014328	AGTAA	2	10	239139	239148	60 %	20 %	20 %	0 %	300853440
4562	NC_014328	TAA	2	6	239188	239193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853440
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4569	NC_014328	TGCT	2	8	239533	239540	0 %	50 %	25 %	25 %	300853440
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4572	NC_014328	A	6	6	239580	239585	100 %	0 %	0 %	0 %	300853440
4573	NC_014328	AGATGT	2	12	239660	239671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853440
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4580	NC_014328	GAA	2	6	240086	240091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853441
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4587	NC_014328	GAATT	2	10	240292	240301	40 %	40 %	20 %	0 %	300853441
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4591	NC_014328	ATA	2	6	240479	240484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853442
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4594	NC_014328	CTA	2	6	240608	240613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853442
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4596	NC_014328	GAT	2	6	240637	240642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853442
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4604	NC_014328	TAT	2	6	240944	240949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853442
4605	NC_014328	CTG	2	6	241073	241078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853442
4606	NC_014328	AT	3	6	241123	241128	50 %	50 %	0 %	0 %	300853442
4607	NC_014328	AAG	2	6	241149	241154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853442
4608	NC_014328	AAAT	2	8	241157	241164	75 %	25 %	0 %	0 %	300853442
4609	NC_014328	TAT	2	6	241173	241178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853442
4610	NC_014328	CAT	2	6	241201	241206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853442
4611	NC_014328	CTT	2	6	241210	241215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853442
4612	NC_014328	GTT	2	6	241240	241245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853442
4613	NC_014328	GTATA	2	10	241254	241263	40 %	40 %	20 %	0 %	300853442
4614	NC_014328	CTTC	2	8	241323	241330	0 %	50 %	0 %	50 %	300853442
4615	NC_014328	TAA	2	6	241331	241336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853442
4616	NC_014328	T	6	6	241378	241383	0 %	100 %	0 %	0 %	300853442
4617	NC_014328	AG	3	6	241390	241395	50 %	0 %	50 %	0 %	300853442
4618	NC_014328	A	6	6	241397	241402	100 %	0 %	0 %	0 %	300853442
4619	NC_014328	GAGAA	2	10	241494	241503	60 %	0 %	40 %	0 %	300853443
4620	NC_014328	ATA	2	6	241513	241518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853443
4621	NC_014328	ACT	3	9	241713	241721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853443
4622	NC_014328	GCT	2	6	241737	241742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853443
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4624	NC_014328	AGA	2	6	241814	241819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853443
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4739	NC_014328	TA	3	6	246746	246751	50 %	50 %	0 %	0 %	300853449
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4744	NC_014328	A	7	7	246905	246911	100 %	0 %	0 %	0 %	300853449
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4993	NC_014328	TAG	2	6	258490	258495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853461
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4996	NC_014328	AGA	2	6	258555	258560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853461
4997	NC_014328	TA	3	6	258563	258568	50 %	50 %	0 %	0 %	300853461
4998	NC_014328	GAA	2	6	258598	258603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853461
4999	NC_014328	GAA	2	6	258642	258647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853461
5000	NC_014328	A	7	7	258650	258656	100 %	0 %	0 %	0 %	300853461

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