MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Puniceispirillum marinum IMCC1322 chromosome

Total Repeats: 46588

< Previous12...82838485868788899091929394Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_014010	ATT	2	6	2748174	2748179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294086109
46502	NC_014010	GCTGGC	2	12	2748253	2748264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294086109
46503	NC_014010	TGA	3	9	2748286	2748294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086109
46504	NC_014010	TGA	2	6	2748303	2748308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086109
46505	NC_014010	CGG	2	6	2748375	2748380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294086109
46506	NC_014010	TCC	2	6	2748474	2748479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294086110
46507	NC_014010	T	7	7	2748512	2748518	0 %	100 %	0 %	0 %	294086110
46508	NC_014010	CGC	2	6	2748551	2748556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294086110
46509	NC_014010	AGA	2	6	2748560	2748565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294086110
46510	NC_014010	TGA	2	6	2748990	2748995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46511	NC_014010	TGCT	2	8	2749037	2749044	0 %	50 %	25 %	25 %	294086111
46512	NC_014010	TGA	2	6	2749054	2749059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46513	NC_014010	TATC	2	8	2749071	2749078	25 %	50 %	0 %	25 %	294086111
46514	NC_014010	TGCC	2	8	2749239	2749246	0 %	25 %	25 %	50 %	294086111
46515	NC_014010	TGA	2	6	2749309	2749314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46516	NC_014010	CGT	2	6	2749411	2749416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294086111
46517	NC_014010	GC	3	6	2749463	2749468	0 %	0 %	50 %	50 %	294086111
46518	NC_014010	GCAA	2	8	2749495	2749502	50 %	0 %	25 %	25 %	294086111
46519	NC_014010	GCG	2	6	2749522	2749527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294086111
46520	NC_014010	AT	3	6	2749570	2749575	50 %	50 %	0 %	0 %	294086111
46521	NC_014010	GGC	2	6	2749612	2749617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294086111
46522	NC_014010	AAG	2	6	2749698	2749703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294086111
46523	NC_014010	CAT	2	6	2749755	2749760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294086111
46524	NC_014010	AT	3	6	2749775	2749780	50 %	50 %	0 %	0 %	294086111
46525	NC_014010	ATG	2	6	2749812	2749817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46526	NC_014010	TGA	2	6	2749867	2749872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46527	NC_014010	GC	3	6	2749909	2749914	0 %	0 %	50 %	50 %	294086111
46528	NC_014010	TCC	2	6	2749917	2749922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294086111
46529	NC_014010	GTG	2	6	2749934	2749939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294086111
46530	NC_014010	A	6	6	2750023	2750028	100 %	0 %	0 %	0 %	294086111
46531	NC_014010	GAT	2	6	2750029	2750034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46532	NC_014010	TGA	2	6	2750056	2750061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46533	NC_014010	AGA	2	6	2750062	2750067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294086111
46534	NC_014010	GAT	2	6	2750096	2750101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46535	NC_014010	AAAG	2	8	2750215	2750222	75 %	0 %	25 %	0 %	294086111
46536	NC_014010	AT	3	6	2750264	2750269	50 %	50 %	0 %	0 %	294086111
46537	NC_014010	ATG	2	6	2750271	2750276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46538	NC_014010	AAG	2	6	2750283	2750288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294086111
46539	NC_014010	ATT	2	6	2750346	2750351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294086111
46540	NC_014010	CTGG	2	8	2750363	2750370	0 %	25 %	50 %	25 %	294086111
46541	NC_014010	GCGG	2	8	2750467	2750474	0 %	0 %	75 %	25 %	294086111
46542	NC_014010	A	6	6	2750599	2750604	100 %	0 %	0 %	0 %	294086111
46543	NC_014010	A	6	6	2750627	2750632	100 %	0 %	0 %	0 %	294086111
46544	NC_014010	ATAG	2	8	2750642	2750649	50 %	25 %	25 %	0 %	294086111
46545	NC_014010	GTT	2	6	2750709	2750714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294086111
46546	NC_014010	ATG	2	6	2750732	2750737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46547	NC_014010	TGA	2	6	2750803	2750808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46548	NC_014010	GGCA	2	8	2750838	2750845	25 %	0 %	50 %	25 %	294086111
46549	NC_014010	CCTT	2	8	2750938	2750945	0 %	50 %	0 %	50 %	294086111
46550	NC_014010	CCTG	2	8	2750965	2750972	0 %	25 %	25 %	50 %	294086111
46551	NC_014010	ACC	2	6	2751050	2751055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294086111
46552	NC_014010	AT	3	6	2751058	2751063	50 %	50 %	0 %	0 %	294086111
46553	NC_014010	CAT	2	6	2751070	2751075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294086111
46554	NC_014010	GTG	2	6	2751095	2751100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294086111
46555	NC_014010	GGC	2	6	2751105	2751110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294086111
46556	NC_014010	GAT	2	6	2751200	2751205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294086111
46557	NC_014010	AGA	2	6	2751292	2751297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294086111
46558	NC_014010	A	6	6	2751362	2751367	100 %	0 %	0 %	0 %	294086111
46559	NC_014010	CAT	2	6	2751379	2751384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294086111
46560	NC_014010	GTG	2	6	2751479	2751484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294086111
46561	NC_014010	GCAA	2	8	2751510	2751517	50 %	0 %	25 %	25 %	294086111
46562	NC_014010	TAA	2	6	2751546	2751551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294086111
46563	NC_014010	TGAA	2	8	2751564	2751571	50 %	25 %	25 %	0 %	294086111
46564	NC_014010	ATA	2	6	2751627	2751632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294086111
46565	NC_014010	TCG	2	6	2751651	2751656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294086111
46566	NC_014010	ATCA	2	8	2751664	2751671	50 %	25 %	0 %	25 %	294086111
46567	NC_014010	AGC	2	6	2751758	2751763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294086111
46568	NC_014010	GATT	2	8	2751849	2751856	25 %	50 %	25 %	0 %	294086111
46569	NC_014010	CTG	2	6	2751878	2751883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294086111
46570	NC_014010	GAG	2	6	2751905	2751910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294086111
46571	NC_014010	GATC	2	8	2752202	2752209	25 %	25 %	25 %	25 %	294086112
46572	NC_014010	GCG	2	6	2752278	2752283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294086112
46573	NC_014010	ATC	2	6	2752302	2752307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294086112
46574	NC_014010	ACG	2	6	2752370	2752375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294086112
46575	NC_014010	A	6	6	2752398	2752403	100 %	0 %	0 %	0 %	294086112
46576	NC_014010	A	6	6	2752409	2752414	100 %	0 %	0 %	0 %	294086112
46577	NC_014010	A	6	6	2752426	2752431	100 %	0 %	0 %	0 %	294086112
46578	NC_014010	CA	3	6	2752512	2752517	50 %	0 %	0 %	50 %	294086112
46579	NC_014010	GCC	2	6	2752557	2752562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294086112
46580	NC_014010	GACA	2	8	2752605	2752612	50 %	0 %	25 %	25 %	294086112
46581	NC_014010	GCTAT	2	10	2752645	2752654	20 %	40 %	20 %	20 %	294086112
46582	NC_014010	AAT	2	6	2752731	2752736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294086112
46583	NC_014010	AAC	2	6	2752829	2752834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294086112
46584	NC_014010	TGT	2	6	2752880	2752885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294086112
46585	NC_014010	ATT	2	6	2752901	2752906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294086112
46586	NC_014010	AGA	2	6	2752957	2752962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294086112
46587	NC_014010	GGT	2	6	2753071	2753076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294086113
46588	NC_014010	TCC	2	6	2753280	2753285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294086113

< Previous12...82838485868788899091929394Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.