MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri DMIN chromosome

Total Repeats: 346

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014004	ATAAA	2	10	7	16	80 %	20 %	0 %	0 %	293977747
2	NC_014004	AAAAT	2	10	752	761	80 %	20 %	0 %	0 %	293977748
3	NC_014004	AGAAA	2	10	1663	1672	80 %	0 %	20 %	0 %	293977748
4	NC_014004	AAATA	2	10	2150	2159	80 %	20 %	0 %	0 %	293977748
5	NC_014004	TTGAT	2	10	2345	2354	20 %	60 %	20 %	0 %	293977748
6	NC_014004	TTATT	2	10	3004	3013	20 %	80 %	0 %	0 %	293977748
7	NC_014004	CGAAA	2	10	3096	3105	60 %	0 %	20 %	20 %	293977748
8	NC_014004	AATAA	2	10	3485	3494	80 %	20 %	0 %	0 %	293977749
9	NC_014004	ATTAT	2	10	3850	3859	40 %	60 %	0 %	0 %	293977749
10	NC_014004	AAAAT	2	10	4436	4445	80 %	20 %	0 %	0 %	293977749
11	NC_014004	TAAAA	2	10	6780	6789	80 %	20 %	0 %	0 %	293977751
12	NC_014004	AAAAT	2	10	7000	7009	80 %	20 %	0 %	0 %	293977751
13	NC_014004	AAATA	2	10	7362	7371	80 %	20 %	0 %	0 %	293977751
14	NC_014004	AAAAC	2	10	7931	7940	80 %	0 %	0 %	20 %	293977751
15	NC_014004	TTATA	2	10	8725	8734	40 %	60 %	0 %	0 %	293977752
16	NC_014004	AAAAT	2	10	9152	9161	80 %	20 %	0 %	0 %	293977752
17	NC_014004	TAATA	2	10	9205	9214	60 %	40 %	0 %	0 %	293977752
18	NC_014004	TTATT	2	10	9289	9298	20 %	80 %	0 %	0 %	293977752
19	NC_014004	ATATT	2	10	9473	9482	40 %	60 %	0 %	0 %	293977752
20	NC_014004	ATGAA	2	10	9655	9664	60 %	20 %	20 %	0 %	293977753
21	NC_014004	TTAAA	2	10	12057	12066	60 %	40 %	0 %	0 %	293977753
22	NC_014004	ATAAA	2	10	13200	13209	80 %	20 %	0 %	0 %	293977754
23	NC_014004	TATAA	2	10	14309	14318	60 %	40 %	0 %	0 %	293977754
24	NC_014004	TAATA	2	10	14659	14668	60 %	40 %	0 %	0 %	293977755
25	NC_014004	AATAA	2	10	14966	14975	80 %	20 %	0 %	0 %	293977755
26	NC_014004	AATTA	2	10	17081	17090	60 %	40 %	0 %	0 %	293977757
27	NC_014004	AAATG	2	10	17891	17900	60 %	20 %	20 %	0 %	293977757
28	NC_014004	TATGT	2	10	17934	17943	20 %	60 %	20 %	0 %	293977758
29	NC_014004	ATTAT	2	10	18661	18670	40 %	60 %	0 %	0 %	293977760
30	NC_014004	CCCAC	2	10	18964	18973	20 %	0 %	0 %	80 %	293977760
31	NC_014004	ATTTT	2	10	19974	19983	20 %	80 %	0 %	0 %	293977761
32	NC_014004	CGTAC	2	10	21624	21633	20 %	20 %	20 %	40 %	293977763
33	NC_014004	ATTTT	2	10	22550	22559	20 %	80 %	0 %	0 %	293977764
34	NC_014004	TTGAT	2	10	22712	22721	20 %	60 %	20 %	0 %	293977765
35	NC_014004	GTTGT	2	10	23165	23174	0 %	60 %	40 %	0 %	293977765
36	NC_014004	AATGT	2	10	23619	23628	40 %	40 %	20 %	0 %	293977766
37	NC_014004	ATTTT	2	10	23631	23640	20 %	80 %	0 %	0 %	293977766
38	NC_014004	TAATT	2	10	25314	25323	40 %	60 %	0 %	0 %	293977767
39	NC_014004	TAAAT	2	10	25597	25606	60 %	40 %	0 %	0 %	293977767
40	NC_014004	ATCTA	2	10	26232	26241	40 %	40 %	0 %	20 %	293977767
41	NC_014004	TATAT	2	10	26724	26733	40 %	60 %	0 %	0 %	293977767
42	NC_014004	ATTTT	2	10	27352	27361	20 %	80 %	0 %	0 %	293977769
43	NC_014004	ATATA	2	10	27428	27437	60 %	40 %	0 %	0 %	293977769
44	NC_014004	TAATA	2	10	27461	27470	60 %	40 %	0 %	0 %	293977769
45	NC_014004	TATTT	2	10	28096	28105	20 %	80 %	0 %	0 %	293977770
46	NC_014004	AGAAA	2	10	28376	28385	80 %	0 %	20 %	0 %	293977770
47	NC_014004	ATCTA	2	10	28417	28426	40 %	40 %	0 %	20 %	293977770
48	NC_014004	AATTA	3	15	28897	28911	60 %	40 %	0 %	0 %	293977770
49	NC_014004	CATAT	2	10	29555	29564	40 %	40 %	0 %	20 %	293977772
50	NC_014004	TCTTT	2	10	30167	30176	0 %	80 %	0 %	20 %	293977772
51	NC_014004	TTTTC	2	10	30361	30370	0 %	80 %	0 %	20 %	293977773
52	NC_014004	TACTA	2	10	32090	32099	40 %	40 %	0 %	20 %	293977774
53	NC_014004	TAAAA	2	10	32868	32877	80 %	20 %	0 %	0 %	293977775
54	NC_014004	ATTAT	2	10	32878	32887	40 %	60 %	0 %	0 %	293977775
55	NC_014004	TCTTT	2	10	33059	33068	0 %	80 %	0 %	20 %	293977775
56	NC_014004	TATTT	2	10	33827	33836	20 %	80 %	0 %	0 %	293977777
57	NC_014004	AATTT	2	10	34907	34916	40 %	60 %	0 %	0 %	293977778
58	NC_014004	ATTTT	2	10	35119	35128	20 %	80 %	0 %	0 %	293977779
59	NC_014004	TTTTA	2	10	35359	35368	20 %	80 %	0 %	0 %	293977779
60	NC_014004	TAAAA	2	10	36914	36923	80 %	20 %	0 %	0 %	293977780
61	NC_014004	AAATA	2	10	38331	38340	80 %	20 %	0 %	0 %	293977782
62	NC_014004	TAAAT	2	10	38365	38374	60 %	40 %	0 %	0 %	293977782
63	NC_014004	CATAA	2	10	39086	39095	60 %	20 %	0 %	20 %	293977783
64	NC_014004	ATTTA	2	10	39647	39656	40 %	60 %	0 %	0 %	293977783
65	NC_014004	TAATA	2	10	40353	40362	60 %	40 %	0 %	0 %	293977784
66	NC_014004	ATTTT	2	10	40778	40787	20 %	80 %	0 %	0 %	293977784
67	NC_014004	ATATG	2	10	41014	41023	40 %	40 %	20 %	0 %	293977784
68	NC_014004	ATTTA	2	10	44441	44450	40 %	60 %	0 %	0 %	293977786
69	NC_014004	TAAAA	2	10	45306	45315	80 %	20 %	0 %	0 %	293977786
70	NC_014004	AGTAA	2	10	45600	45609	60 %	20 %	20 %	0 %	293977787
71	NC_014004	TAATT	2	10	46603	46612	40 %	60 %	0 %	0 %	293977788
72	NC_014004	AAAAT	2	10	46728	46737	80 %	20 %	0 %	0 %	293977788
73	NC_014004	TATAA	2	10	47096	47105	60 %	40 %	0 %	0 %	293977788
74	NC_014004	AAATT	2	10	47562	47571	60 %	40 %	0 %	0 %	293977788
75	NC_014004	AAATA	2	10	48097	48106	80 %	20 %	0 %	0 %	293977790
76	NC_014004	TCTAT	2	10	48880	48889	20 %	60 %	0 %	20 %	293977792
77	NC_014004	TAATT	2	10	49280	49289	40 %	60 %	0 %	0 %	293977792
78	NC_014004	TAAAT	2	10	49537	49546	60 %	40 %	0 %	0 %	293977793
79	NC_014004	CAAAA	2	10	49692	49701	80 %	0 %	0 %	20 %	293977793
80	NC_014004	ATTTT	2	10	50058	50067	20 %	80 %	0 %	0 %	293977794
81	NC_014004	TTTGA	2	10	50380	50389	20 %	60 %	20 %	0 %	293977794
82	NC_014004	TAAAT	2	10	52406	52415	60 %	40 %	0 %	0 %	293977794
83	NC_014004	TTTTA	2	10	52454	52463	20 %	80 %	0 %	0 %	293977794
84	NC_014004	ATATA	2	10	52785	52794	60 %	40 %	0 %	0 %	293977794
85	NC_014004	TATCA	2	10	53960	53969	40 %	40 %	0 %	20 %	293977794
86	NC_014004	ATTTT	2	10	54498	54507	20 %	80 %	0 %	0 %	293977794
87	NC_014004	ATTTA	2	10	55583	55592	40 %	60 %	0 %	0 %	293977795
88	NC_014004	TTCTC	2	10	56347	56356	0 %	60 %	0 %	40 %	293977795
89	NC_014004	AATTA	2	10	57305	57314	60 %	40 %	0 %	0 %	293977795
90	NC_014004	ATTTA	2	10	57386	57395	40 %	60 %	0 %	0 %	293977795
91	NC_014004	AAGTA	2	10	57833	57842	60 %	20 %	20 %	0 %	293977795
92	NC_014004	ATTTT	2	10	60138	60147	20 %	80 %	0 %	0 %	293977798
93	NC_014004	CGTAT	2	10	60713	60722	20 %	40 %	20 %	20 %	293977799
94	NC_014004	TATTT	2	10	62417	62426	20 %	80 %	0 %	0 %	293977800
95	NC_014004	ATCAA	2	10	62908	62917	60 %	20 %	0 %	20 %	293977800
96	NC_014004	GATTT	2	10	63862	63871	20 %	60 %	20 %	0 %	293977801
97	NC_014004	TTCTA	2	10	63971	63980	20 %	60 %	0 %	20 %	293977801
98	NC_014004	AATTT	2	10	65427	65436	40 %	60 %	0 %	0 %	293977801
99	NC_014004	TTATA	2	10	67731	67740	40 %	60 %	0 %	0 %	293977802
100	NC_014004	TAAAA	2	10	68512	68521	80 %	20 %	0 %	0 %	293977803
101	NC_014004	ATTAT	2	10	68568	68577	40 %	60 %	0 %	0 %	293977804
102	NC_014004	TAAAA	2	10	69247	69256	80 %	20 %	0 %	0 %	293977805
103	NC_014004	TAATA	2	10	69613	69622	60 %	40 %	0 %	0 %	293977805
104	NC_014004	AGTAA	2	10	70334	70343	60 %	20 %	20 %	0 %	293977805
105	NC_014004	ATTAA	2	10	70347	70356	60 %	40 %	0 %	0 %	293977805
106	NC_014004	TTTAT	2	10	70889	70898	20 %	80 %	0 %	0 %	293977807
107	NC_014004	GTAAT	2	10	71043	71052	40 %	40 %	20 %	0 %	293977807
108	NC_014004	ATTAT	2	10	71258	71267	40 %	60 %	0 %	0 %	293977807
109	NC_014004	TTTTA	2	10	71626	71635	20 %	80 %	0 %	0 %	293977807
110	NC_014004	ATTTA	2	10	77598	77607	40 %	60 %	0 %	0 %	293977808
111	NC_014004	AATAA	2	10	78244	78253	80 %	20 %	0 %	0 %	293977808
112	NC_014004	TATAA	2	10	78261	78270	60 %	40 %	0 %	0 %	293977808
113	NC_014004	AAATA	2	10	79417	79426	80 %	20 %	0 %	0 %	293977811
114	NC_014004	AATTA	2	10	79913	79922	60 %	40 %	0 %	0 %	293977811
115	NC_014004	ATAAA	2	10	80221	80230	80 %	20 %	0 %	0 %	293977811
116	NC_014004	ATTAA	2	10	80277	80286	60 %	40 %	0 %	0 %	293977811
117	NC_014004	ATTAA	2	10	80391	80400	60 %	40 %	0 %	0 %	293977811
118	NC_014004	AATGG	2	10	80985	80994	40 %	20 %	40 %	0 %	293977812
119	NC_014004	TGAAT	2	10	82592	82601	40 %	40 %	20 %	0 %	293977812
120	NC_014004	ATAAA	2	10	82801	82810	80 %	20 %	0 %	0 %	293977812
121	NC_014004	AGCTA	2	10	83949	83958	40 %	20 %	20 %	20 %	293977814
122	NC_014004	GATTT	2	10	86078	86087	20 %	60 %	20 %	0 %	293977816
123	NC_014004	TAAAA	2	10	86954	86963	80 %	20 %	0 %	0 %	293977817
124	NC_014004	TTAAA	2	10	87177	87186	60 %	40 %	0 %	0 %	293977818
125	NC_014004	ATTAA	2	10	87638	87647	60 %	40 %	0 %	0 %	293977819
126	NC_014004	AGATA	2	10	87738	87747	60 %	20 %	20 %	0 %	293977819
127	NC_014004	ATTAT	2	10	87956	87965	40 %	60 %	0 %	0 %	293977820
128	NC_014004	AATAG	2	10	88312	88321	60 %	20 %	20 %	0 %	293977821
129	NC_014004	ATTAT	2	10	88594	88603	40 %	60 %	0 %	0 %	293977821
130	NC_014004	ATTTA	2	10	88760	88769	40 %	60 %	0 %	0 %	293977822
131	NC_014004	AAAAG	2	10	89499	89508	80 %	0 %	20 %	0 %	293977822
132	NC_014004	AATAT	2	10	89551	89560	60 %	40 %	0 %	0 %	293977822
133	NC_014004	TATAA	2	10	89566	89575	60 %	40 %	0 %	0 %	293977822
134	NC_014004	AAATT	2	10	91475	91484	60 %	40 %	0 %	0 %	293977824
135	NC_014004	ATTTT	3	15	91536	91550	20 %	80 %	0 %	0 %	293977824
136	NC_014004	ATATT	2	10	92173	92182	40 %	60 %	0 %	0 %	293977825
137	NC_014004	ATTTT	2	10	92498	92507	20 %	80 %	0 %	0 %	293977825
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.