MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA chromosome

Total Repeats: 1663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014109	GTAA	2	8	755	762	50 %	25 %	25 %	0 %	295698241
2	NC_014109	ATTA	2	8	2022	2029	50 %	50 %	0 %	0 %	295698242
3	NC_014109	AGAA	2	8	2055	2062	75 %	0 %	25 %	0 %	295698242
4	NC_014109	TTTC	2	8	2239	2246	0 %	75 %	0 %	25 %	295698242
5	NC_014109	AATA	2	8	2726	2733	75 %	25 %	0 %	0 %	295698242
6	NC_014109	TATC	2	8	2906	2913	25 %	50 %	0 %	25 %	295698243
7	NC_014109	TGAT	2	8	3234	3241	25 %	50 %	25 %	0 %	295698243
8	NC_014109	TTTC	2	8	4650	4657	0 %	75 %	0 %	25 %	295698245
9	NC_014109	TCAT	2	8	4688	4695	25 %	50 %	0 %	25 %	295698245
10	NC_014109	GTTA	2	8	4953	4960	25 %	50 %	25 %	0 %	295698245
11	NC_014109	GAAG	2	8	5149	5156	50 %	0 %	50 %	0 %	295698246
12	NC_014109	GAAA	2	8	5162	5169	75 %	0 %	25 %	0 %	295698246
13	NC_014109	AATC	2	8	5369	5376	50 %	25 %	0 %	25 %	295698246
14	NC_014109	ATAG	2	8	5565	5572	50 %	25 %	25 %	0 %	295698247
15	NC_014109	ATCC	2	8	5694	5701	25 %	25 %	0 %	50 %	295698247
16	NC_014109	TCTG	3	12	6130	6141	0 %	50 %	25 %	25 %	295698247
17	NC_014109	AAAG	2	8	6207	6214	75 %	0 %	25 %	0 %	295698247
18	NC_014109	CAAG	2	8	6431	6438	50 %	0 %	25 %	25 %	295698247
19	NC_014109	AATG	2	8	7394	7401	50 %	25 %	25 %	0 %	295698248
20	NC_014109	ATGA	2	8	7527	7534	50 %	25 %	25 %	0 %	295698248
21	NC_014109	ATTT	2	8	7697	7704	25 %	75 %	0 %	0 %	295698248
22	NC_014109	AAAT	2	8	8290	8297	75 %	25 %	0 %	0 %	295698249
23	NC_014109	TTGA	2	8	8314	8321	25 %	50 %	25 %	0 %	295698249
24	NC_014109	TATC	2	8	8331	8338	25 %	50 %	0 %	25 %	295698249
25	NC_014109	GATA	2	8	8380	8387	50 %	25 %	25 %	0 %	295698249
26	NC_014109	GAAA	2	8	8701	8708	75 %	0 %	25 %	0 %	295698250
27	NC_014109	AACA	2	8	9150	9157	75 %	0 %	0 %	25 %	295698250
28	NC_014109	TAAT	2	8	9519	9526	50 %	50 %	0 %	0 %	295698250
29	NC_014109	AATC	2	8	9564	9571	50 %	25 %	0 %	25 %	295698250
30	NC_014109	TCAT	2	8	10108	10115	25 %	50 %	0 %	25 %	295698251
31	NC_014109	CATT	2	8	10241	10248	25 %	50 %	0 %	25 %	295698251
32	NC_014109	CTTG	2	8	11204	11211	0 %	50 %	25 %	25 %	295698252
33	NC_014109	CTTT	2	8	11428	11435	0 %	75 %	0 %	25 %	295698252
34	NC_014109	CAGA	3	12	11501	11512	50 %	0 %	25 %	25 %	295698252
35	NC_014109	TGGA	2	8	11940	11947	25 %	25 %	50 %	0 %	295698252
36	NC_014109	CTAT	2	8	12070	12077	25 %	50 %	0 %	25 %	295698252
37	NC_014109	GATT	2	8	12266	12273	25 %	50 %	25 %	0 %	295698253
38	NC_014109	TTTC	2	8	12473	12480	0 %	75 %	0 %	25 %	295698253
39	NC_014109	CTTC	2	8	12486	12493	0 %	50 %	0 %	50 %	295698253
40	NC_014109	ATGA	2	8	12947	12954	50 %	25 %	25 %	0 %	295698254
41	NC_014109	GAAA	2	8	12985	12992	75 %	0 %	25 %	0 %	295698254
42	NC_014109	AATT	2	8	13319	13326	50 %	50 %	0 %	0 %	295698255
43	NC_014109	GATC	2	8	13855	13862	25 %	25 %	25 %	25 %	295698256
44	NC_014109	ATCA	2	8	14402	14409	50 %	25 %	0 %	25 %	295698256
45	NC_014109	GAAA	2	8	15397	15404	75 %	0 %	25 %	0 %	295698257
46	NC_014109	TTTC	2	8	15580	15587	0 %	75 %	0 %	25 %	295698257
47	NC_014109	TAAT	2	8	15614	15621	50 %	50 %	0 %	0 %	295698257
48	NC_014109	TACT	2	8	16882	16889	25 %	50 %	0 %	25 %	295698258
49	NC_014109	GAAA	2	8	17906	17913	75 %	0 %	25 %	0 %	295698259
50	NC_014109	AATA	2	8	17926	17933	75 %	25 %	0 %	0 %	295698259
51	NC_014109	AATA	2	8	18400	18407	75 %	25 %	0 %	0 %	295698261
52	NC_014109	AGGA	2	8	18822	18829	50 %	0 %	50 %	0 %	295698261
53	NC_014109	TCCA	2	8	19762	19769	25 %	25 %	0 %	50 %	295698262
54	NC_014109	AAGT	2	8	19887	19894	50 %	25 %	25 %	0 %	295698262
55	NC_014109	AATT	2	8	20041	20048	50 %	50 %	0 %	0 %	295698262
56	NC_014109	ATTG	2	8	20089	20096	25 %	50 %	25 %	0 %	295698262
57	NC_014109	TGAA	2	8	20108	20115	50 %	25 %	25 %	0 %	295698262
58	NC_014109	TTCA	2	8	20371	20378	25 %	50 %	0 %	25 %	295698262
59	NC_014109	GCAA	2	8	21608	21615	50 %	0 %	25 %	25 %	295698264
60	NC_014109	TGAT	2	8	21708	21715	25 %	50 %	25 %	0 %	295698264
61	NC_014109	AGGA	2	8	21903	21910	50 %	0 %	50 %	0 %	295698265
62	NC_014109	CAAT	2	8	23317	23324	50 %	25 %	0 %	25 %	295698267
63	NC_014109	ATCT	2	8	24449	24456	25 %	50 %	0 %	25 %	295698268
64	NC_014109	GATT	2	8	24562	24569	25 %	50 %	25 %	0 %	295698268
65	NC_014109	ACTA	2	8	24589	24596	50 %	25 %	0 %	25 %	295698268
66	NC_014109	AAAG	2	8	24697	24704	75 %	0 %	25 %	0 %	295698268
67	NC_014109	CTTT	2	8	24953	24960	0 %	75 %	0 %	25 %	295698268
68	NC_014109	GGTA	2	8	25438	25445	25 %	25 %	50 %	0 %	295698269
69	NC_014109	AGAA	2	8	25629	25636	75 %	0 %	25 %	0 %	295698269
70	NC_014109	ATTT	2	8	25959	25966	25 %	75 %	0 %	0 %	295698269
71	NC_014109	ATAA	2	8	26453	26460	75 %	25 %	0 %	0 %	295698269
72	NC_014109	GGAA	2	8	26518	26525	50 %	0 %	50 %	0 %	295698269
73	NC_014109	AAAG	2	8	26549	26556	75 %	0 %	25 %	0 %	295698269
74	NC_014109	TCAA	2	8	26665	26672	50 %	25 %	0 %	25 %	295698270
75	NC_014109	AGAT	2	8	27669	27676	50 %	25 %	25 %	0 %	295698271
76	NC_014109	AAAG	2	8	27960	27967	75 %	0 %	25 %	0 %	295698271
77	NC_014109	ATAG	2	8	28178	28185	50 %	25 %	25 %	0 %	295698271
78	NC_014109	AATT	2	8	28186	28193	50 %	50 %	0 %	0 %	295698271
79	NC_014109	TAAA	2	8	29348	29355	75 %	25 %	0 %	0 %	295698272
80	NC_014109	ATTG	2	8	29824	29831	25 %	50 %	25 %	0 %	295698273
81	NC_014109	ATTG	2	8	29911	29918	25 %	50 %	25 %	0 %	295698273
82	NC_014109	TTCA	2	8	30101	30108	25 %	50 %	0 %	25 %	295698273
83	NC_014109	AATT	2	8	30849	30856	50 %	50 %	0 %	0 %	295698274
84	NC_014109	TTAT	2	8	31103	31110	25 %	75 %	0 %	0 %	295698274
85	NC_014109	AAGA	2	8	31433	31440	75 %	0 %	25 %	0 %	295698274
86	NC_014109	GATC	2	8	31529	31536	25 %	25 %	25 %	25 %	295698274
87	NC_014109	TTTC	2	8	31693	31700	0 %	75 %	0 %	25 %	295698274
88	NC_014109	CGAA	2	8	31759	31766	50 %	0 %	25 %	25 %	295698274
89	NC_014109	AAAT	2	8	31790	31797	75 %	25 %	0 %	0 %	295698274
90	NC_014109	ATTA	2	8	32017	32024	50 %	50 %	0 %	0 %	295698275
91	NC_014109	ATAA	2	8	32431	32438	75 %	25 %	0 %	0 %	295698276
92	NC_014109	CTTT	2	8	32529	32536	0 %	75 %	0 %	25 %	295698276
93	NC_014109	ATTG	2	8	33086	33093	25 %	50 %	25 %	0 %	295698276
94	NC_014109	GATC	2	8	33190	33197	25 %	25 %	25 %	25 %	295698276
95	NC_014109	TAAT	2	8	33634	33641	50 %	50 %	0 %	0 %	295698277
96	NC_014109	GAAT	2	8	33826	33833	50 %	25 %	25 %	0 %	295698277
97	NC_014109	TAGA	2	8	33979	33986	50 %	25 %	25 %	0 %	295698278
98	NC_014109	GTTT	2	8	34199	34206	0 %	75 %	25 %	0 %	295698278
99	NC_014109	GAAG	2	8	34560	34567	50 %	0 %	50 %	0 %	295698278
100	NC_014109	GATC	2	8	34997	35004	25 %	25 %	25 %	25 %	295698279
101	NC_014109	ATAA	2	8	40833	40840	75 %	25 %	0 %	0 %	295698280
102	NC_014109	GCAT	2	8	41237	41244	25 %	25 %	25 %	25 %	295698280
103	NC_014109	TTTA	2	8	41431	41438	25 %	75 %	0 %	0 %	295698280
104	NC_014109	TTTC	2	8	41854	41861	0 %	75 %	0 %	25 %	295698281
105	NC_014109	GAAT	2	8	42268	42275	50 %	25 %	25 %	0 %	295698282
106	NC_014109	AATC	2	8	42816	42823	50 %	25 %	0 %	25 %	295698283
107	NC_014109	AAAC	2	8	43257	43264	75 %	0 %	0 %	25 %	295698283
108	NC_014109	ATGT	2	8	44076	44083	25 %	50 %	25 %	0 %	295698285
109	NC_014109	TCCA	2	8	44221	44228	25 %	25 %	0 %	50 %	295698285
110	NC_014109	TCCA	2	8	44245	44252	25 %	25 %	0 %	50 %	295698285
111	NC_014109	CGAT	2	8	45416	45423	25 %	25 %	25 %	25 %	295698286
112	NC_014109	ATCC	2	8	46157	46164	25 %	25 %	0 %	50 %	295698286
113	NC_014109	TGAG	2	8	46574	46581	25 %	25 %	50 %	0 %	295698286
114	NC_014109	GATT	2	8	48738	48745	25 %	50 %	25 %	0 %	295698289
115	NC_014109	TCCA	2	8	48820	48827	25 %	25 %	0 %	50 %	295698289
116	NC_014109	CGAT	2	8	48921	48928	25 %	25 %	25 %	25 %	295698289
117	NC_014109	TTTC	2	8	49700	49707	0 %	75 %	0 %	25 %	295698289
118	NC_014109	TCAA	2	8	49999	50006	50 %	25 %	0 %	25 %	295698290
119	NC_014109	TGAT	2	8	50272	50279	25 %	50 %	25 %	0 %	295698290
120	NC_014109	GCTA	2	8	50313	50320	25 %	25 %	25 %	25 %	295698290
121	NC_014109	TCCT	2	8	50672	50679	0 %	50 %	0 %	50 %	295698290
122	NC_014109	GATC	2	8	50752	50759	25 %	25 %	25 %	25 %	295698290
123	NC_014109	AGAT	2	8	51552	51559	50 %	25 %	25 %	0 %	295698291
124	NC_014109	AATT	2	8	51598	51605	50 %	50 %	0 %	0 %	295698291
125	NC_014109	GATG	2	8	51709	51716	25 %	25 %	50 %	0 %	295698291
126	NC_014109	TTAA	2	8	52318	52325	50 %	50 %	0 %	0 %	295698292
127	NC_014109	AAAG	2	8	52930	52937	75 %	0 %	25 %	0 %	295698292
128	NC_014109	TTGA	2	8	53023	53030	25 %	50 %	25 %	0 %	295698292
129	NC_014109	ATTA	2	8	53358	53365	50 %	50 %	0 %	0 %	295698293
130	NC_014109	TCAA	2	8	53389	53396	50 %	25 %	0 %	25 %	295698293
131	NC_014109	ATTT	2	8	53499	53506	25 %	75 %	0 %	0 %	295698293
132	NC_014109	GGAA	2	8	53747	53754	50 %	0 %	50 %	0 %	295698293
133	NC_014109	AATA	2	8	53772	53779	75 %	25 %	0 %	0 %	295698293
134	NC_014109	TAAT	2	8	55710	55717	50 %	50 %	0 %	0 %	295698295
135	NC_014109	CATT	2	8	55821	55828	25 %	50 %	0 %	25 %	295698295
136	NC_014109	AACT	2	8	59540	59547	50 %	25 %	0 %	25 %	295698298
137	NC_014109	GATT	2	8	59612	59619	25 %	50 %	25 %	0 %	295698298
138	NC_014109	CAAT	2	8	59900	59907	50 %	25 %	0 %	25 %	295698298
139	NC_014109	TTCC	2	8	59924	59931	0 %	50 %	0 %	50 %	295698298
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